MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_015850	TCC	2	6	1950432	1950437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782646
40003	NC_015850	ATC	2	6	1950470	1950475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782646
40004	NC_015850	GA	3	6	1950482	1950487	50 %	0 %	50 %	0 %	340782646
40005	NC_015850	CCTT	2	8	1950534	1950541	0 %	50 %	0 %	50 %	340782646
40006	NC_015850	CCT	2	6	1950549	1950554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782646
40007	NC_015850	CGG	2	6	1950601	1950606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782646
40008	NC_015850	T	6	6	1950683	1950688	0 %	100 %	0 %	0 %	340782646
40009	NC_015850	TGG	3	9	1950698	1950706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782646
40010	NC_015850	ATC	2	6	1950707	1950712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782646
40011	NC_015850	T	7	7	1950723	1950729	0 %	100 %	0 %	0 %	340782646
40012	NC_015850	ACC	2	6	1950792	1950797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782646
40013	NC_015850	CGT	2	6	1950880	1950885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782646
40014	NC_015850	TTGCGC	2	12	1950930	1950941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782646
40015	NC_015850	G	8	8	1951105	1951112	0 %	0 %	100 %	0 %	340782646
40016	NC_015850	CAA	2	6	1951117	1951122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782646
40017	NC_015850	CGT	2	6	1951183	1951188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782646
40018	NC_015850	CTG	2	6	1951304	1951309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782646
40019	NC_015850	CGC	2	6	1951414	1951419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782646
40020	NC_015850	TGG	2	6	1951501	1951506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782646
40021	NC_015850	TTC	2	6	1951545	1951550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782646
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40024	NC_015850	ACCC	2	8	1951619	1951626	25 %	0 %	0 %	75 %	340782646
40025	NC_015850	CGC	2	6	1951636	1951641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782646
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40031	NC_015850	GGA	2	6	1952063	1952068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40032	NC_015850	TCG	2	6	1952249	1952254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40033	NC_015850	GCC	2	6	1952287	1952292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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40040	NC_015850	TTCT	2	8	1952795	1952802	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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40043	NC_015850	GGCG	2	8	1952950	1952957	0 %	0 %	75 %	25 %	340782650
40044	NC_015850	TCT	2	6	1952961	1952966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782650
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40054	NC_015850	TAGCA	2	10	1953346	1953355	40 %	20 %	20 %	20 %	340782650
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40102	NC_015850	A	6	6	1956334	1956339	100 %	0 %	0 %	0 %	340782653
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40107	NC_015850	GC	4	8	1956558	1956565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40108	NC_015850	AGAT	2	8	1956662	1956669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40109	NC_015850	CTTG	2	8	1956691	1956698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40110	NC_015850	TTA	2	6	1956834	1956839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340782654
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40113	NC_015850	T	6	6	1956879	1956884	0 %	100 %	0 %	0 %	340782654
40114	NC_015850	CTG	3	9	1956916	1956924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782654
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40118	NC_015850	TGGA	2	8	1957046	1957053	25 %	25 %	50 %	0 %	340782654
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40226	NC_015850	CTC	2	6	1962903	1962908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40227	NC_015850	AGCT	2	8	1962910	1962917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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40232	NC_015850	CCT	2	6	1963168	1963173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40233	NC_015850	CT	3	6	1963224	1963229	0 %	50 %	0 %	50 %	340782661
40234	NC_015850	TGC	2	6	1963268	1963273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782661
40235	NC_015850	GCC	2	6	1963284	1963289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782661
40236	NC_015850	CGT	2	6	1963302	1963307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782661
40237	NC_015850	CCA	2	6	1963309	1963314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782661
40238	NC_015850	TGG	2	6	1963359	1963364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782661
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40240	NC_015850	C	6	6	1963445	1963450	0 %	0 %	0 %	100 %	340782661
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40242	NC_015850	CTA	2	6	1963534	1963539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782661
40243	NC_015850	GTC	2	6	1963590	1963595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782661
40244	NC_015850	TCT	2	6	1963596	1963601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782661
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40246	NC_015850	GGC	2	6	1963673	1963678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782661
40247	NC_015850	GCC	2	6	1963749	1963754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782661
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40249	NC_015850	CAT	2	6	1963936	1963941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782661
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40251	NC_015850	G	6	6	1963984	1963989	0 %	0 %	100 %	0 %	340782661
40252	NC_015850	CCTGC	2	10	1964138	1964147	0 %	20 %	20 %	60 %	340782661
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40254	NC_015850	C	7	7	1964246	1964252	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40255	NC_015850	CCT	2	6	1964338	1964343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40256	NC_015850	GTT	2	6	1964419	1964424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782662
40257	NC_015850	ATATCC	2	12	1964430	1964441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782662
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40261	NC_015850	AAT	2	6	1964614	1964619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340782662
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40266	NC_015850	CTG	3	9	1964892	1964900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782662
40267	NC_015850	CCA	2	6	1964908	1964913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782662
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40271	NC_015850	GGC	2	6	1965027	1965032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782662
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40273	NC_015850	GCA	2	6	1965224	1965229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40274	NC_015850	CATCGA	2	12	1965250	1965261	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340782663
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40289	NC_015850	CCGTG	2	10	1966258	1966267	0 %	20 %	40 %	40 %	340782664
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40299	NC_015850	TCTAG	2	10	1967067	1967076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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40330	NC_015850	GA	3	6	1968162	1968167	50 %	0 %	50 %	0 %	340782668
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40334	NC_015850	CGCC	2	8	1968383	1968390	0 %	0 %	25 %	75 %	340782668
40335	NC_015850	TCA	2	6	1968417	1968422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782668
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40337	NC_015850	CCTT	2	8	1968523	1968530	0 %	50 %	0 %	50 %	340782668
40338	NC_015850	C	6	6	1968537	1968542	0 %	0 %	0 %	100 %	340782668
40339	NC_015850	GCC	2	6	1968629	1968634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782668
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40342	NC_015850	AT	3	6	1968768	1968773	50 %	50 %	0 %	0 %	340782668
40343	NC_015850	CGA	2	6	1968781	1968786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782668
40344	NC_015850	T	6	6	1968901	1968906	0 %	100 %	0 %	0 %	340782668
40345	NC_015850	CGC	2	6	1968917	1968922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782668
40346	NC_015850	GGA	2	6	1968925	1968930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782668
40347	NC_015850	CGA	2	6	1969000	1969005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40348	NC_015850	GC	3	6	1969007	1969012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40349	NC_015850	AG	3	6	1969024	1969029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40350	NC_015850	TGG	2	6	1969047	1969052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40351	NC_015850	ATC	2	6	1969124	1969129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782669
40352	NC_015850	AT	3	6	1969162	1969167	50 %	50 %	0 %	0 %	340782669
40353	NC_015850	CAT	2	6	1969169	1969174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782669
40354	NC_015850	TCT	2	6	1969401	1969406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782670
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40467	NC_015850	GC	4	8	1976699	1976706	0 %	0 %	50 %	50 %	340782677
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