MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015184	GC	3	6	334983	334988	0 %	0 %	50 %	50 %	325168661
6502	NC_015184	CAG	2	6	335010	335015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168661
6503	NC_015184	CGG	2	6	335082	335087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168661
6504	NC_015184	CAAGC	2	10	335145	335154	40 %	0 %	20 %	40 %	325168661
6505	NC_015184	CGG	2	6	335186	335191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168661
6506	NC_015184	CCG	2	6	335197	335202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168661
6507	NC_015184	CAAGC	2	10	335235	335244	40 %	0 %	20 %	40 %	325168661
6508	NC_015184	CCA	2	6	335309	335314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168661
6509	NC_015184	AGA	3	9	335342	335350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168661
6510	NC_015184	CGC	2	6	335369	335374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168661
6511	NC_015184	ACC	2	6	335378	335383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168661
6512	NC_015184	CGA	2	6	335441	335446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168661
6513	NC_015184	CCG	2	6	335480	335485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168661
6514	NC_015184	GAT	2	6	335517	335522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168661
6515	NC_015184	CGA	2	6	335603	335608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168661
6516	NC_015184	CACCG	2	10	335638	335647	20 %	0 %	20 %	60 %	325168661
6517	NC_015184	GGC	2	6	335724	335729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168662
6518	NC_015184	TC	3	6	335857	335862	0 %	50 %	0 %	50 %	325168662
6519	NC_015184	ATG	2	6	336040	336045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168662
6520	NC_015184	CCA	2	6	336080	336085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168662
6521	NC_015184	CGGCA	2	10	336108	336117	20 %	0 %	40 %	40 %	325168662
6522	NC_015184	CAT	2	6	336236	336241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168662
6523	NC_015184	CGG	2	6	336284	336289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168662
6524	NC_015184	GCA	2	6	336298	336303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168662
6525	NC_015184	TGC	2	6	336354	336359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168662
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6527	NC_015184	CGG	2	6	336414	336419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168662
6528	NC_015184	TCT	2	6	336446	336451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168662
6529	NC_015184	CAG	2	6	336579	336584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168662
6530	NC_015184	CTT	2	6	336714	336719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_015184	GCG	2	6	336923	336928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_015184	TGC	2	6	336975	336980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_015184	AT	3	6	336984	336989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_015184	T	6	6	337015	337020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_015184	T	6	6	337111	337116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_015184	TCG	2	6	337184	337189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_015184	GCC	2	6	337212	337217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_015184	AGC	2	6	337295	337300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168663
6539	NC_015184	TGG	2	6	337329	337334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168663
6540	NC_015184	TCGAGG	2	12	337361	337372	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325168663
6541	NC_015184	TCG	2	6	337382	337387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168663
6542	NC_015184	CCAA	2	8	337449	337456	50 %	0 %	0 %	50 %	325168663
6543	NC_015184	TGGCAT	2	12	337515	337526	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325168663
6544	NC_015184	GGA	2	6	337632	337637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168663
6545	NC_015184	CTCG	2	8	337644	337651	0 %	25 %	25 %	50 %	325168663
6546	NC_015184	GAA	2	6	337659	337664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168663
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6553	NC_015184	ACG	2	6	338044	338049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168663
6554	NC_015184	CGTC	2	8	338142	338149	0 %	25 %	25 %	50 %	325168663
6555	NC_015184	C	6	6	338159	338164	0 %	0 %	0 %	100 %	325168663
6556	NC_015184	GTCC	2	8	338196	338203	0 %	25 %	25 %	50 %	325168663
6557	NC_015184	TCT	3	9	338229	338237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168663
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6559	NC_015184	GC	3	6	338256	338261	0 %	0 %	50 %	50 %	325168663
6560	NC_015184	AGCTC	2	10	338304	338313	20 %	20 %	20 %	40 %	325168663
6561	NC_015184	ACC	2	6	338329	338334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168663
6562	NC_015184	TGAA	2	8	338373	338380	50 %	25 %	25 %	0 %	325168663
6563	NC_015184	CAA	3	9	338381	338389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_015184	ACG	2	6	338423	338428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168664
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6566	NC_015184	GCT	2	6	338481	338486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168664
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6569	NC_015184	GATC	2	8	338723	338730	25 %	25 %	25 %	25 %	325168664
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6572	NC_015184	CTCGT	2	10	338889	338898	0 %	40 %	20 %	40 %	325168664
6573	NC_015184	CGAC	2	8	338968	338975	25 %	0 %	25 %	50 %	325168664
6574	NC_015184	ACCA	2	8	339039	339046	50 %	0 %	0 %	50 %	325168664
6575	NC_015184	CAG	2	6	339063	339068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168664
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6585	NC_015184	TCA	2	6	339725	339730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168665
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6611	NC_015184	CGGCA	2	10	341079	341088	20 %	0 %	40 %	40 %	325168666
6612	NC_015184	GGAA	2	8	341111	341118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_015184	CCA	2	6	341138	341143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168667
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6621	NC_015184	GCG	2	6	341453	341458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168667
6622	NC_015184	TCG	2	6	341468	341473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168667
6623	NC_015184	CCGA	2	8	341513	341520	25 %	0 %	25 %	50 %	325168667
6624	NC_015184	TCA	2	6	341534	341539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168667
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6631	NC_015184	TCA	2	6	341945	341950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168667
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6672	NC_015184	TGC	2	6	343939	343944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6744	NC_015184	TTC	2	6	347952	347957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168678
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6859	NC_015184	GAA	2	6	353720	353725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168686
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6988	NC_015184	CCAA	2	8	360826	360833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6989	NC_015184	CT	3	6	360851	360856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6990	NC_015184	ATC	2	6	360965	360970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6991	NC_015184	TG	3	6	361034	361039	0 %	50 %	50 %	0 %	325168694
6992	NC_015184	CTG	2	6	361068	361073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168694
6993	NC_015184	AAG	2	6	361089	361094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168694
6994	NC_015184	AGC	2	6	361095	361100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168694
6995	NC_015184	TCG	2	6	361294	361299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168694
6996	NC_015184	GAT	2	6	361362	361367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168694
6997	NC_015184	GTG	2	6	361387	361392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168694
6998	NC_015184	TTCAT	2	10	361393	361402	20 %	60 %	0 %	20 %	325168694
6999	NC_015184	CG	3	6	361498	361503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7000	NC_015184	CAG	2	6	361505	361510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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