MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017167	AGCGC	2	10	404702	404711	20 %	0 %	40 %	40 %	384134174
9002	NC_017167	GCC	2	6	404733	404738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134174
9003	NC_017167	GCTC	2	8	404815	404822	0 %	25 %	25 %	50 %	384134175
9004	NC_017167	GT	3	6	404837	404842	0 %	50 %	50 %	0 %	384134175
9005	NC_017167	AAG	2	6	404865	404870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134175
9006	NC_017167	GAG	2	6	404883	404888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134175
9007	NC_017167	TTG	2	6	404907	404912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134175
9008	NC_017167	CTG	2	6	404916	404921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134175
9009	NC_017167	TGG	2	6	404937	404942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134175
9010	NC_017167	GTA	2	6	404948	404953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134175
9011	NC_017167	CAA	2	6	404968	404973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134175
9012	NC_017167	GTC	2	6	405032	405037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134176
9013	NC_017167	CAG	2	6	405038	405043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134176
9014	NC_017167	CAA	2	6	405049	405054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134176
9015	NC_017167	GTG	2	6	405059	405064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134176
9016	NC_017167	GTG	2	6	405077	405082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134176
9017	NC_017167	GC	3	6	405211	405216	0 %	0 %	50 %	50 %	384134176
9018	NC_017167	GTCTG	2	10	405235	405244	0 %	40 %	40 %	20 %	384134176
9019	NC_017167	CGCGAG	2	12	405272	405283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384134176
9020	NC_017167	GAAG	2	8	405292	405299	50 %	0 %	50 %	0 %	384134176
9021	NC_017167	TAC	2	6	405308	405313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134176
9022	NC_017167	CGT	2	6	405336	405341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134176
9023	NC_017167	GAA	2	6	405427	405432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134176
9024	NC_017167	AAG	2	6	405440	405445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134176
9025	NC_017167	CGCGC	2	10	405545	405554	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9026	NC_017167	GGA	2	6	405571	405576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_017167	CTG	2	6	405596	405601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9028	NC_017167	TGA	2	6	405645	405650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134177
9029	NC_017167	GCA	2	6	405702	405707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134177
9030	NC_017167	TCG	2	6	405744	405749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134177
9031	NC_017167	GGT	2	6	405766	405771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134177
9032	NC_017167	GC	3	6	405786	405791	0 %	0 %	50 %	50 %	384134177
9033	NC_017167	GCG	2	6	405854	405859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134177
9034	NC_017167	TCA	3	9	405885	405893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134177
9035	NC_017167	GAG	3	9	405914	405922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134177
9036	NC_017167	CGT	2	6	405943	405948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134177
9037	NC_017167	GGT	2	6	405949	405954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134177
9038	NC_017167	CCGAGG	2	12	405990	406001	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384134177
9039	NC_017167	GC	3	6	406028	406033	0 %	0 %	50 %	50 %	384134177
9040	NC_017167	CGG	2	6	406092	406097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_017167	CCG	2	6	406127	406132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9042	NC_017167	CTC	2	6	406158	406163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134178
9043	NC_017167	GGC	2	6	406174	406179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134178
9044	NC_017167	GA	3	6	406180	406185	50 %	0 %	50 %	0 %	384134178
9045	NC_017167	GTG	2	6	406226	406231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134178
9046	NC_017167	CGG	2	6	406264	406269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134178
9047	NC_017167	GACG	2	8	406360	406367	25 %	0 %	50 %	25 %	384134178
9048	NC_017167	GAC	2	6	406391	406396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134178
9049	NC_017167	GCG	2	6	406422	406427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134178
9050	NC_017167	GGT	2	6	406444	406449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134178
9051	NC_017167	GTG	2	6	406478	406483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134178
9052	NC_017167	GGC	2	6	406504	406509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134178
9053	NC_017167	ACG	2	6	406779	406784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134178
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9055	NC_017167	CGGC	2	8	406874	406881	0 %	0 %	50 %	50 %	384134178
9056	NC_017167	CGG	2	6	406893	406898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134178
9057	NC_017167	CG	3	6	406965	406970	0 %	0 %	50 %	50 %	384134178
9058	NC_017167	CCGC	2	8	406995	407002	0 %	0 %	25 %	75 %	384134178
9059	NC_017167	GTG	2	6	407018	407023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134178
9060	NC_017167	GTG	2	6	407114	407119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134178
9061	NC_017167	CGGCGC	2	12	407143	407154	0 %	0 %	50 %	50 %	384134178
9062	NC_017167	GGA	2	6	407179	407184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134178
9063	NC_017167	TC	3	6	407284	407289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9064	NC_017167	CAC	2	6	407335	407340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9065	NC_017167	GGC	2	6	407342	407347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_017167	GC	3	6	407367	407372	0 %	0 %	50 %	50 %	384134179
9067	NC_017167	ACG	2	6	407443	407448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134179
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9071	NC_017167	ACGT	2	8	407583	407590	25 %	25 %	25 %	25 %	384134179
9072	NC_017167	CAGC	2	8	407657	407664	25 %	0 %	25 %	50 %	384134179
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9082	NC_017167	TTC	2	6	408348	408353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134179
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9088	NC_017167	AGC	3	9	408592	408600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134180
9089	NC_017167	GATC	2	8	408659	408666	25 %	25 %	25 %	25 %	384134180
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9093	NC_017167	CGG	2	6	408895	408900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134180
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9098	NC_017167	GCAG	2	8	409040	409047	25 %	0 %	50 %	25 %	384134180
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9101	NC_017167	GGGC	2	8	409208	409215	0 %	0 %	75 %	25 %	384134180
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9107	NC_017167	CAGGTC	2	12	409512	409523	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384134180
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9109	NC_017167	GC	3	6	409559	409564	0 %	0 %	50 %	50 %	384134180
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9120	NC_017167	GCG	2	6	410010	410015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134180
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9243	NC_017167	CGT	2	6	417074	417079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9492	NC_017167	CG	3	6	428854	428859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9493	NC_017167	AGC	2	6	428871	428876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9494	NC_017167	GC	3	6	428879	428884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9495	NC_017167	CCG	2	6	428885	428890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9496	NC_017167	GGC	2	6	428930	428935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9497	NC_017167	CG	3	6	428982	428987	0 %	0 %	50 %	50 %	384134199
9498	NC_017167	CGCGC	2	10	429024	429033	0 %	0 %	40 %	60 %	384134199
9499	NC_017167	CGT	2	6	429076	429081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134199
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