MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_015942	TAAT	2	8	399061	399068	50 %	50 %	0 %	0 %	344198604
8502	NC_015942	CTA	2	6	399154	399159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198604
8503	NC_015942	T	6	6	399207	399212	0 %	100 %	0 %	0 %	344198604
8504	NC_015942	GTG	2	6	399370	399375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_015942	CGG	2	6	399455	399460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_015942	ATA	2	6	399524	399529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_015942	ACT	2	6	399549	399554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_015942	TGT	2	6	399577	399582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_015942	A	6	6	399645	399650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_015942	CG	3	6	399679	399684	0 %	0 %	50 %	50 %	344198605
8511	NC_015942	TTTGG	2	10	399690	399699	0 %	60 %	40 %	0 %	344198605
8512	NC_015942	TCC	2	6	399725	399730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198605
8513	NC_015942	GTC	2	6	399751	399756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198605
8514	NC_015942	ACG	2	6	399803	399808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198605
8515	NC_015942	AGT	2	6	399872	399877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198605
8516	NC_015942	ATG	2	6	399881	399886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198605
8517	NC_015942	TCT	2	6	399919	399924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198606
8518	NC_015942	TGA	2	6	399932	399937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198606
8519	NC_015942	GCA	2	6	400070	400075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198606
8520	NC_015942	TTG	2	6	400126	400131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198606
8521	NC_015942	CAT	2	6	400212	400217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198606
8522	NC_015942	TGG	2	6	400479	400484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_015942	GC	3	6	400495	400500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8524	NC_015942	CAT	2	6	400665	400670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_015942	CT	3	6	400690	400695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8526	NC_015942	CGTCT	2	10	400707	400716	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8527	NC_015942	ACG	2	6	400871	400876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
8528	NC_015942	CCAGA	2	10	400891	400900	40 %	0 %	20 %	40 %	344198607
8529	NC_015942	ATCC	2	8	400962	400969	25 %	25 %	0 %	50 %	344198607
8530	NC_015942	TTGC	2	8	400987	400994	0 %	50 %	25 %	25 %	344198607
8531	NC_015942	ACG	2	6	401007	401012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
8532	NC_015942	GAA	2	6	401147	401152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198607
8533	NC_015942	AAG	2	6	401171	401176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198607
8534	NC_015942	GGC	2	6	401192	401197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198607
8535	NC_015942	CTG	2	6	401206	401211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198607
8536	NC_015942	GC	3	6	401413	401418	0 %	0 %	50 %	50 %	344198607
8537	NC_015942	GCA	2	6	401487	401492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
8538	NC_015942	ACG	2	6	401493	401498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
8539	NC_015942	GAT	2	6	401546	401551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198607
8540	NC_015942	ACC	2	6	401559	401564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198607
8541	NC_015942	A	8	8	401600	401607	100 %	0 %	0 %	0 %	344198607
8542	NC_015942	CGC	2	6	401651	401656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198607
8543	NC_015942	AGC	2	6	401687	401692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
8544	NC_015942	CAG	3	9	401774	401782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
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8546	NC_015942	CGGA	2	8	401804	401811	25 %	0 %	50 %	25 %	344198607
8547	NC_015942	CGA	2	6	401845	401850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
8548	NC_015942	GCA	2	6	401886	401891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
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8550	NC_015942	TAT	2	6	402020	402025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198607
8551	NC_015942	ACT	2	6	402069	402074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_015942	ATC	2	6	402147	402152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198608
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8554	NC_015942	TCG	2	6	402298	402303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198608
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8556	NC_015942	TCT	2	6	402547	402552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198608
8557	NC_015942	ACA	2	6	402655	402660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_015942	GACCA	2	10	402717	402726	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8559	NC_015942	GCA	2	6	402807	402812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198609
8560	NC_015942	CAT	2	6	402826	402831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198609
8561	NC_015942	TGATC	2	10	402886	402895	20 %	40 %	20 %	20 %	344198609
8562	NC_015942	CAA	2	6	402964	402969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198609
8563	NC_015942	TCT	2	6	402970	402975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198609
8564	NC_015942	CTT	2	6	403014	403019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198609
8565	NC_015942	TCA	2	6	403035	403040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198609
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8567	NC_015942	TGC	2	6	403265	403270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198609
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8569	NC_015942	CT	3	6	403356	403361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8570	NC_015942	CAG	2	6	403419	403424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_015942	GGCCTG	2	12	403427	403438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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8573	NC_015942	CCG	2	6	403453	403458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8574	NC_015942	GTGC	2	8	403516	403523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8575	NC_015942	GTG	2	6	403601	403606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8586	NC_015942	TGA	2	6	404213	404218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198610
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8594	NC_015942	T	6	6	404649	404654	0 %	100 %	0 %	0 %	344198610
8595	NC_015942	CAG	2	6	404658	404663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198610
8596	NC_015942	CGG	2	6	404691	404696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198610
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8598	NC_015942	GTC	2	6	404732	404737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198610
8599	NC_015942	TCA	2	6	404794	404799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198610
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8601	NC_015942	G	7	7	404952	404958	0 %	0 %	100 %	0 %	344198610
8602	NC_015942	CCG	2	6	405002	405007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198610
8603	NC_015942	GA	3	6	405150	405155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_015942	TGTGG	2	10	405199	405208	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_015942	GGA	3	9	405257	405265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198611
8606	NC_015942	TGA	2	6	405288	405293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198611
8607	NC_015942	AGG	2	6	405416	405421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_015942	TTC	2	6	405447	405452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8609	NC_015942	ACG	2	6	405497	405502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8610	NC_015942	CATCAG	2	12	405503	405514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8611	NC_015942	GCC	2	6	405594	405599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198612
8612	NC_015942	GGT	2	6	405660	405665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198612
8613	NC_015942	A	6	6	405676	405681	100 %	0 %	0 %	0 %	344198612
8614	NC_015942	CCG	2	6	405698	405703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198612
8615	NC_015942	GCC	2	6	405759	405764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198612
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8617	NC_015942	TGA	2	6	405812	405817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198612
8618	NC_015942	GCC	3	9	405858	405866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198612
8619	NC_015942	CGG	2	6	405874	405879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198612
8620	NC_015942	TGGCG	2	10	405972	405981	0 %	20 %	60 %	20 %	344198612
8621	NC_015942	ATG	2	6	405982	405987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198612
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8623	NC_015942	T	7	7	406015	406021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8995	NC_015942	GTCC	2	8	425891	425898	0 %	25 %	25 %	50 %	344198640
8996	NC_015942	AGCG	2	8	425977	425984	25 %	0 %	50 %	25 %	344198640
8997	NC_015942	GTC	2	6	426001	426006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198640
8998	NC_015942	GAA	2	6	426067	426072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198640
8999	NC_015942	CGC	2	6	426084	426089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198640
9000	NC_015942	GCT	2	6	426117	426122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198640

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