MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_017167	GC	3	6	307546	307551	0 %	0 %	50 %	50 %	384134101
7003	NC_017167	GAC	2	6	307556	307561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134101
7004	NC_017167	TCGG	2	8	307572	307579	0 %	25 %	50 %	25 %	384134101
7005	NC_017167	TTG	2	6	307584	307589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134101
7006	NC_017167	GC	3	6	307613	307618	0 %	0 %	50 %	50 %	384134101
7007	NC_017167	CCG	2	6	307696	307701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134101
7008	NC_017167	GC	3	6	307838	307843	0 %	0 %	50 %	50 %	384134101
7009	NC_017167	CTC	2	6	307847	307852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134101
7010	NC_017167	CGC	2	6	307918	307923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134101
7011	NC_017167	CGA	2	6	307954	307959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134101
7012	NC_017167	CGAT	2	8	308082	308089	25 %	25 %	25 %	25 %	384134101
7013	NC_017167	GCC	2	6	308097	308102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134101
7014	NC_017167	TCG	2	6	308103	308108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134101
7015	NC_017167	CGTG	2	8	308161	308168	0 %	25 %	50 %	25 %	384134101
7016	NC_017167	CGC	2	6	308211	308216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134101
7017	NC_017167	GCG	2	6	308226	308231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134101
7018	NC_017167	GC	5	10	308270	308279	0 %	0 %	50 %	50 %	384134101
7019	NC_017167	CCT	2	6	308287	308292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134101
7020	NC_017167	CGC	2	6	308301	308306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134101
7021	NC_017167	ACG	2	6	308340	308345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134101
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7024	NC_017167	CGC	2	6	308444	308449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134101
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7028	NC_017167	CCA	2	6	308651	308656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7029	NC_017167	GC	3	6	308723	308728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7030	NC_017167	GC	3	6	308758	308763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7031	NC_017167	T	6	6	308794	308799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_017167	GAG	2	6	308869	308874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_017167	GGA	2	6	308885	308890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_017167	CGTC	2	8	308896	308903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7035	NC_017167	AGG	2	6	308965	308970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_017167	CGCT	2	8	309065	309072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7037	NC_017167	GGA	2	6	309093	309098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_017167	GTG	2	6	309139	309144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134102
7039	NC_017167	TCG	2	6	309152	309157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134102
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7042	NC_017167	GC	3	6	309306	309311	0 %	0 %	50 %	50 %	384134102
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7058	NC_017167	CATGGG	2	12	309885	309896	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384134102
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7063	NC_017167	ATG	2	6	310213	310218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134102
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7093	NC_017167	GC	3	6	311617	311622	0 %	0 %	50 %	50 %	384134103
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7110	NC_017167	AGGC	2	8	312265	312272	25 %	0 %	50 %	25 %	384134103
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7112	NC_017167	ACGA	2	8	312372	312379	50 %	0 %	25 %	25 %	384134103
7113	NC_017167	CA	3	6	312428	312433	50 %	0 %	0 %	50 %	384134103
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7117	NC_017167	CTC	2	6	312516	312521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134103
7118	NC_017167	CG	3	6	312526	312531	0 %	0 %	50 %	50 %	384134103
7119	NC_017167	ACG	2	6	312540	312545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134103
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7121	NC_017167	CAT	2	6	312581	312586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134103
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7123	NC_017167	CAT	3	9	312689	312697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134103
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7246	NC_017167	CGC	2	6	318331	318336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134108
7247	NC_017167	TCT	2	6	318363	318368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134108
7248	NC_017167	CT	3	6	318416	318421	0 %	50 %	0 %	50 %	384134108
7249	NC_017167	GCC	2	6	318462	318467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134108
7250	NC_017167	CCT	2	6	318489	318494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134108
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7254	NC_017167	TCC	2	6	318647	318652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134108
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7266	NC_017167	CCTTGG	2	12	319158	319169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134108
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7324	NC_017167	GC	3	6	322083	322088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7369	NC_017167	GCG	2	6	323975	323980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134113
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7371	NC_017167	CGA	2	6	324116	324121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134113
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7373	NC_017167	CGT	2	6	324140	324145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134113
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