MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26 plasmid pAPA26-013

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017130	GGCGCG	2	12	1810	1821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061219
2	NC_017130	GGCTGG	2	12	1834	1845	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384061219
3	NC_017130	GATAAT	2	12	7675	7686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017130	ATTGTC	2	12	12564	12575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384061227
5	NC_017130	CCTGTC	2	12	12584	12595	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384061227
6	NC_017130	TGGATG	2	12	14493	14504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061228
7	NC_017130	CATCCA	2	12	19467	19478	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061232
8	NC_017130	GGAACT	2	12	21233	21244	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384061235
9	NC_017130	CATGCT	2	12	24243	24254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384061237
10	NC_017130	TAAGGG	2	12	27320	27331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384061240
11	NC_017130	TGGATG	2	12	28734	28745	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061242
12	NC_017130	AACAAG	2	12	29979	29990	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384061243
13	NC_017130	GTCAGG	2	12	30748	30759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017130	TCCTGA	2	12	39113	39124	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384061252
15	NC_017130	TGGATG	2	12	40708	40719	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061254
16	NC_017130	TGGATG	2	12	42377	42388	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061255
17	NC_017130	GTGCTT	2	12	45358	45369	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384061258
18	NC_017130	GGCATC	2	12	50288	50299	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061262
19	NC_017130	CGTCAG	2	12	52341	52352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061264
20	NC_017130	TTCGGC	2	12	52893	52904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017130	GGCGTG	2	12	61654	61665	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384061270
22	NC_017130	CATCCA	2	12	64468	64479	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061272
23	NC_017130	ATTTTA	2	12	67759	67770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017130	CATTAT	2	12	69421	69432	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384061275
25	NC_017130	GAGGAC	2	12	73101	73112	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384061279
26	NC_017130	CATCCA	2	12	76036	76047	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061281
27	NC_017130	AACCAG	2	12	77371	77382	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384061282
28	NC_017130	CATCCA	2	12	89426	89437	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061291
29	NC_017130	TGGATG	2	12	93604	93615	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061296
30	NC_017130	GAATAA	2	12	96094	96105	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384061299
31	NC_017130	TCTTAA	2	12	96347	96358	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384061299
32	NC_017130	TTTGCC	2	12	102630	102641	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384061304
33	NC_017130	GGCATC	2	12	108410	108421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061310
34	NC_017130	CAGCCG	2	12	109460	109471	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384061311
35	NC_017130	CTTCCT	2	12	113554	113565	0 %	50 %	0 %	50 %	384061316
36	NC_017130	AGCGGA	2	12	114290	114301	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384061318
37	NC_017130	GGGCCA	2	12	117310	117321	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384061319
38	NC_017130	TGCAGG	2	12	119863	119874	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384061321
39	NC_017130	CCAAAA	2	12	124532	124543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017130	CATCCA	2	12	130536	130547	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061334
41	NC_017130	CCCCCT	2	12	131976	131987	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384061336
42	NC_017130	CCAGAA	2	12	138838	138849	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384061345
43	NC_017130	GAGGAA	2	12	139883	139894	50 %	0 %	50 %	0 %	384061346
44	NC_017130	CATCCA	2	12	141638	141649	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061347
45	NC_017130	TGGATG	2	12	145059	145070	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061350
46	NC_017130	CCCACG	2	12	148839	148850	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384061351
47	NC_017130	GATGCC	2	12	151107	151118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061355
48	NC_017130	CTTCCT	2	12	153514	153525	0 %	50 %	0 %	50 %	384061356
49	NC_017130	TGGATG	2	12	160513	160524	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061369
50	NC_017130	GATGCC	2	12	163516	163527	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061372
51	NC_017130	CATCCA	2	12	164907	164918	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061373
52	NC_017130	GCCATC	2	12	171288	171299	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384061378
53	NC_017130	CCCAAA	2	12	174913	174924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017130	TGGATG	2	12	181121	181132	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061388
55	NC_017130	TGGATG	2	12	182802	182813	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061389
56	NC_017130	TCCAGC	2	12	185799	185810	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384061391
57	NC_017130	ATTCTG	2	12	186609	186620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384061391
58	NC_017130	ATACCG	2	12	187923	187934	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384061392
59	NC_017130	TCAGTT	2	12	188090	188101	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384061392
60	NC_017130	TATCGC	2	12	189537	189548	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.