MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015508	TGCGG	2	10	323526	323535	0 %	20 %	60 %	20 %	332715662
6502	NC_015508	CGGCG	2	10	323662	323671	0 %	0 %	60 %	40 %	332715662
6503	NC_015508	CGT	2	6	323713	323718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715662
6504	NC_015508	CGAA	2	8	323753	323760	50 %	0 %	25 %	25 %	332715662
6505	NC_015508	GAT	2	6	323857	323862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715662
6506	NC_015508	TCG	2	6	323909	323914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715662
6507	NC_015508	GCC	2	6	323971	323976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715662
6508	NC_015508	CTCG	2	8	324006	324013	0 %	25 %	25 %	50 %	332715662
6509	NC_015508	CGCT	2	8	324053	324060	0 %	25 %	25 %	50 %	332715662
6510	NC_015508	AAT	2	6	324065	324070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715662
6511	NC_015508	CG	3	6	324133	324138	0 %	0 %	50 %	50 %	332715662
6512	NC_015508	TAA	2	6	324216	324221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715662
6513	NC_015508	TCTTGC	2	12	324257	324268	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	332715662
6514	NC_015508	GAC	2	6	324303	324308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715663
6515	NC_015508	TCG	2	6	324328	324333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715663
6516	NC_015508	AACG	2	8	324369	324376	50 %	0 %	25 %	25 %	332715663
6517	NC_015508	GCCAT	2	10	324496	324505	20 %	20 %	20 %	40 %	332715663
6518	NC_015508	TCA	2	6	324631	324636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715663
6519	NC_015508	GGT	2	6	324747	324752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715663
6520	NC_015508	CTG	2	6	324819	324824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715663
6521	NC_015508	ATG	2	6	324901	324906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715663
6522	NC_015508	TAA	2	6	324974	324979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715663
6523	NC_015508	TGT	2	6	324980	324985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715663
6524	NC_015508	TACG	2	8	325073	325080	25 %	25 %	25 %	25 %	332715663
6525	NC_015508	CGC	2	6	325125	325130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715663
6526	NC_015508	CCA	2	6	325199	325204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715663
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6528	NC_015508	CTT	2	6	325274	325279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715663
6529	NC_015508	CTTT	2	8	325296	325303	0 %	75 %	0 %	25 %	332715663
6530	NC_015508	AAAC	2	8	325307	325314	75 %	0 %	0 %	25 %	332715663
6531	NC_015508	CCGG	2	8	325318	325325	0 %	0 %	50 %	50 %	332715663
6532	NC_015508	CG	3	6	325403	325408	0 %	0 %	50 %	50 %	332715663
6533	NC_015508	GGT	2	6	325458	325463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715663
6534	NC_015508	AGC	2	6	325520	325525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715663
6535	NC_015508	TCA	2	6	325537	325542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715663
6536	NC_015508	AAC	2	6	325551	325556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715663
6537	NC_015508	AGG	2	6	325731	325736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715663
6538	NC_015508	T	7	7	325740	325746	0 %	100 %	0 %	0 %	332715663
6539	NC_015508	CGT	2	6	325748	325753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715663
6540	NC_015508	AATG	2	8	325837	325844	50 %	25 %	25 %	0 %	332715663
6541	NC_015508	GAA	2	6	325879	325884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715663
6542	NC_015508	GTA	2	6	325935	325940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715663
6543	NC_015508	TGA	2	6	325945	325950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715663
6544	NC_015508	TGCT	2	8	325956	325963	0 %	50 %	25 %	25 %	332715663
6545	NC_015508	TCAT	2	8	325993	326000	25 %	50 %	0 %	25 %	332715663
6546	NC_015508	TC	3	6	326093	326098	0 %	50 %	0 %	50 %	332715663
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6548	NC_015508	TCG	2	6	326116	326121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715663
6549	NC_015508	AAT	2	6	326133	326138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715663
6550	NC_015508	AAG	2	6	326154	326159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715663
6551	NC_015508	TAAGA	2	10	326195	326204	60 %	20 %	20 %	0 %	332715663
6552	NC_015508	TCATT	2	10	326261	326270	20 %	60 %	0 %	20 %	332715663
6553	NC_015508	TCA	2	6	326402	326407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715663
6554	NC_015508	AG	3	6	326585	326590	50 %	0 %	50 %	0 %	332715663
6555	NC_015508	ACC	2	6	326602	326607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715663
6556	NC_015508	CTG	2	6	326610	326615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715663
6557	NC_015508	TGCC	2	8	326627	326634	0 %	25 %	25 %	50 %	332715663
6558	NC_015508	CGCGC	2	10	326668	326677	0 %	0 %	40 %	60 %	332715663
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6560	NC_015508	GCT	2	6	326986	326991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_015508	GTAGC	2	10	327006	327015	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6562	NC_015508	T	7	7	327062	327068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_015508	CAGG	2	8	327282	327289	25 %	0 %	50 %	25 %	332715664
6564	NC_015508	AAC	2	6	327340	327345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715664
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6571	NC_015508	GAG	2	6	327623	327628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_015508	TTC	2	6	327739	327744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_015508	CCG	2	6	327771	327776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6574	NC_015508	GATGC	2	10	327812	327821	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6575	NC_015508	GCTC	2	8	327829	327836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_015508	CCG	2	6	328175	328180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715665
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6580	NC_015508	CAG	2	6	328281	328286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_015508	CGT	2	6	328382	328387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715666
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6584	NC_015508	A	6	6	328459	328464	100 %	0 %	0 %	0 %	332715666
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6588	NC_015508	T	6	6	328778	328783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_015508	TGC	2	6	328794	328799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_015508	TCT	2	6	328827	328832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_015508	GAA	2	6	328869	328874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_015508	AGA	2	6	328899	328904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_015508	A	7	7	328975	328981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_015508	GCCT	2	8	329069	329076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6595	NC_015508	G	6	6	329102	329107	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_015508	TGA	2	6	329142	329147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_015508	GAT	2	6	329249	329254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715667
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6599	NC_015508	GC	3	6	329326	329331	0 %	0 %	50 %	50 %	332715667
6600	NC_015508	TCG	2	6	329341	329346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715667
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6602	NC_015508	AAG	2	6	329424	329429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_015508	AAGA	2	8	329472	329479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_015508	GGA	2	6	329500	329505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_015508	ATC	2	6	329537	329542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_015508	A	6	6	329545	329550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_015508	GA	3	6	329577	329582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_015508	AGA	2	6	329640	329645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715668
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6612	NC_015508	TTG	2	6	329737	329742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715668
6613	NC_015508	GC	3	6	329752	329757	0 %	0 %	50 %	50 %	332715668
6614	NC_015508	CGG	2	6	329780	329785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715668
6615	NC_015508	GC	3	6	329888	329893	0 %	0 %	50 %	50 %	332715668
6616	NC_015508	TGC	2	6	329925	329930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715668
6617	NC_015508	GGCCG	2	10	329953	329962	0 %	0 %	60 %	40 %	332715668
6618	NC_015508	AGT	2	6	330006	330011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715668
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6621	NC_015508	TGGG	2	8	330121	330128	0 %	25 %	75 %	0 %	332715668
6622	NC_015508	CGG	2	6	330152	330157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715668
6623	NC_015508	TGC	3	9	330176	330184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715668
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6625	NC_015508	TGA	2	6	330296	330301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715668
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6994	NC_015508	T	6	6	347088	347093	0 %	100 %	0 %	0 %	332715681
6995	NC_015508	CT	3	6	347233	347238	0 %	50 %	0 %	50 %	332715681
6996	NC_015508	T	6	6	347378	347383	0 %	100 %	0 %	0 %	332715681
6997	NC_015508	CGT	2	6	347414	347419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715681
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