MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_015850	CAG	2	6	2854384	2854389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783535
59002	NC_015850	CAA	2	6	2854429	2854434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783535
59003	NC_015850	GC	3	6	2854456	2854461	0 %	0 %	50 %	50 %	340783535
59004	NC_015850	GCG	2	6	2854660	2854665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783535
59005	NC_015850	GCA	2	6	2854682	2854687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783535
59006	NC_015850	GGC	2	6	2854714	2854719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783535
59007	NC_015850	GTG	2	6	2854742	2854747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783535
59008	NC_015850	GGA	2	6	2854750	2854755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783535
59009	NC_015850	TCG	2	6	2854764	2854769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783535
59010	NC_015850	ACC	2	6	2854865	2854870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783535
59011	NC_015850	GAC	2	6	2854886	2854891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783535
59012	NC_015850	CTG	2	6	2854910	2854915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783535
59013	NC_015850	GAA	2	6	2854925	2854930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783535
59014	NC_015850	ACG	3	9	2854932	2854940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783535
59015	NC_015850	CGA	2	6	2854972	2854977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783535
59016	NC_015850	GGC	2	6	2854996	2855001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783535
59017	NC_015850	CAT	2	6	2855029	2855034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783536
59018	NC_015850	CT	3	6	2855050	2855055	0 %	50 %	0 %	50 %	340783536
59019	NC_015850	TGG	2	6	2855127	2855132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783536
59020	NC_015850	CTG	2	6	2855177	2855182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783536
59021	NC_015850	GGC	2	6	2855212	2855217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783536
59022	NC_015850	TGG	2	6	2855289	2855294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783536
59023	NC_015850	CCT	2	6	2855296	2855301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783536
59024	NC_015850	AAG	2	6	2855345	2855350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783536
59025	NC_015850	GCG	2	6	2855361	2855366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783536
59026	NC_015850	CGC	2	6	2855371	2855376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783536
59027	NC_015850	GCA	2	6	2855389	2855394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783536
59028	NC_015850	TTG	2	6	2855408	2855413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783536
59029	NC_015850	GCC	2	6	2855441	2855446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783536
59030	NC_015850	CG	4	8	2855490	2855497	0 %	0 %	50 %	50 %	340783536
59031	NC_015850	GAT	2	6	2855520	2855525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783536
59032	NC_015850	GTGGCT	2	12	2855565	2855576	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340783537
59033	NC_015850	CTT	2	6	2855622	2855627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783537
59034	NC_015850	GCC	2	6	2855647	2855652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783537
59035	NC_015850	TGG	2	6	2855672	2855677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783537
59036	NC_015850	AT	3	6	2855729	2855734	50 %	50 %	0 %	0 %	340783537
59037	NC_015850	TCA	2	6	2855744	2855749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783537
59038	NC_015850	CGG	2	6	2855763	2855768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783537
59039	NC_015850	GCCT	2	8	2855782	2855789	0 %	25 %	25 %	50 %	340783537
59040	NC_015850	AGC	2	6	2855807	2855812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783537
59041	NC_015850	GC	3	6	2855814	2855819	0 %	0 %	50 %	50 %	340783537
59042	NC_015850	GCGATG	2	12	2855828	2855839	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340783537
59043	NC_015850	GGGT	2	8	2855864	2855871	0 %	25 %	75 %	0 %	340783537
59044	NC_015850	CCG	2	6	2855879	2855884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783537
59045	NC_015850	GACG	2	8	2856003	2856010	25 %	0 %	50 %	25 %	340783537
59046	NC_015850	CG	3	6	2856084	2856089	0 %	0 %	50 %	50 %	340783537
59047	NC_015850	C	8	8	2856119	2856126	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59048	NC_015850	GC	3	6	2856244	2856249	0 %	0 %	50 %	50 %	340783538
59049	NC_015850	GCG	2	6	2856293	2856298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783538
59050	NC_015850	TGT	2	6	2856317	2856322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783538
59051	NC_015850	CA	3	6	2856356	2856361	50 %	0 %	0 %	50 %	340783538
59052	NC_015850	GCC	2	6	2856433	2856438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783538
59053	NC_015850	GTG	2	6	2856502	2856507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783538
59054	NC_015850	GCC	2	6	2856597	2856602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783538
59055	NC_015850	CCA	2	6	2856620	2856625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783538
59056	NC_015850	CAC	2	6	2856647	2856652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783538
59057	NC_015850	CGA	2	6	2856699	2856704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783538
59058	NC_015850	GCG	2	6	2856757	2856762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783538
59059	NC_015850	CG	3	6	2856777	2856782	0 %	0 %	50 %	50 %	340783538
59060	NC_015850	C	6	6	2856797	2856802	0 %	0 %	0 %	100 %	340783538
59061	NC_015850	CTG	2	6	2856817	2856822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783538
59062	NC_015850	CGA	2	6	2856867	2856872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783538
59063	NC_015850	GCT	2	6	2856942	2856947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783538
59064	NC_015850	GCAG	2	8	2856948	2856955	25 %	0 %	50 %	25 %	340783538
59065	NC_015850	CGTA	2	8	2857074	2857081	25 %	25 %	25 %	25 %	340783538
59066	NC_015850	CGC	2	6	2857082	2857087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783538
59067	NC_015850	ATC	2	6	2857203	2857208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59068	NC_015850	TAT	2	6	2857220	2857225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783539
59069	NC_015850	CGG	2	6	2857240	2857245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783539
59070	NC_015850	CTG	2	6	2857409	2857414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783539
59071	NC_015850	T	6	6	2857457	2857462	0 %	100 %	0 %	0 %	340783539
59072	NC_015850	AGG	2	6	2857467	2857472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783539
59073	NC_015850	GCC	3	9	2857628	2857636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783540
59074	NC_015850	GTG	2	6	2857679	2857684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783540
59075	NC_015850	GCG	2	6	2857806	2857811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783540
59076	NC_015850	CAG	2	6	2857832	2857837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783540
59077	NC_015850	CCGGGG	2	12	2857863	2857874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783540
59078	NC_015850	GC	3	6	2857922	2857927	0 %	0 %	50 %	50 %	340783540
59079	NC_015850	CG	3	6	2857948	2857953	0 %	0 %	50 %	50 %	340783540
59080	NC_015850	GCT	2	6	2858011	2858016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783540
59081	NC_015850	CATC	2	8	2858019	2858026	25 %	25 %	0 %	50 %	340783540
59082	NC_015850	TCG	2	6	2858027	2858032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783540
59083	NC_015850	CTG	2	6	2858051	2858056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783540
59084	NC_015850	CAT	2	6	2858071	2858076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783540
59085	NC_015850	GAC	2	6	2858077	2858082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783540
59086	NC_015850	CAG	2	6	2858105	2858110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783540
59087	NC_015850	CGC	2	6	2858176	2858181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783540
59088	NC_015850	CTT	2	6	2858194	2858199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783540
59089	NC_015850	ACT	2	6	2858319	2858324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783541
59090	NC_015850	CGT	2	6	2858337	2858342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783541
59091	NC_015850	CTG	2	6	2858368	2858373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783541
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59094	NC_015850	GC	3	6	2858495	2858500	0 %	0 %	50 %	50 %	340783541
59095	NC_015850	GTC	2	6	2858557	2858562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783541
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59099	NC_015850	CGC	2	6	2858762	2858767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783542
59100	NC_015850	TGG	2	6	2858773	2858778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783542
59101	NC_015850	TCA	2	6	2858842	2858847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783542
59102	NC_015850	CCG	2	6	2858851	2858856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783542
59103	NC_015850	GCA	2	6	2858865	2858870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783542
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59105	NC_015850	GCCC	2	8	2858921	2858928	0 %	0 %	25 %	75 %	340783542
59106	NC_015850	GCACAG	2	12	2858994	2859005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783542
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59113	NC_015850	GCG	2	6	2859240	2859245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783542
59114	NC_015850	GCG	2	6	2859255	2859260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783542
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59116	NC_015850	AAG	2	6	2859309	2859314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783542
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59232	NC_015850	TCT	2	6	2865863	2865868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783550
59233	NC_015850	TGG	2	6	2865869	2865874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783550
59234	NC_015850	CCTG	2	8	2865938	2865945	0 %	25 %	25 %	50 %	340783550
59235	NC_015850	GCG	2	6	2865953	2865958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783550
59236	NC_015850	CGA	2	6	2865970	2865975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783550
59237	NC_015850	GTC	2	6	2866000	2866005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783550
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59239	NC_015850	CTG	2	6	2866102	2866107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783550
59240	NC_015850	CGA	2	6	2866182	2866187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783550
59241	NC_015850	TGG	2	6	2866268	2866273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783550
59242	NC_015850	CCG	2	6	2866416	2866421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783550
59243	NC_015850	CCTCGA	2	12	2866473	2866484	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340783550
59244	NC_015850	CATGGT	2	12	2866497	2866508	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340783550
59245	NC_015850	TGC	2	6	2866604	2866609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783550
59246	NC_015850	TGCCGC	2	12	2866611	2866622	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340783550
59247	NC_015850	CAT	2	6	2866695	2866700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783550
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59249	NC_015850	CGC	2	6	2866795	2866800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59250	NC_015850	GCT	2	6	2866915	2866920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783551
59251	NC_015850	GGC	2	6	2866940	2866945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783551
59252	NC_015850	CTG	2	6	2866973	2866978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783551
59253	NC_015850	CG	3	6	2866986	2866991	0 %	0 %	50 %	50 %	340783551
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59267	NC_015850	CCA	2	6	2867620	2867625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783552
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59290	NC_015850	T	6	6	2868499	2868504	0 %	100 %	0 %	0 %	340783552
59291	NC_015850	GCC	2	6	2868545	2868550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783552
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59294	NC_015850	GTGAG	2	10	2868786	2868795	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59295	NC_015850	A	6	6	2868844	2868849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59296	NC_015850	TGA	2	6	2868946	2868951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783553
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59300	NC_015850	GGCC	2	8	2869075	2869082	0 %	0 %	50 %	50 %	340783553
59301	NC_015850	CGCC	2	8	2869088	2869095	0 %	0 %	25 %	75 %	340783553
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59337	NC_015850	GCGGT	2	10	2870604	2870613	0 %	20 %	60 %	20 %	340783554
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59339	NC_015850	GC	3	6	2870627	2870632	0 %	0 %	50 %	50 %	340783554
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59346	NC_015850	GCC	2	6	2871007	2871012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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59348	NC_015850	GTG	2	6	2871117	2871122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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