MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans ANH9381 chromosome

Total Repeats: 1619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016513	GAATG	2	10	1621	1630	40 %	20 %	40 %	0 %	365966246
2	NC_016513	AATCA	2	10	2078	2087	60 %	20 %	0 %	20 %	365966246
3	NC_016513	CACAA	2	10	3205	3214	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_016513	ATATT	2	10	4109	4118	40 %	60 %	0 %	0 %	365966249
5	NC_016513	TCCAT	2	10	5562	5571	20 %	40 %	0 %	40 %	365966250
6	NC_016513	ATTGT	2	10	7077	7086	20 %	60 %	20 %	0 %	365966252
7	NC_016513	AAATT	2	10	8463	8472	60 %	40 %	0 %	0 %	365966254
8	NC_016513	CCTTA	2	10	8605	8614	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016513	TCTGC	2	10	10982	10991	0 %	40 %	20 %	40 %	365966256
10	NC_016513	ATAAA	2	10	14318	14327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016513	CGTTT	2	10	14411	14420	0 %	60 %	20 %	20 %	365966260
12	NC_016513	AAAAT	2	10	18065	18074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016513	CCAAG	2	10	19104	19113	40 %	0 %	20 %	40 %	365966266
14	NC_016513	TTGAT	2	10	19906	19915	20 %	60 %	20 %	0 %	365966266
15	NC_016513	ATAAA	2	10	20308	20317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016513	AGCAA	2	10	22380	22389	60 %	0 %	20 %	20 %	365966269
17	NC_016513	AATTA	2	10	23590	23599	60 %	40 %	0 %	0 %	365966269
18	NC_016513	AAAAT	2	10	23830	23839	80 %	20 %	0 %	0 %	365966269
19	NC_016513	AAATA	3	15	25975	25989	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016513	TTACG	2	10	27335	27344	20 %	40 %	20 %	20 %	365966271
21	NC_016513	GCCCG	2	10	28617	28626	0 %	0 %	40 %	60 %	365966272
22	NC_016513	TTGTT	2	10	29400	29409	0 %	80 %	20 %	0 %	365966273
23	NC_016513	TTTTC	2	10	29715	29724	0 %	80 %	0 %	20 %	365966274
24	NC_016513	ATTTT	2	10	29769	29778	20 %	80 %	0 %	0 %	365966274
25	NC_016513	CAAAG	2	10	30834	30843	60 %	0 %	20 %	20 %	365966275
26	NC_016513	TACCG	2	10	30911	30920	20 %	20 %	20 %	40 %	365966275
27	NC_016513	ATTTT	2	10	31370	31379	20 %	80 %	0 %	0 %	365966276
28	NC_016513	AAATA	2	10	32735	32744	80 %	20 %	0 %	0 %	365966277
29	NC_016513	ATAAA	2	10	33398	33407	80 %	20 %	0 %	0 %	365966278
30	NC_016513	TTTTG	2	10	35167	35176	0 %	80 %	20 %	0 %	365966280
31	NC_016513	GTAAA	2	10	36979	36988	60 %	20 %	20 %	0 %	365966283
32	NC_016513	ATGGC	2	10	37629	37638	20 %	20 %	40 %	20 %	365966284
33	NC_016513	TCGTT	2	10	38247	38256	0 %	60 %	20 %	20 %	365966285
34	NC_016513	CTTGG	2	10	38356	38365	0 %	40 %	40 %	20 %	365966285
35	NC_016513	CTATT	2	10	38891	38900	20 %	60 %	0 %	20 %	365966285
36	NC_016513	GCCAA	2	10	40424	40433	40 %	0 %	20 %	40 %	365966288
37	NC_016513	GTTTT	2	10	43330	43339	0 %	80 %	20 %	0 %	365966291
38	NC_016513	AATTT	2	10	47693	47702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016513	ATGCA	2	10	47765	47774	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016513	TAAAA	2	10	48333	48342	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016513	ATGTA	2	10	48394	48403	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016513	TAAAT	2	10	51601	51610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016513	TCGGT	2	10	51854	51863	0 %	40 %	40 %	20 %	365966301
44	NC_016513	TTCGG	2	10	52995	53004	0 %	40 %	40 %	20 %	365966301
45	NC_016513	GGTGT	2	10	53145	53154	0 %	40 %	60 %	0 %	365966301
46	NC_016513	CGATT	2	10	53894	53903	20 %	40 %	20 %	20 %	365966301
47	NC_016513	AACGC	2	10	54669	54678	40 %	0 %	20 %	40 %	365966301
48	NC_016513	ACGTT	2	10	56075	56084	20 %	40 %	20 %	20 %	365966303
49	NC_016513	AATGG	2	10	59472	59481	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016513	TTTTA	2	10	61487	61496	20 %	80 %	0 %	0 %	365966308
51	NC_016513	CTTAT	2	10	61825	61834	20 %	60 %	0 %	20 %	365966309
52	NC_016513	GGGTT	2	10	62604	62613	0 %	40 %	60 %	0 %	365966309
53	NC_016513	AAACT	2	10	63538	63547	60 %	20 %	0 %	20 %	365966310
54	NC_016513	ACTTC	2	10	63690	63699	20 %	40 %	0 %	40 %	365966310
55	NC_016513	GAATT	2	10	64067	64076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016513	GATAA	2	10	65779	65788	60 %	20 %	20 %	0 %	365966313
57	NC_016513	AGAAC	2	10	67324	67333	60 %	0 %	20 %	20 %	365966316
58	NC_016513	GAAAT	2	10	67337	67346	60 %	20 %	20 %	0 %	365966316
59	NC_016513	AATTA	2	10	68164	68173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016513	GATCG	2	10	68303	68312	20 %	20 %	40 %	20 %	365966317
61	NC_016513	ACCCA	2	10	70051	70060	40 %	0 %	0 %	60 %	365966318
62	NC_016513	TGGTT	2	10	70679	70688	0 %	60 %	40 %	0 %	365966320
63	NC_016513	CTTTG	2	10	71103	71112	0 %	60 %	20 %	20 %	365966320
64	NC_016513	TTTAT	2	10	71182	71191	20 %	80 %	0 %	0 %	365966320
65	NC_016513	TAAAT	2	10	71281	71290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016513	TTATT	2	10	72558	72567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016513	AGCCA	2	10	72840	72849	40 %	0 %	20 %	40 %	365966322
68	NC_016513	GTCCG	2	10	72946	72955	0 %	20 %	40 %	40 %	365966322
69	NC_016513	ATACG	2	10	73162	73171	40 %	20 %	20 %	20 %	365966322
70	NC_016513	ATTCA	2	10	76377	76386	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016513	TAAAT	2	10	78182	78191	60 %	40 %	0 %	0 %	365966326
72	NC_016513	CAAAG	2	10	78318	78327	60 %	0 %	20 %	20 %	365966326
73	NC_016513	ATAAA	2	10	78389	78398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016513	GCAAA	2	10	80436	80445	60 %	0 %	20 %	20 %	365966329
75	NC_016513	CAACT	2	10	82046	82055	40 %	20 %	0 %	40 %	365966332
76	NC_016513	AATGA	2	10	83785	83794	60 %	20 %	20 %	0 %	365966333
77	NC_016513	TTTGG	2	10	84084	84093	0 %	60 %	40 %	0 %	365966334
78	NC_016513	TTCAA	2	10	90039	90048	40 %	40 %	0 %	20 %	365966338
79	NC_016513	GTTTT	2	10	91998	92007	0 %	80 %	20 %	0 %	365966340
80	NC_016513	GCGCC	2	10	96277	96286	0 %	0 %	40 %	60 %	365966346
81	NC_016513	CATGG	2	10	96440	96449	20 %	20 %	40 %	20 %	365966346
82	NC_016513	CGTTG	2	10	98742	98751	0 %	40 %	40 %	20 %	365966348
83	NC_016513	TTCGT	2	10	99406	99415	0 %	60 %	20 %	20 %	365966348
84	NC_016513	CATTC	2	10	100795	100804	20 %	40 %	0 %	40 %	365966349
85	NC_016513	ACCGC	2	10	104404	104413	20 %	0 %	20 %	60 %	365966353
86	NC_016513	CGCAC	2	10	105164	105173	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_016513	AAAAC	2	10	111194	111203	80 %	0 %	0 %	20 %	365966359
88	NC_016513	ATCCG	2	10	111524	111533	20 %	20 %	20 %	40 %	365966360
89	NC_016513	CAAAA	2	10	112801	112810	80 %	0 %	0 %	20 %	365966361
90	NC_016513	TGATT	2	10	113351	113360	20 %	60 %	20 %	0 %	365966361
91	NC_016513	CCCGC	2	10	113369	113378	0 %	0 %	20 %	80 %	365966361
92	NC_016513	CAATG	2	10	113411	113420	40 %	20 %	20 %	20 %	365966361
93	NC_016513	TTGAA	2	10	118341	118350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016513	CTTTT	2	10	118411	118420	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016513	AACTT	2	10	118711	118720	40 %	40 %	0 %	20 %	365966368
96	NC_016513	TCACC	2	10	120864	120873	20 %	20 %	0 %	60 %	365966369
97	NC_016513	AATTT	2	10	122449	122458	40 %	60 %	0 %	0 %	365966371
98	NC_016513	CATGC	2	10	123510	123519	20 %	20 %	20 %	40 %	365966372
99	NC_016513	TAAAA	2	10	124458	124467	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016513	ATCGG	2	10	124677	124686	20 %	20 %	40 %	20 %	365966373
101	NC_016513	CATTT	2	10	125195	125204	20 %	60 %	0 %	20 %	365966373
102	NC_016513	CGTGC	2	10	126250	126259	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016513	CAAAC	2	10	130689	130698	60 %	0 %	0 %	40 %	365966378
104	NC_016513	CATCA	2	10	130754	130763	40 %	20 %	0 %	40 %	365966378
105	NC_016513	AACAT	2	10	131198	131207	60 %	20 %	0 %	20 %	365966379
106	NC_016513	AAGGC	2	10	133415	133424	40 %	0 %	40 %	20 %	365966382
107	NC_016513	CGACC	2	10	134531	134540	20 %	0 %	20 %	60 %	365966384
108	NC_016513	GTAGC	2	10	135909	135918	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016513	GTTTT	2	10	137748	137757	0 %	80 %	20 %	0 %	365966386
110	NC_016513	CCCAG	2	10	140086	140095	20 %	0 %	20 %	60 %	365966388
111	NC_016513	AAAAG	2	10	140910	140919	80 %	0 %	20 %	0 %	365966389
112	NC_016513	TCGCT	2	10	140983	140992	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_016513	ATTCA	2	10	141017	141026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016513	AAAAT	2	10	141407	141416	80 %	20 %	0 %	0 %	365966390
115	NC_016513	TGGAA	2	10	142363	142372	40 %	20 %	40 %	0 %	365966391
116	NC_016513	TTGTT	2	10	143757	143766	0 %	80 %	20 %	0 %	365966393
117	NC_016513	ACATC	2	10	144014	144023	40 %	20 %	0 %	40 %	365966393
118	NC_016513	GTCGT	2	10	144757	144766	0 %	40 %	40 %	20 %	365966393
119	NC_016513	CCGCC	2	10	144800	144809	0 %	0 %	20 %	80 %	365966393
120	NC_016513	AATTT	2	10	145476	145485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016513	GGCAA	2	10	149603	149612	40 %	0 %	40 %	20 %	365966400
122	NC_016513	CCCAG	2	10	150216	150225	20 %	0 %	20 %	60 %	365966400
123	NC_016513	TCAGA	2	10	150974	150983	40 %	20 %	20 %	20 %	365966401
124	NC_016513	TGCCC	2	10	151115	151124	0 %	20 %	20 %	60 %	365966401
125	NC_016513	CTTTT	2	10	155794	155803	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016513	ACGGC	2	10	156493	156502	20 %	0 %	40 %	40 %	365966410
127	NC_016513	AAAAC	2	10	164398	164407	80 %	0 %	0 %	20 %	365966417
128	NC_016513	GTGCC	2	10	165110	165119	0 %	20 %	40 %	40 %	365966419
129	NC_016513	CGTTA	2	10	168744	168753	20 %	40 %	20 %	20 %	365966422
130	NC_016513	GAAAT	2	10	169047	169056	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016513	CATTG	2	10	172280	172289	20 %	40 %	20 %	20 %	365966425
132	NC_016513	CAACG	2	10	172649	172658	40 %	0 %	20 %	40 %	365966425
133	NC_016513	CTTAA	2	10	172835	172844	40 %	40 %	0 %	20 %	365966425
134	NC_016513	TTAAA	2	10	175253	175262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016513	TCAAA	2	10	175401	175410	60 %	20 %	0 %	20 %	365966429
136	NC_016513	AATCG	2	10	176471	176480	40 %	20 %	20 %	20 %	365966429
137	NC_016513	AACGC	2	10	177912	177921	40 %	0 %	20 %	40 %	365966430
138	NC_016513	CGCAC	2	10	180661	180670	20 %	0 %	20 %	60 %	365966432
139	NC_016513	CAAGC	2	10	180898	180907	40 %	0 %	20 %	40 %	365966433
140	NC_016513	GCCCT	2	10	181561	181570	0 %	20 %	20 %	60 %	365966434
141	NC_016513	AAACC	2	10	182038	182047	60 %	0 %	0 %	40 %	365966434
142	NC_016513	GGTGA	2	10	183791	183800	20 %	20 %	60 %	0 %	365966436
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145	NC_016513	AATGG	2	10	189945	189954	40 %	20 %	40 %	0 %	365966443
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151	NC_016513	CCAAT	2	10	197842	197851	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_016513	ACGCC	2	10	198410	198419	20 %	0 %	20 %	60 %	365966451
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156	NC_016513	ACTTT	2	10	201224	201233	20 %	60 %	0 %	20 %	365966453
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176	NC_016513	CTGCA	2	10	221454	221463	20 %	20 %	20 %	40 %	365966470
177	NC_016513	ACCGC	2	10	221548	221557	20 %	0 %	20 %	60 %	365966470
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179	NC_016513	ACCGC	2	10	223946	223955	20 %	0 %	20 %	60 %	365966471
180	NC_016513	TTAAA	2	10	223984	223993	60 %	40 %	0 %	0 %	365966471
181	NC_016513	GCCCT	2	10	225783	225792	0 %	20 %	20 %	60 %	365966474
182	NC_016513	CTTTT	2	10	225860	225869	0 %	80 %	0 %	20 %	365966474
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187	NC_016513	CCGAT	2	10	236144	236153	20 %	20 %	20 %	40 %	365966486
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191	NC_016513	ATTAA	2	10	241067	241076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_016513	GGAAA	2	10	242186	242195	60 %	0 %	40 %	0 %	365966492
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198	NC_016513	TAAAT	2	10	248569	248578	60 %	40 %	0 %	0 %	365966501
199	NC_016513	ACATT	2	10	249194	249203	40 %	40 %	0 %	20 %	365966501
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208	NC_016513	ACGCA	2	10	261094	261103	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
209	NC_016513	GTTTG	2	10	261189	261198	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
210	NC_016513	CAAAT	2	10	261430	261439	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
211	NC_016513	TTACC	2	10	262141	262150	20 %	40 %	0 %	40 %	365966515
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216	NC_016513	ATTTT	2	10	268170	268179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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237	NC_016513	CCTTG	2	10	311744	311753	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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248	NC_016513	GATTG	2	10	329292	329301	20 %	40 %	40 %	0 %	365966577
249	NC_016513	GCTTT	2	10	329853	329862	0 %	60 %	20 %	20 %	365966577
250	NC_016513	ATAAA	2	10	331394	331403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_016513	AAAAT	2	10	337690	337699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_016513	ATCAA	2	10	340754	340763	60 %	20 %	0 %	20 %	365966588
253	NC_016513	TGGCA	2	10	343839	343848	20 %	20 %	40 %	20 %	365966590
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256	NC_016513	GAACA	2	10	346411	346420	60 %	0 %	20 %	20 %	365966596
257	NC_016513	TCTTT	2	10	351882	351891	0 %	80 %	0 %	20 %	365966603
258	NC_016513	CCGTA	2	10	352984	352993	20 %	20 %	20 %	40 %	365966603
259	NC_016513	GCATT	2	10	361533	361542	20 %	40 %	20 %	20 %	365966608
260	NC_016513	AAGGA	2	10	362562	362571	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
261	NC_016513	GCCGT	2	10	369172	369181	0 %	20 %	40 %	40 %	365966619
262	NC_016513	AAAGC	2	10	370231	370240	60 %	0 %	20 %	20 %	365966620
263	NC_016513	GCCTT	2	10	372979	372988	0 %	40 %	20 %	40 %	365966623
264	NC_016513	CAATG	2	10	373842	373851	40 %	20 %	20 %	20 %	365966623
265	NC_016513	TGGAC	2	10	376568	376577	20 %	20 %	40 %	20 %	365966626
266	NC_016513	ACAAA	2	10	378620	378629	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
267	NC_016513	TTTAT	2	10	378669	378678	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_016513	TTTTG	2	10	382261	382270	0 %	80 %	20 %	0 %	365966633
269	NC_016513	TTTTA	2	10	382450	382459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_016513	CGAAG	2	10	383001	383010	40 %	0 %	40 %	20 %	365966634
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272	NC_016513	CAAAA	2	10	383095	383104	80 %	0 %	0 %	20 %	365966634
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284	NC_016513	CGACT	2	10	393964	393973	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
285	NC_016513	TCGGT	2	10	394339	394348	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_016513	TTCAA	2	10	396989	396998	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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