MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p3

Total Repeats: 18098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016623	TCG	2	6	18683	18688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293536
502	NC_016623	CTT	2	6	18690	18695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293536
503	NC_016623	CGG	2	6	18728	18733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293536
504	NC_016623	TCC	2	6	18797	18802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_016623	CGC	2	6	18864	18869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293537
506	NC_016623	AGC	2	6	18900	18905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293537
507	NC_016623	GAA	2	6	18928	18933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374293537
508	NC_016623	GTGG	2	8	19021	19028	0 %	25 %	75 %	0 %	374293537
509	NC_016623	CGG	2	6	19081	19086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293537
510	NC_016623	CGG	2	6	19098	19103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293537
511	NC_016623	CGA	2	6	19107	19112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293537
512	NC_016623	GCG	2	6	19125	19130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293537
513	NC_016623	AGCG	2	8	19133	19140	25 %	0 %	50 %	25 %	374293537
514	NC_016623	TGG	2	6	19145	19150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293537
515	NC_016623	TCC	2	6	19169	19174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293537
516	NC_016623	CCA	2	6	19179	19184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293537
517	NC_016623	GCT	2	6	19203	19208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293537
518	NC_016623	AGC	2	6	19214	19219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293537
519	NC_016623	CAG	2	6	19225	19230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293537
520	NC_016623	CGT	2	6	19242	19247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293537
521	NC_016623	CGC	2	6	19248	19253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293537
522	NC_016623	AGAT	2	8	19309	19316	50 %	25 %	25 %	0 %	374293538
523	NC_016623	GCC	2	6	19369	19374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293538
524	NC_016623	CGGG	2	8	19379	19386	0 %	0 %	75 %	25 %	374293538
525	NC_016623	GCA	2	6	19394	19399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293538
526	NC_016623	GGC	2	6	19410	19415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293538
527	NC_016623	GCA	2	6	19463	19468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293538
528	NC_016623	CCT	2	6	19490	19495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293538
529	NC_016623	GGT	2	6	19536	19541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293538
530	NC_016623	TAG	2	6	19603	19608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293538
531	NC_016623	ACC	2	6	19609	19614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293538
532	NC_016623	TCC	2	6	19624	19629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293538
533	NC_016623	TCC	2	6	19636	19641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293538
534	NC_016623	ACC	2	6	19678	19683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293538
535	NC_016623	CGC	2	6	19694	19699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293538
536	NC_016623	GC	3	6	19705	19710	0 %	0 %	50 %	50 %	374293538
537	NC_016623	CTG	2	6	19775	19780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293539
538	NC_016623	GCCG	2	8	19795	19802	0 %	0 %	50 %	50 %	374293539
539	NC_016623	CAT	2	6	19847	19852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293539
540	NC_016623	GC	3	6	19883	19888	0 %	0 %	50 %	50 %	374293539
541	NC_016623	CAG	2	6	19898	19903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293539
542	NC_016623	CCG	2	6	19952	19957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293539
543	NC_016623	GCG	2	6	20013	20018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293539
544	NC_016623	CGG	2	6	20026	20031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293539
545	NC_016623	CAG	2	6	20066	20071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293539
546	NC_016623	ATGG	2	8	20093	20100	25 %	25 %	50 %	0 %	374293539
547	NC_016623	CGC	2	6	20102	20107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293539
548	NC_016623	CGG	2	6	20114	20119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293539
549	NC_016623	TGT	2	6	20152	20157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374293539
550	NC_016623	GCC	2	6	20162	20167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293539
551	NC_016623	ACG	2	6	20226	20231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293539
552	NC_016623	TCGGG	2	10	20236	20245	0 %	20 %	60 %	20 %	374293539
553	NC_016623	CGC	2	6	20246	20251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293539
554	NC_016623	GC	3	6	20259	20264	0 %	0 %	50 %	50 %	374293539
555	NC_016623	CAG	2	6	20306	20311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293539
556	NC_016623	CCA	2	6	20335	20340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293539
557	NC_016623	GATCTC	2	12	20390	20401	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374293539
558	NC_016623	GCC	2	6	20414	20419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293539
559	NC_016623	TTC	2	6	20457	20462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293539
560	NC_016623	AGC	2	6	20463	20468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293539
561	NC_016623	CTT	2	6	20471	20476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293539
562	NC_016623	TGG	2	6	20497	20502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293539
563	NC_016623	CCA	2	6	20521	20526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293539
564	NC_016623	GCCG	2	8	20583	20590	0 %	0 %	50 %	50 %	374293540
565	NC_016623	TGG	2	6	20609	20614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293540
566	NC_016623	GC	3	6	20624	20629	0 %	0 %	50 %	50 %	374293540
567	NC_016623	CCT	2	6	20673	20678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293540
568	NC_016623	CAG	2	6	20701	20706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293540
569	NC_016623	CCT	2	6	20724	20729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293540
570	NC_016623	GCA	2	6	20752	20757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293540
571	NC_016623	TGC	2	6	20805	20810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293540
572	NC_016623	TCG	2	6	20828	20833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293540
573	NC_016623	AGA	2	6	20880	20885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374293540
574	NC_016623	ATCG	2	8	20899	20906	25 %	25 %	25 %	25 %	374293540
575	NC_016623	CGG	3	9	20922	20930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293540
576	NC_016623	TCGCC	2	10	21069	21078	0 %	20 %	20 %	60 %	374293540
577	NC_016623	CTT	2	6	21196	21201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293541
578	NC_016623	CGA	2	6	21210	21215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
579	NC_016623	CGGT	2	8	21224	21231	0 %	25 %	50 %	25 %	374293541
580	NC_016623	TGC	2	6	21252	21257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293541
581	NC_016623	GCA	2	6	21294	21299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
582	NC_016623	GCA	2	6	21306	21311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
583	NC_016623	GTT	2	6	21319	21324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374293541
584	NC_016623	CGC	2	6	21396	21401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293541
585	NC_016623	GCG	2	6	21402	21407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293541
586	NC_016623	GCCG	2	8	21469	21476	0 %	0 %	50 %	50 %	374293541
587	NC_016623	CAG	2	6	21487	21492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
588	NC_016623	GAT	2	6	21499	21504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293541
589	NC_016623	GAA	2	6	21517	21522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374293541
590	NC_016623	AGC	2	6	21590	21595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
591	NC_016623	CGG	2	6	21632	21637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293541
592	NC_016623	CAC	2	6	21652	21657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293541
593	NC_016623	GCCG	2	8	21699	21706	0 %	0 %	50 %	50 %	374293541
594	NC_016623	CAG	2	6	21742	21747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
595	NC_016623	CGT	2	6	21768	21773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293541
596	NC_016623	CTG	2	6	21808	21813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293541
597	NC_016623	CGC	2	6	21837	21842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293541
598	NC_016623	GC	4	8	21868	21875	0 %	0 %	50 %	50 %	374293541
599	NC_016623	CAG	2	6	21880	21885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
600	NC_016623	GAA	2	6	21919	21924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374293541
601	NC_016623	CAG	2	6	21976	21981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
602	NC_016623	CAG	2	6	22006	22011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
603	NC_016623	CGG	2	6	22036	22041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293541
604	NC_016623	GAT	2	6	22213	22218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293541
605	NC_016623	CGA	2	6	22230	22235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
606	NC_016623	TCG	2	6	22256	22261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293541
607	NC_016623	GAC	2	6	22288	22293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
608	NC_016623	TGA	2	6	22317	22322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293541
609	NC_016623	TCG	3	9	22334	22342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293541
610	NC_016623	TCG	2	6	22412	22417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293541
611	NC_016623	GGC	2	6	22428	22433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293541
612	NC_016623	GACG	2	8	22519	22526	25 %	0 %	50 %	25 %	374293541
613	NC_016623	CGGC	2	8	22542	22549	0 %	0 %	50 %	50 %	374293541
614	NC_016623	CAC	3	9	22561	22569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293541
615	NC_016623	CGC	2	6	22581	22586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293541
616	NC_016623	TAG	2	6	22604	22609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293541
617	NC_016623	GCC	2	6	22618	22623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293541
618	NC_016623	TCG	2	6	22637	22642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293541
619	NC_016623	CGA	2	6	22647	22652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
620	NC_016623	CAGC	2	8	22660	22667	25 %	0 %	25 %	50 %	374293541
621	NC_016623	CGA	2	6	22692	22697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293541
622	NC_016623	TCG	2	6	22757	22762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293541
623	NC_016623	TGA	2	6	22827	22832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293541
624	NC_016623	CCG	2	6	22882	22887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293542
625	NC_016623	CGT	2	6	22913	22918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293542
626	NC_016623	CCA	2	6	22937	22942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293542
627	NC_016623	GGC	2	6	22946	22951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293542
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1000	NC_016623	ACG	2	6	35916	35921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293553

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