MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 4834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015851	TCG	2	6	181349	181354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783807
3502	NC_015851	CG	3	6	181358	181363	0 %	0 %	50 %	50 %	340783807
3503	NC_015851	GCT	2	6	181408	181413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783807
3504	NC_015851	CA	3	6	181464	181469	50 %	0 %	0 %	50 %	340783807
3505	NC_015851	GC	3	6	181517	181522	0 %	0 %	50 %	50 %	340783807
3506	NC_015851	TCG	2	6	181582	181587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783807
3507	NC_015851	CCT	2	6	181676	181681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_015851	G	6	6	181691	181696	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_015851	TTC	2	6	181701	181706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_015851	ACC	2	6	181743	181748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783808
3511	NC_015851	GCG	2	6	181756	181761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783808
3512	NC_015851	ATC	2	6	181824	181829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783808
3513	NC_015851	TAC	2	6	181835	181840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783808
3514	NC_015851	CCGT	2	8	181842	181849	0 %	25 %	25 %	50 %	340783808
3515	NC_015851	CT	3	6	181852	181857	0 %	50 %	0 %	50 %	340783808
3516	NC_015851	GGTG	2	8	181876	181883	0 %	25 %	75 %	0 %	340783808
3517	NC_015851	CG	3	6	181964	181969	0 %	0 %	50 %	50 %	340783808
3518	NC_015851	CAT	2	6	181975	181980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783808
3519	NC_015851	AT	3	6	182033	182038	50 %	50 %	0 %	0 %	340783808
3520	NC_015851	CAG	2	6	182045	182050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783808
3521	NC_015851	GC	3	6	182061	182066	0 %	0 %	50 %	50 %	340783808
3522	NC_015851	CGG	2	6	182147	182152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783808
3523	NC_015851	TCC	2	6	182202	182207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783808
3524	NC_015851	GCC	2	6	182226	182231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783808
3525	NC_015851	TCCC	2	8	182402	182409	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3526	NC_015851	CG	3	6	182434	182439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_015851	CTTC	2	8	182448	182455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_015851	CCA	2	6	182482	182487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_015851	TTC	2	6	182635	182640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_015851	C	6	6	182648	182653	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3531	NC_015851	CATC	2	8	182972	182979	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_015851	ACG	2	6	183035	183040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783809
3533	NC_015851	GAC	2	6	183124	183129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783809
3534	NC_015851	CCG	2	6	183130	183135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783809
3535	NC_015851	GCG	2	6	183166	183171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783809
3536	NC_015851	AGG	2	6	183296	183301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783809
3537	NC_015851	ATA	2	6	183317	183322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783809
3538	NC_015851	G	6	6	183344	183349	0 %	0 %	100 %	0 %	340783809
3539	NC_015851	GCGA	2	8	183398	183405	25 %	0 %	50 %	25 %	340783809
3540	NC_015851	GCC	2	6	183409	183414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783809
3541	NC_015851	CAA	2	6	183504	183509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783809
3542	NC_015851	CTC	2	6	183523	183528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783809
3543	NC_015851	CTGGAA	2	12	183531	183542	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340783809
3544	NC_015851	AAG	2	6	183604	183609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783810
3545	NC_015851	CGT	3	9	183616	183624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783810
3546	NC_015851	GAA	2	6	183631	183636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783810
3547	NC_015851	AGG	2	6	183665	183670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783810
3548	NC_015851	AGC	2	6	183680	183685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783810
3549	NC_015851	GGC	2	6	183687	183692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783810
3550	NC_015851	GTG	2	6	183717	183722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783810
3551	NC_015851	GTG	3	9	183735	183743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_015851	CCG	2	6	183894	183899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_015851	CAC	2	6	184003	184008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783811
3554	NC_015851	CCA	2	6	184020	184025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783811
3555	NC_015851	ACC	2	6	184035	184040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783811
3556	NC_015851	CCA	3	9	184041	184049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783811
3557	NC_015851	CGC	2	6	184277	184282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783811
3558	NC_015851	GTG	2	6	184424	184429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_015851	TGGG	2	8	184433	184440	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_015851	T	6	6	184512	184517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_015851	GAC	2	6	184522	184527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_015851	TGG	2	6	184552	184557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_015851	CGA	2	6	184659	184664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_015851	TCC	2	6	184686	184691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_015851	CTTC	2	8	184708	184715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_015851	AGC	2	6	184968	184973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_015851	TGA	2	6	185042	185047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_015851	TCC	2	6	185064	185069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_015851	AGGC	2	8	185079	185086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_015851	TGCCT	2	10	185090	185099	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3571	NC_015851	ACT	2	6	185163	185168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783812
3572	NC_015851	CTG	2	6	185186	185191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783812
3573	NC_015851	CGT	2	6	185246	185251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783812
3574	NC_015851	GCC	2	6	185252	185257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783812
3575	NC_015851	GAG	2	6	185354	185359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783812
3576	NC_015851	CCA	2	6	185398	185403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783812
3577	NC_015851	GCTG	2	8	185572	185579	0 %	25 %	50 %	25 %	340783812
3578	NC_015851	G	6	6	185608	185613	0 %	0 %	100 %	0 %	340783812
3579	NC_015851	TCA	2	6	185670	185675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783812
3580	NC_015851	AAC	2	6	185774	185779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783812
3581	NC_015851	GATACG	2	12	185792	185803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340783812
3582	NC_015851	TGC	2	6	185878	185883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783812
3583	NC_015851	CAA	2	6	185909	185914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_015851	TGC	2	6	185958	185963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783813
3585	NC_015851	GAT	2	6	186007	186012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783813
3586	NC_015851	CTG	2	6	186029	186034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783813
3587	NC_015851	TCA	2	6	186042	186047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783813
3588	NC_015851	GAT	2	6	186061	186066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783813
3589	NC_015851	CCGCAT	2	12	186122	186133	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340783813
3590	NC_015851	GTG	3	9	186164	186172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783813
3591	NC_015851	GCG	2	6	186254	186259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783813
3592	NC_015851	AAG	2	6	186263	186268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783813
3593	NC_015851	A	7	7	186394	186400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_015851	A	6	6	186527	186532	100 %	0 %	0 %	0 %	340783814
3595	NC_015851	ATT	2	6	186580	186585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783814
3596	NC_015851	AGCGG	2	10	186673	186682	20 %	0 %	60 %	20 %	340783814
3597	NC_015851	A	7	7	186742	186748	100 %	0 %	0 %	0 %	340783814
3598	NC_015851	GCA	2	6	186760	186765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783814
3599	NC_015851	GGGGC	2	10	186932	186941	0 %	0 %	80 %	20 %	340783814
3600	NC_015851	GGA	2	6	186943	186948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783814
3601	NC_015851	TA	3	6	187007	187012	50 %	50 %	0 %	0 %	340783814
3602	NC_015851	GCG	2	6	187013	187018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783814
3603	NC_015851	CT	3	6	187047	187052	0 %	50 %	0 %	50 %	340783814
3604	NC_015851	CAT	2	6	187076	187081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783814
3605	NC_015851	CAA	2	6	187085	187090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783814
3606	NC_015851	ATTTT	2	10	187095	187104	20 %	80 %	0 %	0 %	340783814
3607	NC_015851	GGT	2	6	187120	187125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783814
3608	NC_015851	ACA	2	6	187130	187135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783814
3609	NC_015851	AGG	2	6	187140	187145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783814
3610	NC_015851	AATA	2	8	187167	187174	75 %	25 %	0 %	0 %	340783814
3611	NC_015851	TAT	2	6	187179	187184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783814
3612	NC_015851	AC	4	8	187223	187230	50 %	0 %	0 %	50 %	340783814
3613	NC_015851	ATTG	2	8	187323	187330	25 %	50 %	25 %	0 %	340783814
3614	NC_015851	ACCA	2	8	187406	187413	50 %	0 %	0 %	50 %	340783814
3615	NC_015851	T	6	6	187513	187518	0 %	100 %	0 %	0 %	340783814
3616	NC_015851	AAC	2	6	187523	187528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783814
3617	NC_015851	ATA	2	6	187535	187540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783814
3618	NC_015851	TAT	2	6	187564	187569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783814
3619	NC_015851	TGC	2	6	187635	187640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783814
3620	NC_015851	CCA	2	6	187642	187647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783814
3621	NC_015851	CGG	2	6	187688	187693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783814
3622	NC_015851	TA	3	6	187717	187722	50 %	50 %	0 %	0 %	340783814
3623	NC_015851	ATA	2	6	187724	187729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783814
3624	NC_015851	TTC	2	6	187745	187750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783814
3625	NC_015851	TGCG	2	8	187851	187858	0 %	25 %	50 %	25 %	340783815
3626	NC_015851	GCCTTG	2	12	187869	187880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783815
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3745	NC_015851	TGA	2	6	194830	194835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783823
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3748	NC_015851	CAG	2	6	195334	195339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3751	NC_015851	CGA	2	6	195543	195548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3753	NC_015851	GAT	2	6	195691	195696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783824
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3963	NC_015851	GAACC	2	10	206744	206753	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3980	NC_015851	ATT	2	6	207625	207630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783835
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3984	NC_015851	ACA	2	6	207999	208004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783835
3985	NC_015851	GTT	2	6	208027	208032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783835
3986	NC_015851	GAA	2	6	208062	208067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3987	NC_015851	GCG	2	6	208133	208138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3988	NC_015851	TC	4	8	208162	208169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3989	NC_015851	A	6	6	208208	208213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3990	NC_015851	T	6	6	208248	208253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3991	NC_015851	CTT	2	6	208283	208288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3992	NC_015851	CAA	2	6	208299	208304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3993	NC_015851	GAA	2	6	208440	208445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3995	NC_015851	TGT	2	6	208454	208459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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