MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV4

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015188	CGGAC	2	10	92	101	20 %	0 %	40 %	40 %	325169002
2	NC_015188	CCCGT	2	10	2076	2085	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_015188	ACGGG	2	10	2966	2975	20 %	0 %	60 %	20 %	325169006
4	NC_015188	TAAAC	2	10	3337	3346	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015188	CCCGG	2	10	3966	3975	0 %	0 %	40 %	60 %	325169009
6	NC_015188	CGGCG	2	10	4792	4801	0 %	0 %	60 %	40 %	325169011
7	NC_015188	GCGTC	2	10	6574	6583	0 %	20 %	40 %	40 %	325169011
8	NC_015188	GCGCC	2	10	6632	6641	0 %	0 %	40 %	60 %	325169011
9	NC_015188	AGCCG	2	10	7303	7312	20 %	0 %	40 %	40 %	325169011
10	NC_015188	CCGCC	2	10	11171	11180	0 %	0 %	20 %	80 %	325169014
11	NC_015188	GCAGT	2	10	13703	13712	20 %	20 %	40 %	20 %	325169019
12	NC_015188	GATGG	2	10	13759	13768	20 %	20 %	60 %	0 %	325169019
13	NC_015188	CGGGG	2	10	14889	14898	0 %	0 %	80 %	20 %	325169019
14	NC_015188	CGCTC	2	10	18319	18328	0 %	20 %	20 %	60 %	325169022
15	NC_015188	AGAAT	2	10	18733	18742	60 %	20 %	20 %	0 %	325169022
16	NC_015188	GCGCT	2	10	19116	19125	0 %	20 %	40 %	40 %	325169023
17	NC_015188	CCCGG	2	10	21070	21079	0 %	0 %	40 %	60 %	325169025
18	NC_015188	GCCCT	2	10	21372	21381	0 %	20 %	20 %	60 %	325169025
19	NC_015188	CGCAG	2	10	22439	22448	20 %	0 %	40 %	40 %	325169027
20	NC_015188	GCTAC	2	10	22573	22582	20 %	20 %	20 %	40 %	325169027
21	NC_015188	GGCAT	2	10	22606	22615	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015188	ATTTT	2	10	22771	22780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015188	AACGG	2	10	23695	23704	40 %	0 %	40 %	20 %	325169028
24	NC_015188	TATCC	2	10	25125	25134	20 %	40 %	0 %	40 %	325169029
25	NC_015188	TCGCT	2	10	25142	25151	0 %	40 %	20 %	40 %	325169029
26	NC_015188	TCATC	2	10	25249	25258	20 %	40 %	0 %	40 %	325169029
27	NC_015188	ATCCA	2	10	25674	25683	40 %	20 %	0 %	40 %	325169029
28	NC_015188	GCAAT	2	10	29161	29170	40 %	20 %	20 %	20 %	325169031
29	NC_015188	AGCTT	2	10	29277	29286	20 %	40 %	20 %	20 %	325169031
30	NC_015188	TTGAA	2	10	30208	30217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015188	CCGTT	2	10	31028	31037	0 %	40 %	20 %	40 %	325169034
32	NC_015188	TAATA	2	10	33938	33947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015188	ACCGC	2	10	35533	35542	20 %	0 %	20 %	60 %	325169039
34	NC_015188	AACGG	2	10	37551	37560	40 %	0 %	40 %	20 %	325169041
35	NC_015188	CTCCC	2	10	38645	38654	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.