MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_015850	GGC	2	6	2651926	2651931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783341
54502	NC_015850	GCG	2	6	2651954	2651959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783341
54503	NC_015850	CCCAA	2	10	2652149	2652158	40 %	0 %	0 %	60 %	340783341
54504	NC_015850	CGA	2	6	2652201	2652206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783341
54505	NC_015850	ATGA	2	8	2652224	2652231	50 %	25 %	25 %	0 %	340783341
54506	NC_015850	CGA	2	6	2652235	2652240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783342
54507	NC_015850	C	6	6	2652244	2652249	0 %	0 %	0 %	100 %	340783342
54508	NC_015850	TCG	2	6	2652262	2652267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783342
54509	NC_015850	CGG	2	6	2652271	2652276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783342
54510	NC_015850	GCG	2	6	2652300	2652305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783342
54511	NC_015850	AGG	2	6	2652333	2652338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783342
54512	NC_015850	CGG	2	6	2652374	2652379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783342
54513	NC_015850	GGT	2	6	2652436	2652441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783342
54514	NC_015850	TGC	2	6	2652447	2652452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783342
54515	NC_015850	GCAT	2	8	2652468	2652475	25 %	25 %	25 %	25 %	340783342
54516	NC_015850	GCA	2	6	2652538	2652543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783342
54517	NC_015850	CCT	2	6	2652568	2652573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783342
54518	NC_015850	TGG	2	6	2652588	2652593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783342
54519	NC_015850	CGA	2	6	2652604	2652609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783342
54520	NC_015850	AGG	2	6	2652687	2652692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783342
54521	NC_015850	TA	3	6	2652774	2652779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54522	NC_015850	AAGC	2	8	2652786	2652793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54523	NC_015850	GGA	2	6	2652855	2652860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54524	NC_015850	CGG	2	6	2652899	2652904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783343
54525	NC_015850	CCG	2	6	2652910	2652915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783343
54526	NC_015850	CG	4	8	2652967	2652974	0 %	0 %	50 %	50 %	340783343
54527	NC_015850	TAC	2	6	2652984	2652989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783343
54528	NC_015850	TTC	2	6	2653056	2653061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783343
54529	NC_015850	GAG	2	6	2653143	2653148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783343
54530	NC_015850	CGGG	2	8	2653177	2653184	0 %	0 %	75 %	25 %	340783343
54531	NC_015850	GGA	2	6	2653280	2653285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783343
54532	NC_015850	CGG	2	6	2653318	2653323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783343
54533	NC_015850	TTC	2	6	2653422	2653427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783343
54534	NC_015850	TCCTT	2	10	2653531	2653540	0 %	60 %	0 %	40 %	340783343
54535	NC_015850	GGC	2	6	2653566	2653571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783343
54536	NC_015850	TGCCC	2	10	2653625	2653634	0 %	20 %	20 %	60 %	340783343
54537	NC_015850	CGG	2	6	2653655	2653660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783343
54538	NC_015850	GGT	2	6	2653688	2653693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783343
54539	NC_015850	TGC	2	6	2653772	2653777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783343
54540	NC_015850	CGG	2	6	2653795	2653800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783343
54541	NC_015850	GCG	2	6	2653825	2653830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783343
54542	NC_015850	GT	3	6	2653863	2653868	0 %	50 %	50 %	0 %	340783343
54543	NC_015850	TCG	2	6	2653870	2653875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783343
54544	NC_015850	TTC	2	6	2654017	2654022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54545	NC_015850	AGT	2	6	2654075	2654080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783344
54546	NC_015850	GCC	2	6	2654081	2654086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783344
54547	NC_015850	GCC	2	6	2654097	2654102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783344
54548	NC_015850	GGC	2	6	2654117	2654122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783344
54549	NC_015850	GGC	2	6	2654157	2654162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783344
54550	NC_015850	CAC	2	6	2654182	2654187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783344
54551	NC_015850	GCA	2	6	2654207	2654212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783344
54552	NC_015850	CGG	3	9	2654249	2654257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783344
54553	NC_015850	ACC	2	6	2654267	2654272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783344
54554	NC_015850	AGG	2	6	2654323	2654328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783344
54555	NC_015850	CAG	2	6	2654346	2654351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783344
54556	NC_015850	GGC	2	6	2654354	2654359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783344
54557	NC_015850	TCG	2	6	2654413	2654418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783344
54558	NC_015850	GC	3	6	2654431	2654436	0 %	0 %	50 %	50 %	340783344
54559	NC_015850	CAG	2	6	2654487	2654492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783344
54560	NC_015850	TCG	2	6	2654509	2654514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783344
54561	NC_015850	GC	3	6	2654524	2654529	0 %	0 %	50 %	50 %	340783344
54562	NC_015850	GC	3	6	2654532	2654537	0 %	0 %	50 %	50 %	340783344
54563	NC_015850	CAG	2	6	2654571	2654576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783344
54564	NC_015850	ACC	2	6	2654583	2654588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54565	NC_015850	CG	3	6	2654611	2654616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54566	NC_015850	CCA	2	6	2654709	2654714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783345
54567	NC_015850	GCT	2	6	2654733	2654738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783345
54568	NC_015850	CGG	2	6	2654762	2654767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783345
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54570	NC_015850	GCC	2	6	2654831	2654836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783345
54571	NC_015850	GCCC	2	8	2654863	2654870	0 %	0 %	25 %	75 %	340783345
54572	NC_015850	GGT	2	6	2654876	2654881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783345
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54575	NC_015850	GCC	3	9	2654930	2654938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783345
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54580	NC_015850	TGCG	2	8	2655060	2655067	0 %	25 %	50 %	25 %	340783345
54581	NC_015850	ACC	2	6	2655071	2655076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783345
54582	NC_015850	CCA	2	6	2655078	2655083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783345
54583	NC_015850	G	7	7	2655096	2655102	0 %	0 %	100 %	0 %	340783345
54584	NC_015850	CGCT	2	8	2655125	2655132	0 %	25 %	25 %	50 %	340783345
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54588	NC_015850	ACG	2	6	2655294	2655299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783346
54589	NC_015850	AGG	2	6	2655397	2655402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783346
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54591	NC_015850	AGATC	2	10	2655479	2655488	40 %	20 %	20 %	20 %	340783346
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54594	NC_015850	GA	3	6	2655592	2655597	50 %	0 %	50 %	0 %	340783346
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54601	NC_015850	GAA	2	6	2656101	2656106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783346
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54606	NC_015850	CG	3	6	2656260	2656265	0 %	0 %	50 %	50 %	340783346
54607	NC_015850	GGGT	2	8	2656280	2656287	0 %	25 %	75 %	0 %	340783346
54608	NC_015850	TTC	2	6	2656321	2656326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783346
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54616	NC_015850	CG	3	6	2656637	2656642	0 %	0 %	50 %	50 %	340783347
54617	NC_015850	CGC	2	6	2656681	2656686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783347
54618	NC_015850	CGA	2	6	2656699	2656704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783347
54619	NC_015850	CGAT	2	8	2656707	2656714	25 %	25 %	25 %	25 %	340783347
54620	NC_015850	GAC	2	6	2656751	2656756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783347
54621	NC_015850	TGA	2	6	2656903	2656908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783347
54622	NC_015850	T	6	6	2656913	2656918	0 %	100 %	0 %	0 %	340783347
54623	NC_015850	GGA	2	6	2656927	2656932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783347
54624	NC_015850	TGA	2	6	2656954	2656959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783347
54625	NC_015850	GCT	2	6	2656972	2656977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783347
54626	NC_015850	GGC	2	6	2656997	2657002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783347
54627	NC_015850	TGA	2	6	2657065	2657070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783347
54628	NC_015850	GCC	3	9	2657139	2657147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783347
54629	NC_015850	GC	3	6	2657183	2657188	0 %	0 %	50 %	50 %	340783347
54630	NC_015850	TTC	2	6	2657228	2657233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783347
54631	NC_015850	ATG	2	6	2657259	2657264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783347
54632	NC_015850	GGC	2	6	2657346	2657351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783347
54633	NC_015850	CGG	2	6	2657356	2657361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783347
54634	NC_015850	CAG	2	6	2657402	2657407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783347
54635	NC_015850	ACG	2	6	2657461	2657466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54636	NC_015850	TGC	2	6	2657524	2657529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783348
54637	NC_015850	CTG	2	6	2657580	2657585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783348
54638	NC_015850	GCA	2	6	2657604	2657609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783348
54639	NC_015850	CGTCTG	2	12	2657613	2657624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783348
54640	NC_015850	CAA	2	6	2657744	2657749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783348
54641	NC_015850	GTGG	2	8	2657777	2657784	0 %	25 %	75 %	0 %	340783348
54642	NC_015850	ATCG	2	8	2657790	2657797	25 %	25 %	25 %	25 %	340783348
54643	NC_015850	TCG	2	6	2657803	2657808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783348
54644	NC_015850	CGGG	2	8	2657829	2657836	0 %	0 %	75 %	25 %	340783348
54645	NC_015850	AGC	2	6	2657883	2657888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783348
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54649	NC_015850	GC	4	8	2658224	2658231	0 %	0 %	50 %	50 %	340783349
54650	NC_015850	CAT	2	6	2658232	2658237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783349
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54674	NC_015850	TGC	2	6	2659298	2659303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54675	NC_015850	CGG	3	9	2659338	2659346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783351
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54677	NC_015850	GAC	2	6	2659382	2659387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783351
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54682	NC_015850	CG	3	6	2659480	2659485	0 %	0 %	50 %	50 %	340783351
54683	NC_015850	CCA	2	6	2659573	2659578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783351
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54692	NC_015850	GGCC	2	8	2660063	2660070	0 %	0 %	50 %	50 %	340783352
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54700	NC_015850	GCCGA	2	10	2660517	2660526	20 %	0 %	40 %	40 %	340783352
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54702	NC_015850	AGCTG	2	10	2660571	2660580	20 %	20 %	40 %	20 %	340783352
54703	NC_015850	GGA	2	6	2660587	2660592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54704	NC_015850	CTG	2	6	2660687	2660692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783353
54705	NC_015850	ACC	2	6	2660825	2660830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783353
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54707	NC_015850	ACCC	2	8	2661047	2661054	25 %	0 %	0 %	75 %	340783353
54708	NC_015850	TCC	2	6	2661074	2661079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783353
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54711	NC_015850	CGGA	2	8	2661195	2661202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54712	NC_015850	GCAG	2	8	2661304	2661311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54713	NC_015850	GTTG	2	8	2661356	2661363	0 %	50 %	50 %	0 %	340783354
54714	NC_015850	TCA	2	6	2661383	2661388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783354
54715	NC_015850	ATT	2	6	2661434	2661439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783354
54716	NC_015850	CGA	2	6	2661450	2661455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783354
54717	NC_015850	TGCA	2	8	2661464	2661471	25 %	25 %	25 %	25 %	340783354
54718	NC_015850	CA	3	6	2661470	2661475	50 %	0 %	0 %	50 %	340783354
54719	NC_015850	CGC	2	6	2661488	2661493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783354
54720	NC_015850	GGT	2	6	2661537	2661542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783354
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54722	NC_015850	GATC	2	8	2661567	2661574	25 %	25 %	25 %	25 %	340783354
54723	NC_015850	GCCGAG	2	12	2661604	2661615	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783354
54724	NC_015850	GCGG	2	8	2661726	2661733	0 %	0 %	75 %	25 %	340783354
54725	NC_015850	GCA	2	6	2661744	2661749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783354
54726	NC_015850	CCA	2	6	2661785	2661790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783354
54727	NC_015850	GGC	3	9	2661798	2661806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783354
54728	NC_015850	GCC	2	6	2661892	2661897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783354
54729	NC_015850	ACC	2	6	2661928	2661933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783354
54730	NC_015850	GTCAAC	2	12	2661994	2662005	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340783354
54731	NC_015850	ACC	2	6	2662127	2662132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783354
54732	NC_015850	GTC	2	6	2662144	2662149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783354
54733	NC_015850	CTG	2	6	2662186	2662191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783354
54734	NC_015850	C	6	6	2662192	2662197	0 %	0 %	0 %	100 %	340783354
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54795	NC_015850	GC	3	6	2664794	2664799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54796	NC_015850	CT	3	6	2664821	2664826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54797	NC_015850	CCA	2	6	2664830	2664835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54798	NC_015850	CA	3	6	2664862	2664867	50 %	0 %	0 %	50 %	340783358
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54801	NC_015850	GGC	2	6	2664954	2664959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783358
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54803	NC_015850	GC	3	6	2665096	2665101	0 %	0 %	50 %	50 %	340783358
54804	NC_015850	TGG	2	6	2665178	2665183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783358
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54822	NC_015850	CCTAC	2	10	2666057	2666066	20 %	20 %	0 %	60 %	340783359
54823	NC_015850	TGCG	2	8	2666136	2666143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54824	NC_015850	GCGGT	2	10	2666163	2666172	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54825	NC_015850	GC	3	6	2666242	2666247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54826	NC_015850	CG	4	8	2666257	2666264	0 %	0 %	50 %	50 %	340783360
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54830	NC_015850	CGC	2	6	2666459	2666464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783360
54831	NC_015850	GCT	2	6	2666514	2666519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783360
54832	NC_015850	CTC	2	6	2666572	2666577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783360
54833	NC_015850	GTT	2	6	2666606	2666611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783360
54834	NC_015850	GCTGT	2	10	2666629	2666638	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54835	NC_015850	ACA	2	6	2666657	2666662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54836	NC_015850	AT	3	6	2666718	2666723	50 %	50 %	0 %	0 %	340783361
54837	NC_015850	CG	3	6	2666743	2666748	0 %	0 %	50 %	50 %	340783361
54838	NC_015850	AAC	2	6	2666936	2666941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783361
54839	NC_015850	GCT	2	6	2666997	2667002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783361
54840	NC_015850	AGC	2	6	2667014	2667019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783361
54841	NC_015850	GCCCGT	2	12	2667049	2667060	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340783361
54842	NC_015850	GCC	2	6	2667062	2667067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783361
54843	NC_015850	AGC	2	6	2667071	2667076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783361
54844	NC_015850	TTTC	2	8	2667141	2667148	0 %	75 %	0 %	25 %	340783361
54845	NC_015850	AGA	2	6	2667269	2667274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783361
54846	NC_015850	GCT	2	6	2667410	2667415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783361
54847	NC_015850	A	6	6	2667465	2667470	100 %	0 %	0 %	0 %	340783361
54848	NC_015850	CCG	2	6	2667492	2667497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783361
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