MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_015850	CG	3	6	2162815	2162820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44002	NC_015850	AGT	2	6	2162836	2162841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44003	NC_015850	TAC	2	6	2162858	2162863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44004	NC_015850	TAG	2	6	2162883	2162888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44005	NC_015850	G	6	6	2162932	2162937	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44006	NC_015850	GCA	2	6	2162943	2162948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44007	NC_015850	TG	4	8	2162992	2162999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44008	NC_015850	AC	4	8	2163015	2163022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44009	NC_015850	GC	3	6	2163074	2163079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44010	NC_015850	TTC	2	6	2163105	2163110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44011	NC_015850	CGG	2	6	2163120	2163125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44012	NC_015850	ATC	2	6	2163169	2163174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44013	NC_015850	TGG	2	6	2163194	2163199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44014	NC_015850	CAT	2	6	2163207	2163212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44015	NC_015850	ACC	2	6	2163233	2163238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44016	NC_015850	CAG	2	6	2163383	2163388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44017	NC_015850	ATG	2	6	2163506	2163511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782861
44018	NC_015850	TTC	2	6	2163536	2163541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782862
44019	NC_015850	CGG	2	6	2163609	2163614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782862
44020	NC_015850	CAT	2	6	2163694	2163699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782862
44021	NC_015850	CTG	2	6	2163701	2163706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782862
44022	NC_015850	TCC	2	6	2163720	2163725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782862
44023	NC_015850	CGG	2	6	2163831	2163836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782862
44024	NC_015850	CAT	2	6	2163959	2163964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782863
44025	NC_015850	AACGG	2	10	2163966	2163975	40 %	0 %	40 %	20 %	340782863
44026	NC_015850	GGC	2	6	2164031	2164036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782863
44027	NC_015850	AGA	2	6	2164115	2164120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782863
44028	NC_015850	CGT	2	6	2164125	2164130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782863
44029	NC_015850	TCG	2	6	2164291	2164296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782863
44030	NC_015850	TGGAC	2	10	2164304	2164313	20 %	20 %	40 %	20 %	340782863
44031	NC_015850	CAT	2	6	2164472	2164477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782863
44032	NC_015850	TCT	2	6	2164489	2164494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782863
44033	NC_015850	GCC	2	6	2164548	2164553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782863
44034	NC_015850	AATCA	2	10	2164617	2164626	60 %	20 %	0 %	20 %	340782863
44035	NC_015850	AGG	2	6	2164663	2164668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782863
44036	NC_015850	G	6	6	2164690	2164695	0 %	0 %	100 %	0 %	340782863
44037	NC_015850	CGA	2	6	2164718	2164723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782863
44038	NC_015850	GT	3	6	2164738	2164743	0 %	50 %	50 %	0 %	340782863
44039	NC_015850	TCG	2	6	2164793	2164798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782863
44040	NC_015850	TGAG	2	8	2164858	2164865	25 %	25 %	50 %	0 %	340782863
44041	NC_015850	AAGA	2	8	2164878	2164885	75 %	0 %	25 %	0 %	340782863
44042	NC_015850	T	6	6	2164893	2164898	0 %	100 %	0 %	0 %	340782863
44043	NC_015850	CGG	2	6	2164925	2164930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782863
44044	NC_015850	TTCCC	2	10	2165001	2165010	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
44045	NC_015850	CATC	2	8	2165062	2165069	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44046	NC_015850	A	6	6	2165091	2165096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44047	NC_015850	GAG	2	6	2165100	2165105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44048	NC_015850	TGC	2	6	2165159	2165164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44049	NC_015850	CTG	2	6	2165173	2165178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44050	NC_015850	CCA	2	6	2165206	2165211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44051	NC_015850	GCG	2	6	2165223	2165228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44052	NC_015850	TGG	2	6	2165251	2165256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44053	NC_015850	TCC	2	6	2165272	2165277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44054	NC_015850	GCC	2	6	2165394	2165399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44055	NC_015850	ATC	2	6	2165400	2165405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44056	NC_015850	TGT	2	6	2165409	2165414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44057	NC_015850	CAT	2	6	2165423	2165428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44058	NC_015850	TTC	2	6	2165521	2165526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44059	NC_015850	AC	3	6	2165632	2165637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44060	NC_015850	AGC	2	6	2165686	2165691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44061	NC_015850	CT	3	6	2165726	2165731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44062	NC_015850	CAC	2	6	2165820	2165825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44063	NC_015850	CA	3	6	2165887	2165892	50 %	0 %	0 %	50 %	340782864
44064	NC_015850	AC	4	8	2165894	2165901	50 %	0 %	0 %	50 %	340782864
44065	NC_015850	GCC	2	6	2165908	2165913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782864
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44067	NC_015850	CCTGG	2	10	2166024	2166033	0 %	20 %	40 %	40 %	340782864
44068	NC_015850	GC	4	8	2166050	2166057	0 %	0 %	50 %	50 %	340782864
44069	NC_015850	GGAC	2	8	2166081	2166088	25 %	0 %	50 %	25 %	340782864
44070	NC_015850	GTCC	2	8	2166096	2166103	0 %	25 %	25 %	50 %	340782864
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44088	NC_015850	GCG	2	6	2167018	2167023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782865
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44095	NC_015850	CGGT	2	8	2167474	2167481	0 %	25 %	50 %	25 %	340782865
44096	NC_015850	TGT	2	6	2167550	2167555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782865
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44105	NC_015850	T	7	7	2168098	2168104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44106	NC_015850	GCACC	2	10	2168115	2168124	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
44107	NC_015850	CA	3	6	2168168	2168173	50 %	0 %	0 %	50 %	340782866
44108	NC_015850	TCCG	2	8	2168176	2168183	0 %	25 %	25 %	50 %	340782866
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44111	NC_015850	GAA	2	6	2168310	2168315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782866
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44121	NC_015850	GCT	2	6	2168731	2168736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782867
44122	NC_015850	C	6	6	2168815	2168820	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44123	NC_015850	CCA	2	6	2168842	2168847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44124	NC_015850	GGA	2	6	2169019	2169024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782868
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44126	NC_015850	GGA	2	6	2169097	2169102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782868
44127	NC_015850	CAT	2	6	2169103	2169108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782868
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44192	NC_015850	CGA	2	6	2173077	2173082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782872
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44223	NC_015850	A	6	6	2174448	2174453	100 %	0 %	0 %	0 %	340782873
44224	NC_015850	GTGG	2	8	2174539	2174546	0 %	25 %	75 %	0 %	340782873
44225	NC_015850	GC	4	8	2174632	2174639	0 %	0 %	50 %	50 %	340782873
44226	NC_015850	CT	3	6	2174684	2174689	0 %	50 %	0 %	50 %	340782873
44227	NC_015850	ATG	2	6	2174749	2174754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782873
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44231	NC_015850	A	7	7	2174968	2174974	100 %	0 %	0 %	0 %	340782873
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44233	NC_015850	GT	3	6	2175183	2175188	0 %	50 %	50 %	0 %	340782873
44234	NC_015850	GCTG	2	8	2175212	2175219	0 %	25 %	50 %	25 %	340782873
44235	NC_015850	CTG	2	6	2175249	2175254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782873
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44346	NC_015850	TCA	2	6	2181744	2181749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44347	NC_015850	TG	3	6	2181815	2181820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44348	NC_015850	A	6	6	2181822	2181827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44349	NC_015850	CGT	2	6	2181882	2181887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44350	NC_015850	GAG	2	6	2181908	2181913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44351	NC_015850	ACGAT	2	10	2181930	2181939	40 %	20 %	20 %	20 %	340782882
44352	NC_015850	TGT	2	6	2181978	2181983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782882
44353	NC_015850	GCCC	2	8	2182011	2182018	0 %	0 %	25 %	75 %	340782882
44354	NC_015850	CGG	2	6	2182056	2182061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782882
44355	NC_015850	GGC	2	6	2182105	2182110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782882
44356	NC_015850	CCG	2	6	2182226	2182231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782882
44357	NC_015850	CGC	2	6	2182243	2182248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782882
44358	NC_015850	CGG	2	6	2182314	2182319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782882
44359	NC_015850	CG	3	6	2182368	2182373	0 %	0 %	50 %	50 %	340782882
44360	NC_015850	TGGC	2	8	2182389	2182396	0 %	25 %	50 %	25 %	340782882
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44369	NC_015850	ATC	2	6	2182792	2182797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782882
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44371	NC_015850	CTGG	2	8	2182956	2182963	0 %	25 %	50 %	25 %	340782882
44372	NC_015850	GGT	2	6	2183010	2183015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782882
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44375	NC_015850	CAC	2	6	2183187	2183192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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44383	NC_015850	GAC	2	6	2183426	2183431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782883
44384	NC_015850	CGT	2	6	2183440	2183445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782883
44385	NC_015850	GCC	2	6	2183501	2183506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782883
44386	NC_015850	ATG	2	6	2183507	2183512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782883
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44390	NC_015850	T	6	6	2183827	2183832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44391	NC_015850	GA	3	6	2183845	2183850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44392	NC_015850	CAT	2	6	2183952	2183957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782884
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44395	NC_015850	GTC	2	6	2183996	2184001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782884
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44409	NC_015850	G	6	6	2184932	2184937	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44410	NC_015850	GGC	2	6	2185007	2185012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782885
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44469	NC_015850	ATG	2	6	2187725	2187730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782887
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44475	NC_015850	GCA	2	6	2188003	2188008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782887
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