MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015851	T	6	6	109	114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015851	G	6	6	1333	1338	0 %	0 %	100 %	0 %	340783627
3	NC_015851	G	6	6	1395	1400	0 %	0 %	100 %	0 %	340783627
4	NC_015851	G	6	6	1684	1689	0 %	0 %	100 %	0 %	340783628
5	NC_015851	C	6	6	1728	1733	0 %	0 %	0 %	100 %	340783628
6	NC_015851	T	6	6	3252	3257	0 %	100 %	0 %	0 %	340783629
7	NC_015851	T	6	6	3388	3393	0 %	100 %	0 %	0 %	340783629
8	NC_015851	C	6	6	3620	3625	0 %	0 %	0 %	100 %	340783629
9	NC_015851	C	6	6	4309	4314	0 %	0 %	0 %	100 %	340783630
10	NC_015851	T	6	6	5288	5293	0 %	100 %	0 %	0 %	340783631
11	NC_015851	A	6	6	6333	6338	100 %	0 %	0 %	0 %	340783632
12	NC_015851	A	6	6	6504	6509	100 %	0 %	0 %	0 %	340783632
13	NC_015851	A	6	6	6612	6617	100 %	0 %	0 %	0 %	340783632
14	NC_015851	A	6	6	6627	6632	100 %	0 %	0 %	0 %	340783632
15	NC_015851	C	6	6	12092	12097	0 %	0 %	0 %	100 %	340783639
16	NC_015851	C	6	6	13961	13966	0 %	0 %	0 %	100 %	340783641
17	NC_015851	A	6	6	14896	14901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015851	A	6	6	14929	14934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015851	G	6	6	15399	15404	0 %	0 %	100 %	0 %	340783642
20	NC_015851	T	7	7	18757	18763	0 %	100 %	0 %	0 %	340783644
21	NC_015851	A	6	6	19340	19345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015851	G	7	7	19877	19883	0 %	0 %	100 %	0 %	340783645
23	NC_015851	A	6	6	21348	21353	100 %	0 %	0 %	0 %	340783645
24	NC_015851	A	6	6	24217	24222	100 %	0 %	0 %	0 %	340783649
25	NC_015851	G	6	6	24449	24454	0 %	0 %	100 %	0 %	340783649
26	NC_015851	G	6	6	25199	25204	0 %	0 %	100 %	0 %	340783650
27	NC_015851	A	6	6	26016	26021	100 %	0 %	0 %	0 %	340783651
28	NC_015851	G	6	6	26722	26727	0 %	0 %	100 %	0 %	340783652
29	NC_015851	C	6	6	28221	28226	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_015851	A	6	6	32250	32255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015851	A	6	6	32569	32574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015851	A	6	6	38692	38697	100 %	0 %	0 %	0 %	340783667
33	NC_015851	C	6	6	38783	38788	0 %	0 %	0 %	100 %	340783667
34	NC_015851	T	6	6	42011	42016	0 %	100 %	0 %	0 %	340783671
35	NC_015851	T	6	6	43447	43452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015851	T	6	6	45898	45903	0 %	100 %	0 %	0 %	340783674
37	NC_015851	T	8	8	46321	46328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015851	A	6	6	46344	46349	100 %	0 %	0 %	0 %	340783675
39	NC_015851	C	6	6	49109	49114	0 %	0 %	0 %	100 %	340783676
40	NC_015851	T	6	6	52077	52082	0 %	100 %	0 %	0 %	340783680
41	NC_015851	C	7	7	53639	53645	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_015851	T	6	6	54345	54350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015851	A	7	7	54392	54398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015851	A	6	6	54419	54424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015851	G	6	6	55871	55876	0 %	0 %	100 %	0 %	340783684
46	NC_015851	C	6	6	56516	56521	0 %	0 %	0 %	100 %	340783684
47	NC_015851	G	6	6	57594	57599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015851	T	8	8	59456	59463	0 %	100 %	0 %	0 %	340783687
49	NC_015851	T	6	6	60136	60141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015851	T	6	6	60280	60285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015851	C	6	6	62750	62755	0 %	0 %	0 %	100 %	340783688
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57	NC_015851	T	6	6	69330	69335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_015851	A	7	7	94096	94102	100 %	0 %	0 %	0 %	340783716
71	NC_015851	A	6	6	94150	94155	100 %	0 %	0 %	0 %	340783716
72	NC_015851	A	6	6	94168	94173	100 %	0 %	0 %	0 %	340783716
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90	NC_015851	A	6	6	106195	106200	100 %	0 %	0 %	0 %	340783725
91	NC_015851	T	6	6	107388	107393	0 %	100 %	0 %	0 %	340783725
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109	NC_015851	A	8	8	141039	141046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_015851	T	7	7	149708	149714	0 %	100 %	0 %	0 %	340783781
112	NC_015851	C	6	6	150958	150963	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_015851	T	6	6	152544	152549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015851	G	6	6	153075	153080	0 %	0 %	100 %	0 %	340783785
115	NC_015851	G	6	6	160593	160598	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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122	NC_015851	T	6	6	172202	172207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_015851	G	6	6	181691	181696	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.