MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015184	ACAGC	2	10	538865	538874	40 %	0 %	20 %	40 %	325168872
10502	NC_015184	TCA	2	6	538901	538906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168872
10503	NC_015184	CAG	2	6	538965	538970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168872
10504	NC_015184	GC	3	6	539005	539010	0 %	0 %	50 %	50 %	325168872
10505	NC_015184	CAT	2	6	539013	539018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168872
10506	NC_015184	GCC	2	6	539019	539024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168872
10507	NC_015184	AAC	2	6	539133	539138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168872
10508	NC_015184	CGCA	2	8	539139	539146	25 %	0 %	25 %	50 %	325168872
10509	NC_015184	CGA	2	6	539153	539158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168872
10510	NC_015184	CGG	2	6	539224	539229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168872
10511	NC_015184	GCG	2	6	539309	539314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168872
10512	NC_015184	CCAG	2	8	539318	539325	25 %	0 %	25 %	50 %	325168872
10513	NC_015184	GAC	2	6	539328	539333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168872
10514	NC_015184	CGA	2	6	539381	539386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168872
10515	NC_015184	AAT	2	6	539424	539429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168872
10516	NC_015184	AAG	2	6	539478	539483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168872
10517	NC_015184	ATC	2	6	539491	539496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168872
10518	NC_015184	CCA	2	6	539603	539608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168873
10519	NC_015184	AGA	2	6	539616	539621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168873
10520	NC_015184	GTCGGC	2	12	539655	539666	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325168873
10521	NC_015184	ATC	2	6	539709	539714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168873
10522	NC_015184	CGG	2	6	539750	539755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168873
10523	NC_015184	AGC	2	6	539760	539765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168873
10524	NC_015184	GC	3	6	539820	539825	0 %	0 %	50 %	50 %	325168873
10525	NC_015184	TGC	2	6	539857	539862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168873
10526	NC_015184	ATG	2	6	539865	539870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168873
10527	NC_015184	GA	3	6	539892	539897	50 %	0 %	50 %	0 %	325168873
10528	NC_015184	ATC	2	6	539964	539969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168873
10529	NC_015184	CCG	2	6	540021	540026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168873
10530	NC_015184	GAT	2	6	540059	540064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168873
10531	NC_015184	AGGA	2	8	540096	540103	50 %	0 %	50 %	0 %	325168873
10532	NC_015184	GAA	2	6	540191	540196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168873
10533	NC_015184	GGC	2	6	540201	540206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168873
10534	NC_015184	CATC	2	8	540223	540230	25 %	25 %	0 %	50 %	325168873
10535	NC_015184	GGTCG	2	10	540233	540242	0 %	20 %	60 %	20 %	325168873
10536	NC_015184	GCG	2	6	540267	540272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168873
10537	NC_015184	AGC	2	6	540282	540287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168873
10538	NC_015184	GCG	2	6	540327	540332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168873
10539	NC_015184	GCG	2	6	540344	540349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168873
10540	NC_015184	GTT	2	6	540437	540442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168874
10541	NC_015184	CGA	2	6	540444	540449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168874
10542	NC_015184	CGA	2	6	540453	540458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168874
10543	NC_015184	GCA	2	6	540528	540533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168874
10544	NC_015184	AT	3	6	540575	540580	50 %	50 %	0 %	0 %	325168874
10545	NC_015184	CGA	2	6	540582	540587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168874
10546	NC_015184	TGA	2	6	540588	540593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168874
10547	NC_015184	CCG	2	6	540596	540601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168874
10548	NC_015184	GAT	2	6	540673	540678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168874
10549	NC_015184	CAT	2	6	540727	540732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168874
10550	NC_015184	CTGG	2	8	540733	540740	0 %	25 %	50 %	25 %	325168874
10551	NC_015184	CCG	2	6	540968	540973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168874
10552	NC_015184	GAT	2	6	540982	540987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168874
10553	NC_015184	GCC	2	6	541022	541027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168874
10554	NC_015184	GCC	2	6	541264	541269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168874
10555	NC_015184	CAC	2	6	541297	541302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168874
10556	NC_015184	ATG	3	9	541340	541348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168874
10557	NC_015184	CGC	2	6	541431	541436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10558	NC_015184	GCA	2	6	541468	541473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168875
10559	NC_015184	GCG	2	6	541480	541485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168875
10560	NC_015184	TCGA	2	8	541486	541493	25 %	25 %	25 %	25 %	325168875
10561	NC_015184	ATC	2	6	541543	541548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168875
10562	NC_015184	TGA	2	6	541586	541591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168875
10563	NC_015184	TCT	2	6	541616	541621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168875
10564	NC_015184	TGGAA	2	10	541709	541718	40 %	20 %	40 %	0 %	325168875
10565	NC_015184	GCC	3	9	541788	541796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168875
10566	NC_015184	GCA	2	6	541871	541876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168875
10567	NC_015184	GACG	2	8	541923	541930	25 %	0 %	50 %	25 %	325168875
10568	NC_015184	GGC	2	6	541945	541950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168875
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10570	NC_015184	CGA	2	6	542067	542072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168875
10571	NC_015184	GGCC	2	8	542078	542085	0 %	0 %	50 %	50 %	325168875
10572	NC_015184	GGC	2	6	542130	542135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168875
10573	NC_015184	TCG	2	6	542152	542157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168875
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10578	NC_015184	GTG	2	6	542314	542319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168875
10579	NC_015184	GGTGAA	2	12	542328	542339	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325168875
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10583	NC_015184	AGGA	2	8	542506	542513	50 %	0 %	50 %	0 %	325168875
10584	NC_015184	AAGA	2	8	542517	542524	75 %	0 %	25 %	0 %	325168875
10585	NC_015184	GCC	2	6	542544	542549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168875
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10587	NC_015184	TCGG	2	8	542605	542612	0 %	25 %	50 %	25 %	325168875
10588	NC_015184	AGC	2	6	542749	542754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168875
10589	NC_015184	GAC	2	6	542778	542783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168875
10590	NC_015184	ATC	2	6	542793	542798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168875
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10592	NC_015184	GAA	2	6	542955	542960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168875
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10594	NC_015184	CGA	3	9	543022	543030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168875
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10598	NC_015184	GCCC	2	8	543432	543439	0 %	0 %	25 %	75 %	325168876
10599	NC_015184	TGC	2	6	543447	543452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10600	NC_015184	TC	3	6	543460	543465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10601	NC_015184	GCC	2	6	543467	543472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10602	NC_015184	CGT	2	6	543563	543568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10603	NC_015184	GCTGG	2	10	543574	543583	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10604	NC_015184	AGA	2	6	543598	543603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_015184	AGA	2	6	543612	543617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_015184	TCG	2	6	543800	543805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168877
10607	NC_015184	GAA	2	6	544288	544293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168878
10608	NC_015184	GCA	2	6	544323	544328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168878
10609	NC_015184	TTC	2	6	544355	544360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168878
10610	NC_015184	TCA	2	6	544393	544398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168878
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10613	NC_015184	GC	3	6	544481	544486	0 %	0 %	50 %	50 %	325168878
10614	NC_015184	GCT	3	9	544594	544602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168878
10615	NC_015184	CCG	2	6	544605	544610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168878
10616	NC_015184	GC	3	6	544628	544633	0 %	0 %	50 %	50 %	325168878
10617	NC_015184	GATC	2	8	544681	544688	25 %	25 %	25 %	25 %	325168878
10618	NC_015184	ATC	2	6	544869	544874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168878
10619	NC_015184	GCA	2	6	544876	544881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168878
10620	NC_015184	TGG	2	6	544882	544887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168878
10621	NC_015184	GAC	2	6	544916	544921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168878
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10624	NC_015184	GCC	2	6	545072	545077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168879
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10653	NC_015184	GCC	2	6	546624	546629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168880
10654	NC_015184	GAT	2	6	546671	546676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168880
10655	NC_015184	GC	4	8	546693	546700	0 %	0 %	50 %	50 %	325168880
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10672	NC_015184	GC	3	6	547350	547355	0 %	0 %	50 %	50 %	325168881
10673	NC_015184	CA	3	6	547382	547387	50 %	0 %	0 %	50 %	325168881
10674	NC_015184	GCG	2	6	547391	547396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168881
10675	NC_015184	ATG	2	6	547421	547426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168881
10676	NC_015184	TGA	2	6	547521	547526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168881
10677	NC_015184	AT	3	6	547647	547652	50 %	50 %	0 %	0 %	325168881
10678	NC_015184	TCG	2	6	547665	547670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168881
10679	NC_015184	AAGA	2	8	547711	547718	75 %	0 %	25 %	0 %	325168881
10680	NC_015184	AGCG	2	8	547727	547734	25 %	0 %	50 %	25 %	325168881
10681	NC_015184	TCA	2	6	547779	547784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10682	NC_015184	ATG	2	6	547896	547901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168882
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10684	NC_015184	CGC	2	6	547970	547975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168882
10685	NC_015184	CGG	2	6	548062	548067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168882
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10689	NC_015184	GCG	2	6	548197	548202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168882
10690	NC_015184	CGG	2	6	548204	548209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168882
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10692	NC_015184	GAT	3	9	548285	548293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168882
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10702	NC_015184	CCAG	2	8	548762	548769	25 %	0 %	25 %	50 %	325168882
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10706	NC_015184	CG	3	6	548950	548955	0 %	0 %	50 %	50 %	325168882
10707	NC_015184	GCG	2	6	548991	548996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168882
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10710	NC_015184	TAT	2	6	549160	549165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10711	NC_015184	CG	3	6	549252	549257	0 %	0 %	50 %	50 %	325168883
10712	NC_015184	GAC	2	6	549302	549307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168883
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10717	NC_015184	CAA	2	6	550012	550017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168883
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10721	NC_015184	ATC	2	6	550157	550162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10723	NC_015184	CAA	2	6	550230	550235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10724	NC_015184	G	6	6	550272	550277	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10725	NC_015184	GCCG	2	8	550283	550290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10726	NC_015184	TTG	2	6	550297	550302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10727	NC_015184	TTGC	2	8	550370	550377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10728	NC_015184	A	6	6	550397	550402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10729	NC_015184	CGA	2	6	550510	550515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168884
10730	NC_015184	TTCGAC	2	12	550537	550548	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325168884
10731	NC_015184	GCG	2	6	550555	550560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168884
10732	NC_015184	ATGT	2	8	550565	550572	25 %	50 %	25 %	0 %	325168884
10733	NC_015184	TGG	2	6	550620	550625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168884
10734	NC_015184	GCC	2	6	550630	550635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168884
10735	NC_015184	TGC	2	6	550692	550697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168884
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10737	NC_015184	CGC	2	6	550766	550771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168884
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10739	NC_015184	CGCT	2	8	550946	550953	0 %	25 %	25 %	50 %	325168884
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10859	NC_015184	GCA	2	6	557207	557212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168888
10860	NC_015184	GGCGA	2	10	557221	557230	20 %	0 %	60 %	20 %	325168888
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10981	NC_015184	GTC	2	6	564339	564344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168897
10982	NC_015184	GATC	2	8	564403	564410	25 %	25 %	25 %	25 %	325168897
10983	NC_015184	AAG	2	6	564480	564485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168897
10984	NC_015184	ATC	2	6	564624	564629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168897
10985	NC_015184	CGA	2	6	564704	564709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168897
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10990	NC_015184	TAA	2	6	564941	564946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10991	NC_015184	AAG	2	6	565003	565008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168898
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10998	NC_015184	TCA	2	6	565515	565520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168899
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