MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 32442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015508	CGG	2	6	144915	144920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715513
2002	NC_015508	TTC	2	6	145087	145092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715513
2003	NC_015508	CGC	2	6	145111	145116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715513
2004	NC_015508	CAA	2	6	145119	145124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715513
2005	NC_015508	CTT	2	6	145171	145176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715513
2006	NC_015508	GAT	2	6	145210	145215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715513
2007	NC_015508	CAT	2	6	145249	145254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715513
2008	NC_015508	CGC	2	6	145272	145277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715513
2009	NC_015508	AGC	2	6	145517	145522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715513
2010	NC_015508	GGC	2	6	145538	145543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715513
2011	NC_015508	CGG	2	6	145561	145566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715513
2012	NC_015508	TAG	2	6	145639	145644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_015508	CGG	3	9	145671	145679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_015508	GCG	2	6	146026	146031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715514
2015	NC_015508	CGG	2	6	146239	146244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715514
2016	NC_015508	GGC	4	12	146246	146257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715514
2017	NC_015508	GAT	2	6	146258	146263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715514
2018	NC_015508	GGC	2	6	146279	146284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715514
2019	NC_015508	GCG	2	6	146420	146425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715514
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2021	NC_015508	CGA	2	6	146644	146649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715514
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2023	NC_015508	CCG	2	6	146680	146685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715514
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2030	NC_015508	TCG	2	6	147120	147125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715515
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2032	NC_015508	GCC	2	6	147185	147190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715515
2033	NC_015508	CGA	2	6	147232	147237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715515
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2051	NC_015508	CGG	2	6	148293	148298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715517
2052	NC_015508	GAC	2	6	148370	148375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715517
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2054	NC_015508	CAT	2	6	148475	148480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715517
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2062	NC_015508	TCG	2	6	149146	149151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715518
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2118	NC_015508	CGC	2	6	152633	152638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715521
2119	NC_015508	CTC	2	6	152715	152720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715522
2120	NC_015508	TCA	2	6	152853	152858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715522
2121	NC_015508	CTG	2	6	152967	152972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2122	NC_015508	CTG	2	6	152983	152988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2123	NC_015508	TCC	2	6	153062	153067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715522
2124	NC_015508	CCG	2	6	153174	153179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715522
2125	NC_015508	GCA	2	6	153225	153230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2126	NC_015508	GTG	2	6	153245	153250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715522
2127	NC_015508	GCG	2	6	153257	153262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715522
2128	NC_015508	ATC	2	6	153277	153282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715522
2129	NC_015508	TGC	2	6	153295	153300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2130	NC_015508	CGG	2	6	153422	153427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715522
2131	NC_015508	GCG	2	6	153582	153587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715522
2132	NC_015508	GCG	2	6	153662	153667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715522
2133	NC_015508	TCC	2	6	153680	153685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715522
2134	NC_015508	GTC	2	6	153737	153742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2135	NC_015508	TCT	2	6	153774	153779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715522
2136	NC_015508	CGA	2	6	153843	153848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2137	NC_015508	CTG	2	6	153862	153867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2138	NC_015508	GGC	2	6	153868	153873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715522
2139	NC_015508	ATG	2	6	153884	153889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715522
2140	NC_015508	CTG	2	6	153898	153903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2141	NC_015508	GTC	2	6	153940	153945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2142	NC_015508	CGT	2	6	153964	153969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2143	NC_015508	GGC	2	6	153974	153979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715522
2144	NC_015508	GCA	2	6	154077	154082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2145	NC_015508	AGA	2	6	154152	154157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715522
2146	NC_015508	CCG	2	6	154250	154255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715522
2147	NC_015508	GTG	2	6	154279	154284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715522
2148	NC_015508	CAC	2	6	154354	154359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715522
2149	NC_015508	TGC	2	6	154383	154388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2150	NC_015508	TGT	2	6	154405	154410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715522
2151	NC_015508	GAA	2	6	154418	154423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715522
2152	NC_015508	CGA	2	6	154605	154610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715523
2153	NC_015508	ACC	2	6	154667	154672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715523
2154	NC_015508	GCC	2	6	154747	154752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715523
2155	NC_015508	GCC	2	6	154781	154786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715523
2156	NC_015508	CCG	2	6	154853	154858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715523
2157	NC_015508	CCG	2	6	154901	154906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715523
2158	NC_015508	TAT	2	6	154953	154958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715523
2159	NC_015508	GCC	2	6	155027	155032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715523
2160	NC_015508	CAC	2	6	155035	155040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715523
2161	NC_015508	CAC	2	6	155074	155079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715523
2162	NC_015508	CCG	2	6	155135	155140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715523
2163	NC_015508	TGC	2	6	155142	155147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715523
2164	NC_015508	CCT	2	6	155370	155375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715523
2165	NC_015508	GCA	2	6	155379	155384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715523
2166	NC_015508	GGT	2	6	155458	155463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715523
2167	NC_015508	GGC	2	6	155482	155487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715523
2168	NC_015508	CGG	2	6	155652	155657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715523
2169	NC_015508	TGC	2	6	155818	155823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715524
2170	NC_015508	ATC	2	6	155935	155940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715524
2171	NC_015508	TCG	2	6	155950	155955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715524
2172	NC_015508	CCA	2	6	155987	155992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715524
2173	NC_015508	TCG	2	6	156019	156024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715524
2174	NC_015508	GCT	3	9	156074	156082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715524
2175	NC_015508	GCG	2	6	156197	156202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715524
2176	NC_015508	TTG	2	6	156283	156288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715524
2177	NC_015508	CAG	2	6	156372	156377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715524
2178	NC_015508	ACC	2	6	156399	156404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715524
2179	NC_015508	GAT	2	6	156405	156410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715524
2180	NC_015508	GAC	2	6	156414	156419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715524
2181	NC_015508	GTT	2	6	156426	156431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715524
2182	NC_015508	ACC	2	6	156510	156515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715525
2183	NC_015508	CCG	2	6	156530	156535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715525
2184	NC_015508	GCA	2	6	156738	156743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715525
2185	NC_015508	GCC	2	6	156823	156828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715525
2186	NC_015508	GCC	2	6	156851	156856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715525
2187	NC_015508	GGT	2	6	156883	156888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715525
2188	NC_015508	GGC	2	6	156893	156898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715525
2189	NC_015508	GAG	2	6	156949	156954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715525
2190	NC_015508	GAT	2	6	157036	157041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715525
2191	NC_015508	CGG	2	6	157071	157076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715525
2192	NC_015508	GGC	2	6	157195	157200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715526
2193	NC_015508	GAA	2	6	157249	157254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715526
2194	NC_015508	TCA	2	6	157341	157346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715526
2195	NC_015508	GCA	2	6	157392	157397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715526
2196	NC_015508	ATG	3	9	157406	157414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715526
2197	NC_015508	CAC	2	6	157491	157496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715526
2198	NC_015508	TTG	2	6	157523	157528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715526
2199	NC_015508	CGG	2	6	157650	157655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715526
2200	NC_015508	CAC	2	6	157756	157761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715526
2201	NC_015508	CAG	2	6	157771	157776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715526
2202	NC_015508	CGC	2	6	157937	157942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715527
2203	NC_015508	CTG	2	6	157986	157991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715527
2204	NC_015508	TGA	2	6	157994	157999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715527
2205	NC_015508	TGA	2	6	158015	158020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715527
2206	NC_015508	ACC	2	6	158083	158088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715527
2207	NC_015508	CGA	2	6	158477	158482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715527
2208	NC_015508	AAT	2	6	158522	158527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715527
2209	NC_015508	GTT	2	6	158547	158552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715527
2210	NC_015508	TCA	2	6	158557	158562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715527
2211	NC_015508	ATG	2	6	158620	158625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715527
2212	NC_015508	GGC	2	6	158667	158672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715527
2213	NC_015508	CAG	2	6	158673	158678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715527
2214	NC_015508	CGA	2	6	158684	158689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715527
2215	NC_015508	TTG	2	6	158705	158710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715527
2216	NC_015508	GCA	2	6	158814	158819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715528
2217	NC_015508	GGA	2	6	159021	159026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2218	NC_015508	ATG	2	6	159029	159034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715529
2219	NC_015508	ACA	2	6	159039	159044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715529
2220	NC_015508	TTG	2	6	159141	159146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715529
2221	NC_015508	GAC	2	6	159257	159262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715529
2222	NC_015508	TGG	2	6	159336	159341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715529
2223	NC_015508	CGC	2	6	159364	159369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715529
2224	NC_015508	TCA	2	6	159375	159380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715529
2225	NC_015508	GCT	2	6	159502	159507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715529
2226	NC_015508	GCG	2	6	159584	159589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715529
2227	NC_015508	CGA	2	6	159666	159671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715529
2228	NC_015508	CGG	2	6	159712	159717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715529
2229	NC_015508	CAC	2	6	159811	159816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715529
2230	NC_015508	TCG	2	6	159846	159851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715529
2231	NC_015508	GCC	2	6	159957	159962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715529
2232	NC_015508	CCG	3	9	160008	160016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715529
2233	NC_015508	GCT	2	6	160036	160041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715529
2234	NC_015508	CAT	2	6	160344	160349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715530
2235	NC_015508	AGG	2	6	160388	160393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715530
2236	NC_015508	GGC	3	9	160455	160463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715530
2237	NC_015508	ATC	2	6	160579	160584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715530
2238	NC_015508	TCA	2	6	160594	160599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715530
2239	NC_015508	GCG	2	6	160621	160626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715530
2240	NC_015508	CCG	2	6	160637	160642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715530
2241	NC_015508	ACC	2	6	160644	160649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715530
2242	NC_015508	GAA	2	6	160695	160700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715530
2243	NC_015508	TGT	2	6	160736	160741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715530
2244	NC_015508	GCG	2	6	160876	160881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715530
2245	NC_015508	CGA	2	6	160919	160924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715530
2246	NC_015508	GCT	2	6	160970	160975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715530
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2252	NC_015508	AGT	2	6	161290	161295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715531
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2266	NC_015508	TAT	2	6	161987	161992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2267	NC_015508	CGC	2	6	162009	162014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2268	NC_015508	GCA	2	6	162018	162023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2269	NC_015508	AAT	2	6	162043	162048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2270	NC_015508	ACA	2	6	162058	162063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2271	NC_015508	AAT	2	6	162098	162103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2272	NC_015508	GCT	2	6	162119	162124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2308	NC_015508	GAG	2	6	164061	164066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2310	NC_015508	GAG	2	6	164136	164141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2334	NC_015508	CGT	2	6	165478	165483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2344	NC_015508	GCC	2	6	166009	166014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715536
2345	NC_015508	TGA	2	6	166109	166114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715536
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2350	NC_015508	CCG	2	6	166666	166671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715536
2351	NC_015508	CGA	4	12	166682	166693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715536
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2353	NC_015508	ACG	2	6	166777	166782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715536
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2355	NC_015508	GCA	2	6	166856	166861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715536
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2357	NC_015508	TTC	2	6	166876	166881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715536
2358	NC_015508	GGC	2	6	166971	166976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715537
2359	NC_015508	CCT	2	6	167021	167026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715537
2360	NC_015508	TCC	2	6	167038	167043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715537
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2383	NC_015508	GCG	2	6	168788	168793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715538
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2468	NC_015508	GCG	2	6	173122	173127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715541
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2475	NC_015508	CGC	2	6	173328	173333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
2476	NC_015508	CCG	2	6	173337	173342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
2477	NC_015508	CGC	2	6	173386	173391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
2478	NC_015508	GGC	2	6	173602	173607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715541
2479	NC_015508	CCG	2	6	173675	173680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
2480	NC_015508	CTG	2	6	173830	173835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715541
2481	NC_015508	GCG	2	6	173861	173866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715541
2482	NC_015508	CTT	2	6	173874	173879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715541
2483	NC_015508	TGG	2	6	173924	173929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715541
2484	NC_015508	TGC	2	6	174005	174010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715541
2485	NC_015508	GCC	2	6	174181	174186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
2486	NC_015508	GTC	2	6	174244	174249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715541
2487	NC_015508	CCG	2	6	174266	174271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
2488	NC_015508	ATG	2	6	174287	174292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715541
2489	NC_015508	CGG	2	6	174317	174322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715541
2490	NC_015508	CAA	2	6	174645	174650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2491	NC_015508	TGC	2	6	174739	174744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715542
2492	NC_015508	GCC	2	6	174796	174801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715542
2493	NC_015508	CAG	2	6	174824	174829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715542
2494	NC_015508	GCA	2	6	174844	174849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715542
2495	NC_015508	TGC	2	6	174901	174906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715542
2496	NC_015508	GTG	2	6	174957	174962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715542
2497	NC_015508	CCT	2	6	174977	174982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715542
2498	NC_015508	ATC	2	6	175000	175005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715542
2499	NC_015508	TTC	2	6	175038	175043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715542
2500	NC_015508	GAG	2	6	175062	175067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715542

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