MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_015850	TCC	2	6	2809019	2809024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783492
58002	NC_015850	C	6	6	2809061	2809066	0 %	0 %	0 %	100 %	340783492
58003	NC_015850	GCC	2	6	2809067	2809072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783492
58004	NC_015850	GCA	2	6	2809131	2809136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783492
58005	NC_015850	TGT	2	6	2809155	2809160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783492
58006	NC_015850	CCG	2	6	2809213	2809218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783492
58007	NC_015850	GCA	2	6	2809254	2809259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783492
58008	NC_015850	TGA	2	6	2809308	2809313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783492
58009	NC_015850	CGG	2	6	2809332	2809337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783492
58010	NC_015850	CCA	2	6	2809353	2809358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783492
58011	NC_015850	ACG	2	6	2809403	2809408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783492
58012	NC_015850	TTC	2	6	2809424	2809429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783492
58013	NC_015850	CG	3	6	2809435	2809440	0 %	0 %	50 %	50 %	340783492
58014	NC_015850	GGC	2	6	2809453	2809458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783492
58015	NC_015850	GGC	2	6	2809495	2809500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783492
58016	NC_015850	GCC	2	6	2809540	2809545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783492
58017	NC_015850	GCGG	2	8	2809552	2809559	0 %	0 %	75 %	25 %	340783492
58018	NC_015850	CTC	2	6	2809617	2809622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58019	NC_015850	ACG	2	6	2809638	2809643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783493
58020	NC_015850	GCA	2	6	2809650	2809655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783493
58021	NC_015850	GAG	2	6	2809760	2809765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783493
58022	NC_015850	CAC	2	6	2809769	2809774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783493
58023	NC_015850	CAA	2	6	2809781	2809786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783493
58024	NC_015850	CAC	2	6	2809787	2809792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783493
58025	NC_015850	CCA	2	6	2809801	2809806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783493
58026	NC_015850	CTC	2	6	2809870	2809875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58027	NC_015850	TAAC	2	8	2809878	2809885	50 %	25 %	0 %	25 %	340783494
58028	NC_015850	CTG	2	6	2809909	2809914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783494
58029	NC_015850	GAGCG	2	10	2809995	2810004	20 %	0 %	60 %	20 %	340783494
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58031	NC_015850	CGATC	2	10	2810216	2810225	20 %	20 %	20 %	40 %	340783494
58032	NC_015850	GCT	2	6	2810282	2810287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783494
58033	NC_015850	GCG	2	6	2810358	2810363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783494
58034	NC_015850	CAC	2	6	2810370	2810375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783494
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58037	NC_015850	GGCG	2	8	2810572	2810579	0 %	0 %	75 %	25 %	340783495
58038	NC_015850	TGGA	2	8	2810603	2810610	25 %	25 %	50 %	0 %	340783495
58039	NC_015850	TCG	2	6	2810639	2810644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783495
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58042	NC_015850	GGC	2	6	2810713	2810718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783495
58043	NC_015850	CG	3	6	2810739	2810744	0 %	0 %	50 %	50 %	340783495
58044	NC_015850	AGC	2	6	2810780	2810785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783495
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58047	NC_015850	GCA	2	6	2810903	2810908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783495
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58049	NC_015850	CGT	2	6	2811069	2811074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783495
58050	NC_015850	TCG	2	6	2811092	2811097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783495
58051	NC_015850	CGG	4	12	2811117	2811128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783495
58052	NC_015850	CGG	2	6	2811141	2811146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783495
58053	NC_015850	GAA	2	6	2811169	2811174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783495
58054	NC_015850	GGC	2	6	2811239	2811244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783495
58055	NC_015850	GAC	2	6	2811256	2811261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783495
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58060	NC_015850	GCGA	2	8	2811526	2811533	25 %	0 %	50 %	25 %	340783496
58061	NC_015850	CG	3	6	2811637	2811642	0 %	0 %	50 %	50 %	340783496
58062	NC_015850	GTC	2	6	2811680	2811685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783496
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58067	NC_015850	TCCGC	2	10	2811807	2811816	0 %	20 %	20 %	60 %	340783496
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58073	NC_015850	GGA	2	6	2812163	2812168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783496
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58081	NC_015850	C	6	6	2812392	2812397	0 %	0 %	0 %	100 %	340783496
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58101	NC_015850	CGG	2	6	2813724	2813729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783497
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58104	NC_015850	T	7	7	2813784	2813790	0 %	100 %	0 %	0 %	340783497
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58108	NC_015850	CG	4	8	2813960	2813967	0 %	0 %	50 %	50 %	340783497
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58112	NC_015850	AT	3	6	2814103	2814108	50 %	50 %	0 %	0 %	340783497
58113	NC_015850	GGAA	2	8	2814208	2814215	50 %	0 %	50 %	0 %	340783497
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58117	NC_015850	TTG	2	6	2814442	2814447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783497
58118	NC_015850	GAG	2	6	2814474	2814479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783497
58119	NC_015850	GGC	2	6	2814492	2814497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783497
58120	NC_015850	GAG	2	6	2814504	2814509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783497
58121	NC_015850	CGA	2	6	2814515	2814520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783497
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58125	NC_015850	CTG	2	6	2814604	2814609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783497
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58127	NC_015850	GCT	2	6	2814715	2814720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783498
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58133	NC_015850	CGC	2	6	2814941	2814946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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58141	NC_015850	ACA	2	6	2815375	2815380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58143	NC_015850	TGG	2	6	2815428	2815433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783500
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58156	NC_015850	TCCT	2	8	2816142	2816149	0 %	50 %	0 %	50 %	340783501
58157	NC_015850	GC	3	6	2816164	2816169	0 %	0 %	50 %	50 %	340783501
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58173	NC_015850	TA	3	6	2816771	2816776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58174	NC_015850	T	6	6	2816803	2816808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58175	NC_015850	AGCA	2	8	2816868	2816875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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58200	NC_015850	AGG	2	6	2817813	2817818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783502
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58206	NC_015850	G	6	6	2817971	2817976	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58207	NC_015850	GC	3	6	2818038	2818043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58208	NC_015850	CTG	2	6	2818069	2818074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783503
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58224	NC_015850	CCA	2	6	2818532	2818537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783503
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58230	NC_015850	ATCCGG	2	12	2818748	2818759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783503
58231	NC_015850	GC	3	6	2818762	2818767	0 %	0 %	50 %	50 %	340783503
58232	NC_015850	GGC	2	6	2818770	2818775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783503
58233	NC_015850	GCA	3	9	2818791	2818799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783503
58234	NC_015850	GGC	2	6	2818926	2818931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783503
58235	NC_015850	CGG	2	6	2818943	2818948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783503
58236	NC_015850	GC	3	6	2818956	2818961	0 %	0 %	50 %	50 %	340783503
58237	NC_015850	ACC	2	6	2818965	2818970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783503
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58342	NC_015850	TGGG	2	8	2823599	2823606	0 %	25 %	75 %	0 %	340783508
58343	NC_015850	TCC	2	6	2823627	2823632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783508
58344	NC_015850	GCG	3	9	2823643	2823651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783508
58345	NC_015850	GATC	2	8	2823667	2823674	25 %	25 %	25 %	25 %	340783508
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58350	NC_015850	TCG	2	6	2823928	2823933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783508
58351	NC_015850	CCG	2	6	2823943	2823948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783508
58352	NC_015850	CGC	2	6	2824048	2824053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783508
58353	NC_015850	GC	3	6	2824052	2824057	0 %	0 %	50 %	50 %	340783508
58354	NC_015850	GCTA	2	8	2824081	2824088	25 %	25 %	25 %	25 %	340783508
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58466	NC_015850	CGC	3	9	2829492	2829500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783513
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58495	NC_015850	GGC	2	6	2830889	2830894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783514
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