MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alteromonas sp. SN2 chromosome

Total Repeats: 93653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015554	AC	3	6	188430	188435	50 %	0 %	0 %	50 %	333891645
3502	NC_015554	TGG	2	6	188447	188452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891645
3503	NC_015554	ATA	2	6	188555	188560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891645
3504	NC_015554	ATC	2	6	188576	188581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891645
3505	NC_015554	AGT	2	6	188629	188634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891645
3506	NC_015554	GA	3	6	188670	188675	50 %	0 %	50 %	0 %	333891645
3507	NC_015554	CATT	2	8	188688	188695	25 %	50 %	0 %	25 %	333891645
3508	NC_015554	CAC	2	6	188853	188858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333891645
3509	NC_015554	GAGCA	2	10	188889	188898	40 %	0 %	40 %	20 %	333891645
3510	NC_015554	TGC	2	6	188919	188924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891645
3511	NC_015554	GAATTC	2	12	188971	188982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333891645
3512	NC_015554	TAA	2	6	189009	189014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891645
3513	NC_015554	GCCC	2	8	189047	189054	0 %	0 %	25 %	75 %	333891645
3514	NC_015554	AAT	2	6	189055	189060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891645
3515	NC_015554	TCA	3	9	189122	189130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891645
3516	NC_015554	TAA	2	6	189153	189158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891645
3517	NC_015554	AAT	2	6	189183	189188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891645
3518	NC_015554	GCA	2	6	189210	189215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891645
3519	NC_015554	CTG	2	6	189244	189249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891645
3520	NC_015554	TGG	2	6	189277	189282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891645
3521	NC_015554	ATG	2	6	189326	189331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891645
3522	NC_015554	GTG	2	6	189494	189499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891645
3523	NC_015554	CAT	2	6	189521	189526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_015554	TTATA	2	10	189554	189563	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_015554	ATTAAA	2	12	189602	189613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_015554	TTGA	2	8	189638	189645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_015554	AGC	2	6	189750	189755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891646
3528	NC_015554	ACA	2	6	189772	189777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891646
3529	NC_015554	AGC	2	6	189778	189783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891646
3530	NC_015554	AGC	2	6	189795	189800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891646
3531	NC_015554	GTT	2	6	189881	189886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891646
3532	NC_015554	GAA	2	6	189929	189934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891646
3533	NC_015554	GAT	3	9	190025	190033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891646
3534	NC_015554	GTT	2	6	190045	190050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891646
3535	NC_015554	ATGA	2	8	190115	190122	50 %	25 %	25 %	0 %	333891646
3536	NC_015554	GAA	2	6	190130	190135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891646
3537	NC_015554	CGG	2	6	190165	190170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333891646
3538	NC_015554	AGTG	2	8	190210	190217	25 %	25 %	50 %	0 %	333891646
3539	NC_015554	GAGC	2	8	190219	190226	25 %	0 %	50 %	25 %	333891646
3540	NC_015554	TGC	2	6	190330	190335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891646
3541	NC_015554	TA	4	8	190350	190357	50 %	50 %	0 %	0 %	333891646
3542	NC_015554	GCA	2	6	190411	190416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891646
3543	NC_015554	AGTT	2	8	190605	190612	25 %	50 %	25 %	0 %	333891646
3544	NC_015554	GAA	2	6	190688	190693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891646
3545	NC_015554	GTA	2	6	190721	190726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891646
3546	NC_015554	GAT	2	6	190753	190758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891646
3547	NC_015554	TTGC	2	8	190814	190821	0 %	50 %	25 %	25 %	333891646
3548	NC_015554	TAT	2	6	190825	190830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891646
3549	NC_015554	TGAAA	2	10	190834	190843	60 %	20 %	20 %	0 %	333891646
3550	NC_015554	TTA	2	6	190904	190909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891646
3551	NC_015554	A	8	8	190946	190953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_015554	T	6	6	190971	190976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_015554	TGC	2	6	191240	191245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891647
3554	NC_015554	TGG	2	6	191246	191251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891647
3555	NC_015554	TTA	2	6	191318	191323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891647
3556	NC_015554	TGA	2	6	191370	191375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891647
3557	NC_015554	ACA	2	6	191378	191383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891647
3558	NC_015554	TAA	2	6	191411	191416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891647
3559	NC_015554	TACC	2	8	191446	191453	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_015554	TAT	2	6	191465	191470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_015554	ATA	2	6	191472	191477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_015554	ATG	2	6	191567	191572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_015554	TTA	2	6	191601	191606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_015554	CTAT	2	8	191649	191656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3565	NC_015554	GC	3	6	191777	191782	0 %	0 %	50 %	50 %	333891648
3566	NC_015554	AAC	2	6	191802	191807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891648
3567	NC_015554	AAACG	2	10	191886	191895	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3568	NC_015554	AAGCA	2	10	191923	191932	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3569	NC_015554	TCC	2	6	191965	191970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_015554	CCGA	2	8	191984	191991	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_015554	CAC	2	6	192008	192013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_015554	TG	3	6	192043	192048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015554	CA	3	6	192067	192072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_015554	ACG	2	6	192073	192078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_015554	AT	3	6	192090	192095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_015554	GGC	2	6	192134	192139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_015554	GAT	2	6	192185	192190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_015554	AG	3	6	192314	192319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_015554	GCA	2	6	192439	192444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_015554	GT	3	6	192492	192497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_015554	GAA	2	6	192498	192503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_015554	TAG	2	6	192545	192550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_015554	AAC	2	6	192575	192580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_015554	AGA	2	6	192581	192586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_015554	CAG	2	6	192607	192612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_015554	GGA	2	6	192798	192803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_015554	CTA	2	6	192911	192916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_015554	GAA	2	6	193061	193066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_015554	TGC	2	6	193137	193142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_015554	GTC	2	6	193149	193154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_015554	TCGTG	2	10	193158	193167	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3592	NC_015554	GGA	2	6	193261	193266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_015554	GAC	2	6	193274	193279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_015554	TCA	2	6	193286	193291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_015554	AC	3	6	193312	193317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_015554	AC	3	6	193481	193486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_015554	AGT	2	6	193521	193526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_015554	CCT	2	6	193622	193627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_015554	TAGTG	2	10	193654	193663	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_015554	TTGTT	2	10	193674	193683	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_015554	GAA	2	6	193691	193696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_015554	T	6	6	193707	193712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_015554	GCCT	2	8	193755	193762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_015554	AGG	2	6	193770	193775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_015554	CAG	2	6	193777	193782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_015554	CCA	2	6	193800	193805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_015554	AATT	2	8	193841	193848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_015554	GAG	2	6	193879	193884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_015554	CGA	2	6	193923	193928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_015554	GCA	2	6	193938	193943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_015554	T	6	6	194228	194233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_015554	GAA	2	6	194242	194247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_015554	ATCA	2	8	194316	194323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3614	NC_015554	TACT	2	8	194354	194361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_015554	ACTTG	2	10	194367	194376	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3616	NC_015554	AAG	2	6	194434	194439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_015554	TTAT	2	8	194553	194560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_015554	ATT	2	6	194564	194569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_015554	CGA	2	6	194609	194614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_015554	GAA	2	6	194669	194674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_015554	AT	3	6	194866	194871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_015554	TAG	2	6	194945	194950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_015554	GCGA	2	8	194953	194960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_015554	GTTT	2	8	195048	195055	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_015554	G	6	6	195102	195107	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_015554	TCC	2	6	195112	195117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_015554	AGCGTT	2	12	195290	195301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3629	NC_015554	TAG	2	6	195403	195408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3997	NC_015554	GAA	2	6	215409	215414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891661
3998	NC_015554	AAGC	2	8	215462	215469	50 %	0 %	25 %	25 %	333891661
3999	NC_015554	T	7	7	215500	215506	0 %	100 %	0 %	0 %	333891661
4000	NC_015554	AAT	2	6	215567	215572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891661

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