MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 101673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015564	CAG	2	6	184204	184209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917842
4002	NC_015564	GA	3	6	184224	184229	50 %	0 %	50 %	0 %	333917842
4003	NC_015564	GT	3	6	184254	184259	0 %	50 %	50 %	0 %	333917842
4004	NC_015564	CGG	2	6	184263	184268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917842
4005	NC_015564	CGG	2	6	184413	184418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917842
4006	NC_015564	GTC	2	6	184477	184482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917842
4007	NC_015564	CGT	2	6	184486	184491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917842
4008	NC_015564	AGGTGC	2	12	184508	184519	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333917842
4009	NC_015564	GGTT	2	8	184543	184550	0 %	50 %	50 %	0 %	333917842
4010	NC_015564	CCG	3	9	184583	184591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917842
4011	NC_015564	CGT	2	6	184626	184631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917842
4012	NC_015564	CGATC	2	10	184666	184675	20 %	20 %	20 %	40 %	333917842
4013	NC_015564	TCC	2	6	184730	184735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917842
4014	NC_015564	TCGG	2	8	184736	184743	0 %	25 %	50 %	25 %	333917842
4015	NC_015564	GAT	2	6	184822	184827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917842
4016	NC_015564	CGT	2	6	184873	184878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015564	TG	3	6	184885	184890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015564	CGA	3	9	184925	184933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917843
4019	NC_015564	GACC	2	8	184983	184990	25 %	0 %	25 %	50 %	333917843
4020	NC_015564	TTC	2	6	184995	185000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917843
4021	NC_015564	TGAG	2	8	185092	185099	25 %	25 %	50 %	0 %	333917843
4022	NC_015564	ACG	2	6	185116	185121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917843
4023	NC_015564	TGT	2	6	185132	185137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917843
4024	NC_015564	ACC	2	6	185176	185181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917843
4025	NC_015564	CGAT	2	8	185213	185220	25 %	25 %	25 %	25 %	333917843
4026	NC_015564	ACC	2	6	185251	185256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917843
4027	NC_015564	CCG	2	6	185263	185268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917843
4028	NC_015564	CGAG	2	8	185276	185283	25 %	0 %	50 %	25 %	333917843
4029	NC_015564	GCATC	2	10	185292	185301	20 %	20 %	20 %	40 %	333917843
4030	NC_015564	ACA	2	6	185315	185320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917843
4031	NC_015564	CCG	2	6	185375	185380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917843
4032	NC_015564	CTC	2	6	185412	185417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917843
4033	NC_015564	GGC	2	6	185430	185435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917843
4034	NC_015564	GTC	3	9	185445	185453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917843
4035	NC_015564	CGA	2	6	185468	185473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917843
4036	NC_015564	TGC	2	6	185475	185480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917843
4037	NC_015564	TCGG	2	8	185535	185542	0 %	25 %	50 %	25 %	333917843
4038	NC_015564	CGG	2	6	185563	185568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917843
4039	NC_015564	ATC	2	6	185668	185673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_015564	AGT	2	6	185757	185762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015564	GC	3	6	185850	185855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_015564	GCT	2	6	185885	185890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917844
4043	NC_015564	CGG	2	6	185903	185908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917844
4044	NC_015564	TGC	2	6	185928	185933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917844
4045	NC_015564	TGCT	2	8	185955	185962	0 %	50 %	25 %	25 %	333917844
4046	NC_015564	GCC	2	6	186028	186033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917844
4047	NC_015564	GC	3	6	186041	186046	0 %	0 %	50 %	50 %	333917844
4048	NC_015564	CCT	2	6	186047	186052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917844
4049	NC_015564	CG	3	6	186086	186091	0 %	0 %	50 %	50 %	333917844
4050	NC_015564	GCG	2	6	186170	186175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917844
4051	NC_015564	TGG	2	6	186202	186207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917844
4052	NC_015564	GTG	2	6	186214	186219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917844
4053	NC_015564	CGA	2	6	186260	186265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917844
4054	NC_015564	CG	3	6	186324	186329	0 %	0 %	50 %	50 %	333917844
4055	NC_015564	GGTA	2	8	186337	186344	25 %	25 %	50 %	0 %	333917844
4056	NC_015564	CAGC	2	8	186359	186366	25 %	0 %	25 %	50 %	333917844
4057	NC_015564	ACT	2	6	186511	186516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917844
4058	NC_015564	GCC	2	6	186555	186560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917844
4059	NC_015564	CTG	2	6	186569	186574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917844
4060	NC_015564	GTC	2	6	186588	186593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917844
4061	NC_015564	GCCGT	2	10	186615	186624	0 %	20 %	40 %	40 %	333917844
4062	NC_015564	TG	3	6	186762	186767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015564	CCGA	2	8	186775	186782	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_015564	CTG	2	6	186870	186875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917845
4065	NC_015564	GCT	2	6	186932	186937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917845
4066	NC_015564	CAC	2	6	186990	186995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917845
4067	NC_015564	GT	3	6	187022	187027	0 %	50 %	50 %	0 %	333917845
4068	NC_015564	CGG	2	6	187055	187060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917845
4069	NC_015564	TCGC	2	8	187118	187125	0 %	25 %	25 %	50 %	333917845
4070	NC_015564	GACG	2	8	187149	187156	25 %	0 %	50 %	25 %	333917845
4071	NC_015564	ACGC	2	8	187188	187195	25 %	0 %	25 %	50 %	333917845
4072	NC_015564	CTGA	2	8	187224	187231	25 %	25 %	25 %	25 %	333917845
4073	NC_015564	GCC	2	6	187272	187277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917845
4074	NC_015564	CGA	2	6	187301	187306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917845
4075	NC_015564	CA	3	6	187361	187366	50 %	0 %	0 %	50 %	333917845
4076	NC_015564	CGT	2	6	187389	187394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917845
4077	NC_015564	GAT	2	6	187409	187414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917845
4078	NC_015564	GT	3	6	187449	187454	0 %	50 %	50 %	0 %	333917845
4079	NC_015564	GCA	2	6	187556	187561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917845
4080	NC_015564	TCG	2	6	187645	187650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917845
4081	NC_015564	ACT	2	6	187674	187679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917846
4082	NC_015564	TTG	2	6	187683	187688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917846
4083	NC_015564	GTG	2	6	187731	187736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917846
4084	NC_015564	CGC	2	6	187820	187825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917846
4085	NC_015564	GAG	2	6	187848	187853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917846
4086	NC_015564	GCCC	2	8	187855	187862	0 %	0 %	25 %	75 %	333917846
4087	NC_015564	GCGA	2	8	187898	187905	25 %	0 %	50 %	25 %	333917846
4088	NC_015564	CGC	2	6	187994	187999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917846
4089	NC_015564	T	6	6	188008	188013	0 %	100 %	0 %	0 %	333917846
4090	NC_015564	TTC	2	6	188047	188052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917846
4091	NC_015564	GAA	2	6	188056	188061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917846
4092	NC_015564	GCG	2	6	188085	188090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917846
4093	NC_015564	TCC	2	6	188091	188096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917846
4094	NC_015564	GGGT	2	8	188108	188115	0 %	25 %	75 %	0 %	333917846
4095	NC_015564	GA	3	6	188121	188126	50 %	0 %	50 %	0 %	333917846
4096	NC_015564	C	6	6	188127	188132	0 %	0 %	0 %	100 %	333917846
4097	NC_015564	CGA	2	6	188137	188142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917846
4098	NC_015564	GAA	2	6	188143	188148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917846
4099	NC_015564	GCG	2	6	188150	188155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917846
4100	NC_015564	GTC	2	6	188156	188161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917846
4101	NC_015564	CCG	2	6	188182	188187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917846
4102	NC_015564	CGA	2	6	188205	188210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917846
4103	NC_015564	TGA	2	6	188239	188244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917846
4104	NC_015564	CAG	2	6	188288	188293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917846
4105	NC_015564	CGG	2	6	188383	188388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917846
4106	NC_015564	CGGT	2	8	188410	188417	0 %	25 %	50 %	25 %	333917846
4107	NC_015564	CAT	2	6	188468	188473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917846
4108	NC_015564	AGA	2	6	188479	188484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917846
4109	NC_015564	TCG	2	6	188556	188561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917846
4110	NC_015564	GTC	2	6	188592	188597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917846
4111	NC_015564	CAA	2	6	188635	188640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917846
4112	NC_015564	TGG	2	6	188681	188686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_015564	AAC	2	6	188688	188693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_015564	GCG	2	6	188715	188720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_015564	CGA	2	6	188807	188812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917847
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4117	NC_015564	ACC	2	6	188855	188860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917847
4118	NC_015564	CGA	2	6	188891	188896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917847
4119	NC_015564	AGT	2	6	188921	188926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917847
4120	NC_015564	GCT	2	6	188980	188985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917847
4121	NC_015564	GGC	2	6	189023	189028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917847
4122	NC_015564	CGC	2	6	189042	189047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917847
4123	NC_015564	GAC	2	6	189081	189086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917847
4124	NC_015564	CGT	2	6	189110	189115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917847
4125	NC_015564	CGC	2	6	189155	189160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917847
4126	NC_015564	GTG	2	6	189197	189202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917847
4127	NC_015564	AACAGC	2	12	189220	189231	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	333917847
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4129	NC_015564	CTG	2	6	189279	189284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917847
4130	NC_015564	CGA	2	6	189326	189331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917847
4131	NC_015564	CCA	2	6	189335	189340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917847
4132	NC_015564	TG	3	6	189348	189353	0 %	50 %	50 %	0 %	333917847
4133	NC_015564	GCG	2	6	189394	189399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917847
4134	NC_015564	GCCTC	2	10	189433	189442	0 %	20 %	20 %	60 %	333917847
4135	NC_015564	CCG	2	6	189451	189456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917847
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4139	NC_015564	GTG	2	6	189520	189525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917847
4140	NC_015564	TACGG	2	10	189537	189546	20 %	20 %	40 %	20 %	333917847
4141	NC_015564	CTCG	2	8	189554	189561	0 %	25 %	25 %	50 %	333917847
4142	NC_015564	TA	3	6	189646	189651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_015564	ACC	2	6	189658	189663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4144	NC_015564	ACCG	2	8	189697	189704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4145	NC_015564	TAA	2	6	189755	189760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_015564	GGTG	2	8	189851	189858	0 %	25 %	75 %	0 %	333917848
4147	NC_015564	GAA	2	6	189865	189870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917848
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4151	NC_015564	ACG	2	6	190153	190158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917849
4152	NC_015564	CGCA	2	8	190193	190200	25 %	0 %	25 %	50 %	333917849
4153	NC_015564	TCG	2	6	190240	190245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917849
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4161	NC_015564	CGA	2	6	190724	190729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917849
4162	NC_015564	ACACC	2	10	190730	190739	40 %	0 %	0 %	60 %	333917849
4163	NC_015564	GAC	2	6	190745	190750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917849
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4171	NC_015564	CGA	2	6	191102	191107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917849
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4174	NC_015564	GCT	2	6	191300	191305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917849
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4179	NC_015564	CGT	2	6	191588	191593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917850
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4182	NC_015564	CAT	2	6	191783	191788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917850
4183	NC_015564	TCGAC	2	10	191791	191800	20 %	20 %	20 %	40 %	333917850
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4206	NC_015564	CG	3	6	192530	192535	0 %	0 %	50 %	50 %	333917851
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4217	NC_015564	TC	3	6	193144	193149	0 %	50 %	0 %	50 %	333917851
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4222	NC_015564	TCG	2	6	193494	193499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917851
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4224	NC_015564	CACG	2	8	193557	193564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4225	NC_015564	TGC	2	6	193570	193575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4226	NC_015564	GAG	2	6	193625	193630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4227	NC_015564	TCG	2	6	193698	193703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917852
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4229	NC_015564	ACG	2	6	193718	193723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917852
4230	NC_015564	GTG	2	6	193726	193731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917852
4231	NC_015564	ACG	3	9	193751	193759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917852
4232	NC_015564	G	6	6	193796	193801	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_015564	CAC	2	6	193826	193831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917853
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4236	NC_015564	ACGT	2	8	194148	194155	25 %	25 %	25 %	25 %	333917853
4237	NC_015564	TTG	2	6	194169	194174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917853
4238	NC_015564	CTG	2	6	194182	194187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917853
4239	NC_015564	AGC	2	6	194244	194249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917853
4240	NC_015564	GAG	2	6	194282	194287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917853
4241	NC_015564	GAT	2	6	194300	194305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917853
4242	NC_015564	GCC	2	6	194354	194359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917853
4243	NC_015564	GTT	2	6	194407	194412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917853
4244	NC_015564	TGA	2	6	194413	194418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917853
4245	NC_015564	TGC	2	6	194461	194466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917853
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4247	NC_015564	AGC	2	6	194580	194585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917853
4248	NC_015564	GTC	2	6	194594	194599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917853
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4263	NC_015564	CTC	2	6	195069	195074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4264	NC_015564	GCG	2	6	195170	195175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917854
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4272	NC_015564	CAGCG	2	10	195701	195710	20 %	0 %	40 %	40 %	333917855
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4357	NC_015564	TCT	2	6	199892	199897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4358	NC_015564	TGCGG	2	10	199926	199935	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4359	NC_015564	CCT	2	6	199946	199951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917860
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4482	NC_015564	ACG	2	6	205710	205715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917867
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4485	NC_015564	TGA	2	6	205821	205826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917867
4486	NC_015564	ACG	2	6	205851	205856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917867
4487	NC_015564	AGC	3	9	205866	205874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917867
4488	NC_015564	CAT	2	6	205901	205906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917867
4489	NC_015564	GCG	2	6	205916	205921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917867
4490	NC_015564	CGG	2	6	205941	205946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917867
4491	NC_015564	TCG	2	6	205947	205952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917867
4492	NC_015564	CTGC	2	8	206000	206007	0 %	25 %	25 %	50 %	333917867
4493	NC_015564	GAT	2	6	206080	206085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917867
4494	NC_015564	AGC	2	6	206100	206105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917867
4495	NC_015564	ATC	2	6	206150	206155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917867
4496	NC_015564	CGA	2	6	206182	206187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917867
4497	NC_015564	CTGAG	2	10	206190	206199	20 %	20 %	40 %	20 %	333917867
4498	NC_015564	CCT	2	6	206200	206205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917867
4499	NC_015564	GCC	2	6	206348	206353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917867
4500	NC_015564	CGC	2	6	206354	206359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917867

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