MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017167	CGT	2	6	238830	238835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134033
5502	NC_017167	CGC	2	6	238849	238854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134033
5503	NC_017167	A	6	6	238881	238886	100 %	0 %	0 %	0 %	384134033
5504	NC_017167	GCC	2	6	238890	238895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134033
5505	NC_017167	GC	3	6	238916	238921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_017167	AGTCG	2	10	239030	239039	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5507	NC_017167	CGG	2	6	239185	239190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134034
5508	NC_017167	AGC	2	6	239209	239214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134034
5509	NC_017167	AGC	2	6	239233	239238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134034
5510	NC_017167	CAA	2	6	239259	239264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134034
5511	NC_017167	ACGT	2	8	239378	239385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_017167	GCC	2	6	239432	239437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_017167	GGA	2	6	239499	239504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017167	GAC	2	6	239634	239639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134035
5515	NC_017167	ACG	2	6	239674	239679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134035
5516	NC_017167	CG	3	6	239760	239765	0 %	0 %	50 %	50 %	384134035
5517	NC_017167	GGA	2	6	239772	239777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134035
5518	NC_017167	CGG	2	6	239871	239876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134035
5519	NC_017167	GCG	2	6	239890	239895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134035
5520	NC_017167	CGG	2	6	239900	239905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134035
5521	NC_017167	TCG	2	6	239906	239911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134035
5522	NC_017167	GCG	2	6	239949	239954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_017167	A	6	6	239975	239980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017167	CG	3	6	240050	240055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_017167	GAG	2	6	240068	240073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017167	CTA	2	6	240095	240100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134036
5527	NC_017167	ACG	2	6	240118	240123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134036
5528	NC_017167	CG	3	6	240127	240132	0 %	0 %	50 %	50 %	384134036
5529	NC_017167	AGG	2	6	240220	240225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134036
5530	NC_017167	GCGCC	2	10	240299	240308	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5531	NC_017167	GCG	2	6	240323	240328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_017167	TTCA	2	8	240405	240412	25 %	50 %	0 %	25 %	384134037
5533	NC_017167	CTCG	2	8	240493	240500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_017167	GTT	2	6	240507	240512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017167	CGG	2	6	240524	240529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_017167	GC	3	6	240585	240590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_017167	CGAC	2	8	240596	240603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_017167	CGC	2	6	240608	240613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_017167	AGA	2	6	240634	240639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134038
5540	NC_017167	CGCC	2	8	240671	240678	0 %	0 %	25 %	75 %	384134038
5541	NC_017167	CAG	2	6	240684	240689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134038
5542	NC_017167	CAGG	2	8	240774	240781	25 %	0 %	50 %	25 %	384134038
5543	NC_017167	CCG	2	6	240812	240817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134038
5544	NC_017167	GC	4	8	240828	240835	0 %	0 %	50 %	50 %	384134038
5545	NC_017167	GCA	2	6	240839	240844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134038
5546	NC_017167	CGCA	2	8	240871	240878	25 %	0 %	25 %	50 %	384134038
5547	NC_017167	CCA	2	6	240887	240892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134038
5548	NC_017167	TGC	2	6	240932	240937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134038
5549	NC_017167	GAT	2	6	240954	240959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134038
5550	NC_017167	CGC	2	6	241014	241019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134038
5551	NC_017167	AAG	2	6	241042	241047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134038
5552	NC_017167	GCG	2	6	241278	241283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134039
5553	NC_017167	GCGCC	2	10	241322	241331	0 %	0 %	40 %	60 %	384134039
5554	NC_017167	GC	3	6	241342	241347	0 %	0 %	50 %	50 %	384134039
5555	NC_017167	TCC	2	6	241354	241359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134039
5556	NC_017167	GGCG	2	8	241430	241437	0 %	0 %	75 %	25 %	384134039
5557	NC_017167	CG	3	6	241443	241448	0 %	0 %	50 %	50 %	384134039
5558	NC_017167	CGC	2	6	241511	241516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134039
5559	NC_017167	CCG	2	6	241556	241561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134039
5560	NC_017167	CGG	2	6	241567	241572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134039
5561	NC_017167	CAT	2	6	241574	241579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134039
5562	NC_017167	GCT	2	6	241661	241666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134039
5563	NC_017167	TGA	2	6	241774	241779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134039
5564	NC_017167	CGT	2	6	241781	241786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134039
5565	NC_017167	TCA	2	6	241804	241809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134039
5566	NC_017167	GTGCTC	2	12	241872	241883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134039
5567	NC_017167	CCG	2	6	241903	241908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134039
5568	NC_017167	CCA	2	6	241949	241954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134039
5569	NC_017167	GCC	2	6	242037	242042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134039
5570	NC_017167	CGGCGT	2	12	242054	242065	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384134039
5571	NC_017167	CTC	2	6	242100	242105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134039
5572	NC_017167	CCG	3	9	242116	242124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134039
5573	NC_017167	CCT	2	6	242144	242149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134039
5574	NC_017167	CCG	2	6	242209	242214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134039
5575	NC_017167	CG	3	6	242224	242229	0 %	0 %	50 %	50 %	384134039
5576	NC_017167	GAG	2	6	242286	242291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134039
5577	NC_017167	AGA	2	6	242365	242370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134039
5578	NC_017167	GCTC	2	8	242386	242393	0 %	25 %	25 %	50 %	384134039
5579	NC_017167	CTG	2	6	242411	242416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134039
5580	NC_017167	GAT	2	6	242426	242431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134039
5581	NC_017167	GCC	2	6	242485	242490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134039
5582	NC_017167	GCGCC	2	10	242491	242500	0 %	0 %	40 %	60 %	384134039
5583	NC_017167	ATG	2	6	242541	242546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134039
5584	NC_017167	GAT	2	6	242603	242608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134039
5585	NC_017167	GTC	2	6	242655	242660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134039
5586	NC_017167	AGA	2	6	242692	242697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134039
5587	NC_017167	AGA	2	6	242716	242721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134039
5588	NC_017167	GC	3	6	242728	242733	0 %	0 %	50 %	50 %	384134039
5589	NC_017167	GGT	2	6	242804	242809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134039
5590	NC_017167	GC	3	6	242824	242829	0 %	0 %	50 %	50 %	384134039
5591	NC_017167	CG	3	6	242840	242845	0 %	0 %	50 %	50 %	384134039
5592	NC_017167	GCC	2	6	242909	242914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134039
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5594	NC_017167	GC	3	6	242949	242954	0 %	0 %	50 %	50 %	384134039
5595	NC_017167	GGCCAT	2	12	242975	242986	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384134039
5596	NC_017167	GCC	2	6	242998	243003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134039
5597	NC_017167	GC	3	6	243089	243094	0 %	0 %	50 %	50 %	384134039
5598	NC_017167	CCT	2	6	243122	243127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134039
5599	NC_017167	CGA	2	6	243152	243157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134039
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5601	NC_017167	CAC	2	6	243218	243223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134039
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5603	NC_017167	TCA	2	6	243316	243321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134039
5604	NC_017167	GAG	2	6	243357	243362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134039
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5607	NC_017167	GGC	2	6	243476	243481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134039
5608	NC_017167	CGA	2	6	243569	243574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134039
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5612	NC_017167	TCA	2	6	243817	243822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134040
5613	NC_017167	CG	3	6	243863	243868	0 %	0 %	50 %	50 %	384134040
5614	NC_017167	CGGCA	2	10	243879	243888	20 %	0 %	40 %	40 %	384134040
5615	NC_017167	TCG	2	6	243889	243894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134040
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5618	NC_017167	GAT	2	6	244025	244030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134040
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5623	NC_017167	GGT	2	6	244145	244150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134040
5624	NC_017167	TCG	2	6	244183	244188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134040
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5632	NC_017167	CGA	2	6	244469	244474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134040
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5684	NC_017167	CGTC	2	8	246131	246138	0 %	25 %	25 %	50 %	384134042
5685	NC_017167	GGT	2	6	246140	246145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134042
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5687	NC_017167	CG	4	8	246172	246179	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5688	NC_017167	GGA	2	6	246218	246223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134042
5689	NC_017167	GC	3	6	246243	246248	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5690	NC_017167	GCG	2	6	246267	246272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
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5694	NC_017167	CGC	2	6	246411	246416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134042
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5700	NC_017167	TGCC	2	8	246667	246674	0 %	25 %	25 %	50 %	384134042
5701	NC_017167	CGA	2	6	246709	246714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134042
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5704	NC_017167	GC	3	6	246865	246870	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5705	NC_017167	GCG	2	6	246880	246885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
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5708	NC_017167	GCG	2	6	247123	247128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134043
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5710	NC_017167	TCA	2	6	247274	247279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134043
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5712	NC_017167	GAT	2	6	247332	247337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134043
5713	NC_017167	GGC	2	6	247347	247352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134043
5714	NC_017167	ACT	2	6	247415	247420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134043
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5717	NC_017167	GGCG	2	8	247550	247557	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5718	NC_017167	TCTT	2	8	247558	247565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5719	NC_017167	GAG	2	6	247614	247619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5720	NC_017167	TTCA	2	8	247744	247751	25 %	50 %	0 %	25 %	384134044
5721	NC_017167	ACA	2	6	247868	247873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134044
5722	NC_017167	CTT	2	6	247884	247889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134044
5723	NC_017167	CTC	2	6	247951	247956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134044
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5726	NC_017167	GAG	2	6	248119	248124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134044
5727	NC_017167	GAG	2	6	248137	248142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134044
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5732	NC_017167	GGCG	2	8	248259	248266	0 %	0 %	75 %	25 %	384134044
5733	NC_017167	TTC	2	6	248281	248286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134044
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5735	NC_017167	TCG	2	6	248318	248323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
5736	NC_017167	CG	3	6	248336	248341	0 %	0 %	50 %	50 %	384134044
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5740	NC_017167	CGCGG	2	10	248422	248431	0 %	0 %	60 %	40 %	384134044
5741	NC_017167	CGG	3	9	248436	248444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134044
5742	NC_017167	ACG	2	6	248447	248452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134044
5743	NC_017167	GCT	2	6	248475	248480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
5744	NC_017167	TCA	2	6	248519	248524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134044
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5999	NC_017167	AGC	2	6	260546	260551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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