MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 2039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015518	TAATA	2	10	1588268	1588277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015518	TTTGA	2	10	1590040	1590049	20 %	60 %	20 %	0 %	332797428
1503	NC_015518	TTTTC	2	10	1590093	1590102	0 %	80 %	0 %	20 %	332797429
1504	NC_015518	AATTT	2	10	1590469	1590478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015518	TATTC	2	10	1590758	1590767	20 %	60 %	0 %	20 %	332797430
1506	NC_015518	AAATA	2	10	1592789	1592798	80 %	20 %	0 %	0 %	332797432
1507	NC_015518	CAAGG	2	10	1593765	1593774	40 %	0 %	40 %	20 %	332797432
1508	NC_015518	AAGAA	2	10	1594180	1594189	80 %	0 %	20 %	0 %	332797432
1509	NC_015518	AATAA	2	10	1596266	1596275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015518	ATTTG	2	10	1596744	1596753	20 %	60 %	20 %	0 %	332797435
1511	NC_015518	TCATA	2	10	1600278	1600287	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1512	NC_015518	ACCTA	2	10	1600470	1600479	40 %	20 %	0 %	40 %	332797440
1513	NC_015518	TCAAA	2	10	1600778	1600787	60 %	20 %	0 %	20 %	332797440
1514	NC_015518	AATTT	2	10	1601946	1601955	40 %	60 %	0 %	0 %	332797441
1515	NC_015518	TGATA	2	10	1602462	1602471	40 %	40 %	20 %	0 %	332797442
1516	NC_015518	TCTAG	2	10	1602776	1602785	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1517	NC_015518	AAGAT	2	10	1603108	1603117	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015518	TTATC	2	10	1603601	1603610	20 %	60 %	0 %	20 %	332797443
1519	NC_015518	ACCCT	2	10	1604112	1604121	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1520	NC_015518	AAATG	2	10	1604533	1604542	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015518	ATCCT	2	10	1609643	1609652	20 %	40 %	0 %	40 %	332797452
1522	NC_015518	GGATA	2	10	1611168	1611177	40 %	20 %	40 %	0 %	332797454
1523	NC_015518	AAGGT	2	10	1611953	1611962	40 %	20 %	40 %	0 %	332797455
1524	NC_015518	CTATA	2	10	1614932	1614941	40 %	40 %	0 %	20 %	332797458
1525	NC_015518	CCTAA	2	10	1615611	1615620	40 %	20 %	0 %	40 %	332797458
1526	NC_015518	TTATA	2	10	1615643	1615652	40 %	60 %	0 %	0 %	332797458
1527	NC_015518	GTTAT	2	10	1617149	1617158	20 %	60 %	20 %	0 %	332797460
1528	NC_015518	AACTT	2	10	1617314	1617323	40 %	40 %	0 %	20 %	332797460
1529	NC_015518	AGTTA	2	10	1618162	1618171	40 %	40 %	20 %	0 %	332797460
1530	NC_015518	CATAC	2	10	1618230	1618239	40 %	20 %	0 %	40 %	332797460
1531	NC_015518	TATAT	2	10	1619126	1619135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_015518	AAAGC	2	10	1620923	1620932	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1533	NC_015518	AACCT	2	10	1621269	1621278	40 %	20 %	0 %	40 %	332797464
1534	NC_015518	ATATA	2	10	1622253	1622262	60 %	40 %	0 %	0 %	332797465
1535	NC_015518	TAACT	2	10	1622864	1622873	40 %	40 %	0 %	20 %	332797466
1536	NC_015518	AAGAT	2	10	1623970	1623979	60 %	20 %	20 %	0 %	332797467
1537	NC_015518	CACTA	2	10	1626818	1626827	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1538	NC_015518	TCAAC	2	10	1627463	1627472	40 %	20 %	0 %	40 %	332797471
1539	NC_015518	ATACA	2	10	1629078	1629087	60 %	20 %	0 %	20 %	332797472
1540	NC_015518	ATTTA	2	10	1629326	1629335	40 %	60 %	0 %	0 %	332797472
1541	NC_015518	ACCCT	2	10	1630626	1630635	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1542	NC_015518	AGGAT	2	10	1631094	1631103	40 %	20 %	40 %	0 %	332797474
1543	NC_015518	TAAAT	2	10	1633072	1633081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015518	TTTCA	2	10	1633663	1633672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1545	NC_015518	CTTAA	2	10	1637070	1637079	40 %	40 %	0 %	20 %	332797483
1546	NC_015518	CAACC	2	10	1637149	1637158	40 %	0 %	0 %	60 %	332797483
1547	NC_015518	TCATT	2	10	1637434	1637443	20 %	60 %	0 %	20 %	332797483
1548	NC_015518	ACTTC	2	10	1637680	1637689	20 %	40 %	0 %	40 %	332797484
1549	NC_015518	TTTAT	2	10	1639030	1639039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015518	TTACT	2	10	1641316	1641325	20 %	60 %	0 %	20 %	332797488
1551	NC_015518	TAATT	2	10	1641642	1641651	40 %	60 %	0 %	0 %	332797488
1552	NC_015518	AGATC	2	10	1641783	1641792	40 %	20 %	20 %	20 %	332797488
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1554	NC_015518	ATTTT	2	10	1644280	1644289	20 %	80 %	0 %	0 %	332797490
1555	NC_015518	CTCTT	2	10	1644617	1644626	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1556	NC_015518	CTTTC	2	10	1644856	1644865	0 %	60 %	0 %	40 %	332797491
1557	NC_015518	ATATC	2	10	1645040	1645049	40 %	40 %	0 %	20 %	332797491
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1559	NC_015518	TTTCA	2	10	1647040	1647049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_015518	ACTCA	2	10	1648253	1648262	40 %	20 %	0 %	40 %	332797495
1561	NC_015518	TCCTT	2	10	1648538	1648547	0 %	60 %	0 %	40 %	332797495
1562	NC_015518	TAATA	2	10	1649112	1649121	60 %	40 %	0 %	0 %	332797496
1563	NC_015518	TGAAA	2	10	1649903	1649912	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015518	TAATT	2	10	1650056	1650065	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015518	CTTTC	2	10	1651138	1651147	0 %	60 %	0 %	40 %	332797498
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1571	NC_015518	TTTAA	2	10	1654020	1654029	40 %	60 %	0 %	0 %	332797502
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1573	NC_015518	TACTA	2	10	1655202	1655211	40 %	40 %	0 %	20 %	332797504
1574	NC_015518	TAAAT	2	10	1656285	1656294	60 %	40 %	0 %	0 %	332797505
1575	NC_015518	GAGAG	2	10	1656904	1656913	40 %	0 %	60 %	0 %	332797506
1576	NC_015518	AGGGA	2	10	1657110	1657119	40 %	0 %	60 %	0 %	332797506
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1579	NC_015518	TAATT	2	10	1662210	1662219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015518	CTTTT	2	10	1666190	1666199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1581	NC_015518	TGAAA	2	10	1668459	1668468	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015518	TTATT	2	10	1668549	1668558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_015518	GTAAA	2	10	1670764	1670773	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015518	TATCG	2	10	1670815	1670824	20 %	40 %	20 %	20 %	332797523
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1591	NC_015518	AACGT	2	10	1676040	1676049	40 %	20 %	20 %	20 %	332797527
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1593	NC_015518	TTACA	2	10	1676930	1676939	40 %	40 %	0 %	20 %	332797528
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1597	NC_015518	TGTCA	2	10	1681039	1681048	20 %	40 %	20 %	20 %	332797530
1598	NC_015518	ATATA	2	10	1681518	1681527	60 %	40 %	0 %	0 %	332797530
1599	NC_015518	CTTAA	2	10	1681888	1681897	40 %	40 %	0 %	20 %	332797530
1600	NC_015518	AAGAA	2	10	1683628	1683637	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_015518	CTTGT	2	10	1684830	1684839	0 %	60 %	20 %	20 %	332797535
1602	NC_015518	GAGGT	2	10	1686441	1686450	20 %	20 %	60 %	0 %	332797536
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1604	NC_015518	ATATT	2	10	1687671	1687680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015518	GAATA	2	10	1688285	1688294	60 %	20 %	20 %	0 %	332797537
1606	NC_015518	TTTAT	2	10	1688447	1688456	20 %	80 %	0 %	0 %	332797537
1607	NC_015518	ATTTT	2	10	1690113	1690122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1609	NC_015518	TAAAT	2	10	1693865	1693874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_015518	ATTAT	2	10	1693916	1693925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_015518	CTTGC	2	10	1694901	1694910	0 %	40 %	20 %	40 %	332797541
1612	NC_015518	TGTCT	2	10	1697947	1697956	0 %	60 %	20 %	20 %	332797543
1613	NC_015518	TAAGC	2	10	1698025	1698034	40 %	20 %	20 %	20 %	332797543
1614	NC_015518	AGAGA	2	10	1698560	1698569	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015518	TATCC	2	10	1699243	1699252	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1616	NC_015518	ATTAT	2	10	1699926	1699935	40 %	60 %	0 %	0 %	332797545
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1622	NC_015518	CTTTT	2	10	1705582	1705591	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1623	NC_015518	CCAGA	2	10	1706249	1706258	40 %	0 %	20 %	40 %	332797552
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1626	NC_015518	ATGCA	2	10	1708228	1708237	40 %	20 %	20 %	20 %	332797554
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1999	NC_015518	TTAAA	2	10	2107843	2107852	60 %	40 %	0 %	0 %	332797992
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