MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_017167	GTT	2	6	1884080	1884085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384135698
41003	NC_017167	CCG	2	6	1884090	1884095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135698
41004	NC_017167	CG	3	6	1884094	1884099	0 %	0 %	50 %	50 %	384135698
41005	NC_017167	GTC	2	6	1884100	1884105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135698
41006	NC_017167	ACG	2	6	1884178	1884183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135698
41007	NC_017167	ATG	2	6	1884184	1884189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135698
41008	NC_017167	GC	3	6	1884230	1884235	0 %	0 %	50 %	50 %	384135698
41009	NC_017167	CCG	2	6	1884238	1884243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135698
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41011	NC_017167	CCTT	2	8	1884397	1884404	0 %	50 %	0 %	50 %	384135698
41012	NC_017167	CTT	2	6	1884494	1884499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135698
41013	NC_017167	CTT	2	6	1884513	1884518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135698
41014	NC_017167	ATG	2	6	1884575	1884580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135699
41015	NC_017167	CAC	2	6	1884772	1884777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135699
41016	NC_017167	CGCC	2	8	1884822	1884829	0 %	0 %	25 %	75 %	384135699
41017	NC_017167	A	6	6	1884864	1884869	100 %	0 %	0 %	0 %	384135699
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41025	NC_017167	GAAA	2	8	1885368	1885375	75 %	0 %	25 %	0 %	384135699
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41042	NC_017167	AG	3	6	1886196	1886201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41043	NC_017167	GGTT	2	8	1886220	1886227	0 %	50 %	50 %	0 %	384135701
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41062	NC_017167	CGGC	2	8	1887420	1887427	0 %	0 %	50 %	50 %	384135702
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41113	NC_017167	CGG	2	6	1889665	1889670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135703
41114	NC_017167	TC	3	6	1889711	1889716	0 %	50 %	0 %	50 %	384135703
41115	NC_017167	GAC	2	6	1889794	1889799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135703
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41117	NC_017167	TGC	2	6	1889915	1889920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135703
41118	NC_017167	TCT	2	6	1889987	1889992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135703
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41131	NC_017167	GC	3	6	1890703	1890708	0 %	0 %	50 %	50 %	384135703
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41218	NC_017167	CACC	2	8	1894472	1894479	25 %	0 %	0 %	75 %	384135707
41219	NC_017167	GGCT	2	8	1894518	1894525	0 %	25 %	50 %	25 %	384135707
41220	NC_017167	ACA	2	6	1894543	1894548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384135707
41221	NC_017167	CACCTG	2	12	1894602	1894613	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384135707
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41223	NC_017167	TCG	2	6	1894702	1894707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135707
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41225	NC_017167	GC	3	6	1894806	1894811	0 %	0 %	50 %	50 %	384135707
41226	NC_017167	CGC	2	6	1894825	1894830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135707
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41228	NC_017167	ACA	2	6	1894994	1894999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384135708
41229	NC_017167	CG	3	6	1895003	1895008	0 %	0 %	50 %	50 %	384135708
41230	NC_017167	CGG	2	6	1895015	1895020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135708
41231	NC_017167	CAAGG	2	10	1895065	1895074	40 %	0 %	40 %	20 %	384135708
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