MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 chromosome

Total Repeats: 139977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015422	GCG	2	6	486624	486629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823097
14002	NC_015422	GCG	2	6	486672	486677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823097
14003	NC_015422	GAG	2	6	486761	486766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330823097
14004	NC_015422	CGA	2	6	486769	486774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14005	NC_015422	ACG	2	6	486780	486785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14006	NC_015422	CG	3	6	486834	486839	0 %	0 %	50 %	50 %	330823097
14007	NC_015422	GC	3	6	486857	486862	0 %	0 %	50 %	50 %	330823097
14008	NC_015422	GCA	2	6	486897	486902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14009	NC_015422	TCA	2	6	486906	486911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823097
14010	NC_015422	CGGCG	2	10	486913	486922	0 %	0 %	60 %	40 %	330823097
14011	NC_015422	CAT	2	6	486961	486966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823097
14012	NC_015422	TGA	2	6	486975	486980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330823097
14013	NC_015422	GCG	2	6	487005	487010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823097
14014	NC_015422	CTGGA	2	10	487079	487088	20 %	20 %	40 %	20 %	330823097
14015	NC_015422	TCCG	2	8	487089	487096	0 %	25 %	25 %	50 %	330823097
14016	NC_015422	CAG	2	6	487103	487108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14017	NC_015422	CTT	2	6	487120	487125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330823097
14018	NC_015422	GAG	2	6	487169	487174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330823097
14019	NC_015422	CGC	2	6	487182	487187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823097
14020	NC_015422	GCA	2	6	487212	487217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14021	NC_015422	GCTG	2	8	487251	487258	0 %	25 %	50 %	25 %	330823097
14022	NC_015422	GC	3	6	487263	487268	0 %	0 %	50 %	50 %	330823097
14023	NC_015422	GCAGCT	2	12	487270	487281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14024	NC_015422	GGT	2	6	487294	487299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823097
14025	NC_015422	GTG	2	6	487340	487345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823097
14026	NC_015422	GCTC	2	8	487362	487369	0 %	25 %	25 %	50 %	330823097
14027	NC_015422	CTC	2	6	487447	487452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330823097
14028	NC_015422	CTG	2	6	487484	487489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14029	NC_015422	CAC	2	6	487492	487497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823097
14030	NC_015422	AAGCC	2	10	487533	487542	40 %	0 %	20 %	40 %	330823097
14031	NC_015422	AGG	2	6	487545	487550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330823097
14032	NC_015422	CTG	2	6	487589	487594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14033	NC_015422	CAC	2	6	487618	487623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823097
14034	NC_015422	TGC	2	6	487644	487649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14035	NC_015422	GAA	2	6	487669	487674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330823097
14036	NC_015422	CGG	2	6	487719	487724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823097
14037	NC_015422	GAAG	2	8	487822	487829	50 %	0 %	50 %	0 %	330823097
14038	NC_015422	CAT	2	6	487843	487848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823097
14039	NC_015422	CGCC	2	8	487857	487864	0 %	0 %	25 %	75 %	330823097
14040	NC_015422	GAA	2	6	487897	487902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330823097
14041	NC_015422	CGC	2	6	487935	487940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823097
14042	NC_015422	GGT	2	6	487948	487953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823097
14043	NC_015422	CGG	2	6	488023	488028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823097
14044	NC_015422	ACCGAG	2	12	488048	488059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14045	NC_015422	GGT	2	6	488152	488157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823097
14046	NC_015422	GAT	2	6	488158	488163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330823097
14047	NC_015422	ATC	2	6	488309	488314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823097
14048	NC_015422	GCC	2	6	488412	488417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823097
14049	NC_015422	ACC	2	6	488433	488438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823097
14050	NC_015422	ACCG	2	8	488475	488482	25 %	0 %	25 %	50 %	330823097
14051	NC_015422	AAG	2	6	488519	488524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330823097
14052	NC_015422	TCA	2	6	488556	488561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823097
14053	NC_015422	CGC	2	6	488562	488567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823097
14054	NC_015422	CGG	2	6	488629	488634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823097
14055	NC_015422	GAC	2	6	488657	488662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14056	NC_015422	GGC	2	6	488672	488677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823097
14057	NC_015422	CGC	2	6	488725	488730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823097
14058	NC_015422	GC	4	8	488729	488736	0 %	0 %	50 %	50 %	330823097
14059	NC_015422	GGT	2	6	488737	488742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823097
14060	NC_015422	ATC	2	6	488795	488800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823097
14061	NC_015422	CG	3	6	488829	488834	0 %	0 %	50 %	50 %	330823097
14062	NC_015422	CGG	2	6	488887	488892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823097
14063	NC_015422	ACT	2	6	488919	488924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823097
14064	NC_015422	CGA	2	6	488947	488952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823097
14065	NC_015422	TGGA	2	8	488987	488994	25 %	25 %	50 %	0 %	330823097
14066	NC_015422	GAG	2	6	488996	489001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330823097
14067	NC_015422	GA	3	6	489043	489048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_015422	CAG	2	6	489145	489150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823098
14069	NC_015422	CAA	2	6	489175	489180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330823098
14070	NC_015422	CGG	2	6	489241	489246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823098
14071	NC_015422	G	6	6	489286	489291	0 %	0 %	100 %	0 %	330823098
14072	NC_015422	GCT	2	6	489301	489306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823098
14073	NC_015422	CCAACC	2	12	489321	489332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823098
14074	NC_015422	CGA	2	6	489343	489348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823098
14075	NC_015422	CTA	2	6	489349	489354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823098
14076	NC_015422	ACC	2	6	489378	489383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823098
14077	NC_015422	CG	3	6	489418	489423	0 %	0 %	50 %	50 %	330823098
14078	NC_015422	GGA	2	6	489481	489486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330823098
14079	NC_015422	GCG	2	6	489495	489500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823098
14080	NC_015422	AGCGC	2	10	489510	489519	20 %	0 %	40 %	40 %	330823098
14081	NC_015422	ATG	2	6	489578	489583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330823098
14082	NC_015422	GCGT	2	8	489620	489627	0 %	25 %	50 %	25 %	330823098
14083	NC_015422	AAG	2	6	489737	489742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330823098
14084	NC_015422	CTA	2	6	489745	489750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823098
14085	NC_015422	TCT	2	6	489783	489788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330823098
14086	NC_015422	TGC	2	6	489864	489869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823098
14087	NC_015422	ACG	2	6	489873	489878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823098
14088	NC_015422	GCC	2	6	490117	490122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823098
14089	NC_015422	CGG	2	6	490140	490145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823098
14090	NC_015422	CCG	2	6	490233	490238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823098
14091	NC_015422	GTG	2	6	490253	490258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823098
14092	NC_015422	CG	3	6	490259	490264	0 %	0 %	50 %	50 %	330823098
14093	NC_015422	GC	3	6	490285	490290	0 %	0 %	50 %	50 %	330823098
14094	NC_015422	CAG	2	6	490340	490345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823098
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14097	NC_015422	GCT	2	6	490497	490502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823098
14098	NC_015422	CGG	2	6	490531	490536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823098
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14101	NC_015422	AAG	2	6	490594	490599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330823099
14102	NC_015422	GC	3	6	490636	490641	0 %	0 %	50 %	50 %	330823099
14103	NC_015422	TGG	2	6	490643	490648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823099
14104	NC_015422	GC	4	8	490668	490675	0 %	0 %	50 %	50 %	330823099
14105	NC_015422	GCA	2	6	490755	490760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823099
14106	NC_015422	GAG	2	6	490789	490794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330823099
14107	NC_015422	GCC	2	6	490820	490825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823099
14108	NC_015422	CG	3	6	490865	490870	0 %	0 %	50 %	50 %	330823099
14109	NC_015422	GGCC	2	8	490914	490921	0 %	0 %	50 %	50 %	330823099
14110	NC_015422	ACC	2	6	490949	490954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823099
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14113	NC_015422	CGC	2	6	491088	491093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823099
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14115	NC_015422	CGA	2	6	491154	491159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823099
14116	NC_015422	CG	3	6	491198	491203	0 %	0 %	50 %	50 %	330823099
14117	NC_015422	CG	3	6	491250	491255	0 %	0 %	50 %	50 %	330823099
14118	NC_015422	TTC	2	6	491346	491351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330823100
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14120	NC_015422	CTGTTC	2	12	491466	491477	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	330823100
14121	NC_015422	TCG	2	6	491488	491493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823100
14122	NC_015422	CGC	2	6	491503	491508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823100
14123	NC_015422	TCA	2	6	491527	491532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823100
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14125	NC_015422	CTG	2	6	491550	491555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823100
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14128	NC_015422	GCT	3	9	491606	491614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823100
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14139	NC_015422	GCCG	2	8	491978	491985	0 %	0 %	50 %	50 %	330823100
14140	NC_015422	GCCGC	2	10	491996	492005	0 %	0 %	40 %	60 %	330823100
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14142	NC_015422	GGA	2	6	492086	492091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14143	NC_015422	GCC	2	6	492111	492116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14144	NC_015422	ACC	4	12	492145	492156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823101
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14148	NC_015422	CTG	2	6	492271	492276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823101
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14153	NC_015422	CGC	2	6	492459	492464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823101
14154	NC_015422	CGCCTG	2	12	492493	492504	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330823101
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14157	NC_015422	TGC	2	6	492572	492577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823101
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14167	NC_015422	GGCC	2	8	492804	492811	0 %	0 %	50 %	50 %	330823101
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14220	NC_015422	GC	5	10	494370	494379	0 %	0 %	50 %	50 %	330823104
14221	NC_015422	GCT	2	6	494396	494401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823104
14222	NC_015422	CGA	2	6	494429	494434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823104
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14225	NC_015422	GCT	2	6	494540	494545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823104
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14227	NC_015422	TGC	2	6	494656	494661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823104
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14229	NC_015422	CG	3	6	494769	494774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14230	NC_015422	ACC	2	6	494804	494809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823105
14231	NC_015422	CGA	2	6	494851	494856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823105
14232	NC_015422	CGCT	2	8	494897	494904	0 %	25 %	25 %	50 %	330823105
14233	NC_015422	CTG	2	6	494909	494914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823105
14234	NC_015422	GC	3	6	494923	494928	0 %	0 %	50 %	50 %	330823105
14235	NC_015422	CG	3	6	494959	494964	0 %	0 %	50 %	50 %	330823105
14236	NC_015422	TGC	2	6	494982	494987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823105
14237	NC_015422	CGC	2	6	495001	495006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823105
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14239	NC_015422	CGC	2	6	495045	495050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823105
14240	NC_015422	GCG	2	6	495063	495068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823105
14241	NC_015422	GC	3	6	495140	495145	0 %	0 %	50 %	50 %	330823105
14242	NC_015422	AGC	2	6	495156	495161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823105
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14244	NC_015422	ACC	2	6	495237	495242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823105
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14248	NC_015422	CTG	2	6	495284	495289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823105
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14252	NC_015422	AAAG	2	8	495438	495445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14253	NC_015422	GCG	2	6	495487	495492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14262	NC_015422	CGG	2	6	495949	495954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14361	NC_015422	TGC	2	6	500059	500064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823109
14362	NC_015422	CAA	3	9	500067	500075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330823109
14363	NC_015422	GCT	2	6	500148	500153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823109
14364	NC_015422	CTG	2	6	500182	500187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823109
14365	NC_015422	CAC	2	6	500316	500321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823109
14366	NC_015422	GGGC	2	8	500339	500346	0 %	0 %	75 %	25 %	330823109
14367	NC_015422	GCC	2	6	500392	500397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823109
14368	NC_015422	CTG	2	6	500401	500406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823109
14369	NC_015422	GC	4	8	500458	500465	0 %	0 %	50 %	50 %	330823109
14370	NC_015422	GC	3	6	500476	500481	0 %	0 %	50 %	50 %	330823109
14371	NC_015422	GCA	2	6	500507	500512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823109
14372	NC_015422	CG	4	8	500562	500569	0 %	0 %	50 %	50 %	330823109
14373	NC_015422	CATG	2	8	500592	500599	25 %	25 %	25 %	25 %	330823109
14374	NC_015422	T	8	8	500692	500699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14375	NC_015422	CAGC	2	8	500712	500719	25 %	0 %	25 %	50 %	330823110
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14378	NC_015422	GC	5	10	500860	500869	0 %	0 %	50 %	50 %	330823110
14379	NC_015422	GCGTG	2	10	500877	500886	0 %	20 %	60 %	20 %	330823110
14380	NC_015422	GCG	3	9	500948	500956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823110
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14392	NC_015422	GCT	2	6	501288	501293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823110
14393	NC_015422	GC	3	6	501331	501336	0 %	0 %	50 %	50 %	330823110
14394	NC_015422	TGC	2	6	501363	501368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823110
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14396	NC_015422	G	6	6	501381	501386	0 %	0 %	100 %	0 %	330823110
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14403	NC_015422	ACC	2	6	501602	501607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823110
14404	NC_015422	GCA	2	6	501648	501653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823110
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14407	NC_015422	GGCC	2	8	501696	501703	0 %	0 %	50 %	50 %	330823110
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14414	NC_015422	GC	3	6	501821	501826	0 %	0 %	50 %	50 %	330823110
14415	NC_015422	GCC	2	6	501835	501840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823110
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14421	NC_015422	CCAG	2	8	502032	502039	25 %	0 %	25 %	50 %	330823110
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14442	NC_015422	CGTT	2	8	502784	502791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14443	NC_015422	GCC	2	6	502839	502844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14444	NC_015422	GC	3	6	502866	502871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14445	NC_015422	GCC	3	9	502876	502884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14446	NC_015422	C	7	7	502883	502889	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14447	NC_015422	CTC	2	6	502891	502896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14448	NC_015422	CGG	2	6	502931	502936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823111
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14451	NC_015422	GCT	2	6	503007	503012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823111
14452	NC_015422	CG	3	6	503224	503229	0 %	0 %	50 %	50 %	330823111
14453	NC_015422	TCT	2	6	503433	503438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330823111
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14463	NC_015422	CGT	2	6	503745	503750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823111
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14467	NC_015422	GCG	2	6	503825	503830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823111
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14471	NC_015422	GC	3	6	503907	503912	0 %	0 %	50 %	50 %	330823111
14472	NC_015422	TGTC	2	8	503928	503935	0 %	50 %	25 %	25 %	330823111
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14476	NC_015422	GGC	2	6	504089	504094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823112
14477	NC_015422	CAT	2	6	504095	504100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823112
14478	NC_015422	GCG	2	6	504101	504106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823112
14479	NC_015422	CG	4	8	504105	504112	0 %	0 %	50 %	50 %	330823112
14480	NC_015422	CAC	2	6	504113	504118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823112
14481	NC_015422	GC	3	6	504126	504131	0 %	0 %	50 %	50 %	330823112
14482	NC_015422	AC	3	6	504139	504144	50 %	0 %	0 %	50 %	330823112
14483	NC_015422	CCA	2	6	504187	504192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823112
14484	NC_015422	GCG	2	6	504209	504214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823112
14485	NC_015422	TCC	2	6	504219	504224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330823112
14486	NC_015422	GGC	2	6	504230	504235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823112
14487	NC_015422	GC	3	6	504287	504292	0 %	0 %	50 %	50 %	330823112
14488	NC_015422	TCT	2	6	504304	504309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330823112
14489	NC_015422	GCC	2	6	504350	504355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823112
14490	NC_015422	CTGG	2	8	504377	504384	0 %	25 %	50 %	25 %	330823112
14491	NC_015422	GCG	2	6	504424	504429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823112
14492	NC_015422	GGC	3	9	504431	504439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823112
14493	NC_015422	CTG	2	6	504452	504457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823112
14494	NC_015422	CTT	2	6	504515	504520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330823112
14495	NC_015422	CAT	2	6	504524	504529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823112
14496	NC_015422	CAG	2	6	504533	504538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823112
14497	NC_015422	CGG	2	6	504559	504564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823112
14498	NC_015422	GCA	2	6	504580	504585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823112
14499	NC_015422	CG	4	8	504604	504611	0 %	0 %	50 %	50 %	330823112
14500	NC_015422	CCA	2	6	504616	504621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823112

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