MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 2039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015518	TAATA	2	10	492665	492674	60 %	40 %	0 %	0 %	332796194
502	NC_015518	GAAAA	2	10	493438	493447	80 %	0 %	20 %	0 %	332796195
503	NC_015518	GAGAT	2	10	493971	493980	40 %	20 %	40 %	0 %	332796196
504	NC_015518	ATACC	2	10	496527	496536	40 %	20 %	0 %	40 %	332796199
505	NC_015518	AAACA	2	10	497494	497503	80 %	0 %	0 %	20 %	332796200
506	NC_015518	GCAAG	2	10	501183	501192	40 %	0 %	40 %	20 %	332796205
507	NC_015518	TAATT	2	10	502747	502756	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015518	AAAGT	2	10	502944	502953	60 %	20 %	20 %	0 %	332796207
509	NC_015518	TAATT	2	10	503183	503192	40 %	60 %	0 %	0 %	332796207
510	NC_015518	CTTAT	2	10	504410	504419	20 %	60 %	0 %	20 %	332796208
511	NC_015518	AAAAC	2	10	504833	504842	80 %	0 %	0 %	20 %	332796209
512	NC_015518	GATTA	2	10	506883	506892	40 %	40 %	20 %	0 %	332796210
513	NC_015518	ACTTA	2	10	508851	508860	40 %	40 %	0 %	20 %	332796214
514	NC_015518	CTGGG	2	10	509642	509651	0 %	20 %	60 %	20 %	332796216
515	NC_015518	CGCTT	2	10	511286	511295	0 %	40 %	20 %	40 %	332796218
516	NC_015518	ATTAC	2	10	512549	512558	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
517	NC_015518	AATGT	2	10	512764	512773	40 %	40 %	20 %	0 %	332796221
518	NC_015518	TTAAA	2	10	513514	513523	60 %	40 %	0 %	0 %	332796221
519	NC_015518	TAATG	2	10	514809	514818	40 %	40 %	20 %	0 %	332796222
520	NC_015518	GAGTA	2	10	518803	518812	40 %	20 %	40 %	0 %	332796227
521	NC_015518	TTACT	2	10	520418	520427	20 %	60 %	0 %	20 %	332796228
522	NC_015518	AATGT	2	10	521633	521642	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015518	CCTTG	2	10	523222	523231	0 %	40 %	20 %	40 %	332796231
524	NC_015518	TTTAC	2	10	525269	525278	20 %	60 %	0 %	20 %	332796236
525	NC_015518	AAGTA	2	10	525617	525626	60 %	20 %	20 %	0 %	332796237
526	NC_015518	TATAT	2	10	526345	526354	40 %	60 %	0 %	0 %	332796238
527	NC_015518	AAAGG	2	10	527844	527853	60 %	0 %	40 %	0 %	332796240
528	NC_015518	AGGAA	2	10	528395	528404	60 %	0 %	40 %	0 %	332796240
529	NC_015518	TTGGT	2	10	528551	528560	0 %	60 %	40 %	0 %	332796240
530	NC_015518	AAAAG	2	10	528877	528886	80 %	0 %	20 %	0 %	332796241
531	NC_015518	GAAAA	2	10	529373	529382	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015518	GAAGA	2	10	530383	530392	60 %	0 %	40 %	0 %	332796243
533	NC_015518	TAAAA	2	10	530638	530647	80 %	20 %	0 %	0 %	332796244
534	NC_015518	AAAAG	2	10	531718	531727	80 %	0 %	20 %	0 %	332796244
535	NC_015518	GATTA	2	10	532858	532867	40 %	40 %	20 %	0 %	332796247
536	NC_015518	GCATT	2	10	534727	534736	20 %	40 %	20 %	20 %	332796250
537	NC_015518	CAAAC	2	10	534985	534994	60 %	0 %	0 %	40 %	332796250
538	NC_015518	CCATG	2	10	535658	535667	20 %	20 %	20 %	40 %	332796250
539	NC_015518	GTAAA	2	10	536139	536148	60 %	20 %	20 %	0 %	332796250
540	NC_015518	AGATA	2	10	537978	537987	60 %	20 %	20 %	0 %	332796251
541	NC_015518	TGTAA	2	10	539072	539081	40 %	40 %	20 %	0 %	332796252
542	NC_015518	TTATA	2	10	541862	541871	40 %	60 %	0 %	0 %	332796254
543	NC_015518	TAATT	2	10	544562	544571	40 %	60 %	0 %	0 %	332796258
544	NC_015518	GGATA	2	10	546087	546096	40 %	20 %	40 %	0 %	332796260
545	NC_015518	ATTAA	2	10	546665	546674	60 %	40 %	0 %	0 %	332796260
546	NC_015518	ATTAT	2	10	546774	546783	40 %	60 %	0 %	0 %	332796260
547	NC_015518	TTAAG	2	10	547882	547891	40 %	40 %	20 %	0 %	332796261
548	NC_015518	GTTAG	2	10	547965	547974	20 %	40 %	40 %	0 %	332796261
549	NC_015518	AAATA	2	10	548657	548666	80 %	20 %	0 %	0 %	332796261
550	NC_015518	ATATT	2	10	552070	552079	40 %	60 %	0 %	0 %	332796266
551	NC_015518	GCTAA	2	10	554302	554311	40 %	20 %	20 %	20 %	332796268
552	NC_015518	AAGAC	2	10	554959	554968	60 %	0 %	20 %	20 %	332796269
553	NC_015518	TTCCA	2	10	555581	555590	20 %	40 %	0 %	40 %	332796270
554	NC_015518	ATCCA	2	10	557709	557718	40 %	20 %	0 %	40 %	332796272
555	NC_015518	TAACT	2	10	559597	559606	40 %	40 %	0 %	20 %	332796273
556	NC_015518	AAGGA	2	10	560567	560576	60 %	0 %	40 %	0 %	332796274
557	NC_015518	AAACA	2	10	561865	561874	80 %	0 %	0 %	20 %	332796276
558	NC_015518	CTTTT	2	10	562065	562074	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
559	NC_015518	CTAGC	2	10	562336	562345	20 %	20 %	20 %	40 %	332796277
560	NC_015518	GATAG	2	10	562704	562713	40 %	20 %	40 %	0 %	332796277
561	NC_015518	AGAGA	2	10	566400	566409	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015518	AGATA	2	10	566428	566437	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015518	ATCTT	2	10	567628	567637	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
564	NC_015518	AGATA	2	10	569550	569559	60 %	20 %	20 %	0 %	332796282
565	NC_015518	AGGAA	2	10	569978	569987	60 %	0 %	40 %	0 %	332796283
566	NC_015518	TTTCT	2	10	575298	575307	0 %	80 %	0 %	20 %	332796290
567	NC_015518	CTAAT	2	10	576551	576560	40 %	40 %	0 %	20 %	332796290
568	NC_015518	ATTAT	2	10	576768	576777	40 %	60 %	0 %	0 %	332796291
569	NC_015518	ATTAT	2	10	576861	576870	40 %	60 %	0 %	0 %	332796291
570	NC_015518	TTTTC	2	10	578294	578303	0 %	80 %	0 %	20 %	332796292
571	NC_015518	TTTTC	2	10	578575	578584	0 %	80 %	0 %	20 %	332796292
572	NC_015518	ATTTT	2	10	578920	578929	20 %	80 %	0 %	0 %	332796292
573	NC_015518	TGCAA	2	10	579172	579181	40 %	20 %	20 %	20 %	332796292
574	NC_015518	AAGTA	2	10	583742	583751	60 %	20 %	20 %	0 %	332796299
575	NC_015518	TCATA	2	10	584156	584165	40 %	40 %	0 %	20 %	332796299
576	NC_015518	TAAAA	2	10	585426	585435	80 %	20 %	0 %	0 %	332796300
577	NC_015518	TCTCC	2	10	586379	586388	0 %	40 %	0 %	60 %	332796301
578	NC_015518	TTTCC	2	10	587451	587460	0 %	60 %	0 %	40 %	332796302
579	NC_015518	TATCT	2	10	588441	588450	20 %	60 %	0 %	20 %	332796303
580	NC_015518	ATTTT	2	10	589471	589480	20 %	80 %	0 %	0 %	332796303
581	NC_015518	AAATG	2	10	589870	589879	60 %	20 %	20 %	0 %	332796303
582	NC_015518	ACTTC	2	10	590182	590191	20 %	40 %	0 %	40 %	332796305
583	NC_015518	GGTCT	2	10	590251	590260	0 %	40 %	40 %	20 %	332796305
584	NC_015518	TTTTA	2	10	590654	590663	20 %	80 %	0 %	0 %	332796305
585	NC_015518	TTGGC	2	10	591785	591794	0 %	40 %	40 %	20 %	332796307
586	NC_015518	AGCTT	2	10	593222	593231	20 %	40 %	20 %	20 %	332796308
587	NC_015518	TATCA	2	10	594167	594176	40 %	40 %	0 %	20 %	332796309
588	NC_015518	TAGTT	2	10	594914	594923	20 %	60 %	20 %	0 %	332796309
589	NC_015518	TCTAT	2	10	594957	594966	20 %	60 %	0 %	20 %	332796309
590	NC_015518	TCAAA	2	10	600726	600735	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
591	NC_015518	ATTCT	2	10	601204	601213	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
592	NC_015518	TAAAT	2	10	601716	601725	60 %	40 %	0 %	0 %	332796317
593	NC_015518	TTTAC	2	10	602427	602436	20 %	60 %	0 %	20 %	332796317
594	NC_015518	TGGCA	2	10	605969	605978	20 %	20 %	40 %	20 %	332796322
595	NC_015518	ATATA	2	10	606466	606475	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015518	ACTCT	2	10	608205	608214	20 %	40 %	0 %	40 %	332796323
597	NC_015518	TTCTT	2	10	608638	608647	0 %	80 %	0 %	20 %	332796323
598	NC_015518	ATACT	2	10	609850	609859	40 %	40 %	0 %	20 %	332796324
599	NC_015518	TTATC	2	10	612142	612151	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
600	NC_015518	CTGTT	2	10	612996	613005	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
601	NC_015518	TTTAT	2	10	614636	614645	20 %	80 %	0 %	0 %	332796329
602	NC_015518	TTGCT	2	10	615482	615491	0 %	60 %	20 %	20 %	332796330
603	NC_015518	AAAAG	2	10	617488	617497	80 %	0 %	20 %	0 %	332796333
604	NC_015518	AAGAG	2	10	617875	617884	60 %	0 %	40 %	0 %	332796333
605	NC_015518	TAAGC	2	10	618934	618943	40 %	20 %	20 %	20 %	332796335
606	NC_015518	TCCTT	2	10	620615	620624	0 %	60 %	0 %	40 %	332796337
607	NC_015518	TCCTT	2	10	621555	621564	0 %	60 %	0 %	40 %	332796338
608	NC_015518	CATCT	2	10	623006	623015	20 %	40 %	0 %	40 %	332796340
609	NC_015518	TAAAG	2	10	623741	623750	60 %	20 %	20 %	0 %	332796341
610	NC_015518	TCTTT	2	10	625474	625483	0 %	80 %	0 %	20 %	332796345
611	NC_015518	GTCTT	2	10	626966	626975	0 %	60 %	20 %	20 %	332796348
612	NC_015518	GAAAA	2	10	635592	635601	80 %	0 %	20 %	0 %	332796357
613	NC_015518	TTTTC	2	10	637052	637061	0 %	80 %	0 %	20 %	332796358
614	NC_015518	AAATA	2	10	638829	638838	80 %	20 %	0 %	0 %	332796361
615	NC_015518	ATTCC	2	10	639755	639764	20 %	40 %	0 %	40 %	332796362
616	NC_015518	AAATT	2	10	641454	641463	60 %	40 %	0 %	0 %	332796364
617	NC_015518	CATAT	2	10	644587	644596	40 %	40 %	0 %	20 %	332796369
618	NC_015518	AAGTA	2	10	645221	645230	60 %	20 %	20 %	0 %	332796369
619	NC_015518	TAAAA	2	10	646030	646039	80 %	20 %	0 %	0 %	332796370
620	NC_015518	TAAAT	2	10	646396	646405	60 %	40 %	0 %	0 %	332796370
621	NC_015518	AAAAG	2	10	647102	647111	80 %	0 %	20 %	0 %	332796371
622	NC_015518	GATAT	2	10	647676	647685	40 %	40 %	20 %	0 %	332796372
623	NC_015518	GACTA	2	10	647968	647977	40 %	20 %	20 %	20 %	332796373
624	NC_015518	CCTAT	2	10	654088	654097	20 %	40 %	0 %	40 %	332796383
625	NC_015518	TTCTA	2	10	655224	655233	20 %	60 %	0 %	20 %	332796385
626	NC_015518	CTTTT	2	10	656075	656084	0 %	80 %	0 %	20 %	332796386
627	NC_015518	TTTTC	2	10	656095	656104	0 %	80 %	0 %	20 %	332796386
628	NC_015518	ATTCT	2	10	656681	656690	20 %	60 %	0 %	20 %	332796387
629	NC_015518	ACTTC	2	10	657333	657342	20 %	40 %	0 %	40 %	332796388
630	NC_015518	TAACA	2	10	658479	658488	60 %	20 %	0 %	20 %	332796390
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