MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56002	NC_015850	CGA	2	6	2714962	2714967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783405
56003	NC_015850	TCT	2	6	2714977	2714982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783405
56004	NC_015850	CTTGC	2	10	2715026	2715035	0 %	40 %	20 %	40 %	340783405
56005	NC_015850	TGG	2	6	2715052	2715057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783405
56006	NC_015850	TGG	2	6	2715084	2715089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783405
56007	NC_015850	GC	3	6	2715272	2715277	0 %	0 %	50 %	50 %	340783406
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56010	NC_015850	CCG	2	6	2715377	2715382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783406
56011	NC_015850	GTC	2	6	2715524	2715529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783406
56012	NC_015850	TGC	2	6	2715559	2715564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783406
56013	NC_015850	CAG	2	6	2715576	2715581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783406
56014	NC_015850	TGGA	2	8	2715591	2715598	25 %	25 %	50 %	0 %	340783406
56015	NC_015850	CG	4	8	2715601	2715608	0 %	0 %	50 %	50 %	340783406
56016	NC_015850	CGG	2	6	2715657	2715662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783406
56017	NC_015850	GC	3	6	2715711	2715716	0 %	0 %	50 %	50 %	340783406
56018	NC_015850	GTG	2	6	2715751	2715756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783406
56019	NC_015850	GCG	2	6	2715913	2715918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783406
56020	NC_015850	CCG	2	6	2715986	2715991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783406
56021	NC_015850	GGT	2	6	2716001	2716006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783406
56022	NC_015850	GGC	2	6	2716088	2716093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783406
56023	NC_015850	GA	3	6	2716132	2716137	50 %	0 %	50 %	0 %	340783406
56024	NC_015850	GCA	2	6	2716151	2716156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783407
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56026	NC_015850	TCG	2	6	2716208	2716213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783407
56027	NC_015850	GC	3	6	2716219	2716224	0 %	0 %	50 %	50 %	340783407
56028	NC_015850	ATC	2	6	2716243	2716248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783407
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56053	NC_015850	CGG	5	15	2717521	2717535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783408
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56062	NC_015850	GCA	3	9	2717893	2717901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783408
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56071	NC_015850	GACCT	2	10	2718272	2718281	20 %	20 %	20 %	40 %	340783408
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56083	NC_015850	GCA	3	9	2718684	2718692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56084	NC_015850	G	7	7	2718695	2718701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56085	NC_015850	AGC	2	6	2718707	2718712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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56087	NC_015850	GGCCA	2	10	2718893	2718902	20 %	0 %	40 %	40 %	340783409
56088	NC_015850	AC	3	6	2718967	2718972	50 %	0 %	0 %	50 %	340783409
56089	NC_015850	GCC	2	6	2718984	2718989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783409
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56092	NC_015850	TCC	2	6	2719029	2719034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783409
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56102	NC_015850	ACCC	2	8	2719775	2719782	25 %	0 %	0 %	75 %	340783409
56103	NC_015850	ACCA	2	8	2719880	2719887	50 %	0 %	0 %	50 %	340783409
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56116	NC_015850	TCA	2	6	2720622	2720627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783409
56117	NC_015850	CGC	3	9	2720635	2720643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783409
56118	NC_015850	ACG	2	6	2720649	2720654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783409
56119	NC_015850	TC	3	6	2720740	2720745	0 %	50 %	0 %	50 %	340783409
56120	NC_015850	CGG	2	6	2720760	2720765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783409
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56122	NC_015850	ATG	2	6	2720801	2720806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783409
56123	NC_015850	CTT	2	6	2720878	2720883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783409
56124	NC_015850	GAG	2	6	2720903	2720908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783409
56125	NC_015850	GGC	2	6	2720950	2720955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783409
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56127	NC_015850	CAG	2	6	2721088	2721093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783409
56128	NC_015850	CCG	2	6	2721171	2721176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783409
56129	NC_015850	GCA	2	6	2721201	2721206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783409
56130	NC_015850	GGCC	2	8	2721295	2721302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56131	NC_015850	GAG	2	6	2721310	2721315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56132	NC_015850	TGG	2	6	2721434	2721439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783410
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56134	NC_015850	CTG	2	6	2721458	2721463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783410
56135	NC_015850	CG	3	6	2721492	2721497	0 %	0 %	50 %	50 %	340783410
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56140	NC_015850	CGG	3	9	2721804	2721812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783410
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56143	NC_015850	CCT	2	6	2721934	2721939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783410
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56147	NC_015850	GCCC	2	8	2722115	2722122	0 %	0 %	25 %	75 %	340783410
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56173	NC_015850	GGCGCG	2	12	2723307	2723318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783411
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56179	NC_015850	GCA	3	9	2723457	2723465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783411
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56181	NC_015850	ATCGC	2	10	2723492	2723501	20 %	20 %	20 %	40 %	340783411
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56184	NC_015850	GCC	3	9	2723644	2723652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783411
56185	NC_015850	GGC	2	6	2723661	2723666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783411
56186	NC_015850	GGA	2	6	2723667	2723672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783411
56187	NC_015850	GCA	2	6	2723677	2723682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783411
56188	NC_015850	GCCGA	2	10	2723687	2723696	20 %	0 %	40 %	40 %	340783411
56189	NC_015850	AGCGG	2	10	2723700	2723709	20 %	0 %	60 %	20 %	340783411
56190	NC_015850	GC	3	6	2723731	2723736	0 %	0 %	50 %	50 %	340783411
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56195	NC_015850	GC	3	6	2723887	2723892	0 %	0 %	50 %	50 %	340783411
56196	NC_015850	CGC	2	6	2723900	2723905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783411
56197	NC_015850	GCA	2	6	2723947	2723952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783411
56198	NC_015850	ATCGTC	2	12	2724025	2724036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340783411
56199	NC_015850	CAG	2	6	2724037	2724042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783411
56200	NC_015850	AGG	2	6	2724101	2724106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783411
56201	NC_015850	AT	3	6	2724213	2724218	50 %	50 %	0 %	0 %	340783411
56202	NC_015850	GATAC	2	10	2724244	2724253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56203	NC_015850	CTC	3	9	2724310	2724318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783412
56204	NC_015850	ACA	2	6	2724374	2724379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783412
56205	NC_015850	TCT	2	6	2724416	2724421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783412
56206	NC_015850	AAG	2	6	2724460	2724465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783412
56207	NC_015850	CGC	2	6	2724645	2724650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783412
56208	NC_015850	CTG	2	6	2724775	2724780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783412
56209	NC_015850	CGC	2	6	2724789	2724794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783412
56210	NC_015850	CAT	2	6	2724825	2724830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783412
56211	NC_015850	CCT	2	6	2724855	2724860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783412
56212	NC_015850	ACA	2	6	2724902	2724907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783412
56213	NC_015850	CAA	2	6	2724990	2724995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783412
56214	NC_015850	CGG	2	6	2725028	2725033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783412
56215	NC_015850	GGC	2	6	2725077	2725082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783412
56216	NC_015850	TCA	2	6	2725148	2725153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783412
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56218	NC_015850	CG	3	6	2725210	2725215	0 %	0 %	50 %	50 %	340783412
56219	NC_015850	GGC	2	6	2725279	2725284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783412
56220	NC_015850	GC	3	6	2725283	2725288	0 %	0 %	50 %	50 %	340783412
56221	NC_015850	CAC	2	6	2725296	2725301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783412
56222	NC_015850	CTA	2	6	2725308	2725313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783412
56223	NC_015850	CGC	2	6	2725316	2725321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783412
56224	NC_015850	GCT	2	6	2725325	2725330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783412
56225	NC_015850	CTG	2	6	2725408	2725413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783412
56226	NC_015850	CCG	2	6	2725498	2725503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783412
56227	NC_015850	GCG	2	6	2725504	2725509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783412
56228	NC_015850	AAG	2	6	2725513	2725518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783412
56229	NC_015850	ACGG	2	8	2725554	2725561	25 %	0 %	50 %	25 %	340783412
56230	NC_015850	GCCCGT	2	12	2725602	2725613	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340783412
56231	NC_015850	GCCG	2	8	2725653	2725660	0 %	0 %	50 %	50 %	340783412
56232	NC_015850	A	6	6	2725682	2725687	100 %	0 %	0 %	0 %	340783412
56233	NC_015850	TG	3	6	2725711	2725716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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56235	NC_015850	CGT	3	9	2725826	2725834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783413
56236	NC_015850	CCTG	2	8	2725937	2725944	0 %	25 %	25 %	50 %	340783413
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56262	NC_015850	GC	3	6	2727159	2727164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56263	NC_015850	G	6	6	2727184	2727189	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56264	NC_015850	TCCC	2	8	2727191	2727198	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56265	NC_015850	T	6	6	2727202	2727207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56266	NC_015850	CGT	2	6	2727275	2727280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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56345	NC_015850	CG	3	6	2730977	2730982	0 %	0 %	50 %	50 %	340783417
56346	NC_015850	GCC	2	6	2731013	2731018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783417
56347	NC_015850	TCCT	2	8	2731031	2731038	0 %	50 %	0 %	50 %	340783417
56348	NC_015850	GCG	2	6	2731184	2731189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783418
56349	NC_015850	CTG	2	6	2731198	2731203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783418
56350	NC_015850	GTG	2	6	2731264	2731269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783418
56351	NC_015850	CAG	2	6	2731300	2731305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783418
56352	NC_015850	TAT	2	6	2731358	2731363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783418
56353	NC_015850	CTG	2	6	2731402	2731407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783418
56354	NC_015850	GTG	2	6	2731615	2731620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783418
56355	NC_015850	CGG	2	6	2731630	2731635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783418
56356	NC_015850	GCA	2	6	2731637	2731642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783418
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56358	NC_015850	TCA	2	6	2731787	2731792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783419
56359	NC_015850	TCACCC	2	12	2731817	2731828	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	340783419
56360	NC_015850	CTGC	2	8	2731890	2731897	0 %	25 %	25 %	50 %	340783419
56361	NC_015850	CGA	3	9	2731902	2731910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783419
56362	NC_015850	TCA	2	6	2731934	2731939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783419
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56365	NC_015850	CCG	2	6	2731979	2731984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783419
56366	NC_015850	GC	3	6	2731995	2732000	0 %	0 %	50 %	50 %	340783419
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56369	NC_015850	GCC	3	9	2732131	2732139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783419
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56372	NC_015850	GCC	2	6	2732185	2732190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783419
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56374	NC_015850	GCA	2	6	2732278	2732283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783419
56375	NC_015850	CTG	3	9	2732371	2732379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783419
56376	NC_015850	GA	3	6	2732400	2732405	50 %	0 %	50 %	0 %	340783420
56377	NC_015850	GCGA	2	8	2732420	2732427	25 %	0 %	50 %	25 %	340783420
56378	NC_015850	AGG	2	6	2732481	2732486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783420
56379	NC_015850	CG	3	6	2732508	2732513	0 %	0 %	50 %	50 %	340783420
56380	NC_015850	CCG	2	6	2732515	2732520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783420
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56385	NC_015850	GCTG	2	8	2732779	2732786	0 %	25 %	50 %	25 %	340783420
56386	NC_015850	ACCC	2	8	2732879	2732886	25 %	0 %	0 %	75 %	340783420
56387	NC_015850	GC	3	6	2732890	2732895	0 %	0 %	50 %	50 %	340783420
56388	NC_015850	GGC	2	6	2732927	2732932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783420
56389	NC_015850	ATCC	2	8	2733070	2733077	25 %	25 %	0 %	50 %	340783420
56390	NC_015850	CG	3	6	2733104	2733109	0 %	0 %	50 %	50 %	340783420
56391	NC_015850	ATG	2	6	2733110	2733115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783420
56392	NC_015850	GAG	2	6	2733116	2733121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783420
56393	NC_015850	GC	3	6	2733131	2733136	0 %	0 %	50 %	50 %	340783420
56394	NC_015850	TCG	2	6	2733165	2733170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783420
56395	NC_015850	CAT	2	6	2733270	2733275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56396	NC_015850	AAG	2	6	2733358	2733363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783421
56397	NC_015850	GA	3	6	2733386	2733391	50 %	0 %	50 %	0 %	340783421
56398	NC_015850	CGC	2	6	2733417	2733422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783421
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56402	NC_015850	CAG	2	6	2733609	2733614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783421
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56408	NC_015850	CGG	2	6	2733876	2733881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783421
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56417	NC_015850	CAG	2	6	2734186	2734191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783421
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56428	NC_015850	CGA	2	6	2734593	2734598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783421
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56432	NC_015850	GCA	2	6	2734725	2734730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783421
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56441	NC_015850	CGGCAT	2	12	2735163	2735174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783421
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56443	NC_015850	CGA	2	6	2735289	2735294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783421
56444	NC_015850	CGC	2	6	2735352	2735357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783421
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56446	NC_015850	CG	3	6	2735477	2735482	0 %	0 %	50 %	50 %	340783421
56447	NC_015850	CTG	2	6	2735509	2735514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783421
56448	NC_015850	CGT	2	6	2735529	2735534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783421
56449	NC_015850	GTC	2	6	2735679	2735684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56450	NC_015850	GCC	2	6	2735807	2735812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783422
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56453	NC_015850	TTC	2	6	2736034	2736039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783422
56454	NC_015850	CCAGGG	2	12	2736096	2736107	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783422
56455	NC_015850	GCC	2	6	2736113	2736118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783422
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56457	NC_015850	CCAGAA	2	12	2736177	2736188	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	340783422
56458	NC_015850	GCCAC	2	10	2736232	2736241	20 %	0 %	20 %	60 %	340783422
56459	NC_015850	TCC	2	6	2736308	2736313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783422
56460	NC_015850	TGAT	2	8	2736338	2736345	25 %	50 %	25 %	0 %	340783422
56461	NC_015850	GCA	2	6	2736384	2736389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783422
56462	NC_015850	GCC	2	6	2736395	2736400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783422
56463	NC_015850	AGT	2	6	2736405	2736410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783422
56464	NC_015850	TCC	2	6	2736470	2736475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783422
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56466	NC_015850	CCGC	2	8	2736522	2736529	0 %	0 %	25 %	75 %	340783422
56467	NC_015850	GGC	2	6	2736530	2736535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783422
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56469	NC_015850	ACG	2	6	2736613	2736618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783422
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56473	NC_015850	A	7	7	2736777	2736783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56500	NC_015850	CTTTC	2	10	2737880	2737889	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

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