MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 5360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015508	CCAG	2	8	2006004	2006011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_015508	CCAG	2	8	2007141	2007148	25 %	0 %	25 %	50 %	332717173
5003	NC_015508	AGGA	2	8	2007251	2007258	50 %	0 %	50 %	0 %	332717173
5004	NC_015508	GGTT	2	8	2007909	2007916	0 %	50 %	50 %	0 %	332717173
5005	NC_015508	TCAT	2	8	2009694	2009701	25 %	50 %	0 %	25 %	332717174
5006	NC_015508	CCGG	2	8	2010378	2010385	0 %	0 %	50 %	50 %	332717175
5007	NC_015508	GCTG	2	8	2010406	2010413	0 %	25 %	50 %	25 %	332717175
5008	NC_015508	CGTC	2	8	2010437	2010444	0 %	25 %	25 %	50 %	332717175
5009	NC_015508	CAGC	2	8	2010805	2010812	25 %	0 %	25 %	50 %	332717175
5010	NC_015508	GCCG	2	8	2011537	2011544	0 %	0 %	50 %	50 %	332717175
5011	NC_015508	GCCG	2	8	2011599	2011606	0 %	0 %	50 %	50 %	332717175
5012	NC_015508	CGAC	2	8	2011629	2011636	25 %	0 %	25 %	50 %	332717175
5013	NC_015508	AGCG	2	8	2011906	2011913	25 %	0 %	50 %	25 %	332717176
5014	NC_015508	GCCA	2	8	2012393	2012400	25 %	0 %	25 %	50 %	332717176
5015	NC_015508	CCAC	2	8	2012854	2012861	25 %	0 %	0 %	75 %	332717177
5016	NC_015508	CGGC	2	8	2013234	2013241	0 %	0 %	50 %	50 %	332717177
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5019	NC_015508	CCTT	2	8	2017164	2017171	0 %	50 %	0 %	50 %	332717181
5020	NC_015508	CTCC	2	8	2017454	2017461	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5021	NC_015508	CCAG	2	8	2017468	2017475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_015508	AATA	2	8	2017524	2017531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_015508	GACG	2	8	2018311	2018318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_015508	CGGC	2	8	2019382	2019389	0 %	0 %	50 %	50 %	332717184
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5030	NC_015508	CGGT	2	8	2021713	2021720	0 %	25 %	50 %	25 %	332717186
5031	NC_015508	CTTG	2	8	2022108	2022115	0 %	50 %	25 %	25 %	332717187
5032	NC_015508	GTCA	2	8	2022139	2022146	25 %	25 %	25 %	25 %	332717187
5033	NC_015508	CGGC	2	8	2022782	2022789	0 %	0 %	50 %	50 %	332717187
5034	NC_015508	GATT	2	8	2023574	2023581	25 %	50 %	25 %	0 %	332717188
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5045	NC_015508	TGGA	2	8	2027101	2027108	25 %	25 %	50 %	0 %	332717191
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5048	NC_015508	ATGG	2	8	2028275	2028282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5051	NC_015508	CCGG	2	8	2028708	2028715	0 %	0 %	50 %	50 %	332717192
5052	NC_015508	TGCC	2	8	2029186	2029193	0 %	25 %	25 %	50 %	332717193
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5054	NC_015508	CGTC	2	8	2029952	2029959	0 %	25 %	25 %	50 %	332717194
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5056	NC_015508	GTTA	2	8	2031129	2031136	25 %	50 %	25 %	0 %	332717196
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5059	NC_015508	GATG	2	8	2033523	2033530	25 %	25 %	50 %	0 %	332717198
5060	NC_015508	CTGG	2	8	2033752	2033759	0 %	25 %	50 %	25 %	332717199
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5062	NC_015508	AGTT	2	8	2034369	2034376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015508	AAAG	2	8	2034447	2034454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015508	GCTG	2	8	2034953	2034960	0 %	25 %	50 %	25 %	332717200
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5073	NC_015508	CCGC	2	8	2036693	2036700	0 %	0 %	25 %	75 %	332717202
5074	NC_015508	GGGC	2	8	2036808	2036815	0 %	0 %	75 %	25 %	332717202
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5099	NC_015508	GCCA	2	8	2044751	2044758	25 %	0 %	25 %	50 %	332717211
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5114	NC_015508	CCGG	2	8	2055356	2055363	0 %	0 %	50 %	50 %	332717221
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.