MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_015183	GGC	2	6	1993439	1993444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293446
43002	NC_015183	ATC	2	6	1993455	1993460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293446
43003	NC_015183	TCG	2	6	1993476	1993481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293446
43004	NC_015183	TTC	2	6	1993487	1993492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293446
43005	NC_015183	CATCA	2	10	1993493	1993502	40 %	20 %	0 %	40 %	325293446
43006	NC_015183	TCT	2	6	1993623	1993628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293446
43007	NC_015183	CGATGG	2	12	1993687	1993698	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325293446
43008	NC_015183	GTT	2	6	1993717	1993722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43009	NC_015183	AGCG	2	8	1993924	1993931	25 %	0 %	50 %	25 %	325293447
43010	NC_015183	GC	3	6	1993973	1993978	0 %	0 %	50 %	50 %	325293447
43011	NC_015183	CCG	2	6	1994030	1994035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293447
43012	NC_015183	CCAG	2	8	1994039	1994046	25 %	0 %	25 %	50 %	325293447
43013	NC_015183	CGC	2	6	1994047	1994052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293447
43014	NC_015183	GTC	2	6	1994163	1994168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293447
43015	NC_015183	CCA	2	6	1994249	1994254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293447
43016	NC_015183	TGT	2	6	1994293	1994298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293447
43017	NC_015183	CCG	2	6	1994396	1994401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293447
43018	NC_015183	CAT	2	6	1994412	1994417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293447
43019	NC_015183	TGC	2	6	1994474	1994479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293447
43020	NC_015183	GC	3	6	1994595	1994600	0 %	0 %	50 %	50 %	325293447
43021	NC_015183	AAGG	2	8	1994629	1994636	50 %	0 %	50 %	0 %	325293447
43022	NC_015183	CGA	2	6	1994674	1994679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43023	NC_015183	ATA	2	6	1994702	1994707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43024	NC_015183	GAG	2	6	1994709	1994714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43025	NC_015183	CGGA	2	8	1994734	1994741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43026	NC_015183	GAC	2	6	1994755	1994760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43027	NC_015183	GGAG	2	8	1994833	1994840	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43028	NC_015183	GATG	2	8	1994866	1994873	25 %	25 %	50 %	0 %	325293448
43029	NC_015183	GCT	2	6	1994905	1994910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293448
43030	NC_015183	GCC	2	6	1994956	1994961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293448
43031	NC_015183	CTG	2	6	1995005	1995010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293448
43032	NC_015183	CAT	2	6	1995022	1995027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293448
43033	NC_015183	GC	3	6	1995061	1995066	0 %	0 %	50 %	50 %	325293448
43034	NC_015183	CAA	2	6	1995088	1995093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293448
43035	NC_015183	CAT	2	6	1995094	1995099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293448
43036	NC_015183	CGA	2	6	1995165	1995170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293448
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43038	NC_015183	TCG	2	6	1995189	1995194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293448
43039	NC_015183	CGA	2	6	1995211	1995216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293448
43040	NC_015183	CAA	2	6	1995229	1995234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293448
43041	NC_015183	CGA	2	6	1995270	1995275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293448
43042	NC_015183	GCT	2	6	1995378	1995383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293448
43043	NC_015183	GCC	2	6	1995400	1995405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293448
43044	NC_015183	TGA	2	6	1995408	1995413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293448
43045	NC_015183	CTC	2	6	1995464	1995469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293448
43046	NC_015183	TCT	2	6	1995564	1995569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293448
43047	NC_015183	CCA	2	6	1995594	1995599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293448
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43049	NC_015183	GCC	2	6	1995707	1995712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293448
43050	NC_015183	TGACAG	2	12	1995779	1995790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325293448
43051	NC_015183	CAT	2	6	1995810	1995815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43052	NC_015183	ACG	2	6	1995829	1995834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43053	NC_015183	ACC	2	6	1995835	1995840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43054	NC_015183	CATGAA	2	12	1995968	1995979	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325293449
43055	NC_015183	ACAA	2	8	1995993	1996000	75 %	0 %	0 %	25 %	325293449
43056	NC_015183	GC	3	6	1996028	1996033	0 %	0 %	50 %	50 %	325293449
43057	NC_015183	CGGCA	2	10	1996089	1996098	20 %	0 %	40 %	40 %	325293449
43058	NC_015183	CATCGT	2	12	1996166	1996177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293449
43059	NC_015183	ACG	2	6	1996270	1996275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293449
43060	NC_015183	CGC	2	6	1996385	1996390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293449
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43065	NC_015183	CAG	2	6	1996786	1996791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293450
43066	NC_015183	GCCCTG	2	12	1996825	1996836	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325293450
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43068	NC_015183	CCTCG	2	10	1996918	1996927	0 %	20 %	20 %	60 %	325293450
43069	NC_015183	GCT	2	6	1997024	1997029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293450
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43071	NC_015183	CAGC	2	8	1997194	1997201	25 %	0 %	25 %	50 %	325293450
43072	NC_015183	ATC	2	6	1997260	1997265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293450
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43074	NC_015183	GCG	2	6	1997430	1997435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43075	NC_015183	AAC	2	6	1997439	1997444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43076	NC_015183	GCCA	2	8	1997478	1997485	25 %	0 %	25 %	50 %	325293451
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43082	NC_015183	ACC	2	6	1997667	1997672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293451
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43085	NC_015183	GC	4	8	1997793	1997800	0 %	0 %	50 %	50 %	325293451
43086	NC_015183	TCGC	2	8	1997847	1997854	0 %	25 %	25 %	50 %	325293451
43087	NC_015183	GCC	2	6	1997865	1997870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293451
43088	NC_015183	GATC	2	8	1997977	1997984	25 %	25 %	25 %	25 %	325293451
43089	NC_015183	CGG	2	6	1997988	1997993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293451
43090	NC_015183	GATGC	2	10	1998064	1998073	20 %	20 %	40 %	20 %	325293451
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43093	NC_015183	CGAAA	2	10	1998197	1998206	60 %	0 %	20 %	20 %	325293451
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43096	NC_015183	CCGCA	2	10	1998299	1998308	20 %	0 %	20 %	60 %	325293451
43097	NC_015183	CA	3	6	1998318	1998323	50 %	0 %	0 %	50 %	325293451
43098	NC_015183	CGC	2	6	1998472	1998477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293451
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43100	NC_015183	GCC	2	6	1998536	1998541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293451
43101	NC_015183	GC	3	6	1998577	1998582	0 %	0 %	50 %	50 %	325293451
43102	NC_015183	GTG	2	6	1998618	1998623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293451
43103	NC_015183	CG	3	6	1998756	1998761	0 %	0 %	50 %	50 %	325293451
43104	NC_015183	TCA	2	6	1998814	1998819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293451
43105	NC_015183	CGA	2	6	1998856	1998861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293451
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43107	NC_015183	CGC	2	6	1999081	1999086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293451
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43112	NC_015183	TCGGC	2	10	1999252	1999261	0 %	20 %	40 %	40 %	325293451
43113	NC_015183	ATC	2	6	1999277	1999282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293451
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43117	NC_015183	GAA	2	6	1999638	1999643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43235	NC_015183	GCG	2	6	2005140	2005145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293457
43236	NC_015183	CGA	2	6	2005201	2005206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293457
43237	NC_015183	TCG	2	6	2005236	2005241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293457
43238	NC_015183	GAT	2	6	2005256	2005261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293457
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43337	NC_015183	ATC	2	6	2009931	2009936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43348	NC_015183	TCCTC	2	10	2010488	2010497	0 %	40 %	0 %	60 %	325293461
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43350	NC_015183	CTG	2	6	2010514	2010519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293461
43351	NC_015183	TCG	2	6	2010569	2010574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293461
43352	NC_015183	ATC	2	6	2010580	2010585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293461
43353	NC_015183	GAA	2	6	2010658	2010663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293461
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43355	NC_015183	CTG	2	6	2010775	2010780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293461
43356	NC_015183	ATCCTG	2	12	2010910	2010921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293461
43357	NC_015183	ACG	2	6	2010922	2010927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293461
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43365	NC_015183	TGA	2	6	2011320	2011325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43369	NC_015183	TCT	2	6	2011526	2011531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293462
43370	NC_015183	GAC	3	9	2011581	2011589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293462
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43373	NC_015183	ATG	2	6	2012042	2012047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293462
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43375	NC_015183	CGA	2	6	2012108	2012113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293462
43376	NC_015183	A	6	6	2012122	2012127	100 %	0 %	0 %	0 %	325293462
43377	NC_015183	TGC	2	6	2012306	2012311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43378	NC_015183	GA	3	6	2012315	2012320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43379	NC_015183	CCG	2	6	2012565	2012570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293463
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43465	NC_015183	ATG	2	6	2016583	2016588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293466
43466	NC_015183	GAA	2	6	2016741	2016746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293466
43467	NC_015183	ATC	3	9	2016757	2016765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293466
43468	NC_015183	AGC	2	6	2016766	2016771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293466
43469	NC_015183	CAT	2	6	2016783	2016788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293466
43470	NC_015183	AGGA	2	8	2016820	2016827	50 %	0 %	50 %	0 %	325293466
43471	NC_015183	GAA	3	9	2016882	2016890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293466
43472	NC_015183	CCG	2	6	2016917	2016922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293466
43473	NC_015183	CGC	2	6	2016972	2016977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293466
43474	NC_015183	AGAA	2	8	2016979	2016986	75 %	0 %	25 %	0 %	325293466
43475	NC_015183	GACCG	2	10	2017014	2017023	20 %	0 %	40 %	40 %	325293466
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43477	NC_015183	GCCG	2	8	2017186	2017193	0 %	0 %	50 %	50 %	325293467
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43479	NC_015183	TGC	2	6	2017223	2017228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293467
43480	NC_015183	CCG	3	9	2017293	2017301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293467
43481	NC_015183	GCC	2	6	2017360	2017365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293467
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43483	NC_015183	TGC	2	6	2017423	2017428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293467
43484	NC_015183	TGG	2	6	2017440	2017445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293467
43485	NC_015183	CCGA	2	8	2017480	2017487	25 %	0 %	25 %	50 %	325293467
43486	NC_015183	CAG	2	6	2017642	2017647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293467
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43491	NC_015183	GCCG	2	8	2017903	2017910	0 %	0 %	50 %	50 %	325293467
43492	NC_015183	TCG	2	6	2017920	2017925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293467
43493	NC_015183	GATC	2	8	2017932	2017939	25 %	25 %	25 %	25 %	325293467
43494	NC_015183	CGG	2	6	2017981	2017986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293467
43495	NC_015183	GCC	2	6	2018017	2018022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293467
43496	NC_015183	GTC	2	6	2018072	2018077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293467
43497	NC_015183	CGC	2	6	2018182	2018187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293467
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43499	NC_015183	TCG	2	6	2018339	2018344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293467
43500	NC_015183	CAA	2	6	2018349	2018354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293467

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