MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_017167	CAG	2	6	285357	285362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134077
6503	NC_017167	GGA	2	6	285377	285382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134077
6504	NC_017167	GGA	2	6	285446	285451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134077
6505	NC_017167	CGA	2	6	285470	285475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134077
6506	NC_017167	GAGT	2	8	285527	285534	25 %	25 %	50 %	0 %	384134077
6507	NC_017167	CCG	2	6	285580	285585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134077
6508	NC_017167	TGGACC	2	12	285633	285644	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384134077
6509	NC_017167	GAT	2	6	285806	285811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134077
6510	NC_017167	GGC	2	6	286005	286010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134077
6511	NC_017167	CAT	2	6	286022	286027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134077
6512	NC_017167	GAG	2	6	286116	286121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134078
6513	NC_017167	GCA	2	6	286184	286189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134078
6514	NC_017167	GGAG	2	8	286194	286201	25 %	0 %	75 %	0 %	384134078
6515	NC_017167	GC	3	6	286221	286226	0 %	0 %	50 %	50 %	384134078
6516	NC_017167	CCG	2	6	286238	286243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134078
6517	NC_017167	GC	3	6	286415	286420	0 %	0 %	50 %	50 %	384134078
6518	NC_017167	ACG	2	6	286456	286461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134078
6519	NC_017167	CGA	2	6	286478	286483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134078
6520	NC_017167	CGA	2	6	286500	286505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134078
6521	NC_017167	CG	3	6	286510	286515	0 %	0 %	50 %	50 %	384134078
6522	NC_017167	AAG	2	6	286537	286542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134078
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6527	NC_017167	CG	3	6	286704	286709	0 %	0 %	50 %	50 %	384134078
6528	NC_017167	GCG	2	6	286714	286719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
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6531	NC_017167	CAGC	2	8	286806	286813	25 %	0 %	25 %	50 %	384134078
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6535	NC_017167	GCCC	2	8	287036	287043	0 %	0 %	25 %	75 %	384134078
6536	NC_017167	GCCAGC	2	12	287056	287067	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384134078
6537	NC_017167	CGG	2	6	287076	287081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
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6539	NC_017167	GCG	2	6	287132	287137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
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6543	NC_017167	TTG	2	6	287238	287243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134078
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6545	NC_017167	TCG	2	6	287300	287305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134078
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6548	NC_017167	GGCCGA	2	12	287414	287425	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384134078
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6551	NC_017167	CGG	2	6	287513	287518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
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6554	NC_017167	GC	3	6	287588	287593	0 %	0 %	50 %	50 %	384134078
6555	NC_017167	CGCC	2	8	287606	287613	0 %	0 %	25 %	75 %	384134078
6556	NC_017167	GCCA	2	8	287628	287635	25 %	0 %	25 %	50 %	384134078
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6563	NC_017167	TCG	2	6	287888	287893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134079
6564	NC_017167	AAG	2	6	287921	287926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134079
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6574	NC_017167	GCGCG	2	10	288285	288294	0 %	0 %	60 %	40 %	384134079
6575	NC_017167	CG	4	8	288291	288298	0 %	0 %	50 %	50 %	384134079
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6587	NC_017167	GC	3	6	289036	289041	0 %	0 %	50 %	50 %	384134080
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6593	NC_017167	GCGTC	2	10	289280	289289	0 %	20 %	40 %	40 %	384134080
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6604	NC_017167	CGGG	2	8	289628	289635	0 %	0 %	75 %	25 %	384134081
6605	NC_017167	CTC	3	9	289753	289761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134081
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6608	NC_017167	CG	3	6	289999	290004	0 %	0 %	50 %	50 %	384134081
6609	NC_017167	CGA	2	6	290007	290012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134081
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6612	NC_017167	AGCGC	2	10	290051	290060	20 %	0 %	40 %	40 %	384134081
6613	NC_017167	GT	3	6	290208	290213	0 %	50 %	50 %	0 %	384134081
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6620	NC_017167	GCG	2	6	290338	290343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
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