MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_015508	GC	4	8	1950002	1950009	0 %	0 %	50 %	50 %	332717118
41003	NC_015508	CGATG	2	10	1950018	1950027	20 %	20 %	40 %	20 %	332717118
41004	NC_015508	CGG	2	6	1950066	1950071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717118
41005	NC_015508	GAA	2	6	1950078	1950083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332717118
41006	NC_015508	TCG	2	6	1950128	1950133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717118
41007	NC_015508	TGCC	2	8	1950134	1950141	0 %	25 %	25 %	50 %	332717118
41008	NC_015508	TTC	2	6	1950155	1950160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332717118
41009	NC_015508	CGGCA	2	10	1950162	1950171	20 %	0 %	40 %	40 %	332717118
41010	NC_015508	CGG	2	6	1950176	1950181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717118
41011	NC_015508	GCC	2	6	1950184	1950189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717118
41012	NC_015508	GCG	2	6	1950214	1950219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717118
41013	NC_015508	GCC	2	6	1950223	1950228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717118
41014	NC_015508	TCC	2	6	1950396	1950401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41015	NC_015508	AGCG	2	8	1950421	1950428	25 %	0 %	50 %	25 %	332717119
41016	NC_015508	CGTGC	2	10	1950454	1950463	0 %	20 %	40 %	40 %	332717119
41017	NC_015508	GCT	2	6	1950464	1950469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717119
41018	NC_015508	GCA	2	6	1950524	1950529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717119
41019	NC_015508	CCG	2	6	1950538	1950543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717119
41020	NC_015508	GTG	2	6	1950607	1950612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332717119
41021	NC_015508	TGC	2	6	1950674	1950679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717119
41022	NC_015508	CGC	2	6	1950680	1950685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717119
41023	NC_015508	GGC	2	6	1950741	1950746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717119
41024	NC_015508	GCC	2	6	1950853	1950858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717119
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41029	NC_015508	GACTGA	2	12	1951097	1951108	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332717119
41030	NC_015508	CCA	2	6	1951238	1951243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332717119
41031	NC_015508	GAT	2	6	1951271	1951276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41032	NC_015508	CG	3	6	1951282	1951287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41033	NC_015508	TCC	2	6	1951336	1951341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41034	NC_015508	ACCGG	2	10	1951342	1951351	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41035	NC_015508	ATAG	2	8	1951365	1951372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41036	NC_015508	ATT	2	6	1951373	1951378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41037	NC_015508	GCGGA	2	10	1951459	1951468	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41038	NC_015508	GCG	2	6	1951472	1951477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41039	NC_015508	TC	3	6	1951482	1951487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41040	NC_015508	GCG	2	6	1951544	1951549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717120
41041	NC_015508	CGGT	2	8	1951586	1951593	0 %	25 %	50 %	25 %	332717120
41042	NC_015508	GTGG	2	8	1951681	1951688	0 %	25 %	75 %	0 %	332717120
41043	NC_015508	CGA	2	6	1951825	1951830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717120
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41047	NC_015508	CGT	2	6	1951930	1951935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717120
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41049	NC_015508	T	6	6	1951997	1952002	0 %	100 %	0 %	0 %	332717120
41050	NC_015508	CTG	2	6	1952018	1952023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717120
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41052	NC_015508	CG	3	6	1952074	1952079	0 %	0 %	50 %	50 %	332717120
41053	NC_015508	CGC	2	6	1952169	1952174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717120
41054	NC_015508	GAT	2	6	1952188	1952193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717120
41055	NC_015508	CGC	2	6	1952236	1952241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717120
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41058	NC_015508	GCA	2	6	1952363	1952368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717121
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41071	NC_015508	T	6	6	1952996	1953001	0 %	100 %	0 %	0 %	332717121
41072	NC_015508	CTAT	2	8	1953017	1953024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41073	NC_015508	AGCC	2	8	1953025	1953032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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41085	NC_015508	TGAA	2	8	1953681	1953688	50 %	25 %	25 %	0 %	332717123
41086	NC_015508	CCCT	2	8	1953767	1953774	0 %	25 %	0 %	75 %	332717123
41087	NC_015508	CGC	2	6	1953784	1953789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717123
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41090	NC_015508	TCGA	2	8	1953932	1953939	25 %	25 %	25 %	25 %	332717123
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41101	NC_015508	GATC	2	8	1954750	1954757	25 %	25 %	25 %	25 %	332717124
41102	NC_015508	GC	3	6	1954764	1954769	0 %	0 %	50 %	50 %	332717124
41103	NC_015508	CGC	2	6	1954915	1954920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717124
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41105	NC_015508	GC	3	6	1955056	1955061	0 %	0 %	50 %	50 %	332717124
41106	NC_015508	GCC	2	6	1955068	1955073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717124
41107	NC_015508	CGA	2	6	1955107	1955112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717124
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41110	NC_015508	GAC	2	6	1955129	1955134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717124
41111	NC_015508	CGGCG	2	10	1955148	1955157	0 %	0 %	60 %	40 %	332717124
41112	NC_015508	TGG	2	6	1955209	1955214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332717124
41113	NC_015508	CGT	2	6	1955215	1955220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717124
41114	NC_015508	GGGA	2	8	1955311	1955318	25 %	0 %	75 %	0 %	332717124
41115	NC_015508	CGA	2	6	1955371	1955376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717124
41116	NC_015508	TAG	2	6	1955508	1955513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717124
41117	NC_015508	TCT	2	6	1955570	1955575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332717124
41118	NC_015508	CT	3	6	1955599	1955604	0 %	50 %	0 %	50 %	332717124
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41230	NC_015508	CCG	2	6	1961077	1961082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717131
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41232	NC_015508	CT	3	6	1961138	1961143	0 %	50 %	0 %	50 %	332717131
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41351	NC_015508	GGC	2	6	1967567	1967572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717136
41352	NC_015508	GGC	2	6	1967599	1967604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717136
41353	NC_015508	GCG	2	6	1967657	1967662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717136
41354	NC_015508	TCGA	2	8	1967684	1967691	25 %	25 %	25 %	25 %	332717136
41355	NC_015508	CGA	3	9	1967721	1967729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717136
41356	NC_015508	TCA	2	6	1967730	1967735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717136
41357	NC_015508	GGC	3	9	1967740	1967748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717136
41358	NC_015508	CGG	2	6	1967784	1967789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717136
41359	NC_015508	GC	3	6	1967826	1967831	0 %	0 %	50 %	50 %	332717136
41360	NC_015508	GCA	2	6	1967871	1967876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717136
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41362	NC_015508	AGGTC	2	10	1967949	1967958	20 %	20 %	40 %	20 %	332717136
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41372	NC_015508	CTG	2	6	1968400	1968405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717136
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41378	NC_015508	GCG	2	6	1968590	1968595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717136
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41382	NC_015508	TGA	2	6	1968693	1968698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717136
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41387	NC_015508	GC	3	6	1968828	1968833	0 %	0 %	50 %	50 %	332717136
41388	NC_015508	CGA	2	6	1968837	1968842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717136
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41396	NC_015508	CGG	2	6	1969044	1969049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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41398	NC_015508	CA	3	6	1969121	1969126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41399	NC_015508	GCC	2	6	1969159	1969164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41400	NC_015508	CGGCG	2	10	1969171	1969180	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41401	NC_015508	GCC	2	6	1969264	1969269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717137
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41422	NC_015508	CCGGT	2	10	1970163	1970172	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41423	NC_015508	GCC	2	6	1970214	1970219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717138
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41443	NC_015508	A	8	8	1970909	1970916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41444	NC_015508	CGAAC	2	10	1970984	1970993	40 %	0 %	20 %	40 %	332717139
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41452	NC_015508	TA	3	6	1971297	1971302	50 %	50 %	0 %	0 %	332717139
41453	NC_015508	ATCGC	2	10	1971421	1971430	20 %	20 %	20 %	40 %	332717139
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41456	NC_015508	GC	3	6	1971584	1971589	0 %	0 %	50 %	50 %	332717139
41457	NC_015508	GC	3	6	1971637	1971642	0 %	0 %	50 %	50 %	332717139
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41460	NC_015508	TCGG	2	8	1971873	1971880	0 %	25 %	50 %	25 %	332717139
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41463	NC_015508	CGGTTC	2	12	1972040	1972051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717139
41464	NC_015508	TCT	2	6	1972054	1972059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332717139
41465	NC_015508	TGC	2	6	1972063	1972068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717139
41466	NC_015508	TCT	2	6	1972129	1972134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332717139
41467	NC_015508	TGCG	2	8	1972162	1972169	0 %	25 %	50 %	25 %	332717139
41468	NC_015508	CGT	3	9	1972178	1972186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717139
41469	NC_015508	CGT	2	6	1972256	1972261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41470	NC_015508	GGC	2	6	1972277	1972282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717140
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41472	NC_015508	CAGG	2	8	1972428	1972435	25 %	0 %	50 %	25 %	332717140
41473	NC_015508	CGA	2	6	1972451	1972456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717140
41474	NC_015508	TCA	2	6	1972495	1972500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717140
41475	NC_015508	GC	3	6	1972524	1972529	0 %	0 %	50 %	50 %	332717140
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