MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p5

Total Repeats: 4965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016619	CCGA	2	8	9	16	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016619	CGA	2	6	34	39	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384559
3	NC_016619	GAT	2	6	40	45	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384559
4	NC_016619	CG	3	6	53	58	0 %	0 %	50 %	50 %	392384559
5	NC_016619	TGC	2	6	87	92	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384559
6	NC_016619	GAT	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384559
7	NC_016619	CCG	2	6	174	179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384559
8	NC_016619	CCG	2	6	325	330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384559
9	NC_016619	GGC	2	6	402	407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384560
10	NC_016619	CAGC	2	8	425	432	25 %	0 %	25 %	50 %	392384560
11	NC_016619	TCAT	2	8	472	479	25 %	50 %	0 %	25 %	392384560
12	NC_016619	CCA	2	6	583	588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392384560
13	NC_016619	GTGC	2	8	607	614	0 %	25 %	50 %	25 %	392384560
14	NC_016619	CCG	2	6	646	651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384560
15	NC_016619	CGG	2	6	674	679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384560
16	NC_016619	G	6	6	684	689	0 %	0 %	100 %	0 %	392384560
17	NC_016619	GCC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384560
18	NC_016619	CGG	2	6	718	723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384560
19	NC_016619	GAC	2	6	727	732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384560
20	NC_016619	GCC	2	6	762	767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016619	CTG	2	6	779	784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016619	GCC	2	6	812	817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016619	CCG	2	6	840	845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384561
24	NC_016619	GCC	2	6	914	919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384561
25	NC_016619	CCG	2	6	943	948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384561
26	NC_016619	GCT	2	6	957	962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384561
27	NC_016619	TC	3	6	963	968	0 %	50 %	0 %	50 %	392384561
28	NC_016619	GGC	2	6	1072	1077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384561
29	NC_016619	GCT	2	6	1088	1093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384561
30	NC_016619	AAATG	2	10	1176	1185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016619	CAC	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016619	AGAA	2	8	1209	1216	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016619	GA	3	6	1233	1238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016619	TCC	2	6	1282	1287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016619	AGG	2	6	1314	1319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016619	TTC	2	6	1362	1367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392384562
37	NC_016619	TGG	3	9	1402	1410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384562
38	NC_016619	CGG	2	6	1423	1428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384562
39	NC_016619	CGA	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384562
40	NC_016619	GAC	2	6	1562	1567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384562
41	NC_016619	GCG	2	6	1578	1583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384562
42	NC_016619	CGA	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384562
43	NC_016619	CGG	2	6	1630	1635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384562
44	NC_016619	GCG	2	6	1671	1676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384562
45	NC_016619	ATC	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392384562
46	NC_016619	GGT	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384562
47	NC_016619	TGC	2	6	1809	1814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384562
48	NC_016619	GCCG	2	8	1840	1847	0 %	0 %	50 %	50 %	392384562
49	NC_016619	CG	3	6	1989	1994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016619	T	8	8	2001	2008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016619	ATT	2	6	2038	2043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016619	ATG	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016619	CACAG	2	10	2150	2159	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016619	AGC	3	9	2161	2169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016619	CCAG	2	8	2190	2197	25 %	0 %	25 %	50 %	392384563
56	NC_016619	TCA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392384563
57	NC_016619	CGT	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384563
58	NC_016619	CGA	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384563
59	NC_016619	CGG	2	6	2476	2481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384563
60	NC_016619	TGGA	2	8	2555	2562	25 %	25 %	50 %	0 %	392384563
61	NC_016619	GATC	2	8	2563	2570	25 %	25 %	25 %	25 %	392384563
62	NC_016619	CAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392384563
63	NC_016619	ATG	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384563
64	NC_016619	TGGGT	2	10	2643	2652	0 %	40 %	60 %	0 %	392384563
65	NC_016619	CGA	2	6	2668	2673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384563
66	NC_016619	CGG	2	6	2716	2721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384563
67	NC_016619	GAG	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392384563
68	NC_016619	CGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384563
69	NC_016619	GCC	2	6	2783	2788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384563
70	NC_016619	ATG	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384563
71	NC_016619	GCT	2	6	2815	2820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384563
72	NC_016619	CCTT	2	8	2923	2930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016619	CGCC	2	8	2932	2939	0 %	0 %	25 %	75 %	392384564
74	NC_016619	GCG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
75	NC_016619	CCG	2	6	2983	2988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
76	NC_016619	CGG	2	6	3049	3054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
77	NC_016619	GCC	2	6	3068	3073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
78	NC_016619	CGA	2	6	3082	3087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384564
79	NC_016619	GCT	3	9	3092	3100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
80	NC_016619	CGCC	3	12	3101	3112	0 %	0 %	25 %	75 %	392384564
81	NC_016619	CCGG	2	8	3113	3120	0 %	0 %	50 %	50 %	392384564
82	NC_016619	GCA	2	6	3133	3138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384564
83	NC_016619	ACA	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392384564
84	NC_016619	GCC	2	6	3302	3307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
85	NC_016619	GTC	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
86	NC_016619	CAC	2	6	3350	3355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392384564
87	NC_016619	GCC	2	6	3380	3385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
88	NC_016619	GCC	2	6	3395	3400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
89	NC_016619	AGC	2	6	3438	3443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384564
90	NC_016619	CGC	2	6	3466	3471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
91	NC_016619	GTG	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384564
92	NC_016619	CCGTC	2	10	3583	3592	0 %	20 %	20 %	60 %	392384564
93	NC_016619	GCC	2	6	3632	3637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
94	NC_016619	GCT	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
95	NC_016619	GGCC	2	8	3715	3722	0 %	0 %	50 %	50 %	392384564
96	NC_016619	GGT	2	6	3758	3763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384564
97	NC_016619	GCC	2	6	3776	3781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
98	NC_016619	CCGCC	2	10	3797	3806	0 %	0 %	20 %	80 %	392384564
99	NC_016619	GTC	2	6	3807	3812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
100	NC_016619	GCC	2	6	3824	3829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
101	NC_016619	GCC	2	6	3833	3838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
102	NC_016619	GCT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
103	NC_016619	GCG	2	6	3877	3882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
104	NC_016619	TGC	2	6	3958	3963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
105	NC_016619	CCG	2	6	3972	3977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
106	NC_016619	GGT	3	9	3998	4006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384564
107	NC_016619	TCG	2	6	4074	4079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
108	NC_016619	CCG	2	6	4281	4286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
109	NC_016619	TGC	2	6	4354	4359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
110	NC_016619	CGC	2	6	4366	4371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
111	NC_016619	GC	3	6	4387	4392	0 %	0 %	50 %	50 %	392384564
112	NC_016619	CGG	2	6	4434	4439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
113	NC_016619	GTG	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384564
114	NC_016619	TGC	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
115	NC_016619	CCG	2	6	4560	4565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
116	NC_016619	GTC	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
117	NC_016619	CGT	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
118	NC_016619	TGG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384564
119	NC_016619	GGAC	2	8	4657	4664	25 %	0 %	50 %	25 %	392384564
120	NC_016619	CGG	2	6	4693	4698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
121	NC_016619	TGC	2	6	4738	4743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
122	NC_016619	CGC	2	6	4750	4755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
123	NC_016619	CGG	2	6	4777	4782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
124	NC_016619	CGC	3	9	4810	4818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
125	NC_016619	CGA	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384564
126	NC_016619	TCG	2	6	4857	4862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
127	NC_016619	ACGG	2	8	4988	4995	25 %	0 %	50 %	25 %	392384564
128	NC_016619	CCG	2	6	5067	5072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
129	NC_016619	GACC	2	8	5189	5196	25 %	0 %	25 %	50 %	392384564
130	NC_016619	CGC	2	6	5248	5253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
131	NC_016619	CGA	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384564
132	NC_016619	CGG	2	6	5302	5307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384565
133	NC_016619	CGG	2	6	5368	5373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384565
134	NC_016619	GGC	2	6	5387	5392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384565
135	NC_016619	GAA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392384565
136	NC_016619	GCC	2	6	5412	5417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384565
137	NC_016619	GGC	2	6	5467	5472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384565
138	NC_016619	TGC	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384565
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159	NC_016619	TGA	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384565
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168	NC_016619	CG	3	6	6626	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
169	NC_016619	GGAA	2	8	6675	6682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_016619	GC	3	6	9611	9616	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
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261	NC_016619	GGA	2	6	9915	9920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392384568
262	NC_016619	CG	3	6	9930	9935	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
263	NC_016619	TCG	2	6	9941	9946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384568
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265	NC_016619	CGG	2	6	10005	10010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384568
266	NC_016619	CGGCG	2	10	10012	10021	0 %	0 %	60 %	40 %	392384568
267	NC_016619	GCGG	2	8	10041	10048	0 %	0 %	75 %	25 %	392384568
268	NC_016619	AGC	2	6	10049	10054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384568
269	NC_016619	GCG	2	6	10058	10063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384568
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272	NC_016619	GGA	2	6	10104	10109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392384568
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275	NC_016619	GC	3	6	10203	10208	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
276	NC_016619	TGA	2	6	10226	10231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384568
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279	NC_016619	GAC	3	9	10297	10305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384568
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282	NC_016619	CG	3	6	10368	10373	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
283	NC_016619	AGC	2	6	10394	10399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384568
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289	NC_016619	G	6	6	10525	10530	0 %	0 %	100 %	0 %	392384568
290	NC_016619	CGG	2	6	10553	10558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384568
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296	NC_016619	GCA	2	6	10671	10676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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389	NC_016619	CGG	2	6	14142	14147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384572
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392	NC_016619	CCG	2	6	14285	14290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384572
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