MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015942	GCG	2	6	162696	162701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198385
3502	NC_015942	GTC	2	6	162742	162747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198385
3503	NC_015942	GCCGC	2	10	162899	162908	0 %	0 %	40 %	60 %	344198385
3504	NC_015942	GGA	2	6	162915	162920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198385
3505	NC_015942	GGC	2	6	163033	163038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198385
3506	NC_015942	GCAG	2	8	163095	163102	25 %	0 %	50 %	25 %	344198385
3507	NC_015942	CCCG	2	8	163107	163114	0 %	0 %	25 %	75 %	344198385
3508	NC_015942	CG	3	6	163113	163118	0 %	0 %	50 %	50 %	344198385
3509	NC_015942	GC	3	6	163120	163125	0 %	0 %	50 %	50 %	344198385
3510	NC_015942	GGC	2	6	163126	163131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198385
3511	NC_015942	AGG	2	6	163350	163355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198385
3512	NC_015942	GC	3	6	163394	163399	0 %	0 %	50 %	50 %	344198385
3513	NC_015942	GTA	2	6	163432	163437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198385
3514	NC_015942	CCA	2	6	163452	163457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198385
3515	NC_015942	A	6	6	163499	163504	100 %	0 %	0 %	0 %	344198385
3516	NC_015942	TGG	2	6	163634	163639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198385
3517	NC_015942	GCG	2	6	163669	163674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198385
3518	NC_015942	GC	3	6	163771	163776	0 %	0 %	50 %	50 %	344198385
3519	NC_015942	GC	3	6	163835	163840	0 %	0 %	50 %	50 %	344198385
3520	NC_015942	GGC	2	6	163885	163890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198385
3521	NC_015942	CGA	2	6	163920	163925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198385
3522	NC_015942	CGC	2	6	163968	163973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198385
3523	NC_015942	CGC	2	6	163982	163987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198385
3524	NC_015942	GT	3	6	164053	164058	0 %	50 %	50 %	0 %	344198385
3525	NC_015942	CAA	2	6	164083	164088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_015942	CG	4	8	164135	164142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_015942	GCG	2	6	164188	164193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198386
3528	NC_015942	GCC	2	6	164223	164228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198386
3529	NC_015942	C	6	6	164227	164232	0 %	0 %	0 %	100 %	344198386
3530	NC_015942	CCAG	2	8	164250	164257	25 %	0 %	25 %	50 %	344198386
3531	NC_015942	CCA	2	6	164275	164280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198386
3532	NC_015942	GCT	2	6	164351	164356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198386
3533	NC_015942	CATA	2	8	164386	164393	50 %	25 %	0 %	25 %	344198386
3534	NC_015942	CGC	2	6	164465	164470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_015942	GACC	2	8	164494	164501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_015942	G	6	6	164508	164513	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_015942	ACT	2	6	164566	164571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198387
3538	NC_015942	CGA	2	6	164623	164628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198387
3539	NC_015942	CAG	2	6	164639	164644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198387
3540	NC_015942	TGC	2	6	164685	164690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198387
3541	NC_015942	AT	3	6	164713	164718	50 %	50 %	0 %	0 %	344198387
3542	NC_015942	TTC	2	6	164726	164731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198387
3543	NC_015942	CGC	2	6	164743	164748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198387
3544	NC_015942	TGGC	2	8	164757	164764	0 %	25 %	50 %	25 %	344198387
3545	NC_015942	TGA	2	6	164775	164780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198387
3546	NC_015942	GGA	2	6	164833	164838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198387
3547	NC_015942	CGT	2	6	164872	164877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198387
3548	NC_015942	ATT	2	6	164927	164932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198387
3549	NC_015942	CGT	2	6	164949	164954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198387
3550	NC_015942	CTG	2	6	164969	164974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198387
3551	NC_015942	TCG	2	6	164976	164981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198387
3552	NC_015942	GCG	2	6	165011	165016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198387
3553	NC_015942	GGC	2	6	165133	165138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198387
3554	NC_015942	TGT	2	6	165226	165231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198388
3555	NC_015942	AAT	2	6	165254	165259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198388
3556	NC_015942	GGT	2	6	165317	165322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198388
3557	NC_015942	TGG	2	6	165349	165354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198388
3558	NC_015942	A	7	7	165371	165377	100 %	0 %	0 %	0 %	344198388
3559	NC_015942	GCCA	2	8	165471	165478	25 %	0 %	25 %	50 %	344198388
3560	NC_015942	CG	3	6	165496	165501	0 %	0 %	50 %	50 %	344198388
3561	NC_015942	TTG	2	6	165510	165515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198388
3562	NC_015942	TGT	2	6	165523	165528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198388
3563	NC_015942	AGC	2	6	165626	165631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_015942	A	6	6	165691	165696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_015942	A	6	6	165700	165705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_015942	CA	3	6	165747	165752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_015942	TACTT	2	10	165817	165826	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3568	NC_015942	CT	3	6	165934	165939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_015942	GCC	2	6	166000	166005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
3570	NC_015942	GC	3	6	166009	166014	0 %	0 %	50 %	50 %	344198389
3571	NC_015942	CTT	2	6	166039	166044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198389
3572	NC_015942	GGA	2	6	166225	166230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198389
3573	NC_015942	GC	3	6	166251	166256	0 %	0 %	50 %	50 %	344198389
3574	NC_015942	GCC	2	6	166280	166285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
3575	NC_015942	CGC	2	6	166318	166323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
3576	NC_015942	CGC	2	6	166351	166356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
3577	NC_015942	GGT	2	6	166448	166453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198389
3578	NC_015942	GCC	2	6	166476	166481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
3579	NC_015942	TCA	2	6	166485	166490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198389
3580	NC_015942	CTC	3	9	166505	166513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198389
3581	NC_015942	ACCA	2	8	166523	166530	50 %	0 %	0 %	50 %	344198389
3582	NC_015942	CTGG	2	8	166552	166559	0 %	25 %	50 %	25 %	344198389
3583	NC_015942	GCC	2	6	166628	166633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
3584	NC_015942	CGCGGC	2	12	166655	166666	0 %	0 %	50 %	50 %	344198389
3585	NC_015942	CTGG	2	8	166693	166700	0 %	25 %	50 %	25 %	344198389
3586	NC_015942	AGG	2	6	166725	166730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198389
3587	NC_015942	GCA	2	6	166762	166767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198389
3588	NC_015942	GAA	2	6	166838	166843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198389
3589	NC_015942	ATG	2	6	166935	166940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198389
3590	NC_015942	GCC	2	6	166993	166998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
3591	NC_015942	GCG	2	6	167085	167090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198389
3592	NC_015942	CGC	2	6	167149	167154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
3593	NC_015942	AAC	2	6	167159	167164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198389
3594	NC_015942	CGGT	2	8	167202	167209	0 %	25 %	50 %	25 %	344198389
3595	NC_015942	CTTCAA	2	12	167245	167256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198389
3596	NC_015942	TGG	2	6	167277	167282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198389
3597	NC_015942	GCC	2	6	167307	167312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
3598	NC_015942	GGC	2	6	167339	167344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198389
3599	NC_015942	CTC	2	6	167354	167359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198389
3600	NC_015942	TGCG	2	8	167394	167401	0 %	25 %	50 %	25 %	344198389
3601	NC_015942	GCA	2	6	167430	167435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198389
3602	NC_015942	ATC	2	6	167486	167491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198389
3603	NC_015942	A	6	6	167555	167560	100 %	0 %	0 %	0 %	344198389
3604	NC_015942	CGC	2	6	167561	167566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
3605	NC_015942	GAG	2	6	167573	167578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198389
3606	NC_015942	T	6	6	167626	167631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_015942	GCA	2	6	167721	167726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_015942	TCT	2	6	167735	167740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_015942	GTT	2	6	167798	167803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198390
3610	NC_015942	CCA	2	6	167841	167846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198390
3611	NC_015942	GCG	2	6	167869	167874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198390
3612	NC_015942	GGC	2	6	167971	167976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198391
3613	NC_015942	AAG	2	6	168005	168010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198391
3614	NC_015942	GCA	2	6	168145	168150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198391
3615	NC_015942	CGCA	2	8	168158	168165	25 %	0 %	25 %	50 %	344198391
3616	NC_015942	GTTG	2	8	168178	168185	0 %	50 %	50 %	0 %	344198391
3617	NC_015942	GC	4	8	168188	168195	0 %	0 %	50 %	50 %	344198391
3618	NC_015942	CGT	2	6	168279	168284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198392
3619	NC_015942	TCA	2	6	168308	168313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198392
3620	NC_015942	GGT	2	6	168451	168456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198392
3621	NC_015942	AGA	2	6	168500	168505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198393
3622	NC_015942	GTT	2	6	168514	168519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198393
3623	NC_015942	GTC	2	6	168532	168537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198393
3624	NC_015942	CTG	2	6	168541	168546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198393
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3869	NC_015942	TCG	2	6	178778	178783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198399
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3882	NC_015942	GCAA	2	8	179706	179713	50 %	0 %	25 %	25 %	344198400
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3964	NC_015942	AAT	2	6	183342	183347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3967	NC_015942	T	6	6	183365	183370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3968	NC_015942	AT	3	6	183371	183376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3969	NC_015942	GC	3	6	183379	183384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3970	NC_015942	ATC	2	6	183402	183407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3972	NC_015942	AGCA	2	8	183427	183434	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3973	NC_015942	G	6	6	183494	183499	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3974	NC_015942	A	6	6	183516	183521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3975	NC_015942	ATTT	2	8	183549	183556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3976	NC_015942	GCT	2	6	183604	183609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3978	NC_015942	GCA	2	6	183709	183714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198404
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3984	NC_015942	ATA	2	6	183950	183955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198404
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3986	NC_015942	GC	3	6	183974	183979	0 %	0 %	50 %	50 %	344198404
3987	NC_015942	CAG	2	6	184025	184030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198404
3988	NC_015942	GAA	2	6	184076	184081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198404
3989	NC_015942	CGA	2	6	184087	184092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198404
3990	NC_015942	TGA	2	6	184093	184098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198404
3991	NC_015942	TCAC	2	8	184158	184165	25 %	25 %	0 %	50 %	344198404
3992	NC_015942	TCA	2	6	184255	184260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198404
3993	NC_015942	GCT	2	6	184262	184267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198404
3994	NC_015942	CGA	2	6	184321	184326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198404
3995	NC_015942	CAG	2	6	184352	184357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198404
3996	NC_015942	AGC	2	6	184362	184367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198404
3997	NC_015942	CAG	2	6	184400	184405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198404
3998	NC_015942	ATT	2	6	184479	184484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198404
3999	NC_015942	TCC	2	6	184490	184495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198405
4000	NC_015942	TCC	2	6	184529	184534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198405

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