MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_015850	GC	4	8	405015	405022	0 %	0 %	50 %	50 %	340781138
8503	NC_015850	ATC	2	6	405135	405140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781138
8504	NC_015850	GC	3	6	405165	405170	0 %	0 %	50 %	50 %	340781138
8505	NC_015850	GGC	2	6	405172	405177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781138
8506	NC_015850	GCG	3	9	405210	405218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781138
8507	NC_015850	CTC	2	6	405233	405238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781138
8508	NC_015850	CTG	2	6	405240	405245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781138
8509	NC_015850	GGC	2	6	405284	405289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781138
8510	NC_015850	TGC	2	6	405304	405309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781138
8511	NC_015850	GAG	2	6	405320	405325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781138
8512	NC_015850	CCAT	2	8	405378	405385	25 %	25 %	0 %	50 %	340781138
8513	NC_015850	TGA	2	6	405406	405411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781138
8514	NC_015850	CCAG	2	8	405493	405500	25 %	0 %	25 %	50 %	340781138
8515	NC_015850	TCG	3	9	405528	405536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781138
8516	NC_015850	ATG	2	6	405537	405542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781138
8517	NC_015850	GCT	2	6	405630	405635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781139
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8519	NC_015850	GGC	2	6	405738	405743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781139
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8521	NC_015850	GCG	2	6	405839	405844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781139
8522	NC_015850	CTG	2	6	405874	405879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781139
8523	NC_015850	GCCGC	2	10	405932	405941	0 %	0 %	40 %	60 %	340781139
8524	NC_015850	GGCT	2	8	405985	405992	0 %	25 %	50 %	25 %	340781139
8525	NC_015850	CGGA	2	8	405996	406003	25 %	0 %	50 %	25 %	340781139
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8529	NC_015850	CTG	2	6	406219	406224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781140
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8533	NC_015850	GC	3	6	406420	406425	0 %	0 %	50 %	50 %	340781140
8534	NC_015850	CTG	2	6	406461	406466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781140
8535	NC_015850	ACG	2	6	406467	406472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781140
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8538	NC_015850	GCAT	2	8	406567	406574	25 %	25 %	25 %	25 %	340781140
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8541	NC_015850	CTGA	2	8	406737	406744	25 %	25 %	25 %	25 %	340781140
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8546	NC_015850	TCC	2	6	406870	406875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781140
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8553	NC_015850	GC	3	6	407234	407239	0 %	0 %	50 %	50 %	340781140
8554	NC_015850	CAG	2	6	407358	407363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781140
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8559	NC_015850	ACCC	2	8	407474	407481	25 %	0 %	0 %	75 %	340781140
8560	NC_015850	GGC	2	6	407483	407488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781140
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8562	NC_015850	GCC	2	6	407653	407658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8563	NC_015850	GCTGGG	2	12	407740	407751	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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8565	NC_015850	CCA	2	6	407923	407928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8572	NC_015850	ACA	2	6	408332	408337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781141
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8580	NC_015850	CGT	2	6	408551	408556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781142
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8582	NC_015850	CAC	2	6	408604	408609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781142
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8593	NC_015850	GC	3	6	409283	409288	0 %	0 %	50 %	50 %	340781142
8594	NC_015850	CGA	2	6	409329	409334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781142
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8596	NC_015850	CAG	2	6	409402	409407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781142
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8600	NC_015850	CG	3	6	409522	409527	0 %	0 %	50 %	50 %	340781142
8601	NC_015850	TCC	2	6	409547	409552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781142
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8607	NC_015850	GC	3	6	409703	409708	0 %	0 %	50 %	50 %	340781142
8608	NC_015850	CAA	2	6	409723	409728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781142
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8612	NC_015850	TCG	4	12	409874	409885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781142
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8619	NC_015850	GATG	2	8	410210	410217	25 %	25 %	50 %	0 %	340781143
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8989	NC_015850	TGGAGC	2	12	427207	427218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340781157
8990	NC_015850	GCGG	2	8	427223	427230	0 %	0 %	75 %	25 %	340781157
8991	NC_015850	GCC	2	6	427245	427250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781157
8992	NC_015850	GT	3	6	427272	427277	0 %	50 %	50 %	0 %	340781157
8993	NC_015850	GCAG	2	8	427304	427311	25 %	0 %	50 %	25 %	340781157
8994	NC_015850	TCG	2	6	427366	427371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781157
8995	NC_015850	GTG	2	6	427372	427377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781157
8996	NC_015850	TCG	2	6	427444	427449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781157
8997	NC_015850	GGC	2	6	427565	427570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781157
8998	NC_015850	TGC	2	6	427574	427579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781157
8999	NC_015850	TGG	2	6	427633	427638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781157
9000	NC_015850	GCACC	2	10	427718	427727	20 %	0 %	20 %	60 %	340781157

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