MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p6

Total Repeats: 4298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016597	GA	3	6	154917	154922	50 %	0 %	50 %	0 %	392380505
4002	NC_016597	TCGC	2	8	154960	154967	0 %	25 %	25 %	50 %	392380505
4003	NC_016597	TCA	2	6	155005	155010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392380505
4004	NC_016597	GCT	2	6	155061	155066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380505
4005	NC_016597	GACA	2	8	155128	155135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_016597	ATAG	2	8	155180	155187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016597	GCA	2	6	155204	155209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_016597	GTC	2	6	155244	155249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_016597	C	6	6	155253	155258	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4010	NC_016597	TC	3	6	155274	155279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_016597	AT	3	6	155427	155432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016597	TCC	2	6	155518	155523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_016597	TGC	2	6	155606	155611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_016597	TCC	2	6	155847	155852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392380506
4015	NC_016597	CAG	2	6	155881	155886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380506
4016	NC_016597	GCT	2	6	155953	155958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380506
4017	NC_016597	GCCG	3	12	155987	155998	0 %	0 %	50 %	50 %	392380506
4018	NC_016597	CCG	2	6	156040	156045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380506
4019	NC_016597	CTG	2	6	156071	156076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380506
4020	NC_016597	AGG	2	6	156087	156092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392380506
4021	NC_016597	CGA	2	6	156163	156168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380506
4022	NC_016597	TGG	2	6	156200	156205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392380506
4023	NC_016597	GCC	2	6	156213	156218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380506
4024	NC_016597	GCG	2	6	156247	156252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380506
4025	NC_016597	GGC	2	6	156253	156258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380506
4026	NC_016597	GC	3	6	156292	156297	0 %	0 %	50 %	50 %	392380506
4027	NC_016597	CGG	2	6	156303	156308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380506
4028	NC_016597	TCGACC	2	12	156342	156353	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392380506
4029	NC_016597	TGG	2	6	156393	156398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392380506
4030	NC_016597	TGG	2	6	156495	156500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392380506
4031	NC_016597	GAG	2	6	156551	156556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392380506
4032	NC_016597	GGT	2	6	156676	156681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392380506
4033	NC_016597	CGA	2	6	156741	156746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380506
4034	NC_016597	GGA	2	6	156751	156756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392380506
4035	NC_016597	GCC	2	6	156782	156787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380506
4036	NC_016597	GCC	2	6	156801	156806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380506
4037	NC_016597	CCG	2	6	156816	156821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380506
4038	NC_016597	GGCG	2	8	156822	156829	0 %	0 %	75 %	25 %	392380506
4039	NC_016597	GCGCC	2	10	156863	156872	0 %	0 %	40 %	60 %	392380506
4040	NC_016597	TCT	2	6	156880	156885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392380506
4041	NC_016597	GGC	2	6	156889	156894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380506
4042	NC_016597	GCA	2	6	156950	156955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4043	NC_016597	GCC	2	6	157014	157019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4044	NC_016597	GC	3	6	157027	157032	0 %	0 %	50 %	50 %	392380507
4045	NC_016597	GCC	2	6	157060	157065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4046	NC_016597	CCG	2	6	157070	157075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4047	NC_016597	GTC	2	6	157077	157082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4048	NC_016597	AGC	2	6	157111	157116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4049	NC_016597	CTG	2	6	157152	157157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4050	NC_016597	GCC	2	6	157215	157220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4051	NC_016597	AGGC	2	8	157252	157259	25 %	0 %	50 %	25 %	392380507
4052	NC_016597	CCG	2	6	157268	157273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4053	NC_016597	CGTG	2	8	157278	157285	0 %	25 %	50 %	25 %	392380507
4054	NC_016597	CGG	2	6	157346	157351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380507
4055	NC_016597	CCGC	2	8	157354	157361	0 %	0 %	25 %	75 %	392380507
4056	NC_016597	TGC	2	6	157381	157386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4057	NC_016597	AGC	2	6	157405	157410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4058	NC_016597	CCA	2	6	157451	157456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392380507
4059	NC_016597	CAC	2	6	157482	157487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392380507
4060	NC_016597	GTT	2	6	157494	157499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392380507
4061	NC_016597	CGC	2	6	157517	157522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4062	NC_016597	CGC	4	12	157530	157541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4063	NC_016597	GTT	2	6	157542	157547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392380507
4064	NC_016597	CGC	2	6	157551	157556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4065	NC_016597	GGGAC	2	10	157623	157632	20 %	0 %	60 %	20 %	392380507
4066	NC_016597	CAG	2	6	157695	157700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4067	NC_016597	ACG	2	6	157747	157752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4068	NC_016597	GGGCA	3	15	157771	157785	20 %	0 %	60 %	20 %	392380507
4069	NC_016597	GCCC	2	8	157808	157815	0 %	0 %	25 %	75 %	392380507
4070	NC_016597	CGG	2	6	157838	157843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380507
4071	NC_016597	GCCG	2	8	157856	157863	0 %	0 %	50 %	50 %	392380507
4072	NC_016597	CGCA	2	8	157882	157889	25 %	0 %	25 %	50 %	392380507
4073	NC_016597	CGT	2	6	157916	157921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4074	NC_016597	GCC	2	6	157923	157928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4075	NC_016597	CGA	2	6	157941	157946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4076	NC_016597	CGG	2	6	157994	157999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380507
4077	NC_016597	CAG	2	6	158013	158018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4078	NC_016597	GCC	2	6	158067	158072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4079	NC_016597	CAG	2	6	158082	158087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4080	NC_016597	CAC	2	6	158097	158102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392380507
4081	NC_016597	GGC	2	6	158177	158182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380507
4082	NC_016597	TCG	2	6	158203	158208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4083	NC_016597	GCA	2	6	158255	158260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4084	NC_016597	CGC	2	6	158309	158314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4085	NC_016597	TGG	2	6	158336	158341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392380507
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4087	NC_016597	TCG	2	6	158404	158409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380507
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4089	NC_016597	GC	3	6	158419	158424	0 %	0 %	50 %	50 %	392380507
4090	NC_016597	CGT	2	6	158444	158449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380507
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4092	NC_016597	GCG	2	6	158522	158527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380507
4093	NC_016597	CAC	2	6	158544	158549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392380507
4094	NC_016597	GCC	3	9	158578	158586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380507
4095	NC_016597	GCCG	2	8	158606	158613	0 %	0 %	50 %	50 %	392380507
4096	NC_016597	GGC	2	6	158643	158648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380507
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4098	NC_016597	GGTC	2	8	158693	158700	0 %	25 %	50 %	25 %	392380507
4099	NC_016597	TCC	2	6	158707	158712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392380507
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4101	NC_016597	GAC	2	6	158802	158807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
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4104	NC_016597	GC	3	6	158895	158900	0 %	0 %	50 %	50 %	392380507
4105	NC_016597	CAG	2	6	158901	158906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4106	NC_016597	GCT	2	6	158915	158920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4107	NC_016597	CGA	2	6	158927	158932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
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4109	NC_016597	GACCTC	2	12	158961	158972	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392380507
4110	NC_016597	GCCCA	2	10	159004	159013	20 %	0 %	20 %	60 %	392380507
4111	NC_016597	ACC	2	6	159049	159054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392380507
4112	NC_016597	GCG	2	6	159077	159082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380507
4113	NC_016597	CAG	2	6	159090	159095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4114	NC_016597	CAG	2	6	159201	159206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380507
4115	NC_016597	TCG	2	6	159242	159247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380507
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4117	NC_016597	GGC	2	6	159261	159266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380507
4118	NC_016597	GCCC	2	8	159381	159388	0 %	0 %	25 %	75 %	392380507
4119	NC_016597	GAT	2	6	159441	159446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392380507
4120	NC_016597	TCG	2	6	159526	159531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4122	NC_016597	GCGCC	2	10	159646	159655	0 %	0 %	40 %	60 %	392380508
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4244	NC_016597	GCA	2	6	165457	165462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380512
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4248	NC_016597	CGG	2	6	165580	165585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392380512
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4275	NC_016597	CTG	2	6	166218	166223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380512
4276	NC_016597	CTG	2	6	166230	166235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380512
4277	NC_016597	GC	3	6	166286	166291	0 %	0 %	50 %	50 %	392380512
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4279	NC_016597	CGA	2	6	166340	166345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380512
4280	NC_016597	GCGCG	2	10	166453	166462	0 %	0 %	60 %	40 %	392380512
4281	NC_016597	GCCG	3	12	166587	166598	0 %	0 %	50 %	50 %	392380512
4282	NC_016597	CGCA	2	8	166632	166639	25 %	0 %	25 %	50 %	392380512
4283	NC_016597	CGA	2	6	166679	166684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392380512
4284	NC_016597	GCC	2	6	166716	166721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392380512
4285	NC_016597	CTG	2	6	166722	166727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392380512
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4287	NC_016597	CCGATC	2	12	166858	166869	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392380512
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4289	NC_016597	TC	3	6	166946	166951	0 %	50 %	0 %	50 %	392380512
4290	NC_016597	GGAA	2	8	166954	166961	50 %	0 %	50 %	0 %	392380512
4291	NC_016597	GGT	2	6	166999	167004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392380512
4292	NC_016597	CGG	2	6	167021	167026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4293	NC_016597	GC	3	6	167069	167074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4294	NC_016597	ACG	2	6	167138	167143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4298	NC_016597	G	6	6	167352	167357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.