MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinoplanes sp. SE50/110 chromosome

Total Repeats: 266867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017803	AACG	2	8	18600	18607	50 %	0 %	25 %	25 %	386845087
502	NC_017803	GCC	2	6	18618	18623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845087
503	NC_017803	TGG	2	6	18629	18634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845087
504	NC_017803	GCC	2	6	18659	18664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845087
505	NC_017803	CCGG	2	8	18667	18674	0 %	0 %	50 %	50 %	386845087
506	NC_017803	CCA	2	6	18784	18789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017803	CAG	2	6	18792	18797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017803	GCC	2	6	18807	18812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_017803	CGG	3	9	18816	18824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017803	GCG	2	6	18954	18959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845088
511	NC_017803	GCGG	2	8	18976	18983	0 %	0 %	75 %	25 %	386845088
512	NC_017803	GGC	2	6	19036	19041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845088
513	NC_017803	GGTGC	2	10	19065	19074	0 %	20 %	60 %	20 %	386845088
514	NC_017803	GCG	2	6	19087	19092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845088
515	NC_017803	GGC	2	6	19093	19098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845088
516	NC_017803	CG	3	6	19102	19107	0 %	0 %	50 %	50 %	386845088
517	NC_017803	GGC	2	6	19135	19140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845088
518	NC_017803	TGG	2	6	19149	19154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845088
519	NC_017803	CAG	3	9	19156	19164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845088
520	NC_017803	CGG	2	6	19186	19191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845088
521	NC_017803	CAG	2	6	19237	19242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845088
522	NC_017803	GGCC	2	8	19262	19269	0 %	0 %	50 %	50 %	386845088
523	NC_017803	GCG	2	6	19282	19287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845088
524	NC_017803	CAG	2	6	19339	19344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845088
525	NC_017803	GAG	2	6	19348	19353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845088
526	NC_017803	CCG	2	6	19382	19387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845088
527	NC_017803	GGT	2	6	19402	19407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845088
528	NC_017803	CAG	2	6	19414	19419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845088
529	NC_017803	GCG	2	6	19453	19458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845088
530	NC_017803	CCT	2	6	19473	19478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845088
531	NC_017803	CCG	2	6	19505	19510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_017803	GCC	2	6	19519	19524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_017803	GGA	2	6	19534	19539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017803	TGG	2	6	19575	19580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017803	ATG	2	6	19611	19616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017803	GCG	2	6	19617	19622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017803	CTG	2	6	19667	19672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845089
538	NC_017803	GCCGG	2	10	19673	19682	0 %	0 %	60 %	40 %	386845089
539	NC_017803	GGA	2	6	19708	19713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845089
540	NC_017803	GTCGAT	2	12	19721	19732	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386845089
541	NC_017803	TGG	2	6	19740	19745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845089
542	NC_017803	TCGA	2	8	19748	19755	25 %	25 %	25 %	25 %	386845089
543	NC_017803	CCG	2	6	19773	19778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845089
544	NC_017803	TG	3	6	19823	19828	0 %	50 %	50 %	0 %	386845089
545	NC_017803	CCA	2	6	19884	19889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845089
546	NC_017803	GCG	2	6	19915	19920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845089
547	NC_017803	GCT	2	6	19921	19926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845089
548	NC_017803	CGA	2	6	20017	20022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845089
549	NC_017803	CGC	2	6	20058	20063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845089
550	NC_017803	ATC	2	6	20069	20074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845089
551	NC_017803	CCGGT	2	10	20109	20118	0 %	20 %	40 %	40 %	386845089
552	NC_017803	GC	3	6	20124	20129	0 %	0 %	50 %	50 %	386845089
553	NC_017803	CAG	2	6	20298	20303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845090
554	NC_017803	CGA	3	9	20345	20353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845090
555	NC_017803	GGT	2	6	20400	20405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845090
556	NC_017803	GCC	2	6	20410	20415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845090
557	NC_017803	GCC	3	9	20446	20454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845090
558	NC_017803	GGCC	2	8	20462	20469	0 %	0 %	50 %	50 %	386845090
559	NC_017803	GGC	2	6	20472	20477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845090
560	NC_017803	CTGC	2	8	20555	20562	0 %	25 %	25 %	50 %	386845090
561	NC_017803	GCC	2	6	20575	20580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845090
562	NC_017803	GGC	2	6	20613	20618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845090
563	NC_017803	ACC	2	6	20620	20625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845090
564	NC_017803	AGTC	2	8	20640	20647	25 %	25 %	25 %	25 %	386845090
565	NC_017803	CTCG	2	8	20649	20656	0 %	25 %	25 %	50 %	386845090
566	NC_017803	GGTGAC	2	12	20784	20795	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386845090
567	NC_017803	GCG	2	6	20829	20834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845090
568	NC_017803	CAC	2	6	20848	20853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845090
569	NC_017803	GAC	2	6	20859	20864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845090
570	NC_017803	AGA	2	6	20902	20907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017803	GCC	2	6	20961	20966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845091
572	NC_017803	GTC	2	6	21018	21023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845091
573	NC_017803	CG	3	6	21087	21092	0 %	0 %	50 %	50 %	386845091
574	NC_017803	GGT	2	6	21093	21098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845091
575	NC_017803	GTG	2	6	21136	21141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845091
576	NC_017803	GAA	2	6	21165	21170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845091
577	NC_017803	CGGC	2	8	21221	21228	0 %	0 %	50 %	50 %	386845091
578	NC_017803	GGC	2	6	21232	21237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845091
579	NC_017803	CAG	2	6	21255	21260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845091
580	NC_017803	ACC	2	6	21271	21276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845091
581	NC_017803	CTC	2	6	21297	21302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845091
582	NC_017803	CGG	2	6	21321	21326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845091
583	NC_017803	GTCA	2	8	21330	21337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
584	NC_017803	CGG	3	9	21376	21384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017803	CGGG	2	8	21397	21404	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
586	NC_017803	CGG	2	6	21410	21415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017803	CGGG	2	8	21418	21425	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
588	NC_017803	GGC	2	6	21464	21469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845092
589	NC_017803	GCA	2	6	21481	21486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845092
590	NC_017803	GCTGAG	2	12	21497	21508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386845092
591	NC_017803	GAC	2	6	21539	21544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845092
592	NC_017803	GGC	2	6	21547	21552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845092
593	NC_017803	GCACG	2	10	21553	21562	20 %	0 %	40 %	40 %	386845092
594	NC_017803	CCT	2	6	21583	21588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845092
595	NC_017803	CTC	2	6	21602	21607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845092
596	NC_017803	GCAC	2	8	21678	21685	25 %	0 %	25 %	50 %	386845092
597	NC_017803	CGGT	2	8	21696	21703	0 %	25 %	50 %	25 %	386845092
598	NC_017803	CGGC	2	8	21718	21725	0 %	0 %	50 %	50 %	386845092
599	NC_017803	CAC	3	9	21734	21742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845092
600	NC_017803	TCG	2	6	21780	21785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845092
601	NC_017803	G	6	6	21787	21792	0 %	0 %	100 %	0 %	386845092
602	NC_017803	CGG	2	6	21796	21801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845092
603	NC_017803	TCA	2	6	21823	21828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845092
604	NC_017803	GGT	2	6	21899	21904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017803	CGTG	2	8	21996	22003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
606	NC_017803	CAA	2	6	22027	22032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017803	CGA	2	6	22113	22118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845093
608	NC_017803	TGG	2	6	22154	22159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845093
609	NC_017803	CGGC	2	8	22218	22225	0 %	0 %	50 %	50 %	386845093
610	NC_017803	AGC	2	6	22247	22252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845093
611	NC_017803	CGGCC	2	10	22273	22282	0 %	0 %	40 %	60 %	386845093
612	NC_017803	GATC	2	8	22353	22360	25 %	25 %	25 %	25 %	386845093
613	NC_017803	CGGG	2	8	22436	22443	0 %	0 %	75 %	25 %	386845093
614	NC_017803	GAT	2	6	22449	22454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845093
615	NC_017803	CG	3	6	22462	22467	0 %	0 %	50 %	50 %	386845093
616	NC_017803	ACG	2	6	22478	22483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845093
617	NC_017803	CGA	2	6	22569	22574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845093
618	NC_017803	CCG	3	9	22589	22597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845093
619	NC_017803	CGG	2	6	22603	22608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845093
620	NC_017803	GAG	3	9	22648	22656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845093
621	NC_017803	GCC	2	6	22668	22673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845093
622	NC_017803	TCG	2	6	22774	22779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845093
623	NC_017803	CAC	2	6	22913	22918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845094
624	NC_017803	CGC	2	6	22928	22933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845094
625	NC_017803	GTC	3	9	22956	22964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845094
626	NC_017803	TGC	2	6	22981	22986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845094
627	NC_017803	CGC	2	6	23084	23089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845094
628	NC_017803	TG	3	6	23092	23097	0 %	50 %	50 %	0 %	386845094
629	NC_017803	GAC	2	6	23118	23123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845094
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999	NC_017803	GCG	2	6	36092	36097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845103
1000	NC_017803	ACT	2	6	36098	36103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845103

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