MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40502	NC_017167	GTC	2	6	1861728	1861733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135674
40503	NC_017167	T	6	6	1861776	1861781	0 %	100 %	0 %	0 %	384135674
40504	NC_017167	GC	3	6	1861853	1861858	0 %	0 %	50 %	50 %	384135674
40505	NC_017167	CGCC	2	8	1861874	1861881	0 %	0 %	25 %	75 %	384135674
40506	NC_017167	GCG	2	6	1862008	1862013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40507	NC_017167	GC	3	6	1862015	1862020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40508	NC_017167	TCGC	2	8	1862035	1862042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40509	NC_017167	CAT	2	6	1862083	1862088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40510	NC_017167	GC	3	6	1862110	1862115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40511	NC_017167	GCA	2	6	1862187	1862192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135675
40512	NC_017167	AGGA	2	8	1862206	1862213	50 %	0 %	50 %	0 %	384135675
40513	NC_017167	CGC	2	6	1862242	1862247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135675
40514	NC_017167	TCG	2	6	1862267	1862272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135675
40515	NC_017167	GGC	2	6	1862298	1862303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135675
40516	NC_017167	CAT	2	6	1862316	1862321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135675
40517	NC_017167	CAC	2	6	1862358	1862363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135675
40518	NC_017167	CTT	2	6	1862398	1862403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135675
40519	NC_017167	GAC	2	6	1862432	1862437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135675
40520	NC_017167	TCA	2	6	1862489	1862494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135675
40521	NC_017167	CTG	2	6	1862575	1862580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135675
40522	NC_017167	CAT	2	6	1862598	1862603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135675
40523	NC_017167	CCG	4	12	1862606	1862617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135675
40524	NC_017167	GCG	2	6	1862625	1862630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135675
40525	NC_017167	GGCCA	2	10	1862632	1862641	20 %	0 %	40 %	40 %	384135675
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40527	NC_017167	CCTG	2	8	1862745	1862752	0 %	25 %	25 %	50 %	384135675
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40533	NC_017167	TGC	2	6	1862949	1862954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135675
40534	NC_017167	CGT	2	6	1862957	1862962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135675
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40539	NC_017167	GCCG	2	8	1863190	1863197	0 %	0 %	50 %	50 %	384135675
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40542	NC_017167	CGC	2	6	1863249	1863254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135675
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40557	NC_017167	TCG	2	6	1863921	1863926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40559	NC_017167	CG	3	6	1864162	1864167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40560	NC_017167	AG	3	6	1864250	1864255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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40563	NC_017167	GCGA	3	12	1864441	1864452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40564	NC_017167	GTC	2	6	1864454	1864459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40567	NC_017167	CGGC	2	8	1864582	1864589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40568	NC_017167	CGA	2	6	1864597	1864602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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