MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 7768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017167	CCTC	2	8	235	242	0 %	25 %	0 %	75 %	384133788
2	NC_017167	CTGC	2	8	442	449	0 %	25 %	25 %	50 %	384133788
3	NC_017167	ACGA	2	8	606	613	50 %	0 %	25 %	25 %	384133788
4	NC_017167	TCGC	2	8	833	840	0 %	25 %	25 %	50 %	384133788
5	NC_017167	CCAA	2	8	964	971	50 %	0 %	0 %	50 %	384133788
6	NC_017167	GACC	2	8	1241	1248	25 %	0 %	25 %	50 %	384133788
7	NC_017167	TCCT	2	8	1543	1550	0 %	50 %	0 %	50 %	384133789
8	NC_017167	CGGT	2	8	1799	1806	0 %	25 %	50 %	25 %	384133790
9	NC_017167	CCGG	2	8	2094	2101	0 %	0 %	50 %	50 %	384133790
10	NC_017167	CTCG	2	8	2384	2391	0 %	25 %	25 %	50 %	384133790
11	NC_017167	ATCG	2	8	2437	2444	25 %	25 %	25 %	25 %	384133790
12	NC_017167	AAGG	2	8	2572	2579	50 %	0 %	50 %	0 %	384133790
13	NC_017167	GCTG	2	8	4850	4857	0 %	25 %	50 %	25 %	384133793
14	NC_017167	GCAC	2	8	5006	5013	25 %	0 %	25 %	50 %	384133793
15	NC_017167	GCAT	2	8	6119	6126	25 %	25 %	25 %	25 %	384133794
16	NC_017167	AGGC	2	8	6291	6298	25 %	0 %	50 %	25 %	384133794
17	NC_017167	CAGC	2	8	7699	7706	25 %	0 %	25 %	50 %	384133794
18	NC_017167	GACG	2	8	8098	8105	25 %	0 %	50 %	25 %	384133794
19	NC_017167	CGGC	2	8	8860	8867	0 %	0 %	50 %	50 %	384133796
20	NC_017167	GACG	2	8	8947	8954	25 %	0 %	50 %	25 %	384133796
21	NC_017167	CGCC	2	8	9154	9161	0 %	0 %	25 %	75 %	384133796
22	NC_017167	TGAC	2	8	11463	11470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017167	AGCC	2	8	12174	12181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017167	GCGA	2	8	12613	12620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017167	AGCC	2	8	12710	12717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017167	GGCC	2	8	12749	12756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017167	GCGA	2	8	13035	13042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017167	GCGA	2	8	13391	13398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017167	GGGA	2	8	13960	13967	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017167	ACCG	2	8	15089	15096	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017167	GAAG	2	8	15211	15218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017167	GCGA	2	8	15369	15376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017167	GCGA	2	8	15510	15517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017167	CGAG	2	8	15549	15556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017167	AGGT	2	8	15671	15678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017167	GGGC	2	8	15860	15867	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017167	ATCT	2	8	16385	16392	25 %	50 %	0 %	25 %	384133800
38	NC_017167	CGGC	2	8	17148	17155	0 %	0 %	50 %	50 %	384133800
39	NC_017167	CGGT	2	8	17620	17627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017167	GGCG	2	8	17818	17825	0 %	0 %	75 %	25 %	384133801
41	NC_017167	GCCG	2	8	17980	17987	0 %	0 %	50 %	50 %	384133801
42	NC_017167	CGCC	2	8	18306	18313	0 %	0 %	25 %	75 %	384133801
43	NC_017167	CGAG	2	8	19423	19430	25 %	0 %	50 %	25 %	384133803
44	NC_017167	AGCG	2	8	19671	19678	25 %	0 %	50 %	25 %	384133803
45	NC_017167	AAGC	2	8	20336	20343	50 %	0 %	25 %	25 %	384133803
46	NC_017167	TGGG	2	8	20467	20474	0 %	25 %	75 %	0 %	384133803
47	NC_017167	GCGT	2	8	21008	21015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017167	GTCG	2	8	21420	21427	0 %	25 %	50 %	25 %	384133805
49	NC_017167	GCCC	2	8	21695	21702	0 %	0 %	25 %	75 %	384133805
50	NC_017167	GGCG	2	8	22050	22057	0 %	0 %	75 %	25 %	384133805
51	NC_017167	CAGC	2	8	22404	22411	25 %	0 %	25 %	50 %	384133805
52	NC_017167	GGCT	2	8	22558	22565	0 %	25 %	50 %	25 %	384133805
53	NC_017167	CATG	2	8	23012	23019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017167	CGTG	2	8	23654	23661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017167	CTGT	2	8	23697	23704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017167	GGAC	2	8	24092	24099	25 %	0 %	50 %	25 %	384133807
57	NC_017167	AACC	2	8	24108	24115	50 %	0 %	0 %	50 %	384133807
58	NC_017167	CAAC	2	8	24243	24250	50 %	0 %	0 %	50 %	384133808
59	NC_017167	ATGC	2	8	24680	24687	25 %	25 %	25 %	25 %	384133808
60	NC_017167	GAAA	2	8	25265	25272	75 %	0 %	25 %	0 %	384133808
61	NC_017167	GAGC	2	8	25542	25549	25 %	0 %	50 %	25 %	384133808
62	NC_017167	GACG	2	8	25787	25794	25 %	0 %	50 %	25 %	384133808
63	NC_017167	TCCG	2	8	26135	26142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017167	TAGG	2	8	26156	26163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017167	TGAA	2	8	26309	26316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017167	CGAG	2	8	26381	26388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017167	TCCA	2	8	26644	26651	25 %	25 %	0 %	50 %	384133809
68	NC_017167	CTTC	2	8	26967	26974	0 %	50 %	0 %	50 %	384133809
69	NC_017167	GCGG	2	8	27118	27125	0 %	0 %	75 %	25 %	384133809
70	NC_017167	CCGA	2	8	27394	27401	25 %	0 %	25 %	50 %	384133809
71	NC_017167	TTTC	2	8	27417	27424	0 %	75 %	0 %	25 %	384133809
72	NC_017167	ATGG	2	8	27799	27806	25 %	25 %	50 %	0 %	384133809
73	NC_017167	GTCT	2	8	28588	28595	0 %	50 %	25 %	25 %	384133811
74	NC_017167	TGTA	2	8	29369	29376	25 %	50 %	25 %	0 %	384133811
75	NC_017167	CCTT	2	8	29386	29393	0 %	50 %	0 %	50 %	384133811
76	NC_017167	CAGG	2	8	29741	29748	25 %	0 %	50 %	25 %	384133811
77	NC_017167	ACCA	2	8	29929	29936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017167	GTTT	2	8	30135	30142	0 %	75 %	25 %	0 %	384133812
79	NC_017167	TTCC	2	8	30167	30174	0 %	50 %	0 %	50 %	384133812
80	NC_017167	TCCG	2	8	30577	30584	0 %	25 %	25 %	50 %	384133813
81	NC_017167	CAGA	2	8	30874	30881	50 %	0 %	25 %	25 %	384133813
82	NC_017167	GGAC	2	8	31685	31692	25 %	0 %	50 %	25 %	384133814
83	NC_017167	TCGG	2	8	32173	32180	0 %	25 %	50 %	25 %	384133814
84	NC_017167	GGCG	2	8	32204	32211	0 %	0 %	75 %	25 %	384133814
85	NC_017167	GGGA	2	8	32274	32281	25 %	0 %	75 %	0 %	384133814
86	NC_017167	GGGC	2	8	33260	33267	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017167	GGCG	2	8	33391	33398	0 %	0 %	75 %	25 %	384133816
88	NC_017167	CGGC	2	8	33588	33595	0 %	0 %	50 %	50 %	384133816
89	NC_017167	GAGT	2	8	33688	33695	25 %	25 %	50 %	0 %	384133816
90	NC_017167	GAGG	2	8	34109	34116	25 %	0 %	75 %	0 %	384133816
91	NC_017167	GTCC	2	8	34148	34155	0 %	25 %	25 %	50 %	384133816
92	NC_017167	GGCG	2	8	35145	35152	0 %	0 %	75 %	25 %	384133817
93	NC_017167	CCGT	2	8	35462	35469	0 %	25 %	25 %	50 %	384133817
94	NC_017167	GGCG	2	8	35472	35479	0 %	0 %	75 %	25 %	384133817
95	NC_017167	CGCC	2	8	35766	35773	0 %	0 %	25 %	75 %	384133817
96	NC_017167	GTTC	2	8	35934	35941	0 %	50 %	25 %	25 %	384133817
97	NC_017167	TGCG	2	8	36044	36051	0 %	25 %	50 %	25 %	384133817
98	NC_017167	GGCC	2	8	36744	36751	0 %	0 %	50 %	50 %	384133818
99	NC_017167	GGGC	2	8	37281	37288	0 %	0 %	75 %	25 %	384133818
100	NC_017167	CCTT	2	8	37441	37448	0 %	50 %	0 %	50 %	384133818
101	NC_017167	GCGG	2	8	37804	37811	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017167	CACT	2	8	37863	37870	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017167	GACA	2	8	38118	38125	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017167	CGGT	2	8	39385	39392	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017167	TTTC	2	8	40360	40367	0 %	75 %	0 %	25 %	384133824
106	NC_017167	TTTC	2	8	40608	40615	0 %	75 %	0 %	25 %	384133824
107	NC_017167	TTCT	2	8	41562	41569	0 %	75 %	0 %	25 %	384133825
108	NC_017167	CGGA	2	8	41709	41716	25 %	0 %	50 %	25 %	384133826
109	NC_017167	CAGG	2	8	42237	42244	25 %	0 %	50 %	25 %	384133826
110	NC_017167	GCAT	2	8	42254	42261	25 %	25 %	25 %	25 %	384133826
111	NC_017167	CTAC	2	8	42344	42351	25 %	25 %	0 %	50 %	384133826
112	NC_017167	GGAT	2	8	42387	42394	25 %	25 %	50 %	0 %	384133826
113	NC_017167	GATG	2	8	42571	42578	25 %	25 %	50 %	0 %	384133826
114	NC_017167	TCCA	2	8	42752	42759	25 %	25 %	0 %	50 %	384133826
115	NC_017167	TGCC	2	8	44700	44707	0 %	25 %	25 %	50 %	384133828
116	NC_017167	CAGC	2	8	44755	44762	25 %	0 %	25 %	50 %	384133828
117	NC_017167	ACCC	2	8	44785	44792	25 %	0 %	0 %	75 %	384133828
118	NC_017167	CGGG	2	8	45410	45417	0 %	0 %	75 %	25 %	384133829
119	NC_017167	CGAA	2	8	45539	45546	50 %	0 %	25 %	25 %	384133829
120	NC_017167	CGTC	2	8	46730	46737	0 %	25 %	25 %	50 %	384133830
121	NC_017167	GCCG	2	8	47046	47053	0 %	0 %	50 %	50 %	384133830
122	NC_017167	CGGG	2	8	47150	47157	0 %	0 %	75 %	25 %	384133830
123	NC_017167	CCAC	2	8	47167	47174	25 %	0 %	0 %	75 %	384133830
124	NC_017167	ATCC	2	8	47408	47415	25 %	25 %	0 %	50 %	384133830
125	NC_017167	CAGC	2	8	49380	49387	25 %	0 %	25 %	50 %	384133832
126	NC_017167	AAGG	2	8	49596	49603	50 %	0 %	50 %	0 %	384133833
127	NC_017167	GCCT	2	8	50076	50083	0 %	25 %	25 %	50 %	384133833
128	NC_017167	GGCG	2	8	50651	50658	0 %	0 %	75 %	25 %	384133834
129	NC_017167	TCCT	2	8	50700	50707	0 %	50 %	0 %	50 %	384133834
130	NC_017167	TCGC	2	8	50736	50743	0 %	25 %	25 %	50 %	384133834
131	NC_017167	AGGA	2	8	51198	51205	50 %	0 %	50 %	0 %	384133835
132	NC_017167	AATC	2	8	51613	51620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017167	CGGC	2	8	52162	52169	0 %	0 %	50 %	50 %	384133836
134	NC_017167	CGCC	2	8	52798	52805	0 %	0 %	25 %	75 %	384133836
135	NC_017167	CGGC	2	8	52926	52933	0 %	0 %	50 %	50 %	384133837
136	NC_017167	TCGC	2	8	53066	53073	0 %	25 %	25 %	50 %	384133837
137	NC_017167	GTGG	2	8	53603	53610	0 %	25 %	75 %	0 %	384133837
138	NC_017167	CCGG	2	8	54012	54019	0 %	0 %	50 %	50 %	384133837
139	NC_017167	GCCC	2	8	54214	54221	0 %	0 %	25 %	75 %	384133837
140	NC_017167	GACG	2	8	54672	54679	25 %	0 %	50 %	25 %	384133838
141	NC_017167	CCGG	2	8	54694	54701	0 %	0 %	50 %	50 %	384133838
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