MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 44024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015850	CGA	2	6	361549	361554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781086
5502	NC_015850	TCG	2	6	361683	361688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781086
5503	NC_015850	GCC	2	6	361722	361727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781086
5504	NC_015850	GGA	2	6	361768	361773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781086
5505	NC_015850	CCG	2	6	361882	361887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781086
5506	NC_015850	ACC	3	9	362090	362098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5507	NC_015850	TCA	3	9	362178	362186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781087
5508	NC_015850	CCA	2	6	362226	362231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5509	NC_015850	ACC	2	6	362276	362281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5510	NC_015850	AGG	2	6	362303	362308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781087
5511	NC_015850	CGC	2	6	362370	362375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
5512	NC_015850	CCA	2	6	362376	362381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5513	NC_015850	TGA	2	6	362397	362402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781087
5514	NC_015850	GTC	2	6	362435	362440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5515	NC_015850	AGC	2	6	362459	362464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5516	NC_015850	GAC	2	6	362476	362481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5517	NC_015850	GCC	2	6	362524	362529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
5518	NC_015850	CGG	2	6	362548	362553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5519	NC_015850	TCG	2	6	362588	362593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5520	NC_015850	CCG	2	6	362634	362639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
5521	NC_015850	AGG	2	6	362795	362800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781087
5522	NC_015850	TGC	2	6	362956	362961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5523	NC_015850	CAC	2	6	363055	363060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5524	NC_015850	GGC	2	6	363163	363168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5525	NC_015850	CGC	2	6	363186	363191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
5526	NC_015850	TCG	2	6	363263	363268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5527	NC_015850	TCC	2	6	363563	363568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
5528	NC_015850	GCA	2	6	363582	363587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
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5530	NC_015850	TGC	2	6	363754	363759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5531	NC_015850	GGA	2	6	363777	363782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781087
5532	NC_015850	GGT	2	6	363846	363851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781087
5533	NC_015850	CCA	4	12	363864	363875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5534	NC_015850	CGG	2	6	363876	363881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5535	NC_015850	CCA	2	6	363885	363890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5536	NC_015850	CCG	2	6	363914	363919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
5537	NC_015850	CCA	2	6	363999	364004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5538	NC_015850	AGT	2	6	364037	364042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781087
5539	NC_015850	CAC	3	9	364045	364053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5540	NC_015850	AGC	2	6	364070	364075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5541	NC_015850	CCA	2	6	364104	364109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5542	NC_015850	CGA	3	9	364227	364235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5543	NC_015850	TCC	2	6	364295	364300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
5544	NC_015850	CGA	2	6	364350	364355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5545	NC_015850	GTC	2	6	364369	364374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5546	NC_015850	CTC	2	6	364423	364428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
5547	NC_015850	CGT	2	6	364443	364448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5548	NC_015850	TTG	2	6	364454	364459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781087
5549	NC_015850	CCA	2	6	364550	364555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5550	NC_015850	GAT	2	6	364603	364608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781087
5551	NC_015850	GCG	2	6	364631	364636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5552	NC_015850	CGG	2	6	364716	364721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5553	NC_015850	CTG	2	6	364759	364764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5554	NC_015850	CCT	2	6	364788	364793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
5555	NC_015850	CAG	2	6	364864	364869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5556	NC_015850	TCC	2	6	364907	364912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
5557	NC_015850	GAT	2	6	364936	364941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781087
5558	NC_015850	GCG	2	6	364950	364955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5559	NC_015850	AGC	3	9	365024	365032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5560	NC_015850	GGC	2	6	365059	365064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5561	NC_015850	CGG	3	9	365105	365113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781088
5562	NC_015850	CAC	2	6	365172	365177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781088
5563	NC_015850	CGA	2	6	365534	365539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781088
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5565	NC_015850	GCA	2	6	365621	365626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781088
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5567	NC_015850	CGG	3	9	365705	365713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781088
5568	NC_015850	GGC	2	6	365717	365722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781088
5569	NC_015850	TGT	2	6	365725	365730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781088
5570	NC_015850	ATG	2	6	365746	365751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781088
5571	NC_015850	TCG	2	6	365770	365775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781088
5572	NC_015850	GGC	2	6	365804	365809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781088
5573	NC_015850	GCT	2	6	365889	365894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781088
5574	NC_015850	GCT	2	6	365937	365942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781088
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5577	NC_015850	GAC	2	6	366158	366163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781088
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5579	NC_015850	TGG	2	6	366277	366282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781089
5580	NC_015850	GAC	2	6	366315	366320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781089
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5583	NC_015850	TGC	2	6	366474	366479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781089
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5589	NC_015850	AGC	2	6	366984	366989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781090
5590	NC_015850	GGC	2	6	367025	367030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781090
5591	NC_015850	CGA	2	6	367279	367284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781090
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5598	NC_015850	TGG	2	6	367639	367644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781090
5599	NC_015850	TCT	2	6	367652	367657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_015850	GGT	2	6	367667	367672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_015850	GAC	2	6	367801	367806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781091
5602	NC_015850	GCC	2	6	367823	367828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781091
5603	NC_015850	GTG	2	6	367832	367837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781091
5604	NC_015850	CTC	2	6	367852	367857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781091
5605	NC_015850	CGG	2	6	367884	367889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781091
5606	NC_015850	CCT	2	6	367929	367934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781091
5607	NC_015850	AGG	2	6	367949	367954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781091
5608	NC_015850	TGT	2	6	367958	367963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781091
5609	NC_015850	CGC	2	6	367994	367999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781091
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5614	NC_015850	GTG	2	6	368128	368133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781092
5615	NC_015850	CGG	2	6	368232	368237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781092
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5619	NC_015850	CGA	2	6	368538	368543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781093
5620	NC_015850	CCG	2	6	368562	368567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781093
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5657	NC_015850	TCC	2	6	370658	370663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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