MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_015850	A	6	6	2026369	2026374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41502	NC_015850	GCTT	2	8	2026388	2026395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41503	NC_015850	GA	3	6	2026427	2026432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41504	NC_015850	TAC	2	6	2026531	2026536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41505	NC_015850	CCA	3	9	2026619	2026627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782725
41506	NC_015850	CTG	2	6	2026660	2026665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782725
41507	NC_015850	CGC	2	6	2026693	2026698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782725
41508	NC_015850	ACG	2	6	2026703	2026708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782725
41509	NC_015850	GTC	2	6	2026726	2026731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782725
41510	NC_015850	GAA	2	6	2026792	2026797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782725
41511	NC_015850	ACC	2	6	2026816	2026821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782725
41512	NC_015850	CG	3	6	2026840	2026845	0 %	0 %	50 %	50 %	340782725
41513	NC_015850	GGC	2	6	2026848	2026853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782725
41514	NC_015850	ATC	2	6	2026858	2026863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782725
41515	NC_015850	CCG	2	6	2026889	2026894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782725
41516	NC_015850	GC	3	6	2026911	2026916	0 %	0 %	50 %	50 %	340782725
41517	NC_015850	AGG	2	6	2026955	2026960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782725
41518	NC_015850	CG	5	10	2026963	2026972	0 %	0 %	50 %	50 %	340782725
41519	NC_015850	ACG	2	6	2026991	2026996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782725
41520	NC_015850	AGA	2	6	2027081	2027086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782725
41521	NC_015850	GAG	2	6	2027215	2027220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782725
41522	NC_015850	CGC	2	6	2027230	2027235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782725
41523	NC_015850	CGA	2	6	2027244	2027249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782725
41524	NC_015850	CTT	2	6	2027259	2027264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782725
41525	NC_015850	GGA	3	9	2027277	2027285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782725
41526	NC_015850	GCC	2	6	2027333	2027338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782725
41527	NC_015850	GCA	2	6	2027339	2027344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782725
41528	NC_015850	CAAGGC	2	12	2027409	2027420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782725
41529	NC_015850	CCG	2	6	2027447	2027452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782725
41530	NC_015850	GCGG	2	8	2027574	2027581	0 %	0 %	75 %	25 %	340782725
41531	NC_015850	TGC	3	9	2027754	2027762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782725
41532	NC_015850	GGC	2	6	2027769	2027774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782725
41533	NC_015850	CTA	2	6	2027905	2027910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782726
41534	NC_015850	AGG	2	6	2027919	2027924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782726
41535	NC_015850	GAG	2	6	2027990	2027995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782726
41536	NC_015850	CGA	2	6	2028013	2028018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782726
41537	NC_015850	GC	3	6	2028037	2028042	0 %	0 %	50 %	50 %	340782726
41538	NC_015850	TCCC	2	8	2028069	2028076	0 %	25 %	0 %	75 %	340782726
41539	NC_015850	GAGT	2	8	2028080	2028087	25 %	25 %	50 %	0 %	340782726
41540	NC_015850	GTC	2	6	2028116	2028121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782727
41541	NC_015850	GAT	2	6	2028131	2028136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782727
41542	NC_015850	CTG	2	6	2028317	2028322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782727
41543	NC_015850	TGG	2	6	2028415	2028420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41544	NC_015850	ATA	2	6	2028590	2028595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41545	NC_015850	AGA	2	6	2028643	2028648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41546	NC_015850	GCG	2	6	2028664	2028669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41547	NC_015850	CCA	2	6	2028730	2028735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41548	NC_015850	TTC	2	6	2028765	2028770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41549	NC_015850	AGA	2	6	2028775	2028780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41550	NC_015850	AT	3	6	2028802	2028807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41551	NC_015850	TGA	2	6	2028823	2028828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41552	NC_015850	TGG	2	6	2028928	2028933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41553	NC_015850	TGAT	2	8	2028948	2028955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41554	NC_015850	GTG	2	6	2028978	2028983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41555	NC_015850	AAG	2	6	2029031	2029036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41556	NC_015850	AGA	3	9	2029060	2029068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41557	NC_015850	ACG	2	6	2029077	2029082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41558	NC_015850	AGCC	2	8	2029102	2029109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41559	NC_015850	GAC	2	6	2029121	2029126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41560	NC_015850	T	6	6	2029135	2029140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41561	NC_015850	AGA	2	6	2029166	2029171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41562	NC_015850	AAC	2	6	2029187	2029192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41563	NC_015850	GTT	2	6	2029223	2029228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41564	NC_015850	CCA	2	6	2029364	2029369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41565	NC_015850	CCG	3	9	2029503	2029511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782728
41566	NC_015850	AAG	2	6	2029529	2029534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782728
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41568	NC_015850	CGCC	2	8	2029636	2029643	0 %	0 %	25 %	75 %	340782728
41569	NC_015850	CT	3	6	2029697	2029702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41570	NC_015850	GAA	2	6	2029709	2029714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41571	NC_015850	CAC	2	6	2029738	2029743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41572	NC_015850	CTGC	2	8	2029750	2029757	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41573	NC_015850	AG	3	6	2029768	2029773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41574	NC_015850	TGAC	2	8	2029775	2029782	25 %	25 %	25 %	25 %	340782729
41575	NC_015850	CTC	2	6	2029783	2029788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782729
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41578	NC_015850	CCCG	2	8	2029938	2029945	0 %	0 %	25 %	75 %	340782729
41579	NC_015850	GGA	2	6	2030139	2030144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782729
41580	NC_015850	TGCTGG	2	12	2030204	2030215	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340782729
41581	NC_015850	GAT	2	6	2030277	2030282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782729
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41583	NC_015850	CGG	2	6	2030322	2030327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782729
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41586	NC_015850	CGAT	2	8	2030417	2030424	25 %	25 %	25 %	25 %	340782729
41587	NC_015850	ACA	2	6	2030429	2030434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782729
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41590	NC_015850	GCG	2	6	2030530	2030535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782729
41591	NC_015850	C	6	6	2030565	2030570	0 %	0 %	0 %	100 %	340782729
41592	NC_015850	CTGGA	2	10	2030581	2030590	20 %	20 %	40 %	20 %	340782729
41593	NC_015850	G	6	6	2030606	2030611	0 %	0 %	100 %	0 %	340782729
41594	NC_015850	GCT	2	6	2030683	2030688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782730
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41598	NC_015850	CTA	2	6	2030869	2030874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782730
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41601	NC_015850	TCG	2	6	2031093	2031098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782730
41602	NC_015850	TGG	2	6	2031102	2031107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782730
41603	NC_015850	CTG	2	6	2031203	2031208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782730
41604	NC_015850	CTG	2	6	2031246	2031251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782730
41605	NC_015850	CAT	2	6	2031355	2031360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782730
41606	NC_015850	ACCA	2	8	2031440	2031447	50 %	0 %	0 %	50 %	340782730
41607	NC_015850	CGT	2	6	2031514	2031519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782730
41608	NC_015850	GAA	2	6	2031527	2031532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782730
41609	NC_015850	TC	3	6	2031544	2031549	0 %	50 %	0 %	50 %	340782730
41610	NC_015850	GC	3	6	2031595	2031600	0 %	0 %	50 %	50 %	340782730
41611	NC_015850	G	6	6	2031623	2031628	0 %	0 %	100 %	0 %	340782730
41612	NC_015850	GAG	3	9	2031704	2031712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782730
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41615	NC_015850	TGT	2	6	2031882	2031887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782730
41616	NC_015850	TGG	2	6	2031945	2031950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41617	NC_015850	AAG	2	6	2032033	2032038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41619	NC_015850	AGC	2	6	2032175	2032180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782731
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41623	NC_015850	TGG	2	6	2032480	2032485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41658	NC_015850	GAT	2	6	2034337	2034342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41967	NC_015850	GGTGG	2	10	2052125	2052134	0 %	20 %	80 %	0 %	340782750
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41970	NC_015850	GC	3	6	2052306	2052311	0 %	0 %	50 %	50 %	340782750
41971	NC_015850	CGG	2	6	2052324	2052329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782750
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