MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26 plasmid pAPA26-013

Total Repeats: 2322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017130	GAC	2	6	165099	165104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061373
2002	NC_017130	GCA	2	6	165254	165259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061373
2003	NC_017130	GCG	2	6	165262	165267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061373
2004	NC_017130	TCA	2	6	165284	165289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061373
2005	NC_017130	AGG	2	6	165366	165371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384061373
2006	NC_017130	TGA	2	6	165422	165427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_017130	TGC	2	6	165510	165515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_017130	GCT	2	6	165646	165651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061374
2009	NC_017130	CGC	2	6	165706	165711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061374
2010	NC_017130	AGG	2	6	165759	165764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384061374
2011	NC_017130	CAC	2	6	165793	165798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061374
2012	NC_017130	GGT	2	6	165916	165921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384061374
2013	NC_017130	GGT	2	6	166016	166021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384061375
2014	NC_017130	CGA	2	6	166033	166038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061375
2015	NC_017130	CTT	2	6	166045	166050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384061375
2016	NC_017130	GAA	2	6	166104	166109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384061375
2017	NC_017130	GAT	2	6	166220	166225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384061375
2018	NC_017130	TGA	2	6	166267	166272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384061375
2019	NC_017130	CAT	2	6	166273	166278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061375
2020	NC_017130	TCA	2	6	166356	166361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061375
2021	NC_017130	TTC	2	6	166392	166397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384061375
2022	NC_017130	GCC	2	6	166504	166509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061375
2023	NC_017130	GAA	2	6	166553	166558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384061375
2024	NC_017130	CCA	2	6	166592	166597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061375
2025	NC_017130	CGA	2	6	166822	166827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061375
2026	NC_017130	GCG	2	6	166852	166857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061375
2027	NC_017130	CAA	2	6	166879	166884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384061375
2028	NC_017130	GTA	2	6	166902	166907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384061375
2029	NC_017130	AAG	2	6	166908	166913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384061375
2030	NC_017130	GCC	2	6	166973	166978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061375
2031	NC_017130	CGT	2	6	167009	167014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061375
2032	NC_017130	ACG	2	6	167058	167063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061375
2033	NC_017130	ATG	2	6	167122	167127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384061375
2034	NC_017130	TGC	2	6	167135	167140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061375
2035	NC_017130	CAT	2	6	167191	167196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061375
2036	NC_017130	CAT	2	6	167272	167277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061375
2037	NC_017130	CGT	2	6	167283	167288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061375
2038	NC_017130	GCC	2	6	167435	167440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061375
2039	NC_017130	CTG	2	6	167486	167491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061375
2040	NC_017130	TGG	2	6	167497	167502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384061375
2041	NC_017130	CAT	2	6	167710	167715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061375
2042	NC_017130	GCA	2	6	167807	167812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061376
2043	NC_017130	GCG	2	6	168018	168023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061376
2044	NC_017130	TCG	2	6	168143	168148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061376
2045	NC_017130	GAA	2	6	168168	168173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384061376
2046	NC_017130	TCA	2	6	168185	168190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061376
2047	NC_017130	CTT	2	6	168225	168230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384061376
2048	NC_017130	CGA	2	6	168456	168461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061376
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2050	NC_017130	CCG	2	6	168962	168967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061376
2051	NC_017130	GAT	2	6	168973	168978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384061376
2052	NC_017130	TGC	2	6	169346	169351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061377
2053	NC_017130	TGC	2	6	169354	169359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061377
2054	NC_017130	CGG	2	6	169412	169417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061377
2055	NC_017130	CAC	2	6	169514	169519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061377
2056	NC_017130	GGT	2	6	169553	169558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384061377
2057	NC_017130	CAC	3	9	169567	169575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061377
2058	NC_017130	CAG	2	6	169771	169776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061377
2059	NC_017130	CGA	2	6	169820	169825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061377
2060	NC_017130	GCT	2	6	169866	169871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061377
2061	NC_017130	GAT	2	6	169914	169919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384061377
2062	NC_017130	GCC	3	9	170063	170071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061377
2063	NC_017130	TGG	2	6	170126	170131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384061377
2064	NC_017130	GCA	2	6	170211	170216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061377
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2068	NC_017130	CGT	2	6	170376	170381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061377
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2070	NC_017130	GCC	2	6	170428	170433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061377
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2072	NC_017130	CAG	2	6	170778	170783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061378
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2089	NC_017130	ACA	2	6	171948	171953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384061379
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2321	NC_017130	AAC	2	6	191215	191220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2322	NC_017130	ATC	2	6	191275	191280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.