MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 4834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015851	AATC	2	8	26400	26407	50 %	25 %	0 %	25 %	340783652
502	NC_015851	GCT	2	6	26458	26463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783652
503	NC_015851	TTGG	2	8	26473	26480	0 %	50 %	50 %	0 %	340783652
504	NC_015851	TGG	2	6	26574	26579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783652
505	NC_015851	GGAG	2	8	26587	26594	25 %	0 %	75 %	0 %	340783652
506	NC_015851	CGG	2	6	26610	26615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783652
507	NC_015851	ACGG	2	8	26705	26712	25 %	0 %	50 %	25 %	340783652
508	NC_015851	G	6	6	26722	26727	0 %	0 %	100 %	0 %	340783652
509	NC_015851	GC	3	6	26777	26782	0 %	0 %	50 %	50 %	340783652
510	NC_015851	ATG	2	6	26801	26806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783652
511	NC_015851	CGC	2	6	26943	26948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783652
512	NC_015851	GCG	2	6	26949	26954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783652
513	NC_015851	CGC	2	6	27015	27020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783652
514	NC_015851	AGC	2	6	27058	27063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783652
515	NC_015851	GC	3	6	27062	27067	0 %	0 %	50 %	50 %	340783652
516	NC_015851	AGA	2	6	27194	27199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783652
517	NC_015851	TCG	2	6	27200	27205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783652
518	NC_015851	TGG	2	6	27291	27296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783652
519	NC_015851	TCAT	2	8	27346	27353	25 %	50 %	0 %	25 %	340783652
520	NC_015851	CGT	2	6	27363	27368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783652
521	NC_015851	GGA	2	6	27468	27473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783652
522	NC_015851	GCC	2	6	27567	27572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783653
523	NC_015851	CGA	2	6	27620	27625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783653
524	NC_015851	GGTAT	2	10	27655	27664	20 %	40 %	40 %	0 %	340783653
525	NC_015851	GCG	2	6	27734	27739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783653
526	NC_015851	GCG	2	6	27870	27875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783653
527	NC_015851	CCG	2	6	27916	27921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_015851	GCT	2	6	27930	27935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_015851	ATT	2	6	28056	28061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015851	GC	3	6	28107	28112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_015851	GCGCG	2	10	28134	28143	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
532	NC_015851	TCG	2	6	28152	28157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015851	C	6	6	28221	28226	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
534	NC_015851	CGT	2	6	28239	28244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_015851	GC	3	6	28259	28264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_015851	GCA	2	6	28343	28348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_015851	CGA	2	6	28431	28436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_015851	GCA	3	9	28482	28490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783654
539	NC_015851	AAGG	2	8	28533	28540	50 %	0 %	50 %	0 %	340783654
540	NC_015851	GC	3	6	28598	28603	0 %	0 %	50 %	50 %	340783654
541	NC_015851	GGC	2	6	28621	28626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783654
542	NC_015851	GCC	2	6	28640	28645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783654
543	NC_015851	GGT	2	6	28651	28656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783654
544	NC_015851	GTG	2	6	28680	28685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783654
545	NC_015851	TCC	2	6	28718	28723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783654
546	NC_015851	GCG	2	6	28748	28753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783654
547	NC_015851	GAA	2	6	28910	28915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783654
548	NC_015851	TGC	2	6	28939	28944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783654
549	NC_015851	GAT	2	6	28997	29002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783654
550	NC_015851	AGATG	2	10	29152	29161	40 %	20 %	40 %	0 %	340783654
551	NC_015851	TGTCT	2	10	29163	29172	0 %	60 %	20 %	20 %	340783654
552	NC_015851	CTG	2	6	29189	29194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783654
553	NC_015851	GCT	2	6	29239	29244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783654
554	NC_015851	CCA	2	6	29279	29284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783654
555	NC_015851	TGA	2	6	29307	29312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783654
556	NC_015851	AAG	2	6	29475	29480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783654
557	NC_015851	GGCA	2	8	29493	29500	25 %	0 %	50 %	25 %	340783654
558	NC_015851	GCG	2	6	29597	29602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783654
559	NC_015851	GTG	2	6	29637	29642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783654
560	NC_015851	AAT	2	6	29705	29710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783654
561	NC_015851	CG	3	6	29712	29717	0 %	0 %	50 %	50 %	340783654
562	NC_015851	GCA	2	6	29799	29804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783654
563	NC_015851	TGGG	2	8	29805	29812	0 %	25 %	75 %	0 %	340783654
564	NC_015851	GGC	2	6	29833	29838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783654
565	NC_015851	TGC	2	6	29856	29861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783654
566	NC_015851	GCG	2	6	29879	29884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783654
567	NC_015851	CAC	2	6	29892	29897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783654
568	NC_015851	GTGC	2	8	29969	29976	0 %	25 %	50 %	25 %	340783654
569	NC_015851	GGT	2	6	30007	30012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783654
570	NC_015851	GGA	2	6	30104	30109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783654
571	NC_015851	ATT	2	6	30140	30145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783655
572	NC_015851	GC	3	6	30226	30231	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
573	NC_015851	CG	3	6	30256	30261	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
574	NC_015851	TG	3	6	30288	30293	0 %	50 %	50 %	0 %	340783655
575	NC_015851	TCTGT	2	10	30334	30343	0 %	60 %	20 %	20 %	340783655
576	NC_015851	GCA	2	6	30349	30354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783655
577	NC_015851	GCG	2	6	30387	30392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783655
578	NC_015851	TGC	2	6	30527	30532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783655
579	NC_015851	AGT	2	6	30546	30551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783655
580	NC_015851	CAC	2	6	30560	30565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783655
581	NC_015851	ATA	2	6	30603	30608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783655
582	NC_015851	TGC	2	6	30774	30779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783655
583	NC_015851	CGA	2	6	30834	30839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783655
584	NC_015851	CGG	2	6	30862	30867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783655
585	NC_015851	TTC	2	6	30917	30922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783655
586	NC_015851	GC	3	6	30981	30986	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
587	NC_015851	ATAA	2	8	31044	31051	75 %	25 %	0 %	0 %	340783655
588	NC_015851	GCA	2	6	31067	31072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015851	GGC	2	6	31137	31142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015851	GAT	2	6	31212	31217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783656
591	NC_015851	CGG	2	6	31229	31234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783656
592	NC_015851	ACGA	2	8	31237	31244	50 %	0 %	25 %	25 %	340783656
593	NC_015851	AGA	2	6	31301	31306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783656
594	NC_015851	GGT	2	6	31314	31319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783656
595	NC_015851	AGC	2	6	31370	31375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783656
596	NC_015851	GGGC	2	8	31380	31387	0 %	0 %	75 %	25 %	340783656
597	NC_015851	TCC	2	6	31389	31394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783656
598	NC_015851	TGG	2	6	31424	31429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783656
599	NC_015851	CTG	2	6	31474	31479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783656
600	NC_015851	TCG	2	6	31482	31487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783656
601	NC_015851	ATCGG	2	10	31562	31571	20 %	20 %	40 %	20 %	340783656
602	NC_015851	GC	3	6	31621	31626	0 %	0 %	50 %	50 %	340783656
603	NC_015851	TCG	2	6	31652	31657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783656
604	NC_015851	AGC	2	6	31682	31687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783656
605	NC_015851	AAG	2	6	31789	31794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783656
606	NC_015851	ATTC	2	8	31851	31858	25 %	50 %	0 %	25 %	340783656
607	NC_015851	GT	3	6	31881	31886	0 %	50 %	50 %	0 %	340783656
608	NC_015851	GCG	2	6	31909	31914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783656
609	NC_015851	GGA	2	6	31977	31982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783656
610	NC_015851	CTGC	2	8	32048	32055	0 %	25 %	25 %	50 %	340783656
611	NC_015851	GCG	2	6	32061	32066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783656
612	NC_015851	GTGC	2	8	32086	32093	0 %	25 %	50 %	25 %	340783656
613	NC_015851	GCC	2	6	32113	32118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783656
614	NC_015851	GGT	2	6	32131	32136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783656
615	NC_015851	ATG	2	6	32185	32190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783656
616	NC_015851	A	6	6	32250	32255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015851	AC	3	6	32392	32397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_015851	A	6	6	32569	32574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015851	CGG	2	6	32678	32683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015851	GTG	2	6	32715	32720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015851	GGGAT	2	10	32753	32762	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015851	GTT	2	6	32813	32818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015851	AC	3	6	32832	32837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_015851	ATT	2	6	32859	32864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783657
625	NC_015851	CCG	2	6	32872	32877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783657
626	NC_015851	ACG	2	6	32879	32884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783657
627	NC_015851	GCT	2	6	32988	32993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783657
628	NC_015851	CCA	3	9	33060	33068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783657
629	NC_015851	AACC	2	8	33148	33155	50 %	0 %	0 %	50 %	340783657
630	NC_015851	CCCG	2	8	33187	33194	0 %	0 %	25 %	75 %	340783657
631	NC_015851	GGA	2	6	33247	33252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783657
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