MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41003	NC_015850	GGC	3	9	2003269	2003277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782703
41004	NC_015850	GA	3	6	2003328	2003333	50 %	0 %	50 %	0 %	340782704
41005	NC_015850	GCG	2	6	2003369	2003374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782704
41006	NC_015850	CGC	2	6	2003383	2003388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782704
41007	NC_015850	CAC	2	6	2003509	2003514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782704
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41010	NC_015850	CTGG	2	8	2003734	2003741	0 %	25 %	50 %	25 %	340782704
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41012	NC_015850	TCG	2	6	2004006	2004011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782704
41013	NC_015850	TACA	2	8	2004113	2004120	50 %	25 %	0 %	25 %	340782704
41014	NC_015850	T	6	6	2004130	2004135	0 %	100 %	0 %	0 %	340782704
41015	NC_015850	GTGG	2	8	2004151	2004158	0 %	25 %	75 %	0 %	340782704
41016	NC_015850	TGG	2	6	2004207	2004212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782704
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41018	NC_015850	TGCT	2	8	2004294	2004301	0 %	50 %	25 %	25 %	340782704
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41022	NC_015850	CTG	3	9	2004505	2004513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782705
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41234	NC_015850	CG	3	6	2013353	2013358	0 %	0 %	50 %	50 %	340782713
41235	NC_015850	TACC	2	8	2013368	2013375	25 %	25 %	0 %	50 %	340782713
41236	NC_015850	CTCC	2	8	2013389	2013396	0 %	25 %	0 %	75 %	340782713
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41239	NC_015850	CG	3	6	2013623	2013628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41240	NC_015850	CGCC	2	8	2013657	2013664	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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41350	NC_015850	TGC	2	6	2018729	2018734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782716
41351	NC_015850	A	6	6	2018823	2018828	100 %	0 %	0 %	0 %	340782716
41352	NC_015850	CGC	2	6	2018853	2018858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782716
41353	NC_015850	CGCC	2	8	2018864	2018871	0 %	0 %	25 %	75 %	340782716
41354	NC_015850	A	6	6	2018917	2018922	100 %	0 %	0 %	0 %	340782716
41355	NC_015850	CG	4	8	2018926	2018933	0 %	0 %	50 %	50 %	340782716
41356	NC_015850	CGA	2	6	2018954	2018959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782716
41357	NC_015850	AGAA	2	8	2019025	2019032	75 %	0 %	25 %	0 %	340782716
41358	NC_015850	CG	3	6	2019110	2019115	0 %	0 %	50 %	50 %	340782716
41359	NC_015850	TGC	2	6	2019251	2019256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782716
41360	NC_015850	CGA	2	6	2019302	2019307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782716
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41362	NC_015850	CAG	3	9	2019558	2019566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782716
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41365	NC_015850	GCA	2	6	2019697	2019702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41366	NC_015850	CGA	2	6	2019720	2019725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41370	NC_015850	CGG	2	6	2019941	2019946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782717
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41372	NC_015850	TGC	2	6	2020028	2020033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782717
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41374	NC_015850	CGG	2	6	2020117	2020122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782718
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41381	NC_015850	TCC	2	6	2020412	2020417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782718
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41384	NC_015850	GTC	2	6	2020507	2020512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782718
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41408	NC_015850	GAG	3	9	2021791	2021799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41448	NC_015850	T	7	7	2023559	2023565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41450	NC_015850	ATT	2	6	2023600	2023605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41453	NC_015850	CGC	3	9	2023711	2023719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41454	NC_015850	CTT	2	6	2023765	2023770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41455	NC_015850	GAGG	2	8	2023775	2023782	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41456	NC_015850	TGG	2	6	2023922	2023927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782722
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41460	NC_015850	GC	3	6	2024030	2024035	0 %	0 %	50 %	50 %	340782722
41461	NC_015850	GACC	2	8	2024058	2024065	25 %	0 %	25 %	50 %	340782722
41462	NC_015850	CGG	2	6	2024086	2024091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782722
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41464	NC_015850	ATC	2	6	2024200	2024205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782722
41465	NC_015850	CG	3	6	2024238	2024243	0 %	0 %	50 %	50 %	340782722
41466	NC_015850	GCG	2	6	2024274	2024279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782722
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41468	NC_015850	CAGC	2	8	2024399	2024406	25 %	0 %	25 %	50 %	340782722
41469	NC_015850	GGC	2	6	2024457	2024462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782722
41470	NC_015850	CGC	2	6	2024466	2024471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782722
41471	NC_015850	CAG	2	6	2024492	2024497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782722
41472	NC_015850	TACC	2	8	2024512	2024519	25 %	25 %	0 %	50 %	340782722
41473	NC_015850	AATG	2	8	2024533	2024540	50 %	25 %	25 %	0 %	340782722
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41496	NC_015850	GCTG	2	8	2026058	2026065	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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41499	NC_015850	CACG	2	8	2026263	2026270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41500	NC_015850	GAG	2	6	2026318	2026323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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