MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 101673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015564	TGACC	2	10	160159	160168	20 %	20 %	20 %	40 %	333917821
3502	NC_015564	CCA	2	6	160173	160178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917821
3503	NC_015564	CGC	2	6	160186	160191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917821
3504	NC_015564	GCT	2	6	160196	160201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917821
3505	NC_015564	CCG	2	6	160264	160269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917821
3506	NC_015564	TCA	2	6	160275	160280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917821
3507	NC_015564	CG	4	8	160285	160292	0 %	0 %	50 %	50 %	333917821
3508	NC_015564	GT	3	6	160302	160307	0 %	50 %	50 %	0 %	333917821
3509	NC_015564	TTC	2	6	160335	160340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917821
3510	NC_015564	GTC	2	6	160376	160381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917821
3511	NC_015564	GT	3	6	160388	160393	0 %	50 %	50 %	0 %	333917821
3512	NC_015564	GGC	2	6	160394	160399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917821
3513	NC_015564	TCG	2	6	160473	160478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917821
3514	NC_015564	TGG	2	6	160519	160524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917821
3515	NC_015564	CGT	2	6	160525	160530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917821
3516	NC_015564	G	6	6	160540	160545	0 %	0 %	100 %	0 %	333917821
3517	NC_015564	GCC	2	6	160621	160626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917821
3518	NC_015564	CGTCG	2	10	160651	160660	0 %	20 %	40 %	40 %	333917821
3519	NC_015564	CGG	2	6	160702	160707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917821
3520	NC_015564	GTCA	2	8	160798	160805	25 %	25 %	25 %	25 %	333917821
3521	NC_015564	GGCG	2	8	160933	160940	0 %	0 %	75 %	25 %	333917821
3522	NC_015564	CACG	2	8	160984	160991	25 %	0 %	25 %	50 %	333917821
3523	NC_015564	CAT	2	6	161014	161019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917821
3524	NC_015564	CGC	2	6	161122	161127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917821
3525	NC_015564	TGG	2	6	161166	161171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917821
3526	NC_015564	GT	3	6	161188	161193	0 %	50 %	50 %	0 %	333917821
3527	NC_015564	TG	3	6	161208	161213	0 %	50 %	50 %	0 %	333917821
3528	NC_015564	GAA	2	6	161261	161266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917821
3529	NC_015564	CGGA	2	8	161302	161309	25 %	0 %	50 %	25 %	333917822
3530	NC_015564	CGC	2	6	161349	161354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917822
3531	NC_015564	TGC	2	6	161393	161398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917822
3532	NC_015564	TGG	2	6	161439	161444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917822
3533	NC_015564	CGA	2	6	161478	161483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917822
3534	NC_015564	CG	3	6	161579	161584	0 %	0 %	50 %	50 %	333917822
3535	NC_015564	ATCC	2	8	161641	161648	25 %	25 %	0 %	50 %	333917822
3536	NC_015564	CGT	2	6	161724	161729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917822
3537	NC_015564	CTG	2	6	161755	161760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917822
3538	NC_015564	TCGC	2	8	161789	161796	0 %	25 %	25 %	50 %	333917822
3539	NC_015564	CG	3	6	161813	161818	0 %	0 %	50 %	50 %	333917822
3540	NC_015564	GC	3	6	161821	161826	0 %	0 %	50 %	50 %	333917822
3541	NC_015564	GAG	2	6	161860	161865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917822
3542	NC_015564	CCG	2	6	161882	161887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917822
3543	NC_015564	TCT	2	6	161940	161945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917822
3544	NC_015564	CGG	2	6	162107	162112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917822
3545	NC_015564	TGGTCT	2	12	162158	162169	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333917823
3546	NC_015564	CGG	2	6	162209	162214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917823
3547	NC_015564	GCC	2	6	162243	162248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917823
3548	NC_015564	GAA	2	6	162249	162254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917823
3549	NC_015564	GAA	2	6	162315	162320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917823
3550	NC_015564	GCT	2	6	162335	162340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917823
3551	NC_015564	CAG	2	6	162393	162398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917823
3552	NC_015564	AGT	2	6	162461	162466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917823
3553	NC_015564	ACGCG	2	10	162475	162484	20 %	0 %	40 %	40 %	333917823
3554	NC_015564	CGAGGA	2	12	162485	162496	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333917823
3555	NC_015564	AGG	2	6	162514	162519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917823
3556	NC_015564	GAG	2	6	162531	162536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917823
3557	NC_015564	GCG	2	6	162589	162594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917823
3558	NC_015564	CTG	2	6	162639	162644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917823
3559	NC_015564	CGA	2	6	162647	162652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917823
3560	NC_015564	GAT	2	6	162690	162695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917823
3561	NC_015564	CCG	2	6	162697	162702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917823
3562	NC_015564	ATC	2	6	162703	162708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917823
3563	NC_015564	AAC	2	6	162718	162723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917823
3564	NC_015564	GAAC	2	8	162725	162732	50 %	0 %	25 %	25 %	333917823
3565	NC_015564	ATC	2	6	162793	162798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917823
3566	NC_015564	TCGA	2	8	162850	162857	25 %	25 %	25 %	25 %	333917823
3567	NC_015564	CTG	2	6	162861	162866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917823
3568	NC_015564	GCG	2	6	162885	162890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917823
3569	NC_015564	TCC	2	6	162895	162900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917823
3570	NC_015564	GGCC	2	8	162911	162918	0 %	0 %	50 %	50 %	333917823
3571	NC_015564	CGT	2	6	162957	162962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917823
3572	NC_015564	TGA	2	6	162986	162991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917823
3573	NC_015564	GAT	2	6	162993	162998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917823
3574	NC_015564	TCG	2	6	163028	163033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917823
3575	NC_015564	GAT	2	6	163149	163154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917823
3576	NC_015564	AGC	2	6	163192	163197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917823
3577	NC_015564	CTT	2	6	163268	163273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917823
3578	NC_015564	GAG	2	6	163326	163331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917823
3579	NC_015564	AGC	2	6	163441	163446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917823
3580	NC_015564	GCC	3	9	163455	163463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917823
3581	NC_015564	GAT	2	6	163464	163469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917823
3582	NC_015564	GCC	2	6	163499	163504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917823
3583	NC_015564	GAG	2	6	163548	163553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917823
3584	NC_015564	TC	3	6	163655	163660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_015564	G	6	6	163708	163713	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_015564	CGTCCG	2	12	163731	163742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_015564	GT	3	6	163766	163771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_015564	CGC	2	6	163775	163780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_015564	CTG	2	6	163781	163786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_015564	ACGTCA	2	12	163787	163798	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_015564	GTC	2	6	163874	163879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_015564	ACC	2	6	163902	163907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917824
3593	NC_015564	ACC	2	6	163918	163923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917824
3594	NC_015564	GCTC	2	8	163939	163946	0 %	25 %	25 %	50 %	333917824
3595	NC_015564	TCT	2	6	163960	163965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917824
3596	NC_015564	GT	4	8	163984	163991	0 %	50 %	50 %	0 %	333917824
3597	NC_015564	CGC	3	9	164016	164024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917824
3598	NC_015564	G	6	6	164192	164197	0 %	0 %	100 %	0 %	333917824
3599	NC_015564	GC	3	6	164236	164241	0 %	0 %	50 %	50 %	333917824
3600	NC_015564	GGA	2	6	164257	164262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917824
3601	NC_015564	TGA	2	6	164294	164299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917824
3602	NC_015564	CG	3	6	164325	164330	0 %	0 %	50 %	50 %	333917824
3603	NC_015564	CCGA	2	8	164390	164397	25 %	0 %	25 %	50 %	333917824
3604	NC_015564	CG	3	6	164424	164429	0 %	0 %	50 %	50 %	333917824
3605	NC_015564	GCG	2	6	164491	164496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917824
3606	NC_015564	GCC	2	6	164509	164514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917824
3607	NC_015564	GGGTG	2	10	164519	164528	0 %	20 %	80 %	0 %	333917824
3608	NC_015564	CCTTG	2	10	164537	164546	0 %	40 %	20 %	40 %	333917824
3609	NC_015564	CGGCC	2	10	164569	164578	0 %	0 %	40 %	60 %	333917824
3610	NC_015564	ACG	2	6	164607	164612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917824
3611	NC_015564	GC	3	6	164620	164625	0 %	0 %	50 %	50 %	333917824
3612	NC_015564	AGGT	2	8	164666	164673	25 %	25 %	50 %	0 %	333917824
3613	NC_015564	AGC	2	6	164683	164688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917824
3614	NC_015564	GGT	2	6	164812	164817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917824
3615	NC_015564	CGGC	2	8	164983	164990	0 %	0 %	50 %	50 %	333917824
3616	NC_015564	CGA	2	6	165038	165043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917824
3617	NC_015564	CG	4	8	165045	165052	0 %	0 %	50 %	50 %	333917824
3618	NC_015564	CGG	2	6	165066	165071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917824
3619	NC_015564	CTTG	2	8	165097	165104	0 %	50 %	25 %	25 %	333917824
3620	NC_015564	CCG	2	6	165126	165131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917824
3621	NC_015564	GCG	3	9	165166	165174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917824
3622	NC_015564	CGA	2	6	165212	165217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917824
3623	NC_015564	TGC	2	6	165258	165263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917824
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3742	NC_015564	CGA	2	6	170205	170210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917829
3743	NC_015564	CG	3	6	170270	170275	0 %	0 %	50 %	50 %	333917829
3744	NC_015564	GCC	2	6	170284	170289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917829
3745	NC_015564	TGG	2	6	170306	170311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917829
3746	NC_015564	ACG	2	6	170319	170324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917829
3747	NC_015564	CG	3	6	170355	170360	0 %	0 %	50 %	50 %	333917829
3748	NC_015564	ACC	2	6	170382	170387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917829
3749	NC_015564	GCG	2	6	170394	170399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917829
3750	NC_015564	CTG	2	6	170434	170439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917829
3751	NC_015564	CGC	2	6	170584	170589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917830
3752	NC_015564	CTGCGC	2	12	170653	170664	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333917830
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3754	NC_015564	TCA	2	6	170813	170818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917830
3755	NC_015564	ATC	2	6	170855	170860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917830
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3757	NC_015564	CGA	2	6	170892	170897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917830
3758	NC_015564	GAT	3	9	170915	170923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917830
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3761	NC_015564	GTG	2	6	171032	171037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3762	NC_015564	TGG	2	6	171101	171106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917831
3763	NC_015564	GCT	2	6	171163	171168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917831
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3772	NC_015564	CGC	2	6	171603	171608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917831
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3775	NC_015564	CA	3	6	171789	171794	50 %	0 %	0 %	50 %	333917831
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3779	NC_015564	TGC	2	6	172329	172334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917832
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3783	NC_015564	CGC	2	6	172497	172502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917832
3784	NC_015564	CG	3	6	172553	172558	0 %	0 %	50 %	50 %	333917832
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3787	NC_015564	AGCG	2	8	172736	172743	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3792	NC_015564	GA	3	6	173106	173111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3793	NC_015564	GTT	2	6	173161	173166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3794	NC_015564	CGA	2	6	173186	173191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3814	NC_015564	GA	3	6	174263	174268	50 %	0 %	50 %	0 %	333917835
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3832	NC_015564	TCG	2	6	175045	175050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3847	NC_015564	GGTT	2	8	175908	175915	0 %	50 %	50 %	0 %	333917836
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3850	NC_015564	GCA	2	6	175992	175997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917836
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3853	NC_015564	CGT	2	6	176041	176046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917836
3854	NC_015564	GC	3	6	176049	176054	0 %	0 %	50 %	50 %	333917836
3855	NC_015564	GCAC	2	8	176080	176087	25 %	0 %	25 %	50 %	333917836
3856	NC_015564	GCC	2	6	176090	176095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917836
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3858	NC_015564	CGA	2	6	176193	176198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3859	NC_015564	GCGTC	2	10	176256	176265	0 %	20 %	40 %	40 %	333917837
3860	NC_015564	TGA	2	6	176302	176307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917837
3861	NC_015564	GC	4	8	176321	176328	0 %	0 %	50 %	50 %	333917837
3862	NC_015564	GCC	3	9	176348	176356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917837
3863	NC_015564	TCG	2	6	176412	176417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917837
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3984	NC_015564	CCT	2	6	183177	183182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917841
3985	NC_015564	GCG	2	6	183185	183190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917841
3986	NC_015564	TGG	2	6	183202	183207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917841
3987	NC_015564	GTT	2	6	183308	183313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917841
3988	NC_015564	ACGA	2	8	183353	183360	50 %	0 %	25 %	25 %	333917841
3989	NC_015564	TCG	2	6	183432	183437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917841
3990	NC_015564	CGA	2	6	183475	183480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917841
3991	NC_015564	CTT	2	6	183490	183495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917841
3992	NC_015564	CGC	2	6	183533	183538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917841
3993	NC_015564	GTC	2	6	183599	183604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917841
3994	NC_015564	GACG	2	8	183655	183662	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3995	NC_015564	TGCG	2	8	183667	183674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3996	NC_015564	GGT	2	6	183778	183783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3997	NC_015564	CAG	2	6	183837	183842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_015564	ACCG	2	8	183856	183863	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3999	NC_015564	GA	3	6	183927	183932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_015564	TTG	2	6	184082	184087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917842

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