MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26 plasmid pAPA26-013

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017130	CG	3	6	422	427	0 %	0 %	50 %	50 %	384061217
2	NC_017130	GC	3	6	1270	1275	0 %	0 %	50 %	50 %	384061219
3	NC_017130	CG	3	6	3182	3187	0 %	0 %	50 %	50 %	384061220
4	NC_017130	TG	3	6	3307	3312	0 %	50 %	50 %	0 %	384061220
5	NC_017130	TG	3	6	3498	3503	0 %	50 %	50 %	0 %	384061220
6	NC_017130	GC	3	6	3892	3897	0 %	0 %	50 %	50 %	384061221
7	NC_017130	TA	3	6	5229	5234	50 %	50 %	0 %	0 %	384061223
8	NC_017130	CG	3	6	5244	5249	0 %	0 %	50 %	50 %	384061223
9	NC_017130	TG	3	6	6288	6293	0 %	50 %	50 %	0 %	384061223
10	NC_017130	AG	3	6	6424	6429	50 %	0 %	50 %	0 %	384061223
11	NC_017130	TG	3	6	7349	7354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017130	GT	3	6	7560	7565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017130	GA	3	6	8415	8420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017130	GA	3	6	10120	10125	50 %	0 %	50 %	0 %	384061227
15	NC_017130	CG	3	6	10597	10602	0 %	0 %	50 %	50 %	384061227
16	NC_017130	CG	3	6	12032	12037	0 %	0 %	50 %	50 %	384061227
17	NC_017130	AG	3	6	12127	12132	50 %	0 %	50 %	0 %	384061227
18	NC_017130	TC	3	6	12471	12476	0 %	50 %	0 %	50 %	384061227
19	NC_017130	CG	3	6	12670	12675	0 %	0 %	50 %	50 %	384061227
20	NC_017130	AG	3	6	12944	12949	50 %	0 %	50 %	0 %	384061227
21	NC_017130	GC	3	6	14882	14887	0 %	0 %	50 %	50 %	384061228
22	NC_017130	GC	3	6	15586	15591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017130	CG	3	6	15707	15712	0 %	0 %	50 %	50 %	384061229
24	NC_017130	AC	3	6	16953	16958	50 %	0 %	0 %	50 %	384061230
25	NC_017130	CA	3	6	17936	17941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017130	CG	3	6	19083	19088	0 %	0 %	50 %	50 %	384061232
27	NC_017130	GC	3	6	19496	19501	0 %	0 %	50 %	50 %	384061232
28	NC_017130	AG	4	8	20185	20192	50 %	0 %	50 %	0 %	384061233
29	NC_017130	TC	3	6	20250	20255	0 %	50 %	0 %	50 %	384061233
30	NC_017130	AC	3	6	20415	20420	50 %	0 %	0 %	50 %	384061233
31	NC_017130	GC	3	6	20826	20831	0 %	0 %	50 %	50 %	384061234
32	NC_017130	TC	3	6	21883	21888	0 %	50 %	0 %	50 %	384061236
33	NC_017130	GA	4	8	21962	21969	50 %	0 %	50 %	0 %	384061236
34	NC_017130	CT	4	8	23716	23723	0 %	50 %	0 %	50 %	384061237
35	NC_017130	GC	3	6	23867	23872	0 %	0 %	50 %	50 %	384061237
36	NC_017130	GT	3	6	26513	26518	0 %	50 %	50 %	0 %	384061240
37	NC_017130	AG	3	6	26755	26760	50 %	0 %	50 %	0 %	384061240
38	NC_017130	CT	3	6	27592	27597	0 %	50 %	0 %	50 %	384061241
39	NC_017130	GA	3	6	27619	27624	50 %	0 %	50 %	0 %	384061241
40	NC_017130	GC	3	6	29123	29128	0 %	0 %	50 %	50 %	384061242
41	NC_017130	CA	3	6	30610	30615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017130	GA	3	6	30655	30660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017130	CA	3	6	30932	30937	50 %	0 %	0 %	50 %	384061244
44	NC_017130	AG	3	6	31183	31188	50 %	0 %	50 %	0 %	384061244
45	NC_017130	TC	3	6	31708	31713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017130	GT	3	6	31796	31801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017130	CT	3	6	31819	31824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017130	AC	3	6	32010	32015	50 %	0 %	0 %	50 %	384061245
49	NC_017130	GA	3	6	34165	34170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017130	AG	3	6	34624	34629	50 %	0 %	50 %	0 %	384061248
51	NC_017130	GC	3	6	34704	34709	0 %	0 %	50 %	50 %	384061248
52	NC_017130	AC	3	6	34727	34732	50 %	0 %	0 %	50 %	384061248
53	NC_017130	CG	3	6	34905	34910	0 %	0 %	50 %	50 %	384061248
54	NC_017130	CG	3	6	35757	35762	0 %	0 %	50 %	50 %	384061248
55	NC_017130	GT	3	6	35765	35770	0 %	50 %	50 %	0 %	384061248
56	NC_017130	CA	3	6	36297	36302	50 %	0 %	0 %	50 %	384061248
57	NC_017130	CT	3	6	37088	37093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017130	CA	3	6	37930	37935	50 %	0 %	0 %	50 %	384061249
59	NC_017130	CA	3	6	38251	38256	50 %	0 %	0 %	50 %	384061250
60	NC_017130	GC	3	6	41097	41102	0 %	0 %	50 %	50 %	384061254
61	NC_017130	GC	3	6	42766	42771	0 %	0 %	50 %	50 %	384061255
62	NC_017130	CA	3	6	44271	44276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017130	TA	3	6	44456	44461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017130	AT	3	6	44570	44575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017130	AC	3	6	45115	45120	50 %	0 %	0 %	50 %	384061257
66	NC_017130	GC	3	6	46158	46163	0 %	0 %	50 %	50 %	384061258
67	NC_017130	CA	3	6	47080	47085	50 %	0 %	0 %	50 %	384061259
68	NC_017130	CG	3	6	47620	47625	0 %	0 %	50 %	50 %	384061259
69	NC_017130	GT	3	6	48298	48303	0 %	50 %	50 %	0 %	384061260
70	NC_017130	TG	3	6	48611	48616	0 %	50 %	50 %	0 %	384061261
71	NC_017130	CT	3	6	48749	48754	0 %	50 %	0 %	50 %	384061261
72	NC_017130	GA	3	6	49268	49273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017130	AG	3	6	49431	49436	50 %	0 %	50 %	0 %	384061262
74	NC_017130	AC	3	6	50122	50127	50 %	0 %	0 %	50 %	384061262
75	NC_017130	GT	3	6	51047	51052	0 %	50 %	50 %	0 %	384061263
76	NC_017130	CA	3	6	52840	52845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017130	AG	3	6	53875	53880	50 %	0 %	50 %	0 %	384061265
78	NC_017130	CG	3	6	55360	55365	0 %	0 %	50 %	50 %	384061266
79	NC_017130	CG	3	6	55698	55703	0 %	0 %	50 %	50 %	384061266
80	NC_017130	CG	3	6	56441	56446	0 %	0 %	50 %	50 %	384061266
81	NC_017130	CA	3	6	59039	59044	50 %	0 %	0 %	50 %	384061268
82	NC_017130	GC	3	6	59610	59615	0 %	0 %	50 %	50 %	384061268
83	NC_017130	CT	3	6	59781	59786	0 %	50 %	0 %	50 %	384061268
84	NC_017130	TC	3	6	60073	60078	0 %	50 %	0 %	50 %	384061268
85	NC_017130	CG	3	6	60520	60525	0 %	0 %	50 %	50 %	384061269
86	NC_017130	CA	3	6	60889	60894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017130	CA	3	6	61068	61073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017130	GC	3	6	61352	61357	0 %	0 %	50 %	50 %	384061270
89	NC_017130	CA	3	6	61383	61388	50 %	0 %	0 %	50 %	384061270
90	NC_017130	GC	3	6	61407	61412	0 %	0 %	50 %	50 %	384061270
91	NC_017130	CT	4	8	61433	61440	0 %	50 %	0 %	50 %	384061270
92	NC_017130	AC	3	6	62695	62700	50 %	0 %	0 %	50 %	384061271
93	NC_017130	AC	3	6	63390	63395	50 %	0 %	0 %	50 %	384061271
94	NC_017130	CG	3	6	64084	64089	0 %	0 %	50 %	50 %	384061272
95	NC_017130	AT	3	6	65243	65248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017130	TC	3	6	65936	65941	0 %	50 %	0 %	50 %	384061273
97	NC_017130	CA	3	6	66898	66903	50 %	0 %	0 %	50 %	384061274
98	NC_017130	AG	3	6	67176	67181	50 %	0 %	50 %	0 %	384061274
99	NC_017130	AT	3	6	67423	67428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017130	TA	4	8	67630	67637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017130	TA	3	6	67684	67689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017130	GA	3	6	67702	67707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017130	AC	3	6	67723	67728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017130	AT	3	6	67932	67937	50 %	50 %	0 %	0 %	384061275
105	NC_017130	CT	3	6	68005	68010	0 %	50 %	0 %	50 %	384061275
106	NC_017130	TC	3	6	68722	68727	0 %	50 %	0 %	50 %	384061275
107	NC_017130	TA	3	6	69465	69470	50 %	50 %	0 %	0 %	384061275
108	NC_017130	AG	3	6	70447	70452	50 %	0 %	50 %	0 %	384061276
109	NC_017130	GC	3	6	70558	70563	0 %	0 %	50 %	50 %	384061276
110	NC_017130	GC	3	6	71143	71148	0 %	0 %	50 %	50 %	384061276
111	NC_017130	TG	3	6	71499	71504	0 %	50 %	50 %	0 %	384061277
112	NC_017130	GA	3	6	71643	71648	50 %	0 %	50 %	0 %	384061277
113	NC_017130	GC	3	6	72795	72800	0 %	0 %	50 %	50 %	384061279
114	NC_017130	CT	4	8	74241	74248	0 %	50 %	0 %	50 %	384061280
115	NC_017130	TC	3	6	74311	74316	0 %	50 %	0 %	50 %	384061280
116	NC_017130	CG	3	6	75652	75657	0 %	0 %	50 %	50 %	384061281
117	NC_017130	TG	3	6	76779	76784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017130	CG	4	8	79810	79817	0 %	0 %	50 %	50 %	384061283
119	NC_017130	GA	3	6	80183	80188	50 %	0 %	50 %	0 %	384061283
120	NC_017130	GC	3	6	80425	80430	0 %	0 %	50 %	50 %	384061283
121	NC_017130	CT	3	6	80621	80626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017130	AG	3	6	80642	80647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017130	CA	3	6	82586	82591	50 %	0 %	0 %	50 %	384061285
124	NC_017130	CT	3	6	82736	82741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017130	CT	3	6	82781	82786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017130	TG	3	6	82954	82959	0 %	50 %	50 %	0 %	384061286
127	NC_017130	CT	3	6	84357	84362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017130	CA	3	6	85199	85204	50 %	0 %	0 %	50 %	384061288
129	NC_017130	CT	3	6	86520	86525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017130	CA	3	6	86792	86797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017130	GT	3	6	87539	87544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017130	AG	3	6	87552	87557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017130	CG	3	6	89042	89047	0 %	0 %	50 %	50 %	384061291
134	NC_017130	GC	3	6	89455	89460	0 %	0 %	50 %	50 %	384061291
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136	NC_017130	AG	4	8	90394	90401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017130	TC	3	6	90440	90445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017130	AT	3	6	90457	90462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017130	AT	3	6	90511	90516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017130	AC	3	6	90868	90873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017130	AC	3	6	92158	92163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017130	GC	3	6	93993	93998	0 %	0 %	50 %	50 %	384061296
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145	NC_017130	GA	3	6	96472	96477	50 %	0 %	50 %	0 %	384061299
146	NC_017130	TG	3	6	96641	96646	0 %	50 %	50 %	0 %	384061299
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305	NC_017130	AG	3	6	189137	189142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
306	NC_017130	GC	3	6	190206	190211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.