MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26003	NC_015508	CGC	2	6	1248021	1248026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716498
26004	NC_015508	CGCC	2	8	1248121	1248128	0 %	0 %	25 %	75 %	332716498
26005	NC_015508	TTC	2	6	1248131	1248136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716498
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26008	NC_015508	TGA	2	6	1248258	1248263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716498
26009	NC_015508	GC	3	6	1248318	1248323	0 %	0 %	50 %	50 %	332716498
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26012	NC_015508	CCGC	2	8	1248516	1248523	0 %	0 %	25 %	75 %	332716498
26013	NC_015508	TGG	2	6	1248626	1248631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716498
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26016	NC_015508	CTTC	2	8	1248831	1248838	0 %	50 %	0 %	50 %	332716498
26017	NC_015508	CGA	2	6	1248874	1248879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716498
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26021	NC_015508	CGCTG	2	10	1248990	1248999	0 %	20 %	40 %	40 %	332716499
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26103	NC_015508	TGA	3	9	1252952	1252960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26118	NC_015508	CGT	2	6	1253725	1253730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716503
26119	NC_015508	CGG	2	6	1253734	1253739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716503
26120	NC_015508	TCG	2	6	1253799	1253804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716503
26121	NC_015508	CGG	2	6	1253812	1253817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716503
26122	NC_015508	CAGG	2	8	1253837	1253844	25 %	0 %	50 %	25 %	332716503
26123	NC_015508	CGT	2	6	1253875	1253880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716503
26124	NC_015508	GCG	2	6	1253892	1253897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716503
26125	NC_015508	CGATC	2	10	1253917	1253926	20 %	20 %	20 %	40 %	332716503
26126	NC_015508	CGA	2	6	1253950	1253955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716503
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26130	NC_015508	CGA	2	6	1254298	1254303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716503
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26132	NC_015508	AGG	2	6	1254396	1254401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332716503
26133	NC_015508	GCG	2	6	1254446	1254451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716503
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26141	NC_015508	CCA	3	9	1254744	1254752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716503
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26144	NC_015508	CGG	2	6	1254822	1254827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716503
26145	NC_015508	AC	3	6	1254942	1254947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26146	NC_015508	CTT	2	6	1255000	1255005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26147	NC_015508	CGTT	2	8	1255059	1255066	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26148	NC_015508	GGT	2	6	1255093	1255098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26149	NC_015508	A	6	6	1255213	1255218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26150	NC_015508	TCAT	2	8	1255284	1255291	25 %	50 %	0 %	25 %	332716504
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26153	NC_015508	GTC	2	6	1255626	1255631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716504
26154	NC_015508	TGA	2	6	1255786	1255791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716504
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26164	NC_015508	GGA	2	6	1256372	1256377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26165	NC_015508	TGA	2	6	1256383	1256388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716505
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26174	NC_015508	GC	3	6	1256996	1257001	0 %	0 %	50 %	50 %	332716505
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26183	NC_015508	GC	3	6	1257567	1257572	0 %	0 %	50 %	50 %	332716506
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26199	NC_015508	ACTG	2	8	1258202	1258209	25 %	25 %	25 %	25 %	332716507
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26206	NC_015508	TGA	3	9	1258726	1258734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716507
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26210	NC_015508	CGG	2	6	1258979	1258984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716508
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26214	NC_015508	CGT	2	6	1259129	1259134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716508
26215	NC_015508	TAGA	2	8	1259258	1259265	50 %	25 %	25 %	0 %	332716508
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26217	NC_015508	TAAAA	2	10	1259371	1259380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26218	NC_015508	TTC	2	6	1259474	1259479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716509
26219	NC_015508	C	6	6	1259517	1259522	0 %	0 %	0 %	100 %	332716509
26220	NC_015508	GTC	2	6	1259638	1259643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716510
26221	NC_015508	TCTG	2	8	1259651	1259658	0 %	50 %	25 %	25 %	332716510
26222	NC_015508	AGC	2	6	1259778	1259783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716511
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26229	NC_015508	CTG	2	6	1260130	1260135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716511
26230	NC_015508	CGG	2	6	1260183	1260188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716511
26231	NC_015508	GAC	2	6	1260210	1260215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716511
26232	NC_015508	GCA	2	6	1260299	1260304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716511
26233	NC_015508	GAA	2	6	1260361	1260366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716511
26234	NC_015508	ACG	2	6	1260367	1260372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716511
26235	NC_015508	CAC	2	6	1260411	1260416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716511
26236	NC_015508	GGC	2	6	1260516	1260521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716511
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26239	NC_015508	GC	3	6	1260845	1260850	0 %	0 %	50 %	50 %	332716511
26240	NC_015508	GAACT	2	10	1260865	1260874	40 %	20 %	20 %	20 %	332716511
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26257	NC_015508	CTG	2	6	1261833	1261838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716512
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26264	NC_015508	ACG	2	6	1262026	1262031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716512
26265	NC_015508	TTTC	2	8	1262066	1262073	0 %	75 %	0 %	25 %	332716512
26266	NC_015508	GA	3	6	1262171	1262176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26267	NC_015508	GTT	2	6	1262205	1262210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26268	NC_015508	AAC	2	6	1262222	1262227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26269	NC_015508	TTG	2	6	1262271	1262276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26270	NC_015508	GAC	2	6	1262296	1262301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26296	NC_015508	CGG	3	9	1263596	1263604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26297	NC_015508	CGC	2	6	1263612	1263617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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26301	NC_015508	GGCC	2	8	1263787	1263794	0 %	0 %	50 %	50 %	332716514
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26304	NC_015508	GGT	2	6	1263912	1263917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716514
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26312	NC_015508	GCCG	3	12	1264279	1264290	0 %	0 %	50 %	50 %	332716514
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26316	NC_015508	CGA	2	6	1264431	1264436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716514
26317	NC_015508	TCA	2	6	1264451	1264456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716514
26318	NC_015508	GCA	2	6	1264476	1264481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716514
26319	NC_015508	GCTT	2	8	1264536	1264543	0 %	50 %	25 %	25 %	332716514
26320	NC_015508	CCGGA	2	10	1264583	1264592	20 %	0 %	40 %	40 %	332716514
26321	NC_015508	GCA	2	6	1264610	1264615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716514
26322	NC_015508	GCT	2	6	1264719	1264724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716514
26323	NC_015508	GGT	2	6	1264764	1264769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716514
26324	NC_015508	CGG	2	6	1264820	1264825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716514
26325	NC_015508	CCG	2	6	1264887	1264892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26326	NC_015508	CTG	2	6	1265091	1265096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716515
26327	NC_015508	TTG	2	6	1265098	1265103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716515
26328	NC_015508	GCA	2	6	1265121	1265126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716515
26329	NC_015508	CCG	2	6	1265134	1265139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716515
26330	NC_015508	ATC	2	6	1265157	1265162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716515
26331	NC_015508	CGATGG	2	12	1265249	1265260	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	332716515
26332	NC_015508	AGA	2	6	1265273	1265278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716515
26333	NC_015508	CTG	2	6	1265286	1265291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716515
26334	NC_015508	GCCG	3	12	1265434	1265445	0 %	0 %	50 %	50 %	332716515
26335	NC_015508	GGCAG	2	10	1265575	1265584	20 %	0 %	60 %	20 %	332716515
26336	NC_015508	TGC	2	6	1265590	1265595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716515
26337	NC_015508	CGA	2	6	1265627	1265632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716515
26338	NC_015508	GCAG	2	8	1265687	1265694	25 %	0 %	50 %	25 %	332716515
26339	NC_015508	CTG	2	6	1265739	1265744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716515
26340	NC_015508	GGC	2	6	1265747	1265752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716515
26341	NC_015508	GGAA	2	8	1265768	1265775	50 %	0 %	50 %	0 %	332716516
26342	NC_015508	TGC	2	6	1265805	1265810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716516
26343	NC_015508	GCC	2	6	1265843	1265848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716516
26344	NC_015508	TCG	2	6	1265850	1265855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716516
26345	NC_015508	GCG	2	6	1265868	1265873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716516
26346	NC_015508	CAT	2	6	1265926	1265931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716516
26347	NC_015508	CGT	2	6	1266163	1266168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716516
26348	NC_015508	CGT	2	6	1266170	1266175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716516
26349	NC_015508	CGG	2	6	1266186	1266191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716516
26350	NC_015508	TGT	2	6	1266246	1266251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716516
26351	NC_015508	TCC	2	6	1266276	1266281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716516
26352	NC_015508	ATC	2	6	1266320	1266325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716516
26353	NC_015508	CGG	2	6	1266363	1266368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716516
26354	NC_015508	CATCGA	2	12	1266373	1266384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332716516
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26357	NC_015508	TTG	2	6	1266690	1266695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716516
26358	NC_015508	GTC	2	6	1266710	1266715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716516
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26360	NC_015508	TTCG	2	8	1266757	1266764	0 %	50 %	25 %	25 %	332716516
26361	NC_015508	CCTTGC	2	12	1266784	1266795	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	332716516
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26365	NC_015508	CGG	2	6	1267072	1267077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716516
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26367	NC_015508	TGT	2	6	1267231	1267236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26368	NC_015508	ACG	2	6	1267266	1267271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26409	NC_015508	ATT	2	6	1268929	1268934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332716519
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26440	NC_015508	GC	3	6	1270207	1270212	0 %	0 %	50 %	50 %	332716519
26441	NC_015508	GAT	2	6	1270214	1270219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716519
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26444	NC_015508	CTG	2	6	1270295	1270300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716519
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26447	NC_015508	CGC	2	6	1270424	1270429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716519
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26450	NC_015508	GGC	3	9	1270548	1270556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716519
26451	NC_015508	GCC	2	6	1270631	1270636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716519
26452	NC_015508	CGT	2	6	1270700	1270705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716519
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26456	NC_015508	ATCGCA	2	12	1270839	1270850	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332716519
26457	NC_015508	CGT	2	6	1270853	1270858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716519
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26459	NC_015508	CGT	2	6	1270936	1270941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716519
26460	NC_015508	CCG	2	6	1270972	1270977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716519
26461	NC_015508	GGC	2	6	1271036	1271041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716519
26462	NC_015508	CGC	2	6	1271125	1271130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716519
26463	NC_015508	CGC	2	6	1271149	1271154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716519
26464	NC_015508	GGATC	2	10	1271176	1271185	20 %	20 %	40 %	20 %	332716519
26465	NC_015508	GCC	2	6	1271196	1271201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716519
26466	NC_015508	TTC	2	6	1271219	1271224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716519
26467	NC_015508	GAA	2	6	1271270	1271275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716519
26468	NC_015508	CGA	2	6	1271284	1271289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716519
26469	NC_015508	CGA	2	6	1271294	1271299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716519
26470	NC_015508	GC	3	6	1271323	1271328	0 %	0 %	50 %	50 %	332716519
26471	NC_015508	GAC	2	6	1271411	1271416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716519
26472	NC_015508	TCG	2	6	1271418	1271423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716519
26473	NC_015508	CTTC	2	8	1271431	1271438	0 %	50 %	0 %	50 %	332716519
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26475	NC_015508	CAGA	2	8	1271522	1271529	50 %	0 %	25 %	25 %	332716519
26476	NC_015508	ATG	2	6	1271531	1271536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716519
26477	NC_015508	CG	3	6	1271542	1271547	0 %	0 %	50 %	50 %	332716519
26478	NC_015508	ACG	2	6	1271562	1271567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716519
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26483	NC_015508	GAT	2	6	1271681	1271686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716519
26484	NC_015508	ACC	2	6	1271693	1271698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716519
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26489	NC_015508	TTC	2	6	1271957	1271962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716519
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26491	NC_015508	CGG	2	6	1271978	1271983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716519
26492	NC_015508	AGC	2	6	1272024	1272029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716519
26493	NC_015508	GTT	2	6	1272096	1272101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716519
26494	NC_015508	CTG	2	6	1272152	1272157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716519
26495	NC_015508	CGC	2	6	1272180	1272185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716519
26496	NC_015508	GCA	2	6	1272264	1272269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716519
26497	NC_015508	TCG	2	6	1272288	1272293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716519
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26499	NC_015508	CTT	2	6	1272353	1272358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716519
26500	NC_015508	GAT	2	6	1272359	1272364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716519

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