MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 457

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015851	GA	3	6	1084	1089	50 %	0 %	50 %	0 %	340783626
2	NC_015851	CT	4	8	1364	1371	0 %	50 %	0 %	50 %	340783627
3	NC_015851	AG	3	6	2400	2405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015851	TA	4	8	2876	2883	50 %	50 %	0 %	0 %	340783629
5	NC_015851	AT	3	6	3737	3742	50 %	50 %	0 %	0 %	340783629
6	NC_015851	TA	3	6	4600	4605	50 %	50 %	0 %	0 %	340783630
7	NC_015851	TA	3	6	4765	4770	50 %	50 %	0 %	0 %	340783630
8	NC_015851	AT	3	6	5605	5610	50 %	50 %	0 %	0 %	340783631
9	NC_015851	GT	3	6	5720	5725	0 %	50 %	50 %	0 %	340783631
10	NC_015851	TG	3	6	5995	6000	0 %	50 %	50 %	0 %	340783631
11	NC_015851	GC	3	6	7818	7823	0 %	0 %	50 %	50 %	340783634
12	NC_015851	GC	3	6	8044	8049	0 %	0 %	50 %	50 %	340783634
13	NC_015851	GC	3	6	8602	8607	0 %	0 %	50 %	50 %	340783634
14	NC_015851	GC	3	6	9675	9680	0 %	0 %	50 %	50 %	340783636
15	NC_015851	GC	3	6	9938	9943	0 %	0 %	50 %	50 %	340783636
16	NC_015851	TC	3	6	10016	10021	0 %	50 %	0 %	50 %	340783636
17	NC_015851	CG	3	6	10022	10027	0 %	0 %	50 %	50 %	340783636
18	NC_015851	GC	3	6	10640	10645	0 %	0 %	50 %	50 %	340783637
19	NC_015851	GC	3	6	12067	12072	0 %	0 %	50 %	50 %	340783639
20	NC_015851	TC	3	6	12734	12739	0 %	50 %	0 %	50 %	340783639
21	NC_015851	GC	4	8	13126	13133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015851	TC	4	8	13136	13143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015851	GA	3	6	13147	13152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015851	GT	3	6	13474	13479	0 %	50 %	50 %	0 %	340783640
25	NC_015851	GC	3	6	14726	14731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015851	AC	3	6	15730	15735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015851	GA	3	6	15911	15916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015851	CG	3	6	16101	16106	0 %	0 %	50 %	50 %	340783643
29	NC_015851	AT	3	6	16251	16256	50 %	50 %	0 %	0 %	340783643
30	NC_015851	AT	3	6	18142	18147	50 %	50 %	0 %	0 %	340783643
31	NC_015851	CG	3	6	18531	18536	0 %	0 %	50 %	50 %	340783644
32	NC_015851	TC	3	6	19238	19243	0 %	50 %	0 %	50 %	340783644
33	NC_015851	TG	3	6	19386	19391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015851	AT	3	6	19928	19933	50 %	50 %	0 %	0 %	340783645
35	NC_015851	TC	3	6	20081	20086	0 %	50 %	0 %	50 %	340783645
36	NC_015851	GC	3	6	20976	20981	0 %	0 %	50 %	50 %	340783645
37	NC_015851	CG	3	6	21522	21527	0 %	0 %	50 %	50 %	340783645
38	NC_015851	GC	3	6	22394	22399	0 %	0 %	50 %	50 %	340783646
39	NC_015851	CG	3	6	22665	22670	0 %	0 %	50 %	50 %	340783647
40	NC_015851	TC	3	6	22890	22895	0 %	50 %	0 %	50 %	340783647
41	NC_015851	TG	3	6	22965	22970	0 %	50 %	50 %	0 %	340783647
42	NC_015851	TG	3	6	23135	23140	0 %	50 %	50 %	0 %	340783647
43	NC_015851	CG	3	6	23505	23510	0 %	0 %	50 %	50 %	340783648
44	NC_015851	TC	3	6	24132	24137	0 %	50 %	0 %	50 %	340783649
45	NC_015851	CG	3	6	24300	24305	0 %	0 %	50 %	50 %	340783649
46	NC_015851	CG	3	6	24313	24318	0 %	0 %	50 %	50 %	340783649
47	NC_015851	CG	3	6	24550	24555	0 %	0 %	50 %	50 %	340783649
48	NC_015851	GT	3	6	24557	24562	0 %	50 %	50 %	0 %	340783649
49	NC_015851	AC	3	6	24810	24815	50 %	0 %	0 %	50 %	340783649
50	NC_015851	CG	3	6	25138	25143	0 %	0 %	50 %	50 %	340783650
51	NC_015851	AT	3	6	25953	25958	50 %	50 %	0 %	0 %	340783651
52	NC_015851	GC	3	6	26777	26782	0 %	0 %	50 %	50 %	340783652
53	NC_015851	GC	3	6	27062	27067	0 %	0 %	50 %	50 %	340783652
54	NC_015851	GC	3	6	28107	28112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015851	GC	3	6	28259	28264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015851	GC	3	6	28598	28603	0 %	0 %	50 %	50 %	340783654
57	NC_015851	CG	3	6	29712	29717	0 %	0 %	50 %	50 %	340783654
58	NC_015851	GC	3	6	30226	30231	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
59	NC_015851	CG	3	6	30256	30261	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
60	NC_015851	TG	3	6	30288	30293	0 %	50 %	50 %	0 %	340783655
61	NC_015851	GC	3	6	30981	30986	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
62	NC_015851	GC	3	6	31621	31626	0 %	0 %	50 %	50 %	340783656
63	NC_015851	GT	3	6	31881	31886	0 %	50 %	50 %	0 %	340783656
64	NC_015851	AC	3	6	32392	32397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015851	AC	3	6	32832	32837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015851	TC	3	6	33777	33782	0 %	50 %	0 %	50 %	340783658
67	NC_015851	GC	3	6	33986	33991	0 %	0 %	50 %	50 %	340783658
68	NC_015851	GC	3	6	34528	34533	0 %	0 %	50 %	50 %	340783659
69	NC_015851	GC	3	6	34683	34688	0 %	0 %	50 %	50 %	340783659
70	NC_015851	GC	3	6	35770	35775	0 %	0 %	50 %	50 %	340783660
71	NC_015851	TC	3	6	36869	36874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015851	GC	3	6	37054	37059	0 %	0 %	50 %	50 %	340783663
73	NC_015851	TG	3	6	38008	38013	0 %	50 %	50 %	0 %	340783665
74	NC_015851	CG	3	6	38274	38279	0 %	0 %	50 %	50 %	340783665
75	NC_015851	CA	3	6	38399	38404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015851	CA	3	6	38523	38528	50 %	0 %	0 %	50 %	340783666
77	NC_015851	CA	3	6	38802	38807	50 %	0 %	0 %	50 %	340783667
78	NC_015851	CG	3	6	39690	39695	0 %	0 %	50 %	50 %	340783669
79	NC_015851	GC	3	6	39876	39881	0 %	0 %	50 %	50 %	340783670
80	NC_015851	GC	3	6	40139	40144	0 %	0 %	50 %	50 %	340783670
81	NC_015851	TC	3	6	40217	40222	0 %	50 %	0 %	50 %	340783670
82	NC_015851	CG	3	6	40223	40228	0 %	0 %	50 %	50 %	340783670
83	NC_015851	CT	3	6	41216	41221	0 %	50 %	0 %	50 %	340783671
84	NC_015851	GC	3	6	41462	41467	0 %	0 %	50 %	50 %	340783671
85	NC_015851	CG	3	6	41603	41608	0 %	0 %	50 %	50 %	340783671
86	NC_015851	AG	3	6	42116	42121	50 %	0 %	50 %	0 %	340783671
87	NC_015851	CA	3	6	42305	42310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015851	GC	3	6	42667	42672	0 %	0 %	50 %	50 %	340783672
89	NC_015851	TC	3	6	42928	42933	0 %	50 %	0 %	50 %	340783672
90	NC_015851	CG	3	6	43531	43536	0 %	0 %	50 %	50 %	340783673
91	NC_015851	CG	3	6	43563	43568	0 %	0 %	50 %	50 %	340783673
92	NC_015851	GC	3	6	43661	43666	0 %	0 %	50 %	50 %	340783673
93	NC_015851	CG	3	6	44167	44172	0 %	0 %	50 %	50 %	340783673
94	NC_015851	GC	3	6	44715	44720	0 %	0 %	50 %	50 %	340783673
95	NC_015851	CG	4	8	46583	46590	0 %	0 %	50 %	50 %	340783675
96	NC_015851	CG	3	6	46680	46685	0 %	0 %	50 %	50 %	340783675
97	NC_015851	GC	3	6	47148	47153	0 %	0 %	50 %	50 %	340783675
98	NC_015851	GC	4	8	47374	47381	0 %	0 %	50 %	50 %	340783675
99	NC_015851	CG	3	6	48090	48095	0 %	0 %	50 %	50 %	340783676
100	NC_015851	GC	4	8	48101	48108	0 %	0 %	50 %	50 %	340783676
101	NC_015851	GC	3	6	48493	48498	0 %	0 %	50 %	50 %	340783676
102	NC_015851	GC	3	6	49010	49015	0 %	0 %	50 %	50 %	340783676
103	NC_015851	CG	3	6	50025	50030	0 %	0 %	50 %	50 %	340783677
104	NC_015851	TA	3	6	51004	51009	50 %	50 %	0 %	0 %	340783679
105	NC_015851	CA	3	6	51135	51140	50 %	0 %	0 %	50 %	340783679
106	NC_015851	GC	3	6	51351	51356	0 %	0 %	50 %	50 %	340783679
107	NC_015851	CA	3	6	52394	52399	50 %	0 %	0 %	50 %	340783681
108	NC_015851	CA	3	6	52902	52907	50 %	0 %	0 %	50 %	340783682
109	NC_015851	CG	3	6	53484	53489	0 %	0 %	50 %	50 %	340783683
110	NC_015851	GC	3	6	54848	54853	0 %	0 %	50 %	50 %	340783684
111	NC_015851	TC	3	6	55292	55297	0 %	50 %	0 %	50 %	340783684
112	NC_015851	GC	3	6	55863	55868	0 %	0 %	50 %	50 %	340783684
113	NC_015851	AT	3	6	57819	57824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015851	GC	3	6	57871	57876	0 %	0 %	50 %	50 %	340783685
115	NC_015851	TG	3	6	58607	58612	0 %	50 %	50 %	0 %	340783685
116	NC_015851	GC	3	6	59375	59380	0 %	0 %	50 %	50 %	340783686
117	NC_015851	GA	3	6	59511	59516	50 %	0 %	50 %	0 %	340783687
118	NC_015851	GA	3	6	61518	61523	50 %	0 %	50 %	0 %	340783688
119	NC_015851	TC	3	6	61578	61583	0 %	50 %	0 %	50 %	340783688
120	NC_015851	GT	3	6	61897	61902	0 %	50 %	50 %	0 %	340783688
121	NC_015851	GC	3	6	64286	64291	0 %	0 %	50 %	50 %	340783689
122	NC_015851	GC	4	8	64514	64521	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
123	NC_015851	GA	3	6	64564	64569	50 %	0 %	50 %	0 %	340783690
124	NC_015851	GC	3	6	64861	64866	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
125	NC_015851	GC	3	6	65069	65074	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
126	NC_015851	CG	3	6	65477	65482	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
127	NC_015851	GC	3	6	65821	65826	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
128	NC_015851	CG	3	6	65862	65867	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
129	NC_015851	TG	3	6	66445	66450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015851	AC	3	6	67179	67184	50 %	0 %	0 %	50 %	340783692
131	NC_015851	GC	3	6	67850	67855	0 %	0 %	50 %	50 %	340783692
132	NC_015851	CT	3	6	68612	68617	0 %	50 %	0 %	50 %	340783693
133	NC_015851	CA	3	6	69546	69551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015851	AC	3	6	69558	69563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015851	GA	3	6	72733	72738	50 %	0 %	50 %	0 %	340783696
136	NC_015851	GT	3	6	74159	74164	0 %	50 %	50 %	0 %	340783698
137	NC_015851	TG	3	6	74691	74696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015851	GC	3	6	75270	75275	0 %	0 %	50 %	50 %	340783699
139	NC_015851	GC	3	6	76652	76657	0 %	0 %	50 %	50 %	340783700
140	NC_015851	GT	5	10	77428	77437	0 %	50 %	50 %	0 %	340783701
141	NC_015851	AT	3	6	78037	78042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015851	GT	3	6	78205	78210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015851	TC	3	6	79030	79035	0 %	50 %	0 %	50 %	340783704
144	NC_015851	GC	3	6	79939	79944	0 %	0 %	50 %	50 %	340783705
145	NC_015851	CG	3	6	81003	81008	0 %	0 %	50 %	50 %	340783706
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