MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_015942	CGC	2	6	349953	349958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198559
7503	NC_015942	CTG	2	6	349994	349999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198559
7504	NC_015942	CGGG	2	8	350107	350114	0 %	0 %	75 %	25 %	344198559
7505	NC_015942	AGC	2	6	350157	350162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198559
7506	NC_015942	TCT	2	6	350188	350193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198559
7507	NC_015942	CGG	2	6	350217	350222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198559
7508	NC_015942	CAG	2	6	350387	350392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198559
7509	NC_015942	CGG	2	6	350433	350438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198559
7510	NC_015942	A	6	6	350471	350476	100 %	0 %	0 %	0 %	344198559
7511	NC_015942	TCA	2	6	350547	350552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198559
7512	NC_015942	GTC	2	6	350562	350567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198559
7513	NC_015942	GC	3	6	350680	350685	0 %	0 %	50 %	50 %	344198559
7514	NC_015942	TCG	2	6	350690	350695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198559
7515	NC_015942	ATG	2	6	350742	350747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198559
7516	NC_015942	GTT	2	6	350794	350799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198559
7517	NC_015942	GAT	2	6	350804	350809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198559
7518	NC_015942	CGGGG	2	10	350916	350925	0 %	0 %	80 %	20 %	344198559
7519	NC_015942	ACAAGG	2	12	351138	351149	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	344198559
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7522	NC_015942	T	7	7	351319	351325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_015942	TTG	2	6	351362	351367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198560
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7532	NC_015942	GCT	2	6	351669	351674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198560
7533	NC_015942	CTGG	2	8	351675	351682	0 %	25 %	50 %	25 %	344198560
7534	NC_015942	ATGC	2	8	351685	351692	25 %	25 %	25 %	25 %	344198560
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7544	NC_015942	GGC	2	6	352173	352178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198560
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7551	NC_015942	TGCA	2	8	352612	352619	25 %	25 %	25 %	25 %	344198561
7552	NC_015942	GCA	2	6	352642	352647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198561
7553	NC_015942	GCG	2	6	352681	352686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198561
7554	NC_015942	TGGG	2	8	352714	352721	0 %	25 %	75 %	0 %	344198561
7555	NC_015942	CTG	2	6	352746	352751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198561
7556	NC_015942	CAT	2	6	352764	352769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198561
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7558	NC_015942	GCA	2	6	352815	352820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198561
7559	NC_015942	GC	4	8	352832	352839	0 %	0 %	50 %	50 %	344198561
7560	NC_015942	TGGGCC	2	12	352846	352857	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344198561
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7565	NC_015942	CTGG	2	8	353060	353067	0 %	25 %	50 %	25 %	344198561
7566	NC_015942	CG	3	6	353104	353109	0 %	0 %	50 %	50 %	344198561
7567	NC_015942	TGG	2	6	353122	353127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198561
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7574	NC_015942	CTG	2	6	353436	353441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198561
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7584	NC_015942	GAGAG	2	10	353955	353964	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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7588	NC_015942	TTCA	2	8	354010	354017	25 %	50 %	0 %	25 %	344198562
7589	NC_015942	TGC	2	6	354121	354126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198562
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7593	NC_015942	CAGG	2	8	354380	354387	25 %	0 %	50 %	25 %	344198562
7594	NC_015942	T	9	9	354432	354440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_015942	T	6	6	354477	354482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_015942	CT	4	8	354524	354531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7597	NC_015942	TG	3	6	354538	354543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_015942	AGG	2	6	354558	354563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_015942	GCCCC	2	10	354588	354597	0 %	0 %	20 %	80 %	344198563
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7601	NC_015942	A	6	6	354629	354634	100 %	0 %	0 %	0 %	344198563
7602	NC_015942	CGC	2	6	354639	354644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198563
7603	NC_015942	CTT	2	6	354723	354728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198563
7604	NC_015942	GTC	2	6	354809	354814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198563
7605	NC_015942	CGT	2	6	354847	354852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198563
7606	NC_015942	GCTGG	2	10	354853	354862	0 %	20 %	60 %	20 %	344198563
7607	NC_015942	CT	3	6	354898	354903	0 %	50 %	0 %	50 %	344198563
7608	NC_015942	CTG	2	6	354934	354939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198563
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7610	NC_015942	CTGAT	2	10	355073	355082	20 %	40 %	20 %	20 %	344198563
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7612	NC_015942	GCCAT	2	10	355163	355172	20 %	20 %	20 %	40 %	344198563
7613	NC_015942	GCC	2	6	355210	355215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198563
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7616	NC_015942	ATG	2	6	355331	355336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198563
7617	NC_015942	TGAT	2	8	355349	355356	25 %	50 %	25 %	0 %	344198563
7618	NC_015942	GGTG	2	8	355368	355375	0 %	25 %	75 %	0 %	344198563
7619	NC_015942	GGACA	2	10	355628	355637	40 %	0 %	40 %	20 %	344198563
7620	NC_015942	ACG	2	6	355658	355663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198563
7621	NC_015942	CGCAG	2	10	355675	355684	20 %	0 %	40 %	40 %	344198563
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7623	NC_015942	GAC	2	6	355804	355809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198563
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7748	NC_015942	CGA	2	6	361139	361144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7999	NC_015942	CGA	2	6	373931	373936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198585
8000	NC_015942	AC	3	6	374050	374055	50 %	0 %	0 %	50 %	344198585

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