MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_015850	GCT	2	6	359476	359481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781085
7502	NC_015850	TGG	2	6	359499	359504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781085
7503	NC_015850	AGC	3	9	359534	359542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781085
7504	NC_015850	GAT	2	6	359581	359586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781085
7505	NC_015850	GCCA	2	8	359600	359607	25 %	0 %	25 %	50 %	340781085
7506	NC_015850	TCG	2	6	359634	359639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781085
7507	NC_015850	GCC	2	6	359666	359671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781085
7508	NC_015850	TTC	2	6	359717	359722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781085
7509	NC_015850	CGA	2	6	359743	359748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781085
7510	NC_015850	CAT	2	6	359800	359805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781085
7511	NC_015850	GGA	2	6	359818	359823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781085
7512	NC_015850	GCC	2	6	359905	359910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781085
7513	NC_015850	CCG	2	6	360012	360017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781085
7514	NC_015850	GGC	2	6	360025	360030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781085
7515	NC_015850	GTAGCG	2	12	360042	360053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340781085
7516	NC_015850	GCG	2	6	360062	360067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781085
7517	NC_015850	CG	3	6	360074	360079	0 %	0 %	50 %	50 %	340781085
7518	NC_015850	CTG	2	6	360116	360121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781085
7519	NC_015850	CTG	2	6	360128	360133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781085
7520	NC_015850	GTT	2	6	360175	360180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781085
7521	NC_015850	GGC	2	6	360188	360193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781085
7522	NC_015850	CTAC	2	8	360321	360328	25 %	25 %	0 %	50 %	340781085
7523	NC_015850	CGG	2	6	360336	360341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781085
7524	NC_015850	GCG	2	6	360402	360407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781085
7525	NC_015850	TGC	2	6	360426	360431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781085
7526	NC_015850	TGA	2	6	360474	360479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781085
7527	NC_015850	GT	3	6	360489	360494	0 %	50 %	50 %	0 %	340781085
7528	NC_015850	CGA	2	6	360504	360509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781085
7529	NC_015850	GGA	2	6	360526	360531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781085
7530	NC_015850	A	6	6	360537	360542	100 %	0 %	0 %	0 %	340781085
7531	NC_015850	CGGGG	2	10	360584	360593	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7532	NC_015850	CG	3	6	360815	360820	0 %	0 %	50 %	50 %	340781086
7533	NC_015850	GC	3	6	360962	360967	0 %	0 %	50 %	50 %	340781086
7534	NC_015850	CGA	2	6	361021	361026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781086
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7536	NC_015850	GGGT	2	8	361069	361076	0 %	25 %	75 %	0 %	340781086
7537	NC_015850	GGA	2	6	361141	361146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781086
7538	NC_015850	TGG	2	6	361152	361157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781086
7539	NC_015850	GCA	2	6	361177	361182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781086
7540	NC_015850	CCT	2	6	361312	361317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781086
7541	NC_015850	CGG	2	6	361369	361374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781086
7542	NC_015850	AGG	2	6	361410	361415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781086
7543	NC_015850	CGA	2	6	361549	361554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781086
7544	NC_015850	CTGG	2	8	361664	361671	0 %	25 %	50 %	25 %	340781086
7545	NC_015850	TCG	2	6	361683	361688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781086
7546	NC_015850	GCCTGC	2	12	361710	361721	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340781086
7547	NC_015850	GCC	2	6	361722	361727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781086
7548	NC_015850	TGGC	2	8	361753	361760	0 %	25 %	50 %	25 %	340781086
7549	NC_015850	GGA	2	6	361768	361773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781086
7550	NC_015850	G	6	6	361863	361868	0 %	0 %	100 %	0 %	340781086
7551	NC_015850	CCG	2	6	361882	361887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781086
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7553	NC_015850	TCA	3	9	362178	362186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781087
7554	NC_015850	CCA	2	6	362226	362231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
7555	NC_015850	ACC	2	6	362276	362281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
7556	NC_015850	AGG	2	6	362303	362308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781087
7557	NC_015850	CGC	2	6	362370	362375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
7558	NC_015850	CCA	2	6	362376	362381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
7559	NC_015850	TGA	2	6	362397	362402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781087
7560	NC_015850	GTC	2	6	362435	362440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
7561	NC_015850	AGC	2	6	362459	362464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
7562	NC_015850	GAC	2	6	362476	362481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
7563	NC_015850	GC	3	6	362491	362496	0 %	0 %	50 %	50 %	340781087
7564	NC_015850	GCC	2	6	362524	362529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
7565	NC_015850	CGG	2	6	362548	362553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
7566	NC_015850	TCG	2	6	362588	362593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
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7569	NC_015850	CG	3	6	362788	362793	0 %	0 %	50 %	50 %	340781087
7570	NC_015850	AGG	2	6	362795	362800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781087
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7574	NC_015850	CGC	2	6	363186	363191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
7575	NC_015850	TCG	2	6	363263	363268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
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7577	NC_015850	GCA	2	6	363582	363587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
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7579	NC_015850	CAG	2	6	363703	363708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
7580	NC_015850	GACGAT	2	12	363718	363729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340781087
7581	NC_015850	TACC	2	8	363732	363739	25 %	25 %	0 %	50 %	340781087
7582	NC_015850	TGC	2	6	363754	363759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
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7588	NC_015850	CCA	2	6	363885	363890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
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7591	NC_015850	GC	3	6	364013	364018	0 %	0 %	50 %	50 %	340781087
7592	NC_015850	AGT	2	6	364037	364042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781087
7593	NC_015850	CAC	3	9	364045	364053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
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7596	NC_015850	CCA	2	6	364104	364109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
7597	NC_015850	CGA	3	9	364227	364235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
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7599	NC_015850	TCC	2	6	364295	364300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
7600	NC_015850	CGA	2	6	364350	364355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
7601	NC_015850	GTC	2	6	364369	364374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
7602	NC_015850	CTC	2	6	364423	364428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
7603	NC_015850	CGCCC	2	10	364433	364442	0 %	0 %	20 %	80 %	340781087
7604	NC_015850	CGT	2	6	364443	364448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
7605	NC_015850	TTG	2	6	364454	364459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781087
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7609	NC_015850	G	6	6	364680	364685	0 %	0 %	100 %	0 %	340781087
7610	NC_015850	C	7	7	364702	364708	0 %	0 %	0 %	100 %	340781087
7611	NC_015850	CGG	2	6	364716	364721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
7612	NC_015850	CTG	2	6	364759	364764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
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7616	NC_015850	GAT	2	6	364936	364941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781087
7617	NC_015850	GCG	2	6	364950	364955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
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7621	NC_015850	CGCC	2	8	365129	365136	0 %	0 %	25 %	75 %	340781088
7622	NC_015850	GC	3	6	365162	365167	0 %	0 %	50 %	50 %	340781088
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7984	NC_015850	GTC	2	6	380880	380885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781106
7985	NC_015850	CTGG	2	8	380904	380911	0 %	25 %	50 %	25 %	340781106
7986	NC_015850	GGT	2	6	380946	380951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781106
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7988	NC_015850	CGTGGC	2	12	381008	381019	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340781106
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7990	NC_015850	TGGACG	2	12	381073	381084	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340781106
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7993	NC_015850	CAC	2	6	381221	381226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781106
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7996	NC_015850	GTG	2	6	381372	381377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7997	NC_015850	CG	5	10	381392	381401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7998	NC_015850	GC	3	6	381476	381481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7999	NC_015850	GCC	2	6	381500	381505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781107
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