MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64501	NC_015942	T	7	7	3170545	3170551	0 %	100 %	0 %	0 %	344201295
64502	NC_015942	ATC	2	6	3170601	3170606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201296
64503	NC_015942	TCG	2	6	3170664	3170669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64504	NC_015942	TG	3	6	3170815	3170820	0 %	50 %	50 %	0 %	344201296
64505	NC_015942	CAG	2	6	3170897	3170902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64506	NC_015942	CG	5	10	3170990	3170999	0 %	0 %	50 %	50 %	344201296
64507	NC_015942	GGC	2	6	3171063	3171068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201296
64508	NC_015942	TCG	2	6	3171123	3171128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64509	NC_015942	CG	3	6	3171211	3171216	0 %	0 %	50 %	50 %	344201296
64510	NC_015942	CGT	2	6	3171301	3171306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64511	NC_015942	CCAT	2	8	3171336	3171343	25 %	25 %	0 %	50 %	344201296
64512	NC_015942	CAGG	2	8	3171371	3171378	25 %	0 %	50 %	25 %	344201296
64513	NC_015942	CTG	2	6	3171379	3171384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64514	NC_015942	AGC	2	6	3171410	3171415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64515	NC_015942	GCT	2	6	3171440	3171445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64516	NC_015942	CCCAAT	2	12	3171477	3171488	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	344201296
64517	NC_015942	AGC	2	6	3171525	3171530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64518	NC_015942	ACC	2	6	3171600	3171605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201296
64519	NC_015942	TTG	2	6	3171615	3171620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201296
64520	NC_015942	GCAG	2	8	3171622	3171629	25 %	0 %	50 %	25 %	344201296
64521	NC_015942	AT	3	6	3171630	3171635	50 %	50 %	0 %	0 %	344201296
64522	NC_015942	AGGT	2	8	3171738	3171745	25 %	25 %	50 %	0 %	344201296
64523	NC_015942	TCA	2	6	3171759	3171764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201296
64524	NC_015942	ATG	3	9	3171864	3171872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201296
64525	NC_015942	CGC	2	6	3171957	3171962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201296
64526	NC_015942	CGC	2	6	3171989	3171994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201296
64527	NC_015942	CAG	2	6	3172223	3172228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64528	NC_015942	GCG	2	6	3172268	3172273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201296
64529	NC_015942	TCA	2	6	3172296	3172301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201296
64530	NC_015942	ATC	2	6	3172376	3172381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201296
64531	NC_015942	AT	3	6	3172444	3172449	50 %	50 %	0 %	0 %	344201296
64532	NC_015942	TCT	2	6	3172488	3172493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201296
64533	NC_015942	TCG	2	6	3172542	3172547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64534	NC_015942	AT	3	6	3172571	3172576	50 %	50 %	0 %	0 %	344201296
64535	NC_015942	ATG	2	6	3172638	3172643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201296
64536	NC_015942	GGA	2	6	3172656	3172661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201296
64537	NC_015942	GTG	2	6	3172671	3172676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201296
64538	NC_015942	AGC	2	6	3172767	3172772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64539	NC_015942	GCC	2	6	3172792	3172797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201296
64540	NC_015942	GC	3	6	3172870	3172875	0 %	0 %	50 %	50 %	344201296
64541	NC_015942	GC	3	6	3172920	3172925	0 %	0 %	50 %	50 %	344201296
64542	NC_015942	CTG	2	6	3172997	3173002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64543	NC_015942	CG	3	6	3173029	3173034	0 %	0 %	50 %	50 %	344201296
64544	NC_015942	CGT	2	6	3173194	3173199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64545	NC_015942	CCA	2	6	3173301	3173306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201296
64546	NC_015942	GT	3	6	3173337	3173342	0 %	50 %	50 %	0 %	344201296
64547	NC_015942	CCA	2	6	3173350	3173355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201296
64548	NC_015942	GAA	2	6	3173423	3173428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201296
64549	NC_015942	CTT	2	6	3173455	3173460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201296
64550	NC_015942	CGG	2	6	3173691	3173696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201296
64551	NC_015942	GGC	2	6	3173717	3173722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201296
64552	NC_015942	TTG	2	6	3173759	3173764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201296
64553	NC_015942	TGC	2	6	3173818	3173823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
64554	NC_015942	CGC	2	6	3173941	3173946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64555	NC_015942	ATA	2	6	3173951	3173956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64556	NC_015942	ATT	2	6	3173965	3173970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64557	NC_015942	A	6	6	3173980	3173985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64558	NC_015942	T	7	7	3173988	3173994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64559	NC_015942	GTC	2	6	3174072	3174077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64560	NC_015942	CTC	2	6	3174188	3174193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201297
64561	NC_015942	CAC	2	6	3174194	3174199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201297
64562	NC_015942	TCG	2	6	3174354	3174359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201297
64563	NC_015942	AGG	2	6	3174363	3174368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201297
64564	NC_015942	GGA	2	6	3174422	3174427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201297
64565	NC_015942	G	6	6	3174439	3174444	0 %	0 %	100 %	0 %	344201297
64566	NC_015942	GAT	2	6	3174476	3174481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201297
64567	NC_015942	TGA	2	6	3174616	3174621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201297
64568	NC_015942	CTGG	2	8	3174629	3174636	0 %	25 %	50 %	25 %	344201297
64569	NC_015942	GAT	2	6	3174653	3174658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201297
64570	NC_015942	GCA	2	6	3174661	3174666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201297
64571	NC_015942	GGA	2	6	3174832	3174837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201297
64572	NC_015942	CGA	2	6	3174859	3174864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201297
64573	NC_015942	CGG	2	6	3174868	3174873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201297
64574	NC_015942	G	6	6	3174872	3174877	0 %	0 %	100 %	0 %	344201297
64575	NC_015942	GCG	2	6	3174910	3174915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201298
64576	NC_015942	GTG	2	6	3175064	3175069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201298
64577	NC_015942	GCA	2	6	3175167	3175172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201298
64578	NC_015942	AGC	3	9	3175235	3175243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201298
64579	NC_015942	C	6	6	3175259	3175264	0 %	0 %	0 %	100 %	344201298
64580	NC_015942	CAC	2	6	3175279	3175284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201298
64581	NC_015942	CAGGAT	2	12	3175285	3175296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344201298
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64583	NC_015942	GGGCG	2	10	3175663	3175672	0 %	0 %	80 %	20 %	344201298
64584	NC_015942	ATG	2	6	3175673	3175678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201298
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64586	NC_015942	GCA	2	6	3175739	3175744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64587	NC_015942	TC	3	6	3175901	3175906	0 %	50 %	0 %	50 %	344201299
64588	NC_015942	GC	3	6	3175971	3175976	0 %	0 %	50 %	50 %	344201299
64589	NC_015942	CGG	2	6	3175994	3175999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201299
64590	NC_015942	CAT	2	6	3176049	3176054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201299
64591	NC_015942	G	6	6	3176073	3176078	0 %	0 %	100 %	0 %	344201299
64592	NC_015942	GTC	2	6	3176119	3176124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201299
64593	NC_015942	TAG	2	6	3176168	3176173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64594	NC_015942	TTG	2	6	3176174	3176179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64595	NC_015942	CAA	2	6	3176187	3176192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201300
64596	NC_015942	GCT	2	6	3176291	3176296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201300
64597	NC_015942	CCGT	2	8	3176428	3176435	0 %	25 %	25 %	50 %	344201300
64598	NC_015942	GAA	2	6	3176491	3176496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201301
64599	NC_015942	CCG	2	6	3176563	3176568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201301
64600	NC_015942	GGA	2	6	3176625	3176630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201301
64601	NC_015942	CAT	2	6	3176719	3176724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201301
64602	NC_015942	CCG	2	6	3176783	3176788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201301
64603	NC_015942	CAT	2	6	3176826	3176831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201301
64604	NC_015942	TTA	2	6	3176833	3176838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201301
64605	NC_015942	CCCA	2	8	3176856	3176863	25 %	0 %	0 %	75 %	344201301
64606	NC_015942	CCA	2	6	3176911	3176916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64607	NC_015942	TGA	2	6	3176924	3176929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64608	NC_015942	AAC	2	6	3176931	3176936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64609	NC_015942	TCCA	2	8	3176937	3176944	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64610	NC_015942	GCCC	2	8	3176971	3176978	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64611	NC_015942	GC	3	6	3177015	3177020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64612	NC_015942	CTTC	2	8	3177200	3177207	0 %	50 %	0 %	50 %	344201302
64613	NC_015942	TCT	2	6	3177226	3177231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201302
64614	NC_015942	TCT	2	6	3177262	3177267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201302
64615	NC_015942	ACG	2	6	3177362	3177367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201302
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64617	NC_015942	CTG	2	6	3177381	3177386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201302
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64733	NC_015942	TGC	2	6	3183202	3183207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201312
64734	NC_015942	CATGGC	2	12	3183296	3183307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344201312
64735	NC_015942	G	6	6	3183326	3183331	0 %	0 %	100 %	0 %	344201312
64736	NC_015942	GGCG	2	8	3183335	3183342	0 %	0 %	75 %	25 %	344201312
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64738	NC_015942	CGC	2	6	3183366	3183371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201312
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64741	NC_015942	CAGC	2	8	3183524	3183531	25 %	0 %	25 %	50 %	344201312
64742	NC_015942	CCTGG	2	10	3183566	3183575	0 %	20 %	40 %	40 %	344201312
64743	NC_015942	CTG	2	6	3183615	3183620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201312
64744	NC_015942	GCG	2	6	3183692	3183697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201312
64745	NC_015942	CGC	2	6	3183712	3183717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201312
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64747	NC_015942	TGC	3	9	3183847	3183855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201312
64748	NC_015942	TCTG	2	8	3183901	3183908	0 %	50 %	25 %	25 %	344201312
64749	NC_015942	TGG	2	6	3183913	3183918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201312
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64754	NC_015942	CGG	2	6	3184204	3184209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201312
64755	NC_015942	GC	3	6	3184253	3184258	0 %	0 %	50 %	50 %	344201312
64756	NC_015942	CGGC	2	8	3184264	3184271	0 %	0 %	50 %	50 %	344201312
64757	NC_015942	CGG	2	6	3184309	3184314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201312
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64764	NC_015942	GC	3	6	3184821	3184826	0 %	0 %	50 %	50 %	344201313
64765	NC_015942	GAA	2	6	3184842	3184847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201313
64766	NC_015942	GCGCG	2	10	3184861	3184870	0 %	0 %	60 %	40 %	344201313
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64784	NC_015942	GTGG	2	8	3185787	3185794	0 %	25 %	75 %	0 %	344201314
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64787	NC_015942	CGG	2	6	3185903	3185908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201314
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64797	NC_015942	GCCG	2	8	3186233	3186240	0 %	0 %	50 %	50 %	344201315
64798	NC_015942	GCC	2	6	3186267	3186272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201315
64799	NC_015942	GTG	2	6	3186282	3186287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201315
64800	NC_015942	CGG	4	12	3186289	3186300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201315
64801	NC_015942	TTC	2	6	3186330	3186335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201315
64802	NC_015942	C	7	7	3186353	3186359	0 %	0 %	0 %	100 %	344201315
64803	NC_015942	ATT	2	6	3186374	3186379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201315
64804	NC_015942	CGC	2	6	3186418	3186423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201315
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64809	NC_015942	CCCTG	2	10	3186535	3186544	0 %	20 %	20 %	60 %	344201315
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64812	NC_015942	A	6	6	3186772	3186777	100 %	0 %	0 %	0 %	344201315
64813	NC_015942	CGC	2	6	3186791	3186796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201315
64814	NC_015942	CAT	2	6	3186811	3186816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201315
64815	NC_015942	CGG	2	6	3186853	3186858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201315
64816	NC_015942	GC	4	8	3186916	3186923	0 %	0 %	50 %	50 %	344201315
64817	NC_015942	TGCCTT	2	12	3186940	3186951	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	344201315
64818	NC_015942	GCC	2	6	3186998	3187003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201316
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64821	NC_015942	TGC	2	6	3187191	3187196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201316
64822	NC_015942	CAG	2	6	3187243	3187248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201316
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64824	NC_015942	GTC	2	6	3187264	3187269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201316
64825	NC_015942	GC	3	6	3187273	3187278	0 %	0 %	50 %	50 %	344201316
64826	NC_015942	AG	3	6	3187313	3187318	50 %	0 %	50 %	0 %	344201316
64827	NC_015942	CAG	2	6	3187330	3187335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201316
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64830	NC_015942	CGC	2	6	3187393	3187398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201316
64831	NC_015942	ATC	2	6	3187450	3187455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201316
64832	NC_015942	CGC	3	9	3187493	3187501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201316
64833	NC_015942	ATG	2	6	3187595	3187600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201316
64834	NC_015942	CGA	2	6	3187602	3187607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201316
64835	NC_015942	GCT	3	9	3187671	3187679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201316
64836	NC_015942	TGG	2	6	3187761	3187766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201316
64837	NC_015942	GAT	2	6	3187774	3187779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201316
64838	NC_015942	GGC	2	6	3187813	3187818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201316
64839	NC_015942	CTGC	2	8	3187830	3187837	0 %	25 %	25 %	50 %	344201316
64840	NC_015942	CGG	2	6	3187895	3187900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64841	NC_015942	ATG	2	6	3187906	3187911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64842	NC_015942	T	6	6	3187952	3187957	0 %	100 %	0 %	0 %	344201317
64843	NC_015942	GCG	2	6	3187969	3187974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201317
64844	NC_015942	ACT	2	6	3187980	3187985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201317
64845	NC_015942	CAC	3	9	3188001	3188009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201317
64846	NC_015942	CAC	2	6	3188043	3188048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201317
64847	NC_015942	GCC	2	6	3188086	3188091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201317
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64967	NC_015942	GCGCC	2	10	3193213	3193222	0 %	0 %	40 %	60 %	344201324
64968	NC_015942	CAG	2	6	3193249	3193254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201324
64969	NC_015942	CTA	2	6	3193255	3193260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201324
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