MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-012

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017134	GCTGG	2	10	272	281	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017134	GGAAA	2	10	1869	1878	60 %	0 %	40 %	0 %	384061579
3	NC_017134	GGCTC	2	10	2132	2141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017134	TGCCA	2	10	3100	3109	20 %	20 %	20 %	40 %	384061580
5	NC_017134	CGATC	2	10	3215	3224	20 %	20 %	20 %	40 %	384061580
6	NC_017134	GAGCT	2	10	3806	3815	20 %	20 %	40 %	20 %	384061581
7	NC_017134	CTGTG	2	10	5534	5543	0 %	40 %	40 %	20 %	384061583
8	NC_017134	ATGTG	2	10	7497	7506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017134	ATCCG	2	10	8722	8731	20 %	20 %	20 %	40 %	384061586
10	NC_017134	AAGCC	2	10	9063	9072	40 %	0 %	20 %	40 %	384061587
11	NC_017134	TACGC	2	10	11257	11266	20 %	20 %	20 %	40 %	384061587
12	NC_017134	GGACA	2	10	18664	18673	40 %	0 %	40 %	20 %	384061592
13	NC_017134	TTTCT	2	10	19997	20006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017134	ACCAC	2	10	20504	20513	40 %	0 %	0 %	60 %	384061593
15	NC_017134	CCAGC	2	10	20973	20982	20 %	0 %	20 %	60 %	384061595
16	NC_017134	CTGGC	2	10	22804	22813	0 %	20 %	40 %	40 %	384061597
17	NC_017134	TGCAA	2	10	23370	23379	40 %	20 %	20 %	20 %	384061597
18	NC_017134	CTGGT	2	10	23661	23670	0 %	40 %	40 %	20 %	384061597
19	NC_017134	AGAAA	2	10	28206	28215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017134	TGTCC	2	10	29539	29548	0 %	40 %	20 %	40 %	384061602
21	NC_017134	CACCT	2	10	32507	32516	20 %	20 %	0 %	60 %	384061605
22	NC_017134	GCTCC	2	10	34106	34115	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017134	GCAGG	2	10	36240	36249	20 %	0 %	60 %	20 %	384061608
24	NC_017134	GCTGT	2	10	37289	37298	0 %	40 %	40 %	20 %	384061609
25	NC_017134	CATGC	2	10	39474	39483	20 %	20 %	20 %	40 %	384061612
26	NC_017134	AGAAA	2	10	40204	40213	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017134	TGTCC	2	10	41537	41546	0 %	40 %	20 %	40 %	384061614
28	NC_017134	AGAAA	2	10	41873	41882	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017134	TGTCC	2	10	43206	43215	0 %	40 %	20 %	40 %	384061615
30	NC_017134	ATGGC	2	10	45908	45917	20 %	20 %	40 %	20 %	384061618
31	NC_017134	CCTGA	2	10	46442	46451	20 %	20 %	20 %	40 %	384061618
32	NC_017134	TTATT	2	10	50894	50903	20 %	80 %	0 %	0 %	384061623
33	NC_017134	CGTTC	2	10	51441	51450	0 %	40 %	20 %	40 %	384061624
34	NC_017134	CGGTC	2	10	53187	53196	0 %	20 %	40 %	40 %	384061625
35	NC_017134	GAAGC	2	10	56331	56340	40 %	0 %	40 %	20 %	384061626
36	NC_017134	TCAAG	2	10	57369	57378	40 %	20 %	20 %	20 %	384061627
37	NC_017134	CAGGA	2	10	58489	58498	40 %	0 %	40 %	20 %	384061628
38	NC_017134	CGGAC	2	10	59343	59352	20 %	0 %	40 %	40 %	384061628
39	NC_017134	CACAT	2	10	62778	62787	40 %	20 %	0 %	40 %	384061631
40	NC_017134	ACACA	2	10	65542	65551	60 %	0 %	0 %	40 %	384061633
41	NC_017134	TTACA	2	10	68940	68949	40 %	40 %	0 %	20 %	384061635
42	NC_017134	ACTGT	2	10	69045	69054	20 %	40 %	20 %	20 %	384061635
43	NC_017134	CAACG	2	10	70457	70466	40 %	0 %	20 %	40 %	384061636
44	NC_017134	CCGTC	2	10	71442	71451	0 %	20 %	20 %	60 %	384061637
45	NC_017134	AGCAG	2	10	73855	73864	40 %	0 %	40 %	20 %	384061639
46	NC_017134	GGACA	2	10	75257	75266	40 %	0 %	40 %	20 %	384061641
47	NC_017134	CACAC	2	10	77071	77080	40 %	0 %	0 %	60 %	384061642
48	NC_017134	ACGCC	2	10	81222	81231	20 %	0 %	20 %	60 %	384061644
49	NC_017134	CTTGC	2	10	81769	81778	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017134	CCGCG	2	10	82137	82146	0 %	0 %	40 %	60 %	384061645
51	NC_017134	GCACA	2	10	83032	83041	40 %	0 %	20 %	40 %	384061646
52	NC_017134	TTTCT	2	10	83719	83728	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017134	GCTGT	2	10	84558	84567	0 %	40 %	40 %	20 %	384061648
54	NC_017134	CCAGA	2	10	86660	86669	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017134	CCGAG	2	10	86973	86982	20 %	0 %	40 %	40 %	384061650
56	NC_017134	GGACA	2	10	88647	88656	40 %	0 %	40 %	20 %	384061651
57	NC_017134	TTTCT	2	10	89980	89989	0 %	80 %	0 %	20 %	384061652
58	NC_017134	TCACT	2	10	91102	91111	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017134	AATCA	2	10	91133	91142	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017134	CTGAG	2	10	91150	91159	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017134	TCCTC	2	10	92034	92043	0 %	40 %	0 %	60 %	384061654
62	NC_017134	TTTAC	2	10	92344	92353	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017134	TGTCC	2	10	94433	94442	0 %	40 %	20 %	40 %	384061656
64	NC_017134	ATGCA	2	10	98001	98010	40 %	20 %	20 %	20 %	384061660
65	NC_017134	TTATG	2	10	99900	99909	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017134	CCTGA	2	10	100428	100437	20 %	20 %	20 %	40 %	384061662
67	NC_017134	CATTG	2	10	100468	100477	20 %	40 %	20 %	20 %	384061662
68	NC_017134	CAAGG	2	10	101526	101535	40 %	0 %	40 %	20 %	384061662
69	NC_017134	CTGGG	2	10	101772	101781	0 %	20 %	60 %	20 %	384061662
70	NC_017134	AGGGG	2	10	102016	102025	20 %	0 %	80 %	0 %	384061662
71	NC_017134	GACAT	2	10	103766	103775	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017134	CTATT	2	10	105180	105189	20 %	60 %	0 %	20 %	384061666
73	NC_017134	GTATT	2	10	111064	111073	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017134	GTCAC	2	10	114548	114557	20 %	20 %	20 %	40 %	384061678
75	NC_017134	TTGGA	2	10	117900	117909	20 %	40 %	40 %	0 %	384061679
76	NC_017134	CGGTT	2	10	119008	119017	0 %	40 %	40 %	20 %	384061680
77	NC_017134	CGTCC	2	10	125755	125764	0 %	20 %	20 %	60 %	384061688
78	NC_017134	TTTCA	2	10	125996	126005	20 %	60 %	0 %	20 %	384061688
79	NC_017134	TTATT	2	10	128728	128737	20 %	80 %	0 %	0 %	384061692
80	NC_017134	GGACA	2	10	129757	129766	40 %	0 %	40 %	20 %	384061694
81	NC_017134	TTTCT	2	10	131090	131099	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017134	GCCCT	2	10	131748	131757	0 %	20 %	20 %	60 %	384061696
83	NC_017134	GCCAC	2	10	133350	133359	20 %	0 %	20 %	60 %	384061698
84	NC_017134	GCTGG	2	10	133859	133868	0 %	20 %	60 %	20 %	384061698
85	NC_017134	AGCGA	2	10	134294	134303	40 %	0 %	40 %	20 %	384061700
86	NC_017134	ATAGT	2	10	135499	135508	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017134	TCCGT	2	10	136947	136956	0 %	40 %	20 %	40 %	384061704
88	NC_017134	CTGCG	2	10	137675	137684	0 %	20 %	40 %	40 %	384061704
89	NC_017134	TCGCG	2	10	138210	138219	0 %	20 %	40 %	40 %	384061704
90	NC_017134	CGTCC	2	10	140357	140366	0 %	20 %	20 %	60 %	384061706
91	NC_017134	GGACA	2	10	140859	140868	40 %	0 %	40 %	20 %	384061707
92	NC_017134	TTTCT	2	10	142192	142201	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017134	CATGG	2	10	142976	142985	20 %	20 %	40 %	20 %	384061709
94	NC_017134	AATTA	2	10	143141	143150	60 %	40 %	0 %	0 %	384061709
95	NC_017134	CTTTT	2	10	144104	144113	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017134	ATGAC	2	10	144244	144253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017134	AGAAA	2	10	144555	144564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017134	TGTCC	2	10	145888	145897	0 %	40 %	20 %	40 %	384061710
99	NC_017134	TGATC	2	10	146237	146246	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017134	CAGAT	2	10	146441	146450	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017134	ACCGT	2	10	146990	146999	20 %	20 %	20 %	40 %	384061711
102	NC_017134	GATCA	2	10	147622	147631	40 %	20 %	20 %	20 %	384061711
103	NC_017134	TGGGG	2	10	149568	149577	0 %	20 %	80 %	0 %	384061713
104	NC_017134	GGCAC	2	10	151690	151699	20 %	0 %	40 %	40 %	384061715
105	NC_017134	AAACA	2	10	153844	153853	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017134	CTTCC	2	10	154447	154456	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017134	CTGCC	2	10	156019	156028	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017134	CCAAC	2	10	157588	157597	40 %	0 %	0 %	60 %	384061722
109	NC_017134	CTGCC	2	10	158705	158714	0 %	20 %	20 %	60 %	384061726
110	NC_017134	GCCAT	2	10	159057	159066	20 %	20 %	20 %	40 %	384061727
111	NC_017134	GCCAC	2	10	159879	159888	20 %	0 %	20 %	60 %	384061728
112	NC_017134	AGAAA	2	10	160009	160018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017134	TGTCC	2	10	161342	161351	0 %	40 %	20 %	40 %	384061729
114	NC_017134	TCTAT	2	10	162206	162215	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017134	TGCCC	2	10	162891	162900	0 %	20 %	20 %	60 %	384061731
116	NC_017134	GGACA	2	10	164128	164137	40 %	0 %	40 %	20 %	384061733
117	NC_017134	TTTCT	2	10	165461	165470	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017134	CATCT	2	10	165621	165630	20 %	40 %	0 %	40 %	384061734
119	NC_017134	ATCGC	2	10	165880	165889	20 %	20 %	20 %	40 %	384061734
120	NC_017134	CCAAC	2	10	166080	166089	40 %	0 %	0 %	60 %	384061735
121	NC_017134	TCCGG	2	10	167319	167328	0 %	20 %	40 %	40 %	384061735
122	NC_017134	CTGCT	2	10	169107	169116	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017134	CCGGA	2	10	169223	169232	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017134	TCCGG	2	10	171808	171817	0 %	20 %	40 %	40 %	384061739
125	NC_017134	TCGCG	2	10	171868	171877	0 %	20 %	40 %	40 %	384061739
126	NC_017134	CCCGG	2	10	172075	172084	0 %	0 %	40 %	60 %	384061740
127	NC_017134	GTCCG	2	10	172679	172688	0 %	20 %	40 %	40 %	384061740
128	NC_017134	TGATC	2	10	173429	173438	20 %	40 %	20 %	20 %	384061741
129	NC_017134	ACACC	2	10	175002	175011	40 %	0 %	0 %	60 %	384061743
130	NC_017134	AGTAG	2	10	175635	175644	40 %	20 %	40 %	0 %	384061743
131	NC_017134	ATGCA	2	10	176416	176425	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017134	CGATG	2	10	177213	177222	20 %	20 %	40 %	20 %	384061744
133	NC_017134	GGAAA	2	10	178101	178110	60 %	0 %	40 %	0 %	384061745
134	NC_017134	AGAAA	2	10	180617	180626	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017134	TGTCC	2	10	181950	181959	0 %	40 %	20 %	40 %	384061748
136	NC_017134	AGAAA	2	10	182298	182307	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017134	TGTCC	2	10	183631	183640	0 %	40 %	20 %	40 %	384061749
138	NC_017134	GCCCA	2	10	184934	184943	20 %	0 %	20 %	60 %	384061751
139	NC_017134	TGCTC	2	10	185743	185752	0 %	40 %	20 %	40 %	384061751
140	NC_017134	CCGAG	2	10	186340	186349	20 %	0 %	40 %	40 %	384061751
141	NC_017134	CATGC	2	10	186887	186896	20 %	20 %	20 %	40 %	384061752
142	NC_017134	CCTGC	2	10	187467	187476	0 %	20 %	20 %	60 %	384061752
143	NC_017134	ACGAC	2	10	190027	190036	40 %	0 %	20 %	40 %	384061753
144	NC_017134	CCAGC	2	10	190377	190386	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_017134	GCCAC	2	10	191206	191215	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.